2011年7月31日
稳定同位素标准和捕捉反肽抗体(SISCAPA)夫妇亲和富集稳定同位素稀释质谱(MRM - MS)的肽作为代理人为各自的蛋白质肽的定量测量提供。在这里,我们描述了一个部分自动化的格式使用磁性粒子的协议。
以下程序的总体目标是分离和定量复杂混合物中的肽,这些肽充当其各自蛋白质的替代物。首先,使用胰蛋白酶等酶将混合物中的大蛋白消化成组分肽。然后,使用抗肽抗体富集靶向肽分析和加标稳定同位素标记的内标,分离后将其固定在蛋白 G 编码的磁性颗粒上。
从磁性颗粒中得到目标肽,并通过质谱分析,以便相对于内标进行定量。与传统免疫测定等现有方法相比,该技术的主要优点是它在构建大量分析时更快、更具成本效益。它的成功率很高,并且很容易被多路复用,证明将要布置该程序。
实验室的技术人员在湿冰上对 10 μL 血浆 Eloqua 进行 Haw。将样品转移到 1000 微升深孔板中,并用比喻膜覆盖,使蛋白质在 20 微升新鲜的 9 摩尔尿素 30 毫摩尔 DTT 中变性 每个样品,并孵育 30 分钟在 37 摄氏度下,向每个样品中加入 3 微升新鲜的 500 毫摩尔 I oto 乙酰胺,并在室温下避光孵育 30 分钟。现在用 100 毫摩尔 tris pH 8 将尿素稀释至 0.6 摩尔,并每微升行程添加 10 微升 1 微克和储备溶液,酶与底物的比例为 1:50。
在 37 摄氏度下用 3 μL 纯甲酸孵育反应过夜至终浓度为 1% 后,继续添加稳定同位素标准品或多个标准品。如果进行多重检测,则用 500 μL 0.1% 甲酸和 80% ACE 丁腈溶液充分清洗 Oasis 小柱板,丢弃流出物。然后通过在水中加入 500 μL 0.1% 甲酸来平衡小柱板,并丢弃流出液。
将消解样品加载到柱板上并调节真空度,使流速非常慢。用 500 微升 0.1% 甲酸的水中洗涤 3 次,弃去流路,用 500 微升 0.1% 甲酸在 80% 乙酸试验中洗脱肽两次,然后冻干或加速洗脱液至干,在 50 微升 PBS 加 0.03%Chaps 中重构干燥的肽,将样品转移到标准 Kingfisher 96 孔板中,加入 1 微克抗体和 1.5 微升蛋白 G每个靶标编码磁珠。添加前涡旋珠子。
确保珠子悬浮良好。用箔纸盖住板,然后用温和的滚揉离心机孵育过夜。以 400 RPM 的速度将板板放置 10 秒,以去除铝箔表面的任何液体。
取下铝箔盖。样品作在 Kingfisher 平台上的自动化 Kingfisher 平台上进行。用 200 微升 PBS 加 0.03% Chaps 洗涤珠子两次,用 200 微升 1 至 10 稀释的 PBS 加 0.03% Chap 洗涤一次,现在用 25 微升 5% 乙酸加 0.03% Chaps 洗
珠子。将洗脱板放在磁力架上,将洗脱液转移到 96 孔板中,注意不要转移剩余的珠子。用天花板垫盖住板,将含有洗脱液的板输送到三重、四重质谱仪进行分析。MRM 方法是通过获得目标肽的串联质谱来构建的,而不是选择和优化最佳过渡碎片离子。
通常,MRM 分析配置使用 C 18 捕集阱和具有两个流动相的分析柱。上样 10 μL 样品,按线性梯度洗脱。对轻肽和重肽的峰面积进行积分,并计算每个样品中未标记肽与标记肽的峰面积比。
轻肽和重肽同时洗脱,可以监测每个肽的多个离子对为了确认身份,测量内源性肽的峰面积相对于内标的面积,以提供目标肽的定量测量。观看此视频后,您应该对如何在实验室中实施这项技术有很好的了解。它可用于定量任何感兴趣的蛋白质,使其适用于生物研究中的广泛应用。
本文介绍了稳定同位素标准与抗肽抗体富集技术(SISCAPA),该技术结合了肽段的亲和富集与稳定同位素稀释质谱法,用于肽段的定量检测。本实验方案采用磁性微粒,并以部分自动化形式进行,以提高检测效率。
定量蛋白质检测在靶点验证和生物标志物发现中仍然是一个关键瓶颈,传统免疫测定方法在成本、周期和干扰方面存在局限性。SISCAPA 提供了一种可扩展、可多重检测的替代方案,通过对抗体无关的特征性肽段进行化学计量学定量,提高了早期发现阶段的预测可信度。这有助于根据风险调整项目组合决策,并实现从假设到临床前模型的转化连续性。
SISCAPA 可整合到从靶点验证到先导物鉴别的发现全过程,通过实现对蛋白质的定量检测,为检测方法开发和筛选工作提供基础。