基于基质辅助激光解吸/电离成像质谱技术(MALDI-IMS)的分子成像可实现对生物样本中多种分析物的同步定位。本文介绍了一种利用MALDI-IMS检测和可视化阿尔茨海默病及脑淀粉样血管病样本脑组织中β淀粉样蛋白的实验方案。
方法文章
* These authors contributed equally
基于基质辅助激光解吸/电离成像质谱技术(MALDI-IMS)的分子成像可实现对生物样本中多种分析物的同步定位。本文介绍了一种利用MALDI-IMS检测和可视化阿尔茨海默病及脑淀粉样血管病样本脑组织中β淀粉样蛋白的实验方案。
阿尔茨海默病(AD)的神经病理学特征是淀粉样β(Aβ)肽在脑组织中积聚并聚集形成细胞外斑块。这些由40个氨基酸组成的Aβ肽是由淀粉样前体蛋白(APP)经β-和γ-分泌酶切割产生。Aβ不仅沉积于脑实质中,还沉积于软脑膜和脑血管壁,后者被称为脑淀粉样血管病(CAA)。尽管已鉴定出多种Aβ肽,但在AD和CAA病理组织中各种Aβ肽的生成机制及其分布模式尚未完全阐明。本文建立了一种基于基质辅助激光解吸/电离成像质谱技术(MALDI-IMS)的人类尸检脑组织蛋白图谱分析方案。为此,人脑皮层样本取自东京都老年医学研究所脑库。将冷冻切片切割后转移至氧化铟锡(ITO)涂层玻璃载片上。使用MALDI系统采集质谱数据,空间分辨率可达20 µm。通过自动或手动喷雾装置将芥子酸(SA)均匀喷涂于载片表面。得益于当前MALDI-IMS技术的优势,可在无需特异性探针的情况下,获得同一人脑尸检切片中多种Aβ肽的完整数据集。此外,对AD脑组织及重度CAA样本进行高分辨率(20 µm)成像的结果清晰显示,Aβ1-36至Aβ1-41主要沉积于软脑膜血管,而Aβ1-42和Aβ1-43则主要沉积于脑实质中形成老年斑(SP)。结合临床、遗传学和病理学观察,采用MALDI-IMS作为标准方法,有助于深入理解AD、CAA及其他神经系统疾病的病理机制。
为了明确诊断并理解神经退行性疾病的发病机制,对病理沉积物进行精确的分子鉴定至关重要1。在阿尔茨海默病(AD)发展过程中,Aβ在疾病发病前很久即已产生,并在脑实质中形成老年斑(SPs),同时在血管中沉积2,3,4,5,6。尽管Aβ1-42是AD脑组织中老年斑的主要肽段,但在受累的AD脑组织中也已鉴定出其他Aβ变体,例如N端或C端截短或修饰的Aβ肽段7,8,9,10。全面了解人脑中各种Aβ物种的分布情况,尤其是阿尔茨海默病和脑淀粉样血管病(CAA)患者脑中的Aβ谱系11,将有助于科研人员深入理解Aβ的生成、代谢及沉积过程。
作为神经病理学的经典方法,免疫组织化学(IHC)一直是确定Aβ在脑组织中定位的最确凿方法12,13,14,15。通常情况下,当多个表位同时共存时,IHC无法区分不同的分子。相比之下,新兴的基于质谱的蛋白质组学分析是一种极具价值的方法,尤其适用于分析脑组织中那些无法通过抗体区分的多种Aβ亚型16,17。传统的基于质谱的脑组织裂解液和免疫沉淀样品分析难以检测到微量的Aβ肽段,并且会丢失Aβ在脑组织中的分布信息。
在早期研究中,使用阿尔茨海默病的转基因动物模型(如 APP23)已成功实现小鼠脑内 Aβ 沉积的可视化。然而,该过程仍需技术上的改进,以在分辨率和灵敏度方面对成像质谱(IMS)与免疫组织化学(IHC)进行比较18,19,20。阿尔茨海默病的神经病理学研究应在人脑组织上开展,因此我们应用基质辅助激光解吸电离成像质谱(MALDI-IMS)技术对人类尸检脑组织进行分析,以获得全面的蛋白质分布图谱21。为此,我们建立了一种先进质谱技术的实验方案,该方法在快速性、灵敏度和可重复性方面具有优势。
