Puffer können verwendet werden, um Verbindungen bei bestimmten pH-Werten zu bewerten. In diesem Abschnitt erfassen Sie das Absorptionsspektrum des Indikators Neutralrot in verschiedenen Puffern. Die protonierte Form von Neutralrot ist Rot und die deprotonierte Form ist gelb-orange, was bedeutet, dass sie grünes bzw. blau-violettes Licht absorbieren. Die saure und die basische Form weisen also unterschiedliche Absorptionswellenlängen auf. Die Proteinbindung verändert die Eigenschaften von Neutralrot und verändert sowohl seine Absorption als auch sein pKa.
Nachdem Sie das Absorptionsspektrum von freiem Neutralrot bei mehreren pH-Werten gemessen haben, fügen Sie den Lösungen Riboflavin-bindendes Protein (RP) hinzu und messen die Absorptionen erneut. Die Absorptionsintensität hängt mit der Konzentration zusammen, daher verwenden Sie die Spektren, um den pKa von freiem und gebundenem Neutralrot nach dem Labor zu bestimmen.
-
Zeichnen Sie die folgende Tabelle in Ihr Labornotizbuch. Nummerieren Sie die Küvetten von 1 bis 10 und listen Sie die neun Puffer-pH-Werte auf, die Sie verwenden werden. Die 10. Küvette wird ein deionisierter Wasserrohling sein.
Anmerkung: Halten Sie die Küvetten immer an den strukturierten Seiten und wischen Sie die transparenten Seiten ab, bevor Sie die Küvette in das Spektralphotometer einsetzen. Denken Sie daran, die transparenten Seiten mit dem Lichtstrahl im Spektralphotometer auszurichten.
Tabelle 2: Absorption von freiem und gebundenem Neutralrot
| Küvette # | Puffer pH | Abs. beiλ max (Freies NRH+) | Abs. beiλ max (Bound NRH) |
| 1 | 5.0 | | |
| 2 | 5.5 | | |
| 3 | 6.0 | | |
| 4 | 6.5 | | |
| 5 | 7.0 | | |
| 6 | 7.5 | | |
| 7 | 8.0 | | |
| 8 | 8.5 | | |
| 9 | 11 | | |
| 10 | leer | | |
Klicken Sie hier, um Tabelle 2 herunterzuladen
-
Besorgen Sie sich zehn 1,5-ml-Küvetten und -Kappen und beschriften Sie die Kappen 1 bis 10, damit sie mit der Tabelle in Ihrem Labornotizbuch übereinstimmen.
-
Beschriften Sie ein 25-ml-Becherglas mit 'DIH2O' und füllen Sie es mit deionisiertem Wasser.
-
Spülen Sie Ihren neutralen wässrigen Abfall in den Abfluss und beschriften Sie das Becherglas in 'wässriger Pufferabfall'.
-
Beschriften eines 400-ml-Bechers für gebrauchte Mikropipettenspitzen.
-
Setze eine Spitze auf eine 1-ml-Mikropipette und gib damit 1000 μl deionisiertes Wasser in die Küvette 10. Dies ist Ihr Lösungsmittelrohling.
-
Geben Sie 925 μl Ihres pH 7,0 Mononatriumphosphat-Puffers in Küvette 5.
-
Bringt die restlichen leeren Küvetten in die Puffertabelle. Geben Sie anhand der Tabelle in Ihrem Labornotizbuch 925 μl jedes Puffers mit den beschrifteten Mikropipetten in die entsprechende Küvette. Achten Sie darauf, nicht dieselbe Pipettenspitze für verschiedene Puffer zu verwenden.
-
Sobald Sie fertig sind, bringen Sie die Puffer zurück zu Ihrem Arbeitsbereich. Stellen Sie dort eine 200-μl-Mikropipette so ein, dass sie 75 μl dispensiert, und befestigen Sie eine Spitze an der Mikropipette.
-
Geben Sie 75 μl Neutralrot in jede der neun Pufferküvetten. Jede Küvette mehrmals umdrehen, um die Lösungen gründlich zu vermischen. Anmerkung: Setzen Sie die Pipettenspitze wieder ein, wenn sie einen Puffer berührt.
-
Sobald Sie Neutralrot mit jedem Puffer gemischt haben, machen Sie ein Foto oder notieren Sie die Farben der Lösungen.
-
Schalten Sie ein tragbares Spektralphotometer ein und lassen Sie die Lichtquelle aufwärmen. Sobald es fertig ist, erstellen Sie ein neues Experiment, um die Absorption in Abhängigkeit von der Wellenlänge für das freie Neutralrot zu messen.
-
Setze die Küvette mit deionisiertem Wasser ein und erhalte ein Spektrum des deionisierten Wassers. Legen Sie es als Lösungsmittelhintergrund oder als Leerzeichen fest.
-
Entfernen Sie dann den Rohling und setzen Sie die Küvette mit Neutralrot in den Puