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Research Article
Razan E. Ahmed*1, Nawin Chanthra*1, Tatsuya Anzai1,2, Keiichiro Koiwai3,4, Tomoki Murakami4, Hiroaki Suzuki4, Yutaka Hanazono1, Hideki Uosaki1
1Division of Regenerative Medicine, Center for Molecular Medicine,Jichi Medical University, 2Department of Pediatrics,Jichi Medical University, 3Institute of Global Innovation Research,Tokyo University of Agriculture and Technology, 4Department of Precision Mechanics, Faculty of Science and Engineering,Chuo University
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
该方法可用于使用多能干细胞衍生心肌细胞与荧光标记肉瘤蛋白来检查肉瘤缩短。
多能干细胞衍生心肌细胞(PSC-CMs)可以同时从胚胎干细胞和诱导多能干细胞(ES/iPS)细胞中产生。这些细胞为心脏病建模提供了有希望的来源。对于心肌病,肉瘤缩短是标准生理评估之一,用于成人心肌细胞检查其疾病表型。然而,现有的方法不适合评估PCS-CM的收缩性,因为这些细胞的肉瘤发育不全,在相对比显微镜下是看不见的。为了解决这个问题,并用PCC-CMs进行肉瘤缩短,使用了荧光标记的肉瘤蛋白和荧光活成像。细 Z 线和 M 线分别位于肉瘤的两端和中心。Z线蛋白 - α-Actinin (ACTN2)、电传素 (TCAP) 和与 ACTIN 相关的 LIM 蛋白 (PDLIM3) 和一种 M 线蛋白-肌素-2 (Myom2) 被标记为荧光蛋白。这些标记的蛋白质可以从内源性等位基因作为敲击或腺相关病毒 (AAV) 表达。在这里,我们介绍了将小鼠和人类多能干细胞分化到心肌细胞、产生 AAV 以及执行和分析活成像的方法。我们还描述了为 PSC-CM 的图案培养物生产聚二甲基硅氧烷 (PDMS) 邮票的方法,这有助于分析带有荧光标记的蛋白质的肉瘤缩短。为了评估肉瘤缩短,在电刺激(0.5-1 Hz)下,以高帧速率(每秒50-100帧)记录了跳动细胞的延时图像。为了分析细胞收缩过程中的肉瘤长度,录制的延时图像受制于 SarcOptiM,这是 ImageJ/Fiji 的插件。我们的战略为研究 PSC-CMs 中的心脏病表型提供了一个简单的平台。
心血管疾病是全世界1人死亡的主要原因,心肌病是心脏相关死亡的第三大原因。心肌病是影响心脏肌肉的一组疾病。诱导多能干细胞(iPS)细胞的最新发展以及iPS细胞对心肌细胞(PSC-CMs)的定向分化,为研究作为心肌病体外模型的患者基因组心肌细胞打开了大门。这些细胞可用于了解心脏病的病理生理学,阐明其分子机制,并测试不同的治疗候选者3。因此,产生了大量的兴趣,因此,产生了患者衍生的iPS细胞(例如,肥大性心肌病[HCM]4,5,心律失常右心室心肌病[ARVC]6,扩张性心肌病[DCM]7,和线粒体相关心肌病8,9)。因为心肌病的特征之一是肉瘤功能障碍和紊乱,因此需要一种能统一测量肉瘤功能的有效工具。
