Summary

通过低温扫描电子显微镜研究光合膜内冻结,割断叶片组织的超分子组织

Published: June 23, 2016
doi:
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Summary

Here we describe a procedure for studying freeze-fractured plant tissues. High-pressure frozen leaf samples are freeze-fractured and double-layer coated, yielding well preserved frozen-hydrated samples that are imaged using the cryo-scanning electron microscope at high magnifications with minimal beam damage.

Abstract

冷冻断裂样品的冷冻扫描电子显微镜(SEM)允许在接近天然条件的生物结构的调查。在这里,我们描述了叶片样品中学习光合(类囊体)膜的超分子组织的技术。这是由叶组织的高压冷冻,冷冻压裂,双层涂层和最后低温SEM成像实现的。双层涂覆方法的使用允许获得高倍率(> 100000)与到冷冻水合样品最小光束损害以及最小充电效果的图像。使用所描述的过程,我们在采取复苏植物Craterostigma细叶脱水过程中进行,现场光系统和捕光天线蛋白复合物超分子分布调查改变。

Introduction

氧光合作用,原产于古代的蓝藻,是由内共生事件,导致叶绿体细胞器的开发继承了藻类和陆生植物。在所有现代的产氧光养,光合作用电子传输和质子动力的产生,并减少功率被称为”类囊体”膜扁平囊样小泡内进行。这些膜容纳该进行光合作用的光驱动反应和提供能量转换介质中的蛋白复合物。植物和(部分)藻类的类囊体膜分化成两个不同的形态结构域:紧紧贴伏膜的区域称为”基粒”和互连基粒未叠加膜,称为”基质片层1。植物和藻类类囊体膜的各种冷冻断裂研究已经进行,在70年代初开始。当冷冻断裂,膜沿着它们的疏水芯2分割,生成exoplasmic面(EF)和原生质面(PF),这取决于蜂窝隔室其中半膜的边界,如最初由Branton 等人提出的。 。在1975年3植物和藻类类囊体有四种不同的裂缝面:EF文件,EFU,PFS和PFU,用's'和'U'表示'堆积'和'拆散'膜的区域,分别为。膜蛋白复合物,这是不分裂或破裂,必须保持与E或膜的P一侧的倾向。最初的意见,即类囊体的不同裂缝面包含不同大小的颗粒和密度4,以及随之而来的大量调查,导致了开展光反应所观察到的颗粒和膜蛋白复合物的鉴定和相关5-13 (见还回顾14,15)。

FRE类囊体膜的结-断裂试验通常进行于叶绿体或分离的类囊体膜的制剂(但见16,17),在任何改变的在结构和/或超分子组织的分离过程期间可能发生的危险。继骨折,复制是铂/炭(PT / C)的蒸发法制备,再由碳(C)厚厚的一层,最后是生物材料18的消化。复制是透射电子显微镜(TEM)观察。传统的冷冻断裂-复制技术继续作为用于研究光合膜的超分子组织和它们适应于不同的一个重要的工具, 例如 ,光,条件19-23。

在我们最近的homoiochlorophyllous复苏植物Craterostigma细叶 24的研究中,我们的目的是探讨在超分子组织为O的变化˚F类囊体膜,以及在整体蜂窝组织,脱水和复水过程中。该homoiochlorophyllous复活的物种的独特性在于它们能够生存在他们的营养组织(叶子)干燥的条件下,同时保持其光合机构。一旦水可用时,这些植物恢复和恢复小时内光合活性几天25。在这项研究中,冻结,割断叶样品的冷冻扫描EM(SEM)成像用高压冷冻样品冷冻固定组合。这些程序提供了在接近其原生状态26的状态可视化冷冻水合生物样品的方法。一个主要的好处是,样品冷冻断裂和涂层,没有连续的步骤后直接检查。这是在不同的相对含水量(RWC)植物的调查尤为重要,因为他们的水合状态,制备过程中保持不变。怎么样以往,人们关键缺点是,当在高放大倍率,光合复合物的大小的精确测量需要扫描冷冻水合样品可从光束损坏成像期间遭受,更是如此。为了克服这一点,一种方法被称为”双层涂层'(DLC)27,28与分别利用特定冷冻SEM成像条件相结合。这导致那些显著光束敏感较少样本和允许的有价值的信息,对光合蛋白质超分子组织和复苏植物C.其他细胞成分的阐明细叶 在原地高放大倍率。

