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方法文章

Bacillus cereus 中脂肪酸的鉴定

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DOI:

10.3791/54960

2016年12月5日

本文内容

摘要

我们提出一种无需纯化即可鉴定脂肪酸的方案。该方法结合了三类脂肪酸衍生物的保留时间信息及其质谱数据,这三类衍生物分别为:脂肪酸甲酯(FAMEs)、4,4-二甲基噁唑啉衍生物(DMOX)和3-吡啶基甲醇酯(picolinyl)。

摘要

Bacillus 属细菌含有支链和不饱和脂肪酸(FAs),其甲基支链(异构或前异构)及双键位置具有多样性。脂肪酸组成的变化在细菌适应环境过程中起着关键作用。这些修饰涉及异构与前异构支链脂肪酸比例的改变,以及不饱和脂肪酸相对于饱和脂肪酸比例的变化,且双键在特定位置形成。精确鉴定脂肪酸谱对于理解 Bacillus 属物种的适应机制至关重要。

许多来自芽孢杆菌属(Bacillus)的脂肪酸(FAs)尚未商业化供应。本文提出的方法通过结合保留时间信息(通过计算等效碳链长度(ECL))与三类脂肪酸衍生物的质谱数据,实现对脂肪酸的鉴定:脂肪酸甲酯(FAMEs)、4,4-二甲基恶唑啉衍生物(DMOX)以及3-吡啶基甲醇酯(picolinyl)。该方法无需对未知脂肪酸进行纯化即可完成鉴定。

将枯草芽孢杆菌(Bacillus cereus)制备的脂肪酸甲酯(FAME)色谱图谱与商业标准品混合物进行比较,可实现对直链饱和脂肪酸的鉴定、等效碳数(ECL)的计算,并对其他脂肪酸的种类作出推断。支链饱和脂肪酸(如异构或反异构型)的FAME相较于具有相同碳原子数的直链饱和脂肪酸,在ECL上表现出恒定的负向偏移。不饱和脂肪酸的FAME可通过其分子离子质量进行检测,其ECL相对于对应的饱和脂肪酸则呈现正向偏移。

通过分别分析吡啶基和DMOX衍生物的电子轰击电离质谱图,可以确定脂肪酸的支链位置以及不饱和脂肪酸双键的位置。该方法可鉴定出B. cereus提取物中所有未知的饱和支链脂肪酸、不饱和直链脂肪酸和不饱和支链脂肪酸。

引言

脂肪酸甲酯(FAME)气相色谱法(GC)是脂质表征的关键方法。在经过短暂提取步骤后,该方法可快速分离并定量样品中的各种脂肪酸(FA)。甲酯衍生物具有高挥发性、稳定性,并且对色谱柱呈惰性,从而避免了拖尾峰的出现。当样品由已知脂肪酸组成时,其鉴定过程较为直接,因为色谱图谱已有发表或可与标准品进行比对。此外,由于各类脂肪酸对火焰离子化检测器(FID)的响应几乎恒定,因此无需重复进样校准标准品即可实现定量1

除了火焰离子化检测(FID)外,质谱(MS)检测可提供一组互补信息以确认脂肪酸甲酯(FAMEs)。然而,当采用电子轰击电离(EI)对FAMEs进行电离时,所得质谱图并不总能用于鉴定脂肪酸的精细结构。例如,支链位置(即, 支链甲基难以预测,因为诊断离子难以检测1 且目标离子丰度的特征变化依赖于仪器,导致无法使用质谱库2另一个挑战在于确定双键的位置,因为电子轰击电离(EI)会导致双键迁移。因此,双键位置不同的脂肪酸异构体无法通过其质谱图加以区分。幸运的是,目前已开发出其他用于脂肪酸鉴定的工具。例如,可通过计算等效碳链长度(ECL)来推断脂肪酸中支链或双键的存在及其位置。3.

其他衍生化方法会产生不同的质谱图,具体取决于双键或支链甲基的位置。4,4-二甲基噁唑啉衍生物(DMOX)4 可用于简便地确定单不....

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方案

1. 细菌培养

  1. 通过将100 µl在LB(Luria-Bertani培养基)中于30 °C培养过夜的细菌(Bacillus cereus菌株ATCC 14579)培养物均匀涂布于LB琼脂平板表面,制备细菌菌苔。将平板在30 °C下过夜培养。

2. ECL:等效碳链长度

  1. 按如下公式计算 ECL:精确质量计算公式,ECLi=n+(Rt-Rtn)/(Rt(n+1)-Rtn),化学方程式。,其中:
    i,为目标溶质;
    n,为在目标溶质 i 之前洗脱的直链饱和脂肪酸甲酯的碳原子数;
    n+1,为在目标溶质 i 之后洗脱的直链饱和脂肪酸甲酯的碳原子数;
    Rti、Rtn、Rt(n+1),分别为上述脂肪酸甲酯(FAME)峰的保留时间。
    ​注意:通过进样直链饱和脂肪酸甲酯标准品混合物(BAME)获得其保留时间。

3. 脂肪酸甲酯的制备与分析

  1. 为获取脂质脂肪酸,用刮刀从琼脂平板上刮取菌落,收集40 mg(鲜重,相当于10

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结果

细菌细胞中脂肪酸鉴定的策略如图1所示。每个步骤提供互补的光谱信息或色谱保留信息。步骤1使用标准溶液进行脂肪酸的初步鉴定。步骤2通过解析脂肪酸甲酯(FAME)的电子轰击电离(EI)质谱及其等效链长(ECL),对产物进行初步鉴定。步骤3确定支链脂肪酸中支链的确切位置。最后,步骤4确定不饱和脂肪酸中双键的精确位置。

脂肪酸甲酯和电子碰撞电离

BAME混合物使我们能够鉴定出一系列直链饱和脂肪酸(n12至n17)以及一些甲基支链脂肪酸(i15、a15、i16、i17)。然而,在我们的样品中仅检测到极少数B. cereus特异性的脂肪酸,这说明了开发下述鉴定方法的必要性。

无论碳.......

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讨论

表1中所示的脂肪酸(FAs)色谱图谱对应于在琼脂平板表面培养的B. cereus ATCC 14579。当该细菌在相同温度下于通气的液体培养基中培养时,也获得了相似的图谱8。对于在液体培养基中培养的细菌,可通过离心收集菌体生物量,并可根据既定的实验方案,依据不同的培养条件进行洗涤8,19。对B. cereus产生的各类脂肪酸进行鉴定,使得在某些对低温生长至关重要的基因发生突变的菌株中,脂肪酸比例的细微变化得以被检测到7,9

通常,ECL 是根据在固定温度下(使用恒温控制的色谱柱 oven)测得的校正保留时间的对数值来计算的20。此处由于采用了非恒温 oven 以实现目标脂肪酸甲酯(FAME)的优化分离,所采用的计算方法为先前报道的线性保留指数计算方法3,21

本研究的目的并非将计算得到的ECL值与文献中描述的数值进行比较,而是基于这些保留数据和光.......

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披露

作者声明不存在任何竞争性经济利益。

致谢

作者感谢 Thomas Mison 提供的技术支持,以及 Rachel Kopec 对稿件的修改。

....

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
气相色谱-质谱联用仪(GC/MS)ShimadzuQP2010
毛细管色谱柱 ZB WAXPhenomenex7HG-G007-1130 m x 0.25 mm x 0.25 µm
色谱纯甲醇(Methanol Lichrosolv)VWR1.06018.2500
氢氧化钾AldrichP1767
四氢呋喃(THF)Hipersolv Chromanorm28559.320
二氯甲烷Hipersolv Chromanorm23373.320
正己烷Hipersolv Chromanorm24575.320
3-吡啶甲醇(3-pyridinemethanol)AldrichP6-680-7
叔丁醇钾Aldrich156671
2-氨基-2-甲基-1-丙醇A-9879
MilliQ Academic 超纯水系统MilliporeZMQS50001
细菌脂肪酸甲酯(BAME)混合标准品Sigma-Aldrich47080-U Supelco

参考文献

  1. Christie, W. W., Han, X. Lipid Analysis 4th Edition. , Oily press. (2010).
  2. HÜbschmann, H. -J. Handbook of GC-MS: fundamental and application. Third edition. , Wiley-vch. (2015).
  3. Sasser, M.

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脂肪酸鉴定气相色谱-质谱联用脂肪酸甲酯等效碳链长度44-二甲基噁唑啉衍生物3-吡啶基甲醇酯支链脂肪酸不饱和脂肪酸甲基支链位置双键位置