本研究中的组织样本采集自东京都老年医院,该医院为日本老年人群提供基于社区的医疗服务。研究中使用的脑尸检样本已根据死者亲属的知情同意,登记至老龄化研究脑库(BBAR)。脑库的建立已获得东京都老年医院及老年学研究所伦理委员会的批准。对于所有登记在脑库中的脑组织样本,我们均获得了患者本人或其家属签署的书面知情同意书,同意将其用于医学研究。患者在死亡后2小时内即被转移至低温(4 °C)环境中,以减少脑组织的死后变化。本文所描述的所有方法均经同志社大学以及东京都老年医院和老年学研究所老龄化研究脑库的批准。
1. 质谱成像组织切片的制备
2. 基质辅助激光解吸电离成像质谱(MALDI-IMS)
3. 数据处理
分析了伴有脑淀粉样血管病(CAA)的散发性阿尔茨海默病患者(n = 5;平均年龄 = 83.2 岁)以及老年无老年斑(SP O)但伴有 CAA 的受试者(n = 5;平均年龄 = 77.2 岁)(表 1)。在本研究中,患者 #3 的 CAA 表型最为显著。通过基质辅助激光解吸电离成像质谱(MALDI-IMS)对患者 #3 脑组织中 Aβ1-40 和 Aβ1-42 沉积物的分布进行了可视化(图 1)。如 图 1 所示,在非病理对照脑组织(患者 #9 和 #10)中未检测到显著信号。此处 MALDI-IMS 清晰显示,Aβ1-42 优先沉积于脑实质中形成老年斑(SPs)。相比之下,较短的 Aβ 片段(如 Aβ1-36 至 Aβ1-41)则优先沉积于软脑膜血管区域(图 1)。
使用组织的相邻冷冻切片,通过免疫组化(IHC)进一步验证了Aβ40和Aβ42的分布。抗Aβ40抗体标记了脑血管淀粉样变(CAA)(图2B中的箭头),这与Aβ42在脑实质中以斑块(SPs)形式分布的情况形成明显对比。对于Aβ1-41,我们是首次在人类脑组织中检测到该片段的研究者,并已开发出特异性抗体,能够将Aβ41与Aβ40和Aβ42区分开来21。
MALDI-IMS 的空间分辨率通常是需要改进的最重要因素。图1 和 图2 展示了分辨率为 100 µm 间距的 MALDI-IMS 结果,获得了相对较大区域的整体分布轮廓21。然而,要精确定义蛛网膜下腔(包括血管结构)中的淀粉样蛋白沉积仍存在困难。为了清晰描绘蛛网膜下腔血管的精细组织结构以及皮层表面的特征,进行了高分辨率 MALDI 成像(40 µm:图3;20 µm:图4 和 图5)。结果表明,MALDI-IMS 清晰地显示了较短的 Aβ 片段(如 Aβ1-36 至 1-41)分布在动脉壁中,这与免疫组化(IHC)结果相一致。
基质辅助激光解吸电离成像质谱技术(MALDI-IMS)揭示了伴中度脑淀粉样血管病(CAA)的阿尔茨海默病(AD)脑组织中 Aβx-40 和 Aβx-42(x = 2, 4, 5, 6, 7, 8, 9 和 11pE)的详细分布情况。例如,Aβx-40 亚型的分布模式与 Aβ1-40 相似,而 Aβx-42 亚型的分布模式则与 Aβ1-42 不同。21根据当前方案,通过MALDI-IMS观察到的单个Aβ肽的离子图像被指认为特定的Aβ亚型。相比之下,所获得的图像数据可利用无监督的多变量统计方法进行分析,以实现对解剖学感兴趣区域的图像分割,进而对未定义的蛋白质进行进一步分析。 图5 显示了对3号患者同一组织切片应用二分k均值分析获得的分割图21。该聚类方法成功识别出实质中的斑块样结构(蓝色) 图5C) 以及蛛网膜下腔中的血管结构(绿色) 图5C)。有趣的是,在实质中发现一个小的圆形区域,该区域位于实质内一条小动脉周围,同时也位于蛛网膜下腔(紫色) 图5C)。这通过这些单个Aβ肽的单离子成像得到验证 图 5D-5F.

