CRISPR/Cas9 越来越多地被用于在非模式生物中鉴定基因功能。本实验方案描述了如何从制备显微注射混合物、获取并注射蚊子胚胎,到饲养、杂交和筛选注射后的蚊子及其后代以获得目标突变,从而建立致倦库蚊(Culex pipiens)的基因敲除品系。
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CRISPR/Cas9 越来越多地被用于在非模式生物中鉴定基因功能。本实验方案描述了如何从制备显微注射混合物、获取并注射蚊子胚胎,到饲养、杂交和筛选注射后的蚊子及其后代以获得目标突变,从而建立致倦库蚊(Culex pipiens)的基因敲除品系。
Culex蚊子是多种对人类和动物健康产生负面影响疾病的首要传播媒介,包括西尼罗病毒以及由丝状线虫引起的疾病,例如犬心丝虫病和象皮病。近年来,CRISPR/Cas9基因组编辑技术已被用于诱导定点突变,方法是将与向导RNA(gRNA)结合的Cas9蛋白注射到多种昆虫物种新产下的胚胎中,其中包括属于Anopheles和Aedes属的蚊子。对Culex蚊子的操作和注射略为困难,因为这类蚊子以直立方式将卵产在浮筏结构上,而非像其他蚊种那样单独产卵。本文介绍如何设计gRNA,将其与Cas9蛋白形成复合物,诱导尖音库蚊(Culex pipiens)雌蚊产卵,以及如何准备并注射新产下的胚胎,以进行Cas9/gRNA的显微注射。我们还描述了如何饲养注射后的蚊子并筛选获得目标突变个体。代表性结果表明,该技术可用于在Culex蚊子基因组中诱导定点突变,并且经过轻微修改后,也可用于在其他蚊种中产生无效突变体。
Culex 蚊广泛分布于全球温带和热带地区,可传播多种致命病毒,包括西尼罗病毒1、圣路易斯脑炎病毒2,以及引起犬心丝虫病3和象皮病4的丝虫类线虫。Culex pipiens 复合体成员包括 Cx. quinquefasciatus、Cx. pipiens pipiens 和 Cx. pipiens molestus,它们在生物学多个方面表现出显著差异。例如,Cx. quinquefasciatus 和 Cx. pipiens molestus 无法进入越冬休眠状态5,6,而 Cx. pipiens pipiens 则表现出强烈的季节性反应,并在短日照条件下进入滞育状态7,8。此外,Cx. pipiens molestus 倾向于嗜人血,而 Cx. pipiens 和 Cx. quinquefasciatus 更倾向于嗜动物血6。然而,在美国及世界许多其他地区,这些物种之间会发生杂交,这对疾病传播具有重要影响,因为 Cx. pipiens pipiens 与 Cx. pipiens molestus 的杂交后代具有机会性吸血行为,既叮咬鸟类也叮咬人类9,从而成为西尼罗病毒的桥梁传播媒介。对 Culex 蚊生物学中这些及其他有趣现象的研究在一定程度上受到限制,部分原因是 Culex 蚊在实验室饲养难度略高于 Aedes 蚊,后者可产下处于静息状态且耐干燥的卵10;此外,针对 Culex 蚊物种的功能性分子工具也尚未充分发展。
CRISPR/Cas9 基因组编辑是一种强大的技术,已被用于研究多种重要蚊类物种的生物学特性11,12,13,其中包括南方库蚊(Culex quinquefasciatus)14,15,16。该技术由 Jennifer Doudna 和 Emmanuelle Charpentier 开发,利用细菌来源的 CRISPR 相关核酸酶(Cas 蛋白;参见 Van der Oost 等人的综述17)来模拟细菌抵御病毒的天然防御机制。当将 Cas9 蛋白与适当的引导 RNA 共同注射到动物胚胎中时,可在基因组内产生双链断裂。这一过程通常通过使用与引导 RNA 形成复合物的 Cas9 蛋白实现,该复合物可将核酸酶活性靶向基因组中的特定区域。在 Cas9 蛋白造成位点特异性的双链断裂后,细胞机制会尝试通过两种机制之一来修复断裂。第一种机制是通过非同源末端连接(NHEJ)将两个末端连接在一起,该过程易出错,常在基因组中产生移码插入或缺失,导致蛋白质功能丧失,从而形成基因敲除突变。另一种机制是细胞利用同源定向修复(HDR),通过寻找相似序列来准确修复断裂。这种相似序列可能来自生物体内的另一条染色体(参见综述18)。然而,如果修复后的序列与原始序列完全一致,Cas9 蛋白将能够再次切割该 DNA。此外,研究人员还可以提供一个供体质粒,其在靶序列切割位点两侧含有同源序列,并携带替代性修复序列——通常是荧光标记蛋白、原始基因的修饰版本或其他修饰——该序列可被复制并插入基因组中,即实现“基因敲入”。
胚胎注射的时机至关重要,尤其是在利用CRISPR/Cas9基因编辑技术在昆虫中创制突变时。这是因为Cas9蛋白和gRNA只有在胚胎处于合胞体状态(即细胞膜尚未形成、多个细胞核共存于胚胎内)时,才具有最强的突变诱导能力。对于蚊子而言,细胞核迁移至胚胎外围大约发生在产卵后2-4小时,具体时间取决于温度19,因此显微注射必须在此时间之前完成。此外,Cas9蛋白能够切割其可接触的任何细胞核DNA,导致注射后发育而成的个体由嵌合的细胞组成,其中部分细胞携带目标突变,而另一些则没有。为了使这些突变得以成功遗传,Cas9蛋白必须切割存在于未来将发育为卵子和精子的生殖系中的DNA。为确保突变发生在生殖系中,最佳做法是将所有注射材料注入胚胎中极细胞附近的位置,因为极细胞是昆虫生殖系的前体细胞。Culex 胚胎的极细胞位于其后端附近20。除了胚胎注射外,还必须制定周密的后代杂交与筛选方案,以便检测目标突变。
本方案描述了如何生成gRNAs,并将其与Cas9蛋白复合以制备显微注射混合物,以及如何诱导雌性蚊子 Culex pipiens 产卵以及如何准备和注射这些卵以进行CRISPR/Cas9介导的基因组编辑。此外,我们还描述了如何培育、杂交并筛选注射后的胚胎及其后代,以确认已获得目标突变。利用本方案,我们针对一个目的基因成功产生了无效突变, 循环,于巴克眼品系中 Culex pipiens该品系于2013年最初由美国俄亥俄州哥伦布市采集的蚊虫建立,并由Meuti实验室保种。本方案可用于需要在蚊虫中进行CRISPR/Cas9基因组编辑的其他研究。 库蚊 蚊子以及其他蚊虫物种,更广泛地说,该方法适用于利用CRISPR/Cas9基因组编辑技术对任何昆虫物种进行操作。
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在大多数研究机构中,在产生或维持转基因昆虫之前,必须制定经批准的生物安全规程,以确保转基因生物不会逃逸或被带出实验室设施。此外,可能还适用其他政府法规。在启动此类项目之前,应查阅所有机构的政策和程序,以确定所需的文件和审批事项。
1. 设计gRNA并制备显微注射混合液
2. 拉制与斜面处理针头
注意:成功的注射以及胚胎的存活需要使用锋利的针头(图1)。
3. 对蚊子亲代进行血液饲喂
4. 诱导成年蚊虫产卵
5. 显微操作新产的 Culex 蚊卵
6. 显微注射 Culex 胚胎
7. 将显微注射后的胚胎(F0)培育至成体并建立杂交
8. 获取并饲养F1 代蚊子,并筛选其突变
9. 获取并饲养F2和F3代蚊子,并筛选突变体
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通过采用所述方案,我们成功地对尖音库蚊(Cx. pipiens)的胚胎进行了显微注射,并观察到注射后胚胎具有较高的存活率(约55%,图1)。早期实验的存活率较低,可能是因为卵泡前端附着在医用胶带条上,阻碍了蚊子幼虫从卵壳中脱出并顺利游入水中。确保卵的前端超出医用胶带条边缘,可显著提高幼虫存活率,并获得高质量的后代,这些后代能够正常发育至成虫阶段并具备繁殖能力(图2B)。
后续实验和筛选结果表明,生物钟基因cycle(cyc;KM355981)的无效突变已整合至显微注射胚胎的生殖系中(图3)。由于所设计的引物扩增的是靠近切割位点的cyc基因大片段,因此在杂合子F1代蚊子中难以观察到两条独立的条带。这说明在设计引物时,应选择能够扩增出约100–200 bp、围绕切割位点的片段,同时也强调了对所有疑似突变蚊子进行测序验...
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本方案介绍了将特定突变引入基因组的方法 库蚊属 蚊子,并且也可用于编辑其他蚊子的基因组。该方案的意义在于,不仅详细说明了如何准备注射材料,还提供了关于如何诱导蚊子产卵,以及如何准备和注射卵的详细视频概述。我们还总结了如何利用雌性蚊子的生物学特性 Cx. pipiens 将卵产在独立的卵筏中,从而对每只雌虫较少比例的后代进行目标突变筛选。本文所述方法已针对以下情况优化 Cx. pipiens 但通过微小调整,也可适用于编辑其他蚊虫或昆虫的基因组。此外,本文所述的显微操作与显微注射方案可用于向昆虫胚胎中注射多种不同物质,包括转座子、双链RNA(dsRNA)或其他核酸内切酶,如TALENs或锌指核酸酶(Zinc-Finger nucleases)。同时,斜面打磨方案可制备出针孔大小可变的显微注射针,从而获得适用于注射多种不同类型注射材料的针头。针孔大小可通过在针头打磨完成后逐步降低气压,并记录气泡停止从新开口针尖流出时的气压值来推断。产生气泡所需气压越低,表明针头开口越大;反之,所需气压越高,则表明针头开口越小。开口较大的针头更适合注射较大颗粒或黏稠度较高的物质,但可能对胚胎造成更大损伤,...