Protocol

叶片组织1.超低温固定用高压冻结注意:本节介绍了如何进行叶片组织的高压冻结的冻结破裂实验。对于与植物样品的考虑看29。这可以适用于其他类型的组织或样品与一些修改。 使用刀片的角,挠0.1 / 0.2 mm铝血小板的0.1毫米空腔的底部( 图1)。至少准备一打血小板(6个样本)。采取小心不要在盘的圆周创建刀痕。 搔抓后,洗碟无水乙醇,让他们干,保持一个干净的菜。 根据制造商的说明制备高压冷冻机。填充用异丙醇高压冷冻机的酒精室。 制备自制真空辅助infiltratioÑ​​设备来替换与液体的叶组织中发现的气体。 紧紧一个200μl的移液管尖端连接到10毫升注射器的端部。切断〜1厘米尖。使在1.5ml微量离心管的盖,以一个孔紧密地配合切割尖端。真空可在管内通过拉动注射器的柱塞被创建。 从使用刀片的植物切一小片叶子并用镊子放置一个离心管中一半填充有1-十六内的叶。通过轻轻拉动柱塞创建真空渗入与液体叶子的细胞间隙,保持约30秒,然后缓慢释放柱塞。 删除用镊子管中的叶片。修剪用刀片的情况下,它是0.2mm以上厚的叶和切一小片,将适合成血小板。 将一个洁净的血小板与抓伤的一面朝上放入冻机的支架,然后将切下的乐AF成血小板。填充周围用1-十六叶的剩余空间。使用其他血小板关闭三明治,但面向叶划痕。 关闭并拧紧固定器,并将其插入到机器的腔。然后按'喷气机'按钮冻结(〜2100条300 – 500毫秒),并迅速持有者转移到液氮中。使用预冷却的镊子,小心不要折断夹心从支架小心取出冷冻的三明治。 注意事项:密闭冷冻三明治可以冻结裂隙立即或保存在供以后使用液氮。液氮操作时,使用的防护服和护目镜。 2.冷冻断裂和双层涂层27,28 制备冷冻断裂机的使用,包括枪为铂/碳(铂/ C)和碳的蒸发,根据制造商的说明。放置的Pt / C枪在45度的次在90度的碳枪。 预编程的Pt / C(涂敷速度0.02 – 0.04纳米/秒)的2纳米层的一个涂覆方案和碳的6纳米层(在〜0.1纳米/秒)。 进入冷冻断裂机的屏幕上的安装。选择在哪里,该涂层方案将被保存在用户数。 选择的Pt / C为”1层”。选择一个时间框架, 例如 ,5分钟(超过完成涂层所需的必要的时间)。使用上下箭头来定义的厚度为2纳米。 按”层”按钮移动到2层重复步骤2.1.1.2,只不过选择碳和定义,厚度为6纳米。 测试和调整喷枪作业。 选择”图层1″。按”GUN1″按钮选择的Pt / C枪,然后按冷冻断裂机的蒸发器上的”打开”按钮。监视蒸发速率和使用的电压和发射旋钮UNT调整它IL达到0.02的速率 – 0.04纳米/秒。按”OFF”关闭的Pt / C的枪。 选择”2层”。重复2.1.2.1,除了选择'GUN2'并调整为0.1nm /秒的〜的蒸发速率。 酷(分别为水合或脱水叶)冷冻断裂系统的阶段-140℃或-160˚C。装上真空冷冻班车服务的机器,并用液氮填补其室。毫巴-7 8×10 -压在冷却冷冻断裂室通常在1之间。 插入冷冻压裂试样保持器(适合于3毫米血小板)到装载站。洪水用液氮装载站室中。 采用高精度等级镊子一个装载两个冷冻三明治到持有人之一。拧紧第一块三明治到支架,然后翻转持有人过来检查到位牢固地安装。重复第二个三明治。 ðetach从冷冻断裂机冷却班车和它连接到装载站。打开梭阀,引进收回臂插入支架,并将其锁定到位。重新引入与保持到穿梭臂以及使用该装载站旋钮关闭梭阀。附加穿梭于冷冻断裂机和引入保持件与所述收回臂的腔室。从分离机的班车。 对准冷冻断裂切片刀的高度,使得其将敲落三明治的顶端血小板。 随着切片刀,迅速突破了三明治,然后立即提出来,以防止样品污染的碎片执着刀,并把新暴露的平面上方的冷却快门由水分子免受可能的污染样品室中。 大衣搭配铂和碳样本。 输入”图层1″的SC颖。按”GUN1″按钮,然后按”ON”按钮打开的Pt / C的枪。审查的蒸发速率和一旦达到0.02 – 0.04纳米/秒,同时暴露出样品,并按下”测量”按钮来监测沉积层的厚度。 注:当厚度已经达到了预选值枪会自动关闭。 盖与快门样本时完成的Pt / C的蒸发。 按”层”按钮移动到”2层”。重复步骤2.8.1和2.8.2,以选择”GUN2'(碳)和0.1纳米/秒的〜的蒸发速率的异常。 温冷冻断裂系统的阶段-120˚C。 3.超低温扫描电子显微镜制备用于低温工作的扫描型电子显微镜。 从主菜单,确认选择舞台/舞台初始化。 选择工具/ GOTO面板,并从列表中选择打开”气密室”面板。点击”关闭柱箱阀门”按钮。通过点击”真空”选项卡下的通风排气按钮,在显微镜室。 选择工具/转到面板,打开”阶段点列表”面板。选择低温交换位置向载物台移动到正确的坐标用于接收试样架。注意:”低温交换位置”被预设为在对准与真空传送单元的位置。 开用干净的一对手套的试样腔室和插入低温阶段到显微镜的主要阶段。关闭室,然后点击”真空”标签下泵按钮。 酷显微镜-120˚C。填写显微镜用杜瓦瓶液氮。激活低温传送控制单元上的热作用到-120˚C一旦阶段的温度低于-120˚C。 ATTACH的低温传送梭显微镜并使用收回臂进入显微镜低温阶段(如在步骤2.5)传送样品架。分离从显微镜的班车。 点击气密室面板中的”打开柱箱阀门”按钮。 小心移动样品支架接近物镜(工作距离1 – 2mm)的使用操纵杆。选择在”孔径”选项卡10微米的孔径。在”枪”选项卡中双击EHT领域。输入10(千伏)的EHT目标,然后单击确定。点击底部EHT标签,选择”EHT开”。 在”探测器”选项卡中选择从检测器下拉列表”InLens”。优化成像条件(对焦,亮度和对比度,光束对准,散光)为宜。 点击”扫描”选项卡。选择一个快速扫描(”扫描速度= 1',对应于100纳秒每像素的驻留时间),以最小化光束的损坏,并1,024×768像素一个”存储分辨率”。在”降噪”下拉列表中选择”平均线”。 N的值调整为20 – 30线搜索。使用”中心站”的功能(通过按下键盘上的控制标签)来搜索与裂隙细胞和叶绿体( 图2A和2B)的区域移动样品。 ( – 70的kX 50)( 图2C和2D)在低放大倍率获得裂缝叶绿体的图像。使用(按键盘上的控制移选项卡)的'中心功能'功能放大到有趣叶绿体裂缝面,在高放大倍率获取图像(100 – 200的kX, 图3和图4)。使用相同的参数,在步骤3.6图像采集,但改线平均价值N> 100降噪30。 主显微镜控制单元上或在”扫描”选项卡按冻结,停止扫描并保存按”保存TIFF”按钮图像。 4.图像分析注意:本节介绍使用斐济31开源包冷冻断裂的SEM图像颗粒膜分割一小段程序。类似的结果可以与其他图像分析软件来获得。 通过拖动图像文件到主程序窗口斐济打开图像。通过选择图像/类型/ 8位图像转换为8位。选择图像/调整/亮度/对比度和根据需要调整( 图5A)。 采用直线工具画一条线嵌入图像比例尺的大小。选择分析/设置比例。输入正确的档位信息(长度已知的距离和单位),然后单击确定。保存此调整缩放后的图像。 选择Process /过滤器/高斯模糊(1.5纳米半径),并单击OK( 图5B)。 选择图像/调整/ AUTØ局部阈值(使用Niblack法)并单击OK( 图5C)。 选择编辑/翻转,然后再处理/二进制/流域( 图5D)。 绘制手绘选择工具感兴趣区域(ROI)的区域周围的边框。通过选择编辑/选择添加选择的投资回报率经理/添加到管理器或通过点击”T”。 选择编辑/清除外( 图5E)。 选择分析/集测量,选择合适的参数 ( 如面积,配合椭圆形)。 选择分析/分析颗粒。输入一个适当的范围颗粒的尺寸和标记”显示结果”,”添加到管理器”,如果有必要,”排除在边缘”选项,然后单击确定。该结果示于图5F。 打开保存的缩放成像文件(步骤4.2)。选择”显示所有”,并在投资回报率经理取消选择”标签”。查看所选partic莱放置到原始图像和手动添加或使用”添加”或”删除”的投资回报率经理的按钮移除选项。更正通过使用写意选择工具和投资回报率经理( 图5G和5H)的”更新”按钮,任何必要的选择。 分析使用所获得的测量数据。在结果窗口中,单击结果/总结获得,例如平均面积,平均主要和投资回报率管理器中列出的粒子的短轴。点击结果/配送,选择参数(例如面积),然后单击确定以查看该参数的直方图。

Representative Results

图1显示了包含高压冻结,冻结,割断Craterostigma细叶叶片血小板冷冻SEM图像。在一些样品中,裂缝单元的大区域被获得( 图1A)。在其他情况下,叶片保持紧密结合到上盘并与它一起( 图1B)脱落。然而,即使在第二种情况下,某些叶组织可保持附着在血小板( 图1B,箭头)和数据的相当数量的刀槽仍可以通过成?…

Discussion

本文中所描述的技术允许保存完好的高压冷冻的植物组织的由低温扫描电子显微镜的范围内冻结,割断膜调查。使用这些程序的主要优点是样品制备是纯物理;涉及化学品或脱水任何步骤是必要的。因此,它可以在一个近乎原生状态26,32研究生物结构。用叶组织的好处是,可以得到在整体蜂窝组织的信息,以及作为研究特定的膜,如类囊体膜,其天然生理环境, 内,叶绿体内。另?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

我们感谢安德烈Kaech(苏黎世大学)为他的扫描电子显微成像有用的建议。这项工作是由美国 – 以色列两国农业研究和发展基金(批准号:US-4334-10,ZR),以色列科学基金会(批准号:1034年至1012年,ZR),和人类前沿科学计划支持(RGP0005 / 2013,ZR)。透射电镜研究在欧文和Cherna莫斯科维茨中心纳米和生物纳米成像在魏茨曼科学研究所进行。

Materials

ethanol abs Bio-Lab 052505
isopropanol Bio-Lab 162605
1-hexadecene Sigma-Aldrich H7009
0.1/0.2 platelets Engineering Office M. Wohlwend GmbH, Switzerland 241 Platelets are of 3-mm diameter and 0.5-mm-thick (Type A) with 0.1/0.2-mm-deep cavities (of diamater 2 mm). Similar platelets can be obtained from Leica Microsystems.
high-precision-grade tweezers Electron Microscopy Sciences 72706-01 Dumont (Switzerland) Durostar style #5 tweezers; Can be substituted with other high-precision tweezers.
high-pressure freezing machine Bal-Tec HPM 010 High-pressure freezing alternatives: 1. HPF Compact 02, Wohlwend GmbH; 2. HPM 010, RMC Boeckeler; 3. EM PACT2, Leica Microsystems; 4. EM HPM 100, Leica Microsystems; 5. EM ICE, Leica Microsystems.
freeze-fracture system Leica Microsystems EM BAF 060
cryo preparation loading stage Leica Microsystems 16770228
specimen holder for univeral freeze fracturing Leica Microsystems 16LZ04746VN Clamp holder for specimen carriers of diameter 3 mm
vacuum cryo-transfer shuttle Leica Microsystems EM VCT 100
scanning electron microscope Zeiss Ultra 055
cryo SEM stage Leica Microsystems 16770299905
image acquisiton software SmartSEM, Carl Zeiss Microscopy GmbH
image analysis software Fiji/Image J, National Institute of Health http://fiji.sc/Fiji

References

  1. Anderson, J. M. Insights into the consequences of grana stacking of thylakoid membranes in vascular plants: a personal perspective. Aust. J. Plant Physiol. 26 (7), 625-639 (1999).
  2. Branton, D. Fracture Faces of Frozen Membranes. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 55 (5), 1048-1056 (1966).
  3. Branton, D., et al. Freeze-Etching Nomenclature. Science. 190 (4209), 54-56 (1975).
  4. Goodenough, U. W., Staehelin, L. A. Structural Differentiation of Stacked and Unstacked Chloroplast Membranes – Freeze-Etch Electron Microscopy of Wild-Type and Mutant Strains of Chlamydomonas. J. Cell Biol. 48 (3), 594-619 (1971).
  5. Simpson, D. J. Freeze-Fracture Studies on Barley Plastid Membranes .6. Location of the P700-Chlorophyll a-Protein-1. Eur. J. Cell Biol. 31 (2), 305-314 (1983).
  6. Staehelin, L. A. Reversible Particle Movements Associated with Unstacking and Restacking of Chloroplast Membranes. Invitro. J. Cell Biol. 71 (1), 136-158 (1976).
  7. Miller, K. R. A Chloroplast Membrane Lacking Photosystem-I – Changes in Unstacked Membrane Regions. Biochim. Biophys. Acta. 592 (1), 143-152 (1980).
  8. Miller, K. R., Cushman, R. A. Chloroplast Membrane Lacking Photosystem-II – Thylakoid Stacking in the Absence of the Photosystem-II Particle. Biochim. Biophys. Acta. 546 (3), 481-497 (1979).
  9. Miller, K. R., Staehelin, L. A. Analysis of Thylakoid Outer Surface – Coupling Factor Is Limited to Unstacked Membrane Regions. J. Cell Biol. 68 (1), 30-47 (1976).
  10. Simpson, D. J. Freeze-Fracture Studies on Barley Plastid Membranes .3. Location of the Light-Harvesting Chlorophyll-Protein. Carlsberg Res. Commun. 44 (5), 305-336 (1979).
  11. Olive, J., Recouvreur, M., Girardbascou, J., Wollman, F. A. Further Identification of the Exoplasmic Face Particles on the Freeze-Fractured Thylakoid Membranes – a Study Using Double and Triple Mutants from Chlamydomonas-Reinhardtii Lacking Various Photosystem-Ii Subunits and the Cytochrome B6/F Complex. Eur. J. Cell Biol. 59 (1), 176-186 (1992).
  12. Olive, J., Vallon, O., Wollman, F. A., Recouvreur, M., Bennoun, P. Studies on the Cytochrome B6/F Complex .2. Localization of the Complex in the Thylakoid Membranes from Spinach and Chlamydomonas-Reinhardtii by Immunocytochemistry and Freeze-Fracture Analysis of B6/F Mutants. Biochim. Biophys. Acta. 851 (2), 239-248 (1986).
  13. Armond, P. A., Staehelin, L. A., Arntzen, C. J. Spatial Relationship between Light Harvesting Complex and Photosystem-1 and Photosystem-2 in Stacked and Unstacked Chloroplast Membranes. J. Cell Biol. 70 (2), 400-418 (1976).
  14. Staehelin, L. A. Chloroplast structure: from chlorophyll granules to supra-molecular architecture of thylakoid membranes. Photosynth. Res. 76 (1-3), 185-196 (2003).
  15. Nevo, R., Charuvi, D., Tsabari, O., Reich, Z. Composition, architecture and dynamics of the photosynthetic apparatus in higher plants. Plant J. 70 (1), 157-176 (2012).
  16. Platt, K. A., Oliver, M. J., Thomson, W. W. Membranes and Organelles of Dehydrated Selaginella and Tortula Retain Their Normal Configuration and Structural Integrity – Freeze-Fracture Evidence. Protoplasma. 178 (1-2), 57-65 (1994).
  17. Platt-Aloia, K. A., Thomson, W. W. Advantages of the use of intact plant tissues in freeze-fracture electron microscopy. J. Electron Microsc. Tech. 13 (4), 288-299 (1989).
  18. Carson, J. L. Fundamental technical elements of freeze-fracture/freeze-etch in biological electron microscopy. J. Vis. Exp. (91), e51694 (2014).
  19. Kirchhoff, H., et al. Low-light-induced formation of semicrystalline photosystem II arrays in higher plant chloroplasts. Biochemistry. 46 (39), 11169-11176 (2007).
  20. Johnson, M. P., et al. Photoprotective Energy Dissipation Involves the Reorganization of Photosystem II Light-Harvesting Complexes in the Grana Membranes of Spinach Chloroplasts. Plant Cell. 23 (4), 1468-1479 (2011).
  21. Kirchhoff, H., Tremmel, I., Haase, W., Kubitscheck, U. Supramolecular photosystem II organization in grana thylakoid membranes: evidence for a structured arrangement. Biochemistry. 43 (28), 9204-9213 (2004).
  22. Belgio, E., Ungerer, P., Ruban, A. V Light-harvesting superstructures of green plant chloroplasts lacking photosystems. Plant Cell Environ. , (2015).
  23. Goral, T. K., et al. Light-harvesting antenna composition controls the macrostructure and dynamics of thylakoid membranes in Arabidopsis. Plant J. 69 (2), 289-301 (2012).
  24. Charuvi, D., et al. Photoprotection Conferred by Changes in Photosynthetic Protein Levels and Organization during Dehydration of a Homoiochlorophyllous Resurrection Plant. Plant Physiol. 167 (4), 1554-1565 (2015).
  25. Farrant, J. M., Brandt, W., Lindsey, G. G. An Overview of Mechanisms of Desiccation Tolerance in Selected Angiosperm Resurrection Plants. Plant Stress. 1 (1), 72-84 (2007).
  26. Walther, P., Schatten, H., Pawley, J. B. High-resolution cryoscanning electron microscopy of biological samples. Biological Low-Voltage Scanning Electron Microscopy. , 245-261 (2008).
  27. Walther, P., Müller, M. Double-layer coating for field-emission cryo-scanning electron microscopy–present state and applications. Scanning. 19 (5), 343-348 (1997).
  28. Walther, P., Wehrli, E., Hermann, R., Müller, M. Double-layer coating for high-resolution low-temperature scanning electron microscopy. J. Microsc. 179, 229-237 (1995).
  29. Hess, M. W. Cryopreparation methodology for plant cell biology. Cell. Electron Microsc. 79, 57-100 (2007).
  30. Schertel, A., et al. Cryo FIB-SEM: Volume imaging of cellular ultrastructure in native frozen specimens. J. Struct. Biol. 184 (2), 355-360 (2013).
  31. Schindelin, J., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat. Methods. 9 (7), 676-682 (2012).
  32. Walther, P. Recent progress in freeze-fracturing of high-pressure frozen samples. J. Microsc. 212 (1), 34-43 (2003).
  33. Nevo, R., et al. Architecture of Thylakoid Membrane Networks. Lipids Photosynth. 30, 295-328 (2009).
Studying the Supramolecular Organization of Photosynthetic Membranes within Freeze-fractured Leaf Tissues by Cryo-scanning Electron Microscopy

Play Video

Cite This Article
Charuvi, D., Nevo, R., Kaplan-Ashiri, I., Shimoni, E., Reich, Z. Studying the Supramolecular Organization of Photosynthetic Membranes within Freeze-fractured Leaf Tissues by Cryo-scanning Electron Microscopy. J. Vis. Exp. (112), e54066, doi:10.3791/54066 (2016).

View Video