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Research Article
Renee G. C. Maas1, Tess Beekink*1, Nino Chirico*1, Christian J. B. Snijders Blok1, Inge Dokter1, Vasco Sampaio-Pinto1, Alain van Mil1, Pieter A. Doevendans1, Jan W. Buikema2, Joost P. G. Sluijter*1, Francesca Stillitano*1
1Utrecht Regenerative Medicine Center, Circulatory Health Laboratory, University Utrecht, Department of Cardiology,University Medical Center Utrecht, 2Amsterdam Cardiovascular Sciences, Department of Physiology,Amsterdam University Medical Center
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
这里介绍的是一组方案,用于从以高通量、多维形式培养的人诱导多能干细胞衍生心肌细胞中生成和冷冻保存心脏球体 (CS)。该三维模型可作为疾病建模、高通量筛选的强大平台,并在冷冻保存后保持其功能。
人诱导的多能干细胞来源心肌细胞(hiPSC-CMs)对于人类心脏病建模和治疗至关重要。我们最近发表了一种具有成本效益的策略,用于在二维(2D)上大规模扩增hiPSC-CMs。两个主要限制是细胞不成熟以及高通量筛选(HTS)平台中缺乏三维(3D)排列和可扩展性。为了克服这些限制,扩增的心肌细胞形成了产生3D心脏细胞培养和组织工程技术的理想细胞来源。后者在心血管领域具有巨大潜力,可提供更先进和生理相关的HTS。在这里,我们描述了一种与 HTS 兼容的工作流程,该工作流程易于扩展,用于 96 孔格式的心球 (CS) 的生成、维护和光学分析。这些小型CS对于填补当前 体外 疾病模型和/或3D组织工程平台生成中存在的空白至关重要。CS呈现高度结构化的形态,大小和细胞组成。此外,作为CS培养的hiPSC-CMs显示出增加的成熟度和人类心脏的几个功能特征,例如自发的钙处理和收缩活性。通过自动化从CS生成到功能分析的完整工作流程,我们提高了批次内和批次间的重现性,如高通量(HT)成像和钙处理分析所证明的那样。所描述的协议允许在全自动HTS工作流程中对心脏病进行建模,并在复杂的3D细胞环境中评估单细胞水平的药物/治疗效果。此外,该研究描述了一种用于全球体长期保存和生物样本库的简单程序,从而为研究人员提供了创建下一代功能性组织储存的机会。HTS与长期储存相结合,将为广泛领域的转化研究做出重大贡献,包括药物发现和测试、再生医学和个性化疗法的开发。
人类诱导多能干细胞(hiPSCs)的发现为在细胞水平上研究人类发育和疾病提供了前所未有的机会。在过去的十年中,利用发育经验,已经建立了各种方案,以确保hiPSCs有效分化为心肌细胞(CMs)1,2,3,4。hiPSC 来源的心肌细胞 (hiPSC-CM) 可以作为模拟遗传性心血管疾病 (CVD)、测试新药心脏安全性和心脏再生策略的资源5,6,7,8。尽管hiPSCs具有定向心脏分化,但不确定的CM数量在心脏领域仍然是一个挑战,因为成熟的hiPSC-CMs通常是非增殖性的,并且原代人细胞的数量不高。
最近,我们描述了伴随的Wnt信号激活与低细胞密度培养导致hiPSC-CMs9,10的大规模增殖反应(高达250倍)。这种通过培养瓶形式的连续传代 大规模 扩增hiPSC-CMs的经济高效的策略有助于大量功能性hiPSC-CMs的标准化和质量控制。此外,为了跟上各种供体对大批量hiPSC-CMs的需求,已经描述了hiPSC-CMs的生物样本库10。然而,接种在这些标准培养皿中的心肌细胞单层不能代表心脏中存在的复杂3D结构。此外,hiPSC-CMs的不成熟仍然是一个障碍,因此在模拟 体内 心血管环境的生物学和生理表型方面存在不足。