图 1:阿尔茨海默病/CAA 患者冰冻脑组织切片的 MALDI-IMS 分析。 左侧图显示伴有严重脑淀粉样血管病(CAA)的阿尔茨海默病患者(病例 #3)中多种C端截短的Aβ肽的分布,右侧图显示对照病例(所有图像中右侧为病例 #9,左侧为病例 #10)。Aβ1-36 至 Aβ1-41 主要沉积于软脑膜血管中,而 Aβ1-42 和 Aβ1-43 则在病例 #3 中主要沉积于脑实质内形成老年斑;在对照病例(病例 #9 和 #10)脑组织中未检测到信号。分辨率 = 100 μm。比例尺 = 5 mm。本图经 Kakuda 等人21 许可修改。 请点击此处查看该图的放大版本。

图 2:阿尔茨海默病(AD)/脑淀粉样血管病(CAA)冰冻脑组织切片及来自AD脑组织枕叶皮层相邻切片的基质辅助激光解吸电离成像质谱(MALDI-IMS)分析。 (A - C)AD/CAA冰冻脑组织切片以及(D 和 E)来自AD脑组织的枕叶皮层相邻切片经免疫染色处理,并聚焦于小动脉和脑实质,使用针对Aβ40(D:BA27)或Aβ42(E:抗Aβ42多克隆抗体)的抗体。两项分析均表明,Aβ40优先沉积于软脑膜血管(图 D 中箭头所示)以及蛛网膜下腔和脑实质中的小动脉,形成CAA。相比之下,Aβ42主要沉积于老年斑(SPs)。IMS分析中,分辨率为100 μm。比例尺 = 5 mm(A、B 和 C)= 5 mm,500(D 和 E)。本图经Kakuda等21许可修改。 请点击此处查看本图的放大版本。

图 3:阿尔茨海默病/CAA 患者冰冻脑组织切片(患者 #3)的 MALDI-IMS 分析,分辨率为 40 µm。 伴有严重脑淀粉样血管病(CAA)的阿尔茨海默病(AD)患者(患者 #3)中存在多种C端和N端截短及修饰的 Aβ 肽段。Aβ1-36 至 Aβ1-41 主要沉积于软脑膜血管中,而 Aβ1-42 和 Aβ1-43 则作为老年斑沉积于脑实质中。比例尺 = 1 mm(A-B),2 mm(左上角)。分辨率 = 40 μm。 请点击此处查看该图的高清版本。

图 4:阿尔茨海默病/脑淀粉样血管病(AD/CAA)患者冰冻脑组织切片(患者 #3)的基质辅助激光解吸电离成像质谱(MALDI-IMS),分辨率为 20 µm。 本图展示了伴有严重脑淀粉样血管病(CAA)的阿尔茨海默病(AD)患者(患者 #3)脑组织中多种C端和N端截短及修饰形式的Aβ肽。Aβ1-36 至 Aβ1-41 主要沉积于软脑膜血管中,而 Aβ1-42 和 Aβ1-43 则作为老年斑沉积于脑实质中。比例尺 = 200 μm(a, b, c),1 mm(左上角)。分辨率 = 20 μm。请点击此处查看该图的高清版本。

图 5:通过 MALDI-IMS 对冰冻阿尔茨海默病(AD)脑切片进行分析获得的分割图,揭示了假定的老年斑、大的蛛网膜下腔血管结构以及小的实质小动脉。(A)从 MALDI-IMS 数据的多变量图像分析中获得的分割图。(B)基于二分 k-均值聚类分析在枕叶皮层中识别出类似斑块和类似血管的结构。聚类及其子结构和它们之间的关系以节点形式显示(例如,1-0-0)。(C)不同的 Aβ 肽定位模式,分别类似于斑块(蓝色)、蛛网膜下腔血管(绿色)和小动脉(红色)结构。注意,一些红色聚类也分布在蛛网膜下腔中。这通过这些单个 Aβ 肽在 20 µm 分辨率下的单离子图像得到验证:(D)Aβ 1-40,(E)Aβ 1-41,和(F)Aβ 1-42。请点击此处查看该图的放大版本。
| 病例 | 性别 | 死亡年龄 | Braak SP | CAA |
| 1 | M | 83 | C | 0.5 |
| 2 | M | 88 | C | 1 |
| 3 | M | 84 | C | 2 |
| 4 | M | 78 | C | 1 |
| 5 | M | 83 | C | 1 |
| 6 | M | 84 | O | 0 |
| 7 | M | 78 | O | 0 |
| 8 | M | 70 | O | 0 |
| 9 | M | 73 | O | 0 |
| 10 | M | 81 | O | 0 |
表1:伴有CAA的AD病例与老年SP O期受试者的临床及病理数据。 用于成像质谱(IMS)和免疫组化(IHC)的人类皮质标本取自东京都老年学研究所脑库。每例脑标本均来自5名阿尔茨海默病(AD)患者和5名年龄匹配的对照个体的枕叶皮质。Aβ单克隆抗体显示的淀粉样蛋白沉积程度根据Braak SP(淀粉样蛋白)分期进行定义。O期时,整个异型皮质几乎无老年斑;C期时,几乎所有异型皮质区域均受累。AD患者脑组织均处于C期。本表格经Kakuda等21许可修改。
