灵长类大脑类器官的电穿孔技术为在接近灵长类(病理)生理新皮层发育的模型系统中,向不同类型的前体细胞和神经元引入瞬时遗传修饰提供了一种精确且高效的方法。该技术可用于研究神经发育和进化过程,也可应用于疾病建模。
灵长类大脑类器官的电穿孔技术为在接近灵长类(病理)生理新皮层发育的模型系统中,向不同类型的前体细胞和神经元引入瞬时遗传修饰提供了一种精确且高效的方法。该技术可用于研究神经发育和进化过程,也可应用于疾病建模。
大脑皮层是最外层的脑结构,负责感觉输入和运动输出的处理;它被认为是哺乳动物,尤其是灵长类动物高级认知功能的中枢。由于技术和伦理原因,在灵长类动物大脑中研究基因功能具有挑战性,但脑类器官技术的建立使得在传统灵长类模型(如恒河猴和普通狨猴)以及此前实验难以触及的灵长类物种(如大型类人猿)中,能够在符合伦理且技术要求较低的体系下研究脑发育过程。此外,人类脑类器官还允许对神经发育障碍和神经系统疾病进行深入研究。
由于脑类器官能够重现大脑发育的诸多过程,因此它们也成为在进化背景下识别不同物种脑发育遗传决定因素差异并进行功能比较的有力工具。使用类器官的一大优势在于可以引入遗传修饰,从而实现基因功能的检测。然而,此类修饰的引入过程繁琐且成本较高。本文介绍了一种快速且经济高效的遗传修饰方法,可用于灵长类脑类器官——一种脑类器官亚型——中类似脑室结构内的细胞群体。该方法结合了改良后的人源、黑猩猩源、恒河猴源和普通狨猴源诱导性多能干细胞(iPSCs)脑类器官稳定生成方案,以及显微注射与电穿孔技术,为研究神经发育和进化过程提供了有效工具,亦可用于疾病建模。
研究大脑皮层的(病理)生理发育与进化是一项艰巨的任务,其进展受到缺乏合适模型系统的限制。以往,此类研究局限于二维细胞培养模型(如原代神经前体细胞或神经元细胞培养)以及进化上相距较远的动物模型(如啮齿类动物)1,2。尽管这些模型在回答某些问题方面具有价值,但它们在模拟健康和疾病状态下发育中人类新皮层的复杂性、细胞类型组成、细胞结构以及基因表达模式方面存在局限性。这些局限性导致例如小头畸形等人类疾病的小鼠模型难以有效转化为人类实际情况,正如某些研究案例所述(如 Zhang 等人3)。近年来,转基因非人灵长类动物因其在进化、功能和形态上更接近人类新皮层发育过程,逐渐成为研究焦点4,5,6,7,8,能够克服基于细胞培养和啮齿类动物模型的诸多局限。然而,非人灵长类动物在科研中的使用不仅成本高昂且耗时漫长,还引发伦理方面的担忧。最近,脑类器官技术的发展9,10成为一种极具前景的替代方案,可解决先前多种模型存在的诸多局限11,12,13,14,15,16。
脑类器官是三维(3D)多细胞结构,可在特定的发育时间窗口内模拟一个或多个脑区的主要细胞结构特征和细胞类型组成11,12,13,14,17。这些三维结构可通过诱导性多能干细胞(iPSCs)生成,或在目标物种可获得的情况下,通过胚胎干细胞(ESCs)生成。根据所使用的方法,通常可将脑类器官分为两类:非定向类器官和区域化(定向)类器官18。在生成后一类类器官时,会添加小分子或因子,以引导多能干细胞向特定脑区的类器官(例如前脑类器官)分化18。相比之下,非定向类器官的分化不依赖于外源小分子的添加,而是完全依赖iPSCs/ESCs的自发分化。由此产生的脑类器官包含代表不同脑区的细胞类型(例如大脑类器官)18。只要能够获得iPSCs或ESCs,脑类器官便可相对低成本且高效地从任何目标物种中生成,并整合了脑发育的诸多关键特征11,12,13,14。这使得脑类器官成为多种神经生物学研究的优秀模型,研究范围涵盖进化与发育问题,到疾病建模和药物筛选15,16。然而,利用脑类器官开展此类研究在很大程度上依赖于多种基因编辑技术的可及性。
研究新皮层(病理)生理发育及其进化的一个关键方面是对基因及基因变异的功能分析。这通常通过基因的(异位)表达和/或基因的敲低(KD)或敲除(KO)来实现。这类遗传修饰可分为稳定的遗传修饰和瞬时遗传修饰,也可根据其是否具有时间和空间上的限制性进行分类。稳定的遗传修饰是指将遗传改变引入宿主基因组中,并可传递给所有后续细胞世代。根据遗传修饰发生的时间点不同,其可能影响类器官中的所有细胞,也可能仅局限于特定的细胞群体。最常见的是,在诱导性多能干细胞(iPSC)或胚胎干细胞(ESC)水平上,利用慢病毒、转座子样系统以及CRISPR/Cas9技术对脑类器官实现稳定的遗传修饰(参见Fischer等17、Kyrousi等19和Teriyapirom等20的综述)。这种方法的优势在于,脑类器官中的所有细胞均携带该遗传修饰,且不受时间和空间的限制。然而,构建和鉴定这些稳定的iPSC/ESC细胞系非常耗时,通常需要数月时间才能开始分析首批经修饰的脑类器官(参见Fischer等17、Kyrousi等19或Teriyapirom等20的综述)。
相比之下,瞬时基因修饰是指递送不整合到宿主基因组中的遗传物质(例如,基因表达质粒)。虽然原则上这种修饰可传递至后续的细胞世代,但所递送的遗传物质会随着每次细胞分裂而逐渐被稀释。因此,这类基因修饰通常在时间和空间上均受到限制。脑类器官中的瞬时基因修饰可通过腺相关病毒或电穿孔实现(例如,Fischer 等人17、Kyrousi 等人19 和 Teriyapirom 等人20 已对此进行综述),其中后者在本文中将被详细描述。与稳定的基因修饰相比,该方法具有快速且成本效益高的优势。事实上,电穿孔操作可在数分钟内完成,且根据靶向的细胞群体不同,经电穿孔处理的类器官可在数天内即可用于分析(例如,Fischer 等人17 和 Kyrousi 等人19 已对此进行综述)。然而,由于此类基因修饰在时间和空间上的局限性,无法通过该方法检测脑类器官的整体形态学变化,例如大小差异。这种局限性在某些情况下也可能成为优势,例如用于研究类器官内特定细胞群体,或在特定发育时间点研究对脑类器官的影响(例如,Fischer 等人17 和 Kyrousi 等人19 已对此进行综述)。
研究基因功能在大脑发育和进化过程中的经典方法是 在子宫内 电穿孔 在子宫内 电穿孔是一种将基因表达载体导入啮齿类动物的常用且有效的技术21,22,23 和雪貂24,25 大脑。首先,将含有目的表达载体的溶液通过子宫壁显微注射至胚胎大脑的特定脑室中,具体注射的脑室取决于目标区域。第二步,施加电脉冲以转染直接毗邻目标脑室的细胞。该方法不仅可用于基因的异位表达或过表达,还可通过显微注射短发夹RNA(shRNA)或CRISPR/Cas9系统(以表达质粒或核糖核蛋白复合物[RNPs]形式)分别实现基因敲低(KD)或基因敲除(KO)研究。26,27。然而, 在子宫内 小鼠、大鼠和雪貂胚胎的电穿孔具有与上述这些动物模型所述相同的局限性。
理想情况下,人们希望直接在灵长类动物体内进行in utero电穿孔。虽然从原则上讲这在技术上是可行的,但由于伦理问题、高昂的动物饲养成本以及较小的每胎数量,in utero电穿孔并未在灵长类动物中实施。对于某些灵长类动物,例如类人猿(包括人类),这种方法完全不可行。然而,这些灵长类动物在研究人类(病理)生理性的新皮层发育及其进化方面具有最大的潜力。解决这一困境的一个方案是将电穿孔技术应用于灵长类动物脑类器官28。
本文介绍了一种针对灵长类脑类器官(即灵长类大脑类器官)进行电穿孔的实验方案。该方法可快速、经济地对类器官中类似脑室结构内的细胞群体进行遗传学改造。具体而言,我们描述了一种统一的实验流程,用于从人(Homo sapiens)、黑猩猩(Pan troglodytes)、恒河猴(Macaca mulatta)和普通狨猴(Callithrix jacchus)的诱导多能干细胞(iPSCs)生成灵长类大脑类器官。此外,我们详细阐述了显微注射与电穿孔技术,并提供了进行灵长类大脑类器官电穿孔的"可行"与"不可行"判断标准。该方法是一种有效的工具,可用于研究新皮质在生理和病理条件下的发育过程及其演化机制,且该模型尤其接近人类的真实情况。