已经开发了新颖的3D体外模型,其中hiPSC-CMs表现出更紧密的生理行为,例如自组织11,12,细胞外基质(ECM)重塑13,增强成熟14,15,16和同步收缩17,18,19.3D模型已被用于药物发现,药物心脏毒性测试,疾病建模,再生疗法,甚至首次临床试验20,21,22,23,24。最常用的模型之一是基于纤维蛋白的工程心脏组织(EHT),其表现出组织样排列和心脏收缩力13,17,25。之前,我们发现由扩增的hiPSC-CMs产生的EHT表现出与未扩增的hiPSC-CMs相当的收缩性,显示出扩增9后细胞功能不受损害。然而,尽管从hiPSC-CMs生成EHT已经建立,但预计在建立HT评估平台方面会有进一步发展。在这里,快速生成大量96孔格式的自聚集心脏球体(CS)可以改善用于高通量筛选(HTS)目的的3D条件。
总体而言,CS作为3D细胞培养的优势在于其高可重复性和可扩展性。特别是,CS与机器人样品处理相结合,可以使CS培养、药物治疗和高内涵分析标准化和自动化20。在这里,我们描述了优化的方案以产生高纯度和高质量的CS,通过使用光学钙采集和分析系统进行Ca2 + 瞬态测量,可以有效地冷冻保存和筛选心脏功能。该模型提供了一个简单而强大的工具,可以在数百到数千个球体17,18上执行高通量筛选。
注意:本研究中使用的hiPSC-CM是根据先前描述的hiPSC培养和CM分化方案26,27生成的。或者,hiPSC-CM可以在开始CS方案之前扩增和冷冻保存(第4节)10。
1. 细胞培养基、溶液和等分试样的制备
2. 缓冲液的制备
3. 小分子的制备
4. 心球生成
注意:对于大量 CS,在带有 2 mL hiPSC-CM 重镀培养基的 6 孔超低附着板中接种多达 100 万个 CM。这项研究在96孔板的每个孔中使用了至少2,500(2.5k CS)至20,000(20k CS)hiPSC-CM。
5. CS的冷冻保存
注意:CS 可以冷冻保存以长期储存。CS可以从CS生成后的第3天开始进行,CS可以直接冷冻保存在96孔板的孔中,也可以作为CS悬浮液保存在冷冻管中。
6. 心球解冻
注意:一次不要解冻多个板,以确保快速解冻过程。
7. 细胞内 Ca2+ 瞬变的评估
注意:CS在培养中总共培养3周;冷冻前 2 周和解冻后 1 周。"新鲜"控件与年龄匹配。
8. 解离心脏球体的流式细胞术分析
注意:在本研究中,流式细胞术用于确定解冻过程前后CS的活力。
9. 整个3D球体的免疫荧光染色
注意:该协议基于免疫荧光标记时整个类器官的高分辨率3D成像方案,该协议先前发表于29 并针对心脏球体进行了调整。在此过程中,所有移液器吸头和锥形管都可以涂上1%wt/v BSA-PBS,以防止球体粘附在塑料上。要涂覆材料,请浸入 1% 的 BSA-PBS 中。小心不要使用 5 mL 移液管损坏球体,避免机械损坏。
图1A所示的实验方案描述了从先前扩展的hiPSC-CM生成CS。CS在接种后第1天在超低附着圆底板中获得3D结构,并且可以培养长达6周(图1B)。通过免疫荧光染色评估,3周龄CS中的大多数细胞表达肌瘤蛋白,如α-肌动蛋白和肌钙蛋白T,并显示出规则的肌节组织(图1C)。为了定量α-肌动蛋白阳性细胞,进行了流式细胞术分析。根据免疫荧光结果,流式细胞术数据在第0天(76.9%±16.6%)和3周龄CS(71.1%±22.7%)中显示出相当高水平的α-肌动蛋白(图1D),表明培养过程中细胞组成恒定且高度纯化。与 hiPSC-CM 衍生球体(第 42 天)中连接(GJA1、JPH2 和 PKP2)、桥粒 (DES) 和线粒体 (ATP5A) 的心脏基因表达增加,与 hiPSC-CM 在 2D 中培养 90 天相比(图 1E)。这些基因的表达是细胞间相互作用和成熟的标志30。
随后,在不同时间点评估CSs的功能特性,即跳动速率和Ca2+处理(图2)。如图2A,B所示评估了钙瞬态参数,如上升时间、峰值时间、衰减时间和钙瞬态持续时间(CTD90)。在生成后的前 3 周,击败 CS 的百分比相似,但在第 6 周 (Wk6) CS 中显着下降(图 2C)。与Wk1相比,Wk3的跳动率显着降低,与CS的跳动百分比类似,在Wk6处急剧下降(图2D)。在Wk6,观察到CS恶化,这可以解释跳动速率和跳动CS数量的下降。 钙瞬态参数的测量表明Wk2处的峰值显着更高(图2E),而与Wk1相比,Wk3处的上升时间,衰减时间和CTD90显着增加(图2F-H).综上所述,这些结果表明,hiPSC-CM衍生的球体在生成后第2周和第3周左右在功能上是最佳的。
图3显示了球体尺寸对跳动速率和钙处理的影响。通过在 96 孔板的孔中接种 2.5 x 10 4、5 x 104、10 x 104 和 20 x 104 hiPSC-CM 来生成 CS,每个条件总共 24 个 CS/孔(图 3A)。正如预期的那样,球体尺寸随着所用细胞数量的增加而增加,范围从 178 ± 36 μm 到 351 ± 65 μm(图 3A,右图)。在四种不同的播种密度下测量了3周龄CS中的Ca2+瞬变(图3B)。对击败CS的测量表明,只有约50%的较小尺寸CS(2.5K和5K-CS)跳动,而较大尺寸的CS(10K和20K-CS)的百分比显着更高(约85%)(图3C)。5K、10K和20K-CS显示出类似的跳动率(约28 bpm),与2.5K-CS相比明显更高(图3D)。钙图像的峰值在所有测试条件下相似(图3E),但是,与较小的CS(2.5K和5K-CS)相比,较大尺寸的CS(10K和20K-CS)的上升时间(图3F)、衰减时间(图3G)和CTD90(图3H)显着增加。综上所述,这些结果表明,当使用10K至20K hiPSC-CMs/孔的接种密度时,hiPSC-CM衍生的球状体是钙处理筛选的最佳选择。
接下来,我们评估了冷冻保存对CS活力和功能的影响。在分析之前,解冻的CS在培养物中维持1周(图4A)。如流式细胞术(图4B)和钙黄绿素-AM(图4C)细胞活力测试所示,冷冻保存不影响CS内的细胞活力。 此外,与新鲜年龄匹配的CS相比,解冻的CS显示出相似的肉瘤蛋白表达水平(图4D)。这些数据表明,CSs可以有效地冷冻保存,用于随后的心脏功能分析和高通量筛选。
最后,在新鲜和冷冻保存的CS中测量打浆活性和Ca2+处理(图5)。分别在解冻后的不同时间点测量击败CSs的百分比,分别为2天,5天和7天。虽然大多数新鲜CS随着时间的推移显示出跳动活性,但显然冷冻保存的CS需要长达1周的培养才能恢复其跳动活性(图5B)。解冻的CS与新鲜CS的跳动率没有显着变化;然而,在一些冷冻CS中没有观察到自发跳动活动(图5C)。尽管与新鲜CS相比,冷冻/解冻CS的峰值显着降低(图5D),但与新鲜CS相比,冷冻/解冻CS的上升时间,腐烂时间和CTD90没有显着变化(图5E-G)。这些数据表明,解冻后,重要的是让CS在培养箱中恢复至少1周,然后再测量跳动活性和Ca2+瞬态。
综上所述,这些结果表明,hiPSC-CM衍生球体的冷冻保存可保持心肌细胞活力,肌瘤结构及其功能特征,例如自发跳动活性和钙处理。因此,hiPSC-CM衍生的球状体代表了在 体外准确概括心脏电生理学的合适模型。

图1:心脏球体的生成 。 (A)基于Wnt的定向心脏分化,hiPSC-CM的后续扩增以及CS的产生示意图 biorender.com。(B)CS培养不同时间点的明场图像。比例尺,200 μm。周代表周。(C)3周龄CS中心脏肌瘤蛋白α-肌动蛋白和肌钙蛋白T的代表性免疫荧光图像。 免疫荧光:Hoechst(蓝色),α-肌动蛋白(绿色)和肌钙蛋白T(红色)。比例尺,200 μm。右侧放大的合并图片显示了肌节组织。比例尺,50 μm。 (D)在CSs形成之前(第0天)和3周前(第0天)和3周对α-肌动蛋白阳性细胞进行流式细胞术定量。 (n = 14-23每种条件。(E)对培养90天(2D)的hiPSC-CMs和培养42天的球状体样品进行RT-qPCR,以确定与细胞连接,中间丝和线粒体相关的不同心脏基因的表达水平。(n = 1-3 批次)。数据表示为平均值±标准偏差。 NS(非显著性),由非配对 t 检验计算得出。 请点击此处查看此图的大图。

图2:CS在生成后不同周的跳动率和钙处理。 (A)Cyteseer软件中Vala科学分析算法计算的钙瞬态参数示例。(B)CSs在生成后不同时间点(周)的代表性钙瞬态迹线和延时图像。比例尺,200 μm。 (C)自发跳动活动的时程量化表示为跳动CS的百分比。 (D)培养期间CS的跳动率。(E-H)钙瞬变的定量,显示峰值、上升时间、衰减时间和CTD90。显示的数据是SD±平均值,生物学重复= 3,技术重复= 38,50,66和7。*p < 0.05, ****p < 0.001;单因素方差分析,然后是Tukey的事后多重比较测试。缩写;CTD = 钙瞬时持续时间,Wk = 周,CSs = 人心球。请点击此处查看此图的大图。

图 3:使用不同细胞接种密度生成的 CS 中的跳动速率和钙处理。 (A)使用不同数量的hiPSC-CM生成的CS的明场成像(左)和尺寸测量(右)。比例尺,200 μm。 (B)2.5K-20K-CSs的代表性钙瞬态迹线和延时图像。(中,四)2.5K-20K-CS的跳动率和跳动率。(E-H)2.5K-20K-CS中的峰值、上升时间、衰减时间和CTD90。数据平均值±SD.生物学重复= 3,技术重复= 28-39。*p < 0.05, ****p < 0.001;单因素方差分析,然后是Tukey的事后多重比较测试。缩写:CTD = 钙瞬时持续时间,Wk = 周,k = x 1,000 个细胞,CSs = 心脏球状体。请点击此处查看此图的大图。

