DNA-barcode-based Multiplex Immunofluorescence Imaging to Analyze FFPE Specimens from Genetically Reprogrammed Murine Melanoma

Sachin  S. Surwase; Xin Ming M. Zhou; Kathryn M. Luly; Qingfeng Zhu; Niki Talebian; Robert A. Anders; Jordan J. Green; Stephany Y. Tzeng; Joel C. Sunshine

doi:10.3791/68124

基于 DNA 条形码的多重免疫荧光成像分析来自基因重编程小鼠黑色素瘤的 FFPE 标本

JoVE Journal
Cancer Research

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DNA-barcode-based Multiplex Immunofluorescence Imaging to Analyze FFPE Specimens from Genetically Reprogrammed Murine Melanoma

基于 DNA 条形码的多重免疫荧光成像分析来自基因重编程小鼠黑色素瘤的 FFPE 标本

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09:58 min

June 6, 2025

DOI: 10.3791/68124-v

Sachin S. Surwase*^1,2,3, Xin Ming M. Zhou*^3,4, Kathryn M. Luly^1,2,3, Qingfeng Zhu^5,6,7, Niki Talebian⁶, Robert A. Anders^5,6,7,8,9, Jordan J. Green^{1,2,3,5,8,9,10,11,12}, Stephany Y. Tzeng^1,2,3, Joel C. Sunshine^{1,3,4,5,6,8,9}

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

该方案为设计用于小鼠 FFPE 黑色素瘤组织基于 DNA 条形码的成像的多重免疫荧光抗体面板提供了分步指南。我们还描述了一个使用开源工具的图像分析管道，用于生成对小鼠黑色素瘤肿瘤免疫微环境的空间蛋白质组学见解。

我们提出了一种开发和验证多重免疫荧光组合的方案，以研究小鼠FFPE组织，并通过研究用递送血浆DNA的纳米颗粒处理的黑色素瘤模型的样本来证明其实用性，编码用于重新编程肿瘤微环境的免疫信号。该领域缺少与小鼠福尔马林固定石蜡包埋FFPE组织兼容的严格开发和验证的多重免疫荧光方案。

福尔马林固定石蜡包埋可长期保留组织形态，易于处理和储存，并能够创建组织微阵列，以便在一张载玻片上查看多个标本。

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