2011年12月19日
本文描述了一种测定乙酸激酶活性的方法。该检测方法利用直接反应来测定乙酸激酶在生成乙酸方向上的酶活性及动力学,适用于不同的磷酸基受体。此外,该方法还可用于检测其他利用乙酰磷酸或乙酰辅酶A的酶。
本实验旨在直接测定乙酸激酶的乙酸形成活性。通过向含有乙酰磷酸和DP底物的反应混合物中加入酶来启动反应。然后加入盐酸羟胺,将剩余的乙酰磷酸转化为乙酰羟肟酸。
加入显色液,将乙酰羟酸盐转化为可检测的有色三价铁羟酸盐复合物。通过分光光度法测定反应中消耗的乙酰磷酸底物量,从而确定酶动力学参数。该方法相较于现有技术的优势在于,其直接测量乙酰磷酸的消耗,而非通过将ATP生成与ADP还原偶联来间接推算。由于该检测方法不依赖ATP的生成,因此可用于一类新型乙酸激酶的研究,这类酶生成的是磷酸化腺苷(power phosphate)而非ATP。为建立包含六至八个数据点的标准曲线,将乙酰磷酸储备液用100毫摩尔/升Tris缓冲液稀释至终体积300微升;同时设置不含乙酰磷酸的对照样品。将所有样品置于37摄氏度恒温金属浴中平衡1分钟。
现在,加入50 µL的2摩尔盐酸羟胺溶液,振荡混匀3次,并在60 °C的加热块中孵育5分钟。然后加入100 µL显色液,振荡混匀3次,于室温下显色至少1分钟。使用塑料比色皿将样品离心,用于分光光度计检测。
在 540 纳米波长下测定样品。使用适当的数据分析和绘图软件,绘制 540 纳米处吸光度相对于乙酰磷酸微摩尔数的标准曲线。计算 r 平方值。
将300微升反应混合物分装至微量离心管中。请记得设置一个不加酶的对照反应,并将所有管子在37摄氏度下平衡1分钟。若同时进行多个反应,需在特定时间间隔内向各管中加入酶,并立即将每支管子放回37摄氏度的加热块中。
五分钟后,加入50 µL的2摩尔盐酸羟胺溶液,混匀,并在60°C下孵育5分钟。然后加入100 µL显色液,混匀后于室温放置进行显色。随后将样品在18,000 ×g下离心1分钟。
在540纳米处测定吸光度。通过与乙酰磷酸标准曲线比较,确定样品中乙酰磷酸的含量。数据可作图并拟合McKayla Cementin方程,以确定动力学参数。
该实验通过测定乙酰磷酸底物的消耗量,以检测乙酸激酶在生成乙酸方向上的酶活性。在酶促反应进行一定时间后,剩余的乙酰磷酸被转化为乙酰羟基丁酸盐,进而形成红色的氢氧化铁络合物,其在540纳米处的吸光度可进行测定。此典型的乙酰磷酸标准曲线以540纳米处的吸光度对乙酰磷酸的微摩尔数作图,其斜率为每微摩尔乙酰磷酸1.2332吸光度单位。
所得的 R² 值为 0.99,表明数据与此处所示的线性方程拟合良好。该检测可用于测定不同酶制剂对乙酰磷酸的 KM 值。在 5 毫摩尔浓度的 ADP 条件下,使用不同浓度的乙酰磷酸对来自甲醇嗜热菌的纯化重组乙酸激酶进行实验,结果显示该酶对每种底物均遵循典型的 Michaelis-Menten 动力学,其表观 KM 值为 0.27 ± 0.01 毫摩尔乙酰磷酸。
与标准的偶联测定法不同,这种直接测定法能够检测利用乙酰辅酶A以外底物的乙酸激酶活性。例如,在棘阿米巴组内产生焦磷酸盐的乙酸激酶利用乙酰磷酸的过程中,反应体系中以磷酸钠替代了ADP。所得曲线显示,乙酰磷酸的表观KM值为0.50 ± 0.006毫摩尔。观看本视频后,您应能清楚地了解如何通过测定消耗的乙酰磷酸量来直接检测乙酸激酶活性。
获得可重复结果的关键因素是在每一步操作中保持一致性,尤其是在添加酶和混匀步骤中。
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本文介绍了一种直接测定乙酸激酶活性的方法,重点研究其在生成乙酸方向上的动力学特性。该检测方法也可适用于其他利用乙酰磷酸或乙酰辅酶A的酶。
该乙酸激酶活性的直接检测方法通过测定乙酰磷酸的消耗,实现了精确的动力学表征,克服了依赖ATP的偶联检测方法的局限性。该方法支持对利用替代性磷酸基供体的酶进行靶点验证和机制去风险化,拓展了微生物代谢中可成药靶点的范围。本方法通过提供可重复的定量数据,用于先导化合物的鉴定和通路解析,从而在早期发现阶段提高了预测的可信度。
该检测适用于从靶点验证到先导化合物发现的整个发现过程,可提供动力学数据,为苗头化合物向先导化合物的推进以及临床前候选物的选择提供依据。