图4.冷冻保存对心脏球状体活力和结构的影响。 (A)CS生成,随后的生物样本库和解冻的示意图。(B)新鲜和冷冻保存的CS中的流式细胞术细胞活力测试。作为阳性对照,使用10%Triton-X溶液处理5分钟。(每个条件 n = 4)。数据表示为标准偏差±平均值。 ** **p < 0.001;单因素方差分析,然后是Tukey的事后多重比较测试。(C)培养7天后新鲜与解冻CS中的钙黄绿素-AM细胞活力测试(n = 15-17每个条件,** **p <0.001,通过配对t检验;比例尺,200μm)。(D)新鲜和解冻CS中α-肌动蛋白和肌钙蛋白T表达的代表性明场(左)和免疫荧光染色。 免疫荧光:Hoechst(蓝色),α-肌动蛋白(绿色)和肌钙蛋白T(红色)。右侧合并的图片显示了CS中的肌节条纹。 比例尺,50 μm。 缩写:X = 选择的解冻日,PI = 碘化丙啶,Cal-AM = 钙黄绿素-AM,EthD-I = 乙锭同型二聚体 I。 请点击此处查看此图的大图。

图5:新鲜与解冻CS中的钙瞬变。 (A)冷冻保存前和解冻后1周CS的代表性钙瞬态迹线和延时图像。(B)新鲜和冷冻/解冻的心脏球体的跳动百分比。条形表示单个实验。(C)新鲜和冷冻/解冻的心脏球体的跳动速率。(D-G)钙瞬态参数的量化:峰值、上升时间、衰减时间和CTD90。数据平均值±标准偏差*p < 0.05,****p < 0.001;单因素方差分析,然后是Tukey的事后多重比较测试。缩写;CTD = 钙瞬时持续时间,CSs = 心脏球状体。请点击此处查看此图的大图。
补充图1:流式细胞术分析的代表性门控策略。 (A)纯人群中α-肌动蛋白阳性hiPSC-CMs的代表性门控策略与阴性对照和同种型对照的比较。α-肌动蛋白阳性分析细胞的数量为25 x 105。缩写;SSC = 侧散射,PI+ = 碘化丙啶阳性。(B)用于新鲜,解冻,阳性对照(Triton-X)和阴性对照(未染色)的活力分析的代表性门控策略。 请点击此处下载此文件。
作者没有什么可透露的。
这里介绍的是一组方案,用于从以高通量、多维形式培养的人诱导多能干细胞衍生心肌细胞中生成和冷冻保存心脏球体 (CS)。该三维模型可作为疾病建模、高通量筛选的强大平台,并在冷冻保存后保持其功能。
我们要感谢VARA科学为Cyteseer软件包和自动3D钙分析的优化。我们要感谢 PLN 基金会 (RM) 的赠款支持。P.A.D.和F.S.由CUREPLaN Leducq支持。J.P.G.S.得到了欧洲研究理事会(ERC)的H2020-EVICARE (#725229)的支持。J.W.B.得到了UMC乌得勒支临床奖学金,荷兰心脏研究所奖学金和CVON-Dosis青年人才奖学金的支持;荷兰心脏基金会(CVON-Dosis 2014-40)。北卡罗来纳州得到了荷兰科学研究组织(RegmedXB #024.003.013)的引力计划"材料驱动的再生"和玛丽·斯克沃多夫斯卡-居里行动(赠款协议RESCUE #801540)的支持。V.S.-P.由联盟基金(UMCU、UU、TU / E)支持。A.v.M.由欧盟资助的项目BRAVE(H2020,ID:874827)提供支持
| 24 孔悬垂板 | 康宁 | 3738 | |
| 96 孔 超低附着度多孔板 | 康宁 | CLS3474-24EA | |
| Albumax | Thermo Fisher Scientific | 11020021 | |
| 抗 α;-肌动蛋白(肌节)抗体 | Sigma-Aldrich | A7811 | 稀释度:1:200 |
| 抗心肌肌钙蛋白 T 抗体 (ab45932) | Abcam | ab45932 | 稀释度:1:200 |
| 抗坏血酸 | Sigma-Aldrich | A8960 | |
| B-27 补充剂 | Thermo Fisher Scientific | 17504-044 | |
| 素 | Sigma-Aldrich | B4639 | |
| 血清白蛋白组分V(BSA) | Roche | 10735086001 | |
| Cal-520,AM | Abcam | ab171868 | |
| 共聚焦显微镜 | Leica | DMi8 | |