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1. 灵长类 iPSC 的培养
注意:由于该方法具有较强的稳健性,可应用于任何灵长类诱导多能干细胞(iPSC)系。本文描述了利用人源(iLonza2.2)29、黑猩猩(Sandra A)30、恒河猴(iRh33.1)29, 和普通狨猴(cj_160419_5)31 的iPSC系进行脑类器官的制备。培养条件总结于表1中。有关本实验方案所用全部材料、试剂和设备的详细信息,请参见材料表。
2. 利用灵长类动物诱导多能干细胞生成脑类器官
注意:脑类器官生成方案基于原始脑类器官方案10,34的改良版本28,30,32,33,并进行了一些物种特异性的修改(详见下文)。
3. 灵长类脑类器官的电穿孔
注意:从技术角度来看,一旦脑类器官中出现足够明显的脑室样结构,即可对其进行电穿孔操作,以便通过显微注射进行靶向。最佳电穿孔时间窗口取决于具体的研究问题以及目标细胞群体。例如,若主要靶向的是顶端前体细胞(APs),则约30天的脑类器官已适用于实验;若主要靶向的是基底前体细胞(BPs)或神经元,则应使用超过50天的较老脑类器官(参见例如Fischer等人的研究28)。
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本文所述方案可高效地从人、黑猩猩、恒河猴和普通狨猴的诱导多能干细胞系生成脑类器官,且不同物种间所需时间调整极少(图1A)。这些类器官可在20至50天(dps)之间进行电转染,具体时间取决于类腔室结构的可及性以及目标细胞群体的丰度。然而,在电转染之前,必须首先确定脑类器官是否具有足够质量以进行电转染。
用于电穿孔的脑类器官应在外周表现出明显且明亮的脑室样结构,无退化迹象(如细胞脱落、扩大的凋亡核心),并具有总体致密健康的形态(如无过度生长)(图1B,“可用”)。优先选择具有大而结构良好的脑室样结构的脑类器官,以靶向更多数量的细胞。如果类器官的外周区域较暗且未显示任何突出结构,则不建议用于电穿孔,因为缺乏可视性线索可能会影响精确的微量注射(图1B,“不可用”)。为获得最佳的脑类器官形态,必须确保神经外胚层诱导和基质包埋等关键步骤的时间控制准确。脑类器官形态相关的问题通常源于神经外胚层和/或神经上皮芽结构形成失...
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本文所述方法代表了一种统一的实验方案,用于通过靶向电穿孔技术从不同灵长类物种生成脑类器官。该方法可在模拟灵长类(包括人类)新皮层(病理)生理发育的模型系统中实现目的基因(GOI)的异位表达。这一用于生成灵长类脑类器官的统一方案,在所涉及的四种灵长类物种中均使用相同的材料(如培养基)和操作步骤。不同物种间的发育差异通过调整关键步骤的时间节点来应对(即神经诱导及在基底膜基质中的包埋;见上文)。这可能大致反映了 体内 这些物种之间神经发育的时间差异,构成了一个值得进一步研究的有趣课题。
该方法基于先前一篇关于脑类器官的电穿孔实验研究所描述的技术10。然而,正如Lancaster及其同事所指出的,这些实验受限于严重的细胞凋亡现象,这是由于绿色荧光蛋白(GFP)浓度过高所致,并导致表达强GFP信号的电穿孔细胞被排除10。在我们的实验中,我们发现最终总质粒浓度(例如,编码EGFP的质粒浓度加上编码目的基因的质粒浓度)以1,000 ng/µL为最佳。...
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作者声明不存在利益冲突。
由于篇幅限制,未能引用所有相关研究人员的工作,我们对此表示歉意。感谢DPZ技术服务中心的Ulrich Bleyer以及MPI-CBG车间的Hartmut Wolf协助构建了培养皿电极室;感谢Stoyan Petkov和Rüdiger Behr提供了人源(iLonza2.2)、恒河猴(iRh33.1)和狨猴(cj_160419_5)的诱导多能干细胞(iPSCs);感谢Sabrina Heide完成了冷冻切片和免疫荧光染色实验;感谢Neringa Liutikaite和César Mateo Bastidas Betancourt对稿件的审阅与批评建议。W.B.H.实验室的工作得到了ERA-NET NEURON(MicroKin)项目的资助。M.H.实验室的工作得到了欧洲研究理事会启动基金(101039421)的资助。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 20 µL 微量移液器 | Eppendorf | 5242956003 | |
| 2-巯基乙醇 | Merck | 8.05740.0005 | |
| 35 mm 细胞培养皿 | Sarstedt | 83.3900 | |
| 60 mm 细胞培养皿 | CytoOne | CC7682-3359 | |
| 激活素 A(Activin A) | Sigma-Aldrich | SRP3003 | |
| AOC1 | Selleckchem | S7217 | |
| Axio Observer.Z1 倒置荧光显微镜 | Zeiss | 可由性能相当的荧光显微镜替代 | |
| AZD0530 | Selleckchem | S1006 | |
| B-27 添加剂(含维生素 A(视黄酸,RA))(50x) | Gibco | 17504-044 | |
| B-27 添加剂(不含维生素 A)(50x) | Gibco | 12587-010 | |
| BTX ECM 830 方波电穿孔系统 | BTX | 45-2052 | |
| CGP77675 | Sigma-Aldrich | SML0314 | |
| 黑猩猩诱导多能干细胞系 Sandra A | doi: 10.7554/elife.18683 | ||
| 普通狨猴诱导多能干细胞系 cj_160419_5 | doi: 10.3390/cells9112422 | ||
| 杜尔贝科改良伊格尔培养基/营养混合物 F-12(DMEM/F12) | Gibco | 11320-033 | |
| 杜尔贝科磷酸盐缓冲液(DPBS) | Gibco | 14190-094 | pH 7.0−7.3;使用前恢复至室温 |
| 快绿染料(Fast Green) | Sigma-Aldrich | F7252-5G | |
| 佛司可林(Forskolin) | Selleckchem | 2449 | |
| GlutaMAX 添加剂(100x) | Gibco | 35050-061 | 谷氨酰胺替代添加剂 |
| 肝素(1 mg/mL 储存液) | Sigma-Aldrich | H3149 | |
| 人诱导多能干细胞系 iLonza2.2 | doi: 10.3390/cells9061349 | ||
| 人神经营养因子-3(NT-3) | PeproTech | 450-03 | |
| 胰岛素 | Sigma-Aldrich | 19278 | |
| IWR1 | Sigma-Aldrich | I0161 | |
| Leica MS5 体视显微镜(MDG 17 透射光底座) | Leica | 10473849 | 可由性能相当的体视显微镜替代 |
| Matrigel | Corning | 354277/354234 | 基底膜基质;也可使用 Geltrex(ThermoFisher Scientific,A1413302) |
| MEM 非必需氨基酸溶液(100x) | Sigma-Aldrich | M7145 | |
| N-2 添加剂(100x) | Gibco | 17502-048 | |
| Neurobasal 培养基 | Gibco | 21103-049 | |
| Parafilm 封口膜 | Sigma-Aldrich | P7793 | |
| 多聚甲醛 | Merck | 818715 | 因具有致癌性,操作时需谨慎 |
| 青霉素/链霉素(10,000 U/mL) | PanBiotech | P06-07100 | |
| 培养皿电极室 | 自制(见补充文件1) | 也可商业购买 | |
| 预拉制玻璃移液管 | WPI | TIP10LT | 长锥形硼硅酸盐玻璃移液管,尖端直径 10 µm |
| 促存活化合物(Pro-Survival Compound) | MerckMillipore | 529659 | |
| 重组人/小鼠/大鼠脑源性神经营养因子(BDNF) | PeproTech | AF-450-02 | |
| 恒河猴诱导多能干细胞系 iRh33.1 | doi: 10.3390/cells9061349 | ||
| StemMACS iPS-Brew XF | Miltenyi Biotech | 130-104-368 | |
| StemPro Accutase 细胞解离试剂 | Gibco | A1110501 | 蛋白水解和胶原水解酶混合物 |
| TrypLE | Gibco | 12604-013 | 重组胰蛋白酶替代物;使用前恢复至室温 |
| 超低吸附 96 孔板 | Costar | 7007 | |
| Y27632 | Stemcell Technologies | 72305 |
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