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RH 任职于昆虫转化设施中心,该中心提供昆虫遗传改造相关服务。
我们感谢 David O’Brochta 博士以及昆虫遗传技术协作研究网络的所有成员,为我们及其他研究人员在遗传技术应用方面提供的帮助与培训。我们特别感谢 Channa Aluvihare 优化了显微操作方案,使得能够对 Culex 胚胎进行显微注射并成功孵化。我们还感谢在 Meuti 实验室工作的本科学生 Devante Simmons 和 Joseph Urso 在转基因蚊虫的饲养与筛选工作中提供的协助,以及来自 ITF 的 Zora Elmkami 在蚊虫饲养和注射前准备方面的帮助。本研究得到了俄亥俄州立大学传染病研究所向 MEM 提供的跨学科种子基金资助。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 人工膜饲喂器 | Hemotek | SP5W1-3 | 公司所在地:英国布莱克本 |
| ATP | Invitrogen | 18330019 | 公司所在地:美国加利福尼亚州卡尔斯巴德 |
| 硼硅酸盐玻璃微毛细管,外径 1 mm | World Precision Instruments | 1B100-6 | 公司所在地:美国佛罗里达州萨拉索塔 |
| BV10 针头斜面打磨仪 | Sutter Instruments | BV-10-B | 公司所在地:美国加利福尼亚州诺瓦托 |
| Whatman 圆形滤纸(12.5 cm) | Sigma Aldrich | WHA1001125 | 公司所在地:美国密苏里州圣路易斯 |
| 锥形管(50 mL) | Thermo Fisher Scientific | 339652 | 公司所在地:美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 |
| Fisherbrand 快速流速粗孔滤纸 | Thermo Fisher Scientific | 09-800 | 公司所在地:美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 |
| 盖玻片(24 × 40 mm) | Thermo Fisher Scientific | 50-311-20 | 公司所在地:美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 |
| 牙科橡皮障 | Henry Schein Inc | 1010171 | 公司所在地:美国纽约州梅尔维尔 |
| Scotch 双面胶带 | Thermo Fisher Scientific | NC0879005 | 公司所在地:美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 |
| FemtoJet 4i 微注射仪 | Eppendorf | 5252000021 | 公司所在地:德国汉堡 |
| 玻璃小瓶(2 dram) | Thermo Fisher Scientific | 033401C | 公司所在地:美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 |
| 卤代烃油 | Sigma Aldrich | H8898-50ML | 公司所在地:美国密苏里州圣路易斯 |
| P-2000 激光拉针仪 | Sutter Instruments | P-2000/G | 公司所在地:美国加利福尼亚州诺瓦托 |
| Parafilm 封口膜 | Thermo Fisher Scientific | 50-998-944 | 公司所在地:美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 |
| PC-100 加重拉针仪 | Narishige | PC-100 | 该设备与已停产的早期 PC-10 型号兼容。公司所在地:美国纽约州阿米蒂维尔 |
| Phire 直接 PCR 试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | F140WH | 公司所在地:美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 |
| Kodak Photo-Flo(1%) | Thermo Fisher Scientific | 50-268-05 | 公司所在地:美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 |
| 石英玻璃微毛细管,外径 1 mm | Capillary Tube Supplies Limited | QGCT 1.0 | 公司所在地:英国康沃尔 |
| Guide-it™ sgRNA 筛选试剂盒 | Takara Bio USA | 632639 | 该试剂盒可用于体外检测 gRNA 是否切割 DNA 序列。公司所在地:美国加利福尼亚州山景城 |
| Sigmacote 疏水涂层剂 | Sigma Aldrich | SL2-100ML | 公司所在地:美国密苏里州圣路易斯 |
| 小型培养皿(35 × 10 mm) | Thermo Fisher Scientific | 50-190-0273 | 公司所在地:美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 |
| 柠檬酸钠抗凝鸡血 | Lampire Biologicals | 7201406 | 公司所在地:美国宾夕法尼亚州埃弗里特 |
| Fisherbrand 方形培养皿(10 cm × 10 cm) | Thermo Fisher Scientific | FB0875711A | 公司所在地:美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 |
| Tegaderm 透明敷料 | Henry Schein Inc. | 7771180 | 公司所在地:美国纽约州梅尔维尔 |
| 热带鱼饲料 | Tetramin | N/A | |
| Whatman 滤纸 | Thermo Fisher Scientific | 09-927-826 | 公司所在地:美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 |
| Whatman 滤纸,4.25 cm | Sigma Aldrich | 1001-042 | 公司所在地:美国密苏里州圣路易斯 |
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