本文展示了利用基质辅助激光解吸电离成像质谱技术(MALDI-IMS)对阿尔茨海默病(AD)和脑淀粉样血管病(CAA)患者尸检脑组织中Aβ及其亚型进行可视化分析的详细实验方案与结果。Aβ沉积物的分布特征从Aβ1-42显著转变为具有不同N端和C端变异的形式。Aβ1-41首次通过本实验方案在人脑组织中被鉴定并实现可视化,并进一步通过免疫组化(IHC)得到验证21。考虑到高分辨率(20 μm)成像质谱(IMS)所呈现的Aβ沉积形态必须与免疫组化结果高度一致,因此IMS与IHC在基于沉积物位置、蛋白质组成以及形态学特征来区分Aβ沉积方面具有同等重要的作用。由于本研究中所有实验均在枕叶皮层进行,未来若应用本实验方案对全脑不同区域中各类β-淀粉样蛋白的定位进行研究,将有助于获得更具普适性的结论。
实验方案中的关键步骤是组织制备步骤,以实现对人脑组织中聚集蛋白的有效离子化。需要使用基质层来吸收激光能量,并诱导分析物的脱附和离子化。在此过程中,整个组织切片将被均匀地涂覆上微小晶体。分析物与基质的均匀共结晶对于实现高灵敏度且无伪影的成像至关重要。三种喷涂方法各有优势。手动喷涂是最常用的方法之一。气动喷雾法操作便捷,但需要熟练的操作技巧。由于实验技术的精确性和可重复性至关重要,建议采用本方案中所述的超声喷涂仪和/或自动喷涂仪。使用超声喷涂仪时,因其在封闭腔室内进行喷涂,不受环境湿度和温度的影响。而使用自动喷涂仪则可以获得相对较高的空间分辨率以及良好的可重复性。总体而言,这三种方法所获得的空间分辨率按以下顺序依次提高:1)气动喷涂,2)自动喷涂装置,3)超声喷涂仪。
最重要的是,本方案最初是为了检测和可视化人脑尸检样本中的 Aβ 而设计的。此前已有其他研究者利用现有方法,对基于人源 APP 瑞典型突变构建的 AD 动物模型 APP23 小鼠脑组织中的 Aβ 进行了 MALDI-IMS 可视化分析18,19。然而,先前用于 APP23 小鼠的方案在侧向分辨率和灵敏度方面尚不足以有效可视化 Aβ。早期研究指出,在使用其方案对 APP23 小鼠成像时,组织边界外出现的高 Aβ 信号明显属于伪影18,19。这意味着由于基质萃取步骤的存在,真实老年斑(SPs)与成像结果之间出现所谓的“模糊”现象在 MALDI 成像中难以避免。但在本方案中,这种模糊现象已消失,每个质谱信号均能准确对应脑实质中的单个老年斑。
如图所示,我们首次利用基质辅助激光解吸电离成像质谱(MALDI-IMS)以及自行制备的特异性抗体通过免疫组化(IHC)方法,在阿尔茨海默病(AD)和脑淀粉样血管病(CAA)脑组织中对Aβ1-41进行了示踪21根据Aβ加工模型,Aβ1-38来源于Aβ1-45 通过 Aβ1-42,而Aβ1-41由Aβ1-45经γ-分泌酶逐步切割产生27,28,29,30,31这意味着当前方案支持该模型。至于该技术的局限性,我们必须考虑来自人类尸检脑组织样本的异质性问题。从某种意义上说,最关键的步骤是对具备伦理合规证明的合格尸检脑组织进行评估。针对这些合格的尸检脑组织,采用当前方案结合基质辅助激光解吸电离成像质谱技术(MALDI-IMS),可分别追踪具有多种修饰的复杂分子的全脑分布,以及尚待明确的调控阿尔茨海默病(AD)发病机制的未知因子。此外,在理解老年人脑中多种神经病理改变的整体发病机制时,将MALDI-IMS与神经系统疾病的临床、遗传和病理学观察相结合,有望成为一种标准化的研究方法。
MALDI-IMS 的另一个关键步骤是对获得的数据集进行数据挖掘,这一过程通常十分耗时。手动对每个峰的分布进行数据挖掘时,用户需要逐一浏览每幅图像,寻找可能与分析样本形态相关的分布特征。自动空间分割可作为数据挖掘的第一步,提供数据集的整体概览,并实现显著特征的快速识别。在此方法中,通过统计学方法确定特定区域内光谱之间的相似性,并将相似的光谱归为同一簇。所有像素根据其所属的簇进行颜色编码(图5)。在当前针对阿尔茨海默病(AD)和脑淀粉样血管病(CAA)的研究中,感兴趣区域为实质斑块中 Aβ 沉积的空间分布,以及软脑膜和实质内的血管结构。通过免疫组化(IHC)进一步验证的两个显著峰分别为 Aβ1-40 和 Aβ1-42 的质荷比(m/z)值21。因此,可方便地找出与 Aβ1-40 和 Aβ1-42 共定位的 m/z 值,这些峰已被注释为 N 端和 C 端截短的 Aβ 肽段,以及尚未鉴定的肽段,供后续深入分析。
Weller 及其同事报道,Aβ 在血管壁中积聚,且在动脉周围的沉积多于静脉周围21此外,有研究提出,脑实质排出的Aβ会进入淋巴结,并存在于组织间液(ISF)中。 通过 一种血管周围引流通路22,23,24,25,26当前基于分辨率为20 µm的MALDI-IMS数据集生成分割图的实验方案支持脑内存在血管周围引流通路的可能性图5),这些成分在阿尔茨海默病(AD)的脑淀粉样血管病(CAA)中具有重要贡献21,32此外,我们可以通过计算每个m/z值的相关性,发现与斑块和软脑膜下血管共定位的标志蛋白。在理解老年人脑中多种神经病理整体发病机制的过程中,将基质辅助激光解吸电离成像质谱技术(MALDI-IMS)与神经系统疾病中已建立的临床、遗传和病理观察的免疫组织化学(IHC)数据相结合,作为一种强有力的分析方法,具有重要的应用前景。
作者无任何利益冲突需要披露。
本工作部分由创新领域科学研究费补助金(脑蛋白老化与痴呆症控制 26117004;授予 M.I. 和 T.M.)资助。本研究还部分得到了日本医疗研究开发机构(AMED)脑科学战略性研究项目的支持。所有实验均按照 ARRIVE 指南的要求进行。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 冷冻切片机 | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | CM1950 | |
| 氧化铟锡(ITO)涂层显微镜玻片 | Bruker Daltonics | #237001 | |
| 刀片(一次性) | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | #117394 | |
| O.C.T. 包埋剂 | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | FSC 22 Blue | |
| 扫描仪 | EPSON | GT-980 | |
| 喷笔 | GSI Creos | PS274 | |
| 空气压缩机 | MRHOBBY | Mr.Linear compressor L5 | |
| 超声波喷涂仪 | Bruker Daltonics | ImagePrep | |
| 自动喷涂仪 | HTX Technologies | TM Sprayer | |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Carl Zeiss Inc. | LSM 700 | |
| 超高速MALDI质谱仪 | Bruker Daltonics | rapifleX MALDI Tissuetyper | |
| MALDI控制软件 | Bruker Daltonics | FlexControl 3.8 | |
| 数据分析软件 | Bruker Daltonics | FlexImaging 5.0 | |
| 分子组织学软件 | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
| 统计分析软件 | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
| 芥子酸(Sinapinic acid, SA) | Nacalai tesque | 30494-91 | |
| α-氰基-4-羟基肉桂酸(Alpha-Cyano-4-hydroxyl-cinnamic acid, CHCA) | Wako | 037-19261 | |
| 校准标准品 | Bruker Daltonics | ||
| 生物素标记的抗小鼠IgG抗体 | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
| 生物素标记的抗兔IgG抗体 | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
| 亲和素与生物素化辣根过氧化物酶复合物 | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit | |
| 3,3-二氨基联苯胺(3,3-diaminobenzidine, DAB) | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit |
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