2015年3月9日
本文介绍了一种快速且有效的功能重建方法,可用于重建纯化的野生型和突变型CFTR蛋白,该方法能够保持这种氯离子通道的活性,而CFTR在囊性纤维化中存在功能缺陷。通过CFTR介导的重建蛋白脂质体中的碘离子外流,可研究通道活性以及小分子化合物的作用。
本实验的总体目标是在重建的系统中测量 CFTR 通道群体的功能,并研究这些通道对调节分子存在的反应。首先,通过快速纯化方法从 SF nine 细胞中纯化野生型或突变型 CFTR 蛋白,获得在去垢剂溶液中具有功能活性的 CFTR 蛋白;其次,将纯化的蛋白重组到由实验者选定的特定脂质构成的蛋白脂质体中。
接下来,通过去除脂质体外的过量碘离子,在膜两侧形成碘离子的化学梯度,从而为离子经CFTR通道的跨膜移动提供驱动力。最后一步是在目标调节分子存在的情况下激活通道,启动蛋白脂质体中碘离子的释放。最终,在该重建系统中,利用碘离子选择性电极实时监测CFTR通道的功能。
该方法可实现将纯化的CFTR分子群体重组到磷脂脂质体后,对其氯离子通道活性进行研究。尽管该方法最初旨在深入了解CFTR第九通道的功能及小分子调节剂的作用,但也可应用于其他体系,例如对其他膜蛋白的功能表征。为确保实验成功,初次操作该方法的研究人员需优化蛋白与脂质的比例,确保所用蛋白具有良好的功能活性,避免使用功能低下或无功能的蛋白,并在密封良好的囊泡两侧建立足够的碘离子浓度梯度。
首先,在非硼硅酸盐玻璃管中加入五毫克卵磷脂酰胆碱(egg phosphatidylcholine)或卵磷脂(egg PC),在室温下通入氩气流中干燥20分钟。接着,根据文本方案中说明计算所需缓冲液六(buffer six)的体积,然后将缓冲液六直接加入脂质中。用Perfil密封玻璃管,随后在室温下涡旋振荡两分钟,使脂质在缓冲液中充分悬浮。
接下来,使用连接在1毫升注射器上的25号针头在室温下悬浮脂质,直至试管壁上无可见的脂质膜。由于脂质处于悬浮状态,缓冲液将呈现浑浊。将试管置于含冰的水浴中超声处理,进行22次脉冲超声,然后将试管放在冰上静置1分钟。
重复此步骤三次。接着,将CFTR蛋白加入脂质中,最终体积为一毫升。用25号针头将蛋白与脂质悬液混合10次。
将样品置于冰上 30 分钟,每 5 分钟轻轻涡旋混匀试管 5 次,孵育期间保持混合。取一次性去垢剂结合离心柱,折断底部标签,于 2000 × g 离心 2 分钟。为去除保存缓冲液,用 5 mL 缓冲液 7 洗涤柱子,于 2000 × g 离心 4 分钟,以洗脱洗涤缓冲液。
用缓冲液洗涤柱子三次,将全部1 mL蛋白质-脂质样品转移至柱子树脂顶部,室温孵育2分钟。在室温下以2000 × g离心柱子4分钟。然后将浑浊的蛋白-脂质体样品转移至一支干净的微量离心管中,并将管子置于冰上。将5 g Sephadex G-50珠子浸入50 mL缓冲液九中,室温下至少浸泡2小时。
然后将四个小型筛选柱装入饱和的珠子,直至填充至至少四分之三满。以2000 × g离心柱子4分钟,以去除树脂中的过量缓冲液。离心后,柱中应含有约2.25 mL的压紧树脂。
必须确保树脂充分水化,以便用蛋白脂质体进行洗脱。接下来,将125微升蛋白脂质体样品加至每根层析柱的顶部,以2000 × g离心4分钟。收集洗脱液(EITs),用于后续的碘化物FLX实验。
将一个微型F型聚四氟乙烯搅拌子放入96孔板的一个孔中,然后向该孔加入150 µL VX seven 70,使其在缓冲液9中的浓度为20 µmol。使用移液枪头去除任何气泡。随后向孔中加入150 µL蛋白脂质体样品,总体积为300 µL。