| 共聚焦显微镜软件 | 徕卡 | Las X | |
| 锥形管 15 mL | Greiner Bio-One | 5618-8271 | |
| 肌酸一水合物 | Sigma-Aldrich | C3630 | |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 | 浓度:1 &微量;g/mL |
| DMEM 无葡萄糖 | Thermo Fisher Scientific | 11966025 | |
| EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | |
| 果糖 | Sigma-Aldrich | 76050771.05 | |
| 葡萄糖 | Sigma-Aldrich | G7021 | |
| 甘油 | 杆 | 76050771.05 | |
| 山羊抗小鼠 Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11029 | 稀释度:1:500 |
| 山羊抗兔 Alexa Fluor 568 | Invitrogen | A11011 | 稀释度:1:500 |
| 水平摇床 | IKA | 4003000 | |
| 人诱导多能干细胞系 | (斯坦福心血管研究所 (S-CVI) 生物样本库) | CVI-273(对照 1) | |
| 人诱导多能干细胞系 | 德国 | 141 (对照 2) 144 (对照 3) | |
| 盐酸 (HCl) | Ajax Firechem | 265.2.5L-PL | 10 M 储备液,腐蚀性 |
| 同种型对照,FITC 小鼠 IgM κ同种型 | BD | 556652 | |
| KnockOut 血清替代物 | Thermo Fisher Scientific | 10828 | 避光左 |
| 肉碱 | Sigma-Aldrich | C0283 | |
| 肌细胞钙和收缩系统 | 徕卡 | Thunder, DMi8 | |
| 非必需氨基酸 (NEAA) | Thermo Fisher Scientific | 11140 | |
| 多聚甲醛溶液 4% 在 1x PBS 中,pH 7.0–7.6 | 圣克鲁斯 | SC281692 | 有害 |
| PBS,pH 7.4 | Thermo Fisher Scientific | 10010023 | |
| 青霉素/链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15140 | |
| PES 膜真空过滤系统 | Corning | 431097 | |
| PI/RNase 染色液 | Invitrogen | F10797 | 稀释度:1:1000 |
| Pluronic F-127 | Sigma-Aldrich | P2443 | |
| PSC低温保存套件 | Thermo Fisher Scientific | A2644601 | |
| RevitaCell | Thermo Fisher Scientific | A2644501 | |
| RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11875 | |
| 硅胶弹性体套件 | SYLGARD | 184 | |
| 十二烷基硫酸钠溶液 (10%) | Sigma-Aldrich | 71736 | |
| L-乳酸钠 | Sigma-Aldrich | 71718 | |
| 牛磺酸 | Sigma-Aldrich | T0625 | |
| Tris Fisher | 科学 | 11486631 | |
| Triton X-100 | Merck | X100-1L | 有害 |
| 台盼蓝溶液,0.4% | Thermo Fisher Scientific | 15250061 | |
| TrypLE Select 酶 (10x) | Thermo Fisher Scientific | A1217701 | |
| Tween-20 | Sigma-Aldrich | P1379 | |
| 尿素 | Sigma-Aldrich | 51456 | |
| 维生素 B12 | Sigma-Aldrich | V6629 | |
| Y-27632 二盐酸盐(Rho激酶抑制剂) | Tocris | 1254 | 避光 |