肉瘤缩短是评估肉瘤功能和从动物模型和人类衍生的成人心肌细胞收缩性最广泛使用的技术。要执行肉瘤缩短,需要在相对比下可见的发达肉瘤。然而,PSC-CMs培养的体外显示器不发达和混乱的肉瘤,因此,不能用于正确测量肉瘤缩短10。这种难以正确评估PCS-CMs收缩性的问题阻碍了它们作为体外评估心脏功能的平台的使用。为了间接评估PCS-CMs收缩性,原子力显微镜、微柱阵列、牵引力显微镜和阻抗测量被用来测量这些细胞对周围环境的运动效果。更复杂和侵入性较小的视频显微镜记录的实际细胞运动(例如,SI8000从索尼)可以用来替代评估其收缩性,但是,这种方法不能直接测量肉瘤运动或力生成动能14。
为了直接测量PCC-CMs中的肉瘤运动,新的方法,如荧光标记到肉瘤蛋白,正在出现。例如,Lifeact 用于标记丝状活性素 (F-actin) 来测量肉瘤运动15、16。转基因iPS细胞是另一种选择标记肉瘤蛋白(例如,α-actinin[ACTN2]和Myomesin-2[MYOM2])由荧光蛋白17,18,19。
在本文中,我们描述了如何使用 Myom2-TagRFP(小鼠胚胎干细胞 [ES] 细胞) 和 ACTN2-mCherry(人类 iPS 细胞)执行测量肉瘤缩短的延时成像。我们还表明,有图案的文化有助于肉瘤的排列。此外,我们使用腺相关病毒 (AAV) 描述肉瘤标记的替代方法,该病毒可广泛应用于患者衍生的 iPS 细胞。
1. 小鼠多能干细胞的分化
2. 人类多能干细胞的分化
3. 使用腺相关病毒对肉瘤进行荧光标记
4. [可选] 基于 AAV 的 PSC-CM 净化
5. 准备PDMS邮票
6. 多能干细胞衍生心肌细胞的模式培养
7. 荧光显微镜下肉瘤的延时成像
8. 使用 SarcOptiM(图像J/Fiji 插件)进行延时成像分析
使用敲击 PSC-CMs 记者线测量肉瘤缩短。沙科默标签的 PSC-CM 用于测量肉瘤缩短。线条表达 Myom2 - rfp 和 Actn2 - mcherry 从内源性洛西。TagRFP 入Myom2 ,编码 M 蛋白本地化到 M 线,而 mCherry 被敲入ACTN2 ,编码α - 阿克蒂宁,本地化到 Z 线 18 , 25 。获得延时图像,并用于确定肉瘤缩短,如图1和2和电影1-3。
为了克服 PSC-CM 的混乱,特定的 PDMS 邮票用于在条纹图案中培养 PSC-CM。与非模式区域培养的细胞(图2B 和 2C)相比,这种模式培养促进了细胞形状的拉长和更有条理的肉瘤模式。凭借这一优势,模式培养促进了细胞更好的收缩,并提供了一个光滑的肉瘤长度配置文件,如 电影2 和 3 和 图2D显示。
使用 AAV 载体对 Z 线蛋白进行荧光标记。 为了可视化PSC-CMs的Z线而不产生敲击iPS细胞,使用AAV转导来表达荧光标记的Z线蛋白。两种小Z线蛋白,Telethonin(TCAP)和Actin相关的LIM蛋白(PDLIM3)与GFP,被标记和包装使用AAV6帽(图3A)。一旦 PSC-CM 被区分和净化,AAV 就会被转换为 PSC-CM(图 3B)。转录的 PSC-CM 早在转录后三天(图 3C 和 3D)就沿 PSC-CM 表示了肉瘤 GFP 信号。通常,AAV 在 105 vg/细胞的 MOI 中转导足以可视化荧光标记肉瘤蛋白,较高的滴答声可能导致 GFP 细胞质的非特定本地化,尽管它增加了总体 GFP 强度。
使用 AAV 载体净化 PSC-CM。目前的方法依赖于已经在PCC-CMs的基因组上的药物选择盒,无论是转基因还是仿制线。然而,从患者衍生的iPS细胞中产生这样的线是劳动密集型的。由于AAV载体已被证明可以驱动荧光标记的Z线蛋白的表达,而无需敲击,我们试图建立纯化方法,而无需敲击(图4)。为此,构建了一个新的AAV载体,在cTNT促进剂的控制下编码抗爆霉素基因(图4A)。AAV (105 vg/细胞的 MOI) 在第 4 天被转换为区分人类 iPS 细胞。然后,细胞在7至9天(图4B)之间用2.5-10微克/兆升的爆破剂(需要为每根细胞线点状)进行治疗。第14天,PSC-CM的纯度超过90%(图4C)。

图1:从Myom2-TagRFP细胞系中提取的鼠标PCC-CM的沙科默尔缩短。A. 鼠标 PSC-CM 分化的时间表。 B. 以黄条表示的测量区域在不同时间点缩短肉瘤的代表图像。秤杆 = 10μm。 C. 在收缩心肌细胞期间,以1 Hz的电刺激的肉瘤长度轮廓。帧速率为每秒 50 帧。像素大小为 0.26 μm。 请单击此处查看此图的较大版本。

图2:代表数据表明,在非模式化和模式化培养中,来自ACTN2-mCherry细胞系的人类PCC-CMs的肉瘤缩短。A. 人类 PSC-CM 分化的时间表。 B. 在非模式化文化中培养的 C. 心肌细胞表现出混乱的肉瘤模式(B),而模式文化促进肉瘤(C)的良好对齐。用黄条表示的测量区域。 D. 在电刺激引起的细胞收缩期间获得的相应肉瘤长度图,速率为 0.5 Hz,每秒帧速率为 100 帧。像素大小 = 0.26 μm, 刻度条 = 10μm。 请点击这里查看此图的较大版本。

图3: AAV转导后3天的鼠标PCS-CMs。A. 用于肉瘤标记的 AAV 示意图向量图。肉瘤蛋白(感兴趣的基因,GOI)与GFP与Gly-Gly-Gly-Ser链接器(L)相连,并在心脏肌肽T(cTNT)促进剂的控制下表达。 B. 鼠标 PSC-CM 分化和 AAV 转导的时间表。 C. 和 D. 代表图像显示清晰的肉瘤定位和相应的肉瘤长度配置文件 TCAP-GFP (C) 和 PDLIM3-GFP (D) 经过 3 天的转导到 PSC-CM 从 Myom2-TagRFP 细胞线生成。秤杆 = 10μm。 请单击此处查看此图的较大版本。

图4:人类PCC-CM的爆炸性净化,无需敲击。
A. AAV 的示意图矢量图,其中将抗爆西丁基因盒(BSR)插入下游,以 cTNT 促进器。 B. 人类 PSC-CMs 分化、转导和爆破选择的时间表。 C. 显示人类 PSC-CMs 中 cTNT ® 细胞百分比的代表数据(在第 4 天转录 105 vg/细胞 AAV6,然后在第 7 天和第 9 天使用 2.5 μg/mL 爆炸剂进行治疗)。请单击此处查看此图的较大版本。
电影 1: 从Myom2-TagRFP 细胞线生成的鼠标 PSC-CM 的荧光延时视频。RFP 信号在 PSC-CM 培养后显示 28 天的肉瘤模式。当在1Hz的电刺激下,细胞显示同步跳动。延时图像每 20 ms 获得一次,镜头为 100 倍。秤杆 = 5 μm。请点击这里下载这部电影。
电影2:人类PCC-CMs的荧光延时视频,在非图案文化盘上培养ACTN2-mCherry。 在非图案文化盘上表达 ACTN2-mCherry 的 PSC-CMs 不仅表现出肉瘤的混乱,而且还呈现出挥舞的收缩,因此很难确定肉瘤的缩短。这些电池以0.5 Hz的电刺激,图像每10ms获得100倍的镜头。秤杆 = 10μm。请点击这里下载这部电影。
电影 3: 荧光延时视频的人类 Psc - cms 与 Actn2 - mcherry 培养在图案文化盘上。 图案培养促进肉瘤的对齐,并迫使细胞到杆形。这种方法使PCC-CM中的肉瘤缩短更容易确定。该视频是通过在0.5 Hz用电刺激细胞获得的。帧速率为每秒 100 帧。秤杆 = 10μm。请点击这里下载这部电影。
补充 CAD 文件。 CAD 文件用于创建宽度为 200 μm 的邮票,凹槽为 10 μm(Stamp_200x10.dxf)、25 μm(Stamp_200x25.dxf)和 50 μm(Stamp_200x50.dxf)。请点击这里下载此文件。
H.U. 已申请与此手稿相关的专利。
该方法可用于使用多能干细胞衍生心肌细胞与荧光标记肉瘤蛋白来检查肉瘤缩短。
我们感谢济池医科大学再生医学系的所有实验室成员提供有益的讨论和技术援助。这项研究得到了日本医学研究开发厅(AMED)的资助:JP18bm0704012 和 JP20bm0804018),日本科学促进会 (JSPS;JP19KK0219),以及日本流通协会(基础研究补助金)给H.U.
| 1-硫代甘油 | Sigma-Aldrich | M6145-25 | |
| 2-巯基乙醇 (55mM) | Thermo Fisher Scientific | 21985-023 | |
| 2-甲基丙烯酰氧酰氧乙基磷酸胆碱 (MPC) 聚合物, | NOF Corp. | LIPIDURE-CM5206 | |
| 2-丙醇 | Fujifilm wako | 166-04836 | |
| 35 毫米成像皿,带聚合物盖玻片(&微培养皿 35 毫米,高) | 同上 | 81156 | |
| AAVproR 无辅助系统 (AAV6) (载体;pHelper、pRC6、pAAV-CMV-载体) | Takara | 6651 | |
| ACTN2-mCherry (AR12, AR21) hiPSCs | N.A. | 我们按照其他地方描述的方法(安新,方法 Mol Biol,正在出版) | |
| B-27 补充剂 (50X),无血清 | 赛默飞世尔科技 | 17504-044 | |
| B-27 补充剂,不含胰岛素,不含胰岛素 | ,赛默飞世尔科技 | A18956-01 | B27 补充剂 (50X),不含胰岛素 Thermo Fisher Scientific A18956-01|
| B27 补充剂 (50X),不含维生素 A | Thermo Fisher Scientific | 12587-010 | |
| Benzonase (25 U/µL) | Merck Millipore | 70746 | |
| 杀稻瘟菌素 S 盐酸盐 | Fujifilm wako | 029-18701 | |
| BMP-4,人,重组, | R&D Systems 公司 | 314-BP-010 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A4503-100g | |
| C59,Wnt 拮抗剂 (WntC59) | abcam | ab142216 | |
| CAD 绘图软件, | Robert McNeel and Associates,WA,USA | Rhinoceros 6.0 | |
| 离心超滤装置 (100k MWCO),Vivaspin-20 | Sartorius | VS2042 | |
| CHIR99021 | 开曼 | 群岛13122 | |
| 铬蚀刻剂 | 日本化学产业有限公司 | N14B | |
| 镀铬掩膜涂有日本 AZP1350 | Clean Surface Technology Co., | 日本CBL2506Bu-AZP | |
| Dr. GenTLE 沉淀载体(20mg/mL 糖原,3 M 乙酸钠 (pH 5.2)) | Takara | 9094 | |
| Dulbecco's 改良鹰's 培养基 (DMEM) - 高葡萄糖 | Sigma-Aldrich | D6429-500 | |
| Dulbecco's 改良鹰's 培养基 (DMEM) - 高葡萄糖,不含丙酮酸钠 | Sigma-Aldrich | D5796 | |
| 乙醇 (99.5) | Fujifilm wako | 057-00456 | |
| 胎牛血清 | Moregate | 59301104 | |
| FGF-10,人,重组, | R&D Systems 公司 | 345-FG-025 | |
| 成纤维细胞生长因子(碱性),人,重组 | Fujifilm wako | 060-04543 | |
| 猪皮明胶粉末 | Sigma-Aldrich | G1890-100g | |
| 格拉斯哥最低必需培养基 (GMEM) | Sigma-Aldrich | G5154-500 | |
| 玻璃底培养板 | MatTek | P24G-1.5-13-F/H | |
| Ham’s F-12 | Thermo Fisher Scientific | 11765-062 | |
| Iscove 改良的 Dulbecco 培养基 (IMDM) | Thermo Fisher Scientific | 12440-061 | |
| L-丙氨酸-L-谷氨酰胺(GlutaMAX 补充剂,200 mM) | Thermo Fisher Scientific | 35050-061 | |
| L(+)-抗坏血酸钠盐 | Fujifilm wako | 196-01252 | |
| 层粘连蛋白-511 E8 片段 (LN511-E8, iMatrix-511) | Nippi | 892012 | |
| 掩模对准器 | Union Optical Co., Ltd.,日本 | PEM-800 | |
| 无掩模光刻工具 | NanoSystem Solutions, Inc.,日本 | D-Light DL-1000 | |
| MEM 非必需氨基酸溶液 (100X) | Thermo Fisher Scientific | 11140-050 | |
| Millex-HV 针头过滤器装置,0.45 µm,PVDF (0.45-µm 过滤器) | Merck Millipore | SLHVR33RS | |
| Myom2-RFP (SMM18) | N.A. | 在我们之前的论文 (Chanthra, Sci Rep, 2020) 中开发 | |
| N-2 补充剂 (100X) | Thermo Fisher Scientific | 17502-048 | |
| ORCA-Flash4.0 V3 数字 CMOS 相机 | Hamamatsu | C13440-20CU | |
| PD0325901 | Stemgent | 04-0006-10 | |
| 青霉素-链霉素 (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140-122 | |
| 培养皿 | Sansei medical co. Ltd | 01-004 | |
| 苯酚/氯仿/异戊醇 (25:24:1) | Nippon Gene | 311-90151 | |
| 聚二甲基硅氧烷 (PDMS) 弹性体 | Dow Corning Corp., MI, USA | SILPOT 184 | |
| 聚乙烯亚胺 MAX (MW. 40,000) | Polyscience | 24765-1 | |
| 正性光刻胶显影剂 | Tokyo Ohka Kogyo Co., Ltd., 日本 | NMD-3 | |
| PowerUp SYBR Green 预混液 | Thermo Fisher Scientific | A25742 | |
| 蛋白酶 K | Takara | 9034 | |
| 嘌呤霉素二盐酸盐 | Fujifilm wako | 166-23153 | |
| 重组人/小鼠/大鼠激活素 A 蛋白 | R&D Systems 公司 | 338-AC-050 | |
| 重组胰蛋白酶样蛋白酶 (rTrypsin;TrypLE express) | Thermo Fisher Scientific | 12604-039 | |
| RPMI1640 Medium | Thermo Fisher Scientific | 11875-119 | |
| 硅晶片 | Matsuzaki Seisakusyo Co., Ltd., Japan | N.A. | |
| 丙酮酸钠 (100 mM) | Thermo Fisher Scientific | 11360-070 | |
| 旋涂机 | Mikasa Co., Ltd.,日本 | MS-A100 | |
| 旋涂共聚焦显微镜 | 牛津仪器 | Andor Dragonfly 转盘系统 | |
| StemSure LIF,小鼠,重组,溶液 (10^6U) | Fujifilm wako | 195-16053 | |
| SU-8 3010 | Kayaku Advanced Materials, Inc., 马萨诸塞州, 美国 | SU-8 3010 | |
| SU-8 显影 | 剂Kayaku Advanced Materials, Inc., MA, USA | SU-8 显影 | |
| Tris-EDTA | Nippon Gene | 314-90021 | |
| 血管内皮生长因子-A165(VEGF),人,重组 | Fujifilm wako | 226-01781 |