将96孔板置于搅拌器上,以每分钟130转的速度搅拌。将碘离子敏感电极的探头插入溶液中,注意不要接触搅拌子或孔底。为记录电极信号的轨迹,通过低通滤波器对信号进行过滤,以每秒2赫兹的采样率记录样品信号持续5分钟,以使样品达到平衡。
应产生一条稳定且近乎平坦的基线。然后在 pH 7 条件下加入 3 µL 100 mmol/L 的氯化镁 ATP 储备液。为激活 CFTR 通道,让样品再平衡 5 分钟,以达到新的基线。
接着,加入 3 µL 的 2 µmol/L 原液缬氨霉素,以消除由 CFTR 活性产生的电化学梯度。记录至少五分钟内由 CFTR 介导的碘化物 FLX 活性引起的电压下降。
然后向样品中加入3 µL 10% Triton X-100溶液,作为对照以释放蛋白脂质体腔内的碘化物。若检测到显著的碘化物释放,表明囊泡中捕获的碘化物浓度并未限制CFTR活性。测定样品后,在缓冲液9中配制从微摩尔至纳摩尔浓度的碘化钾系列稀释液。
从最稀释的溶液开始,记录电极在每种碘离子浓度下的毫伏响应值,以生成标准曲线。对野生型CFTR进行了碘离子检测。重组后测得的F流活性单位为每秒阿摩尔。
在存在CFTR和ATP的情况下,碘离子外流显著高于缺乏CFTR的对照组,且通过添加ATP可进一步增强。当CFTR被环磷酸腺苷(cAMP)依赖性蛋白激酶A的催化亚基(PKA)磷酸化时,碘离子外流增加;相反,预先使用强效抑制剂CFTR抑制剂172处理,则会降低碘离子外流速率。VX-770增强野生型CFTR介导的碘离子外流能力的实验在有或无PKA磷酸化的情况下进行测试,结果显示VX-770仅在磷酸化CFTR存在时增加相对碘离子外流。该效应通过CFTR的一种突变体ΔF508-CFTR进行验证。作为阴性对照,无活性类似物V091188不能增强磷酸化ΔF508-CFTR的活性,而VX-770可提高其相对碘离子外流。一旦掌握该技术,从CFTR纯化到功能活性检测的全过程可在典型的八小时工作日内完成:CFTR纯化约需四小时,重组耗时约一小时,随后即可开始eFlex检测。
采用此方案后,还可利用同一份CFDR蛋白样品进行其他方法检测,包括T PS测定法以及在para脂质S中进行单通道电导测量,以进一步表征小分子与蛋白的相互作用。通过这些方法,囊性纤维化研究人员将能够回答CFTR调节剂领域中的关键问题,即:该调节剂是否直接与CFTR蛋白相互作用,以及该调节剂的作用机制是什么。
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本文介绍了一种快速重建纯化的野生型和突变型CFTR蛋白功能的方法,该方法对于研究囊性纤维化中CFTR蛋白的活性及其调节分子的作用至关重要。该技术可用于检测CFTR通道功能以及调节分子对其功能的影响。
该方法能够在纯化且重建的系统中直接测量CFTR通道的活性,为评估调节剂对靶标功能的影响提供了一个简化主义的研究平台。通过将CFTR从细胞复杂环境中分离出来,该方法有助于在囊性纤维化治疗药物的早期发现阶段进行机制性风险评估,并在先导化合物优化过程中提供可预测的信心。该方法通过量化通道群体对磷酸化、核苷酸以及小分子(如激动剂和抑制剂)的响应,促进靶标验证和检测方法的开发。
该方法适用于从靶点验证到先导化合物鉴定的整个发现流程,可在开展细胞检测之前实现对靶点结合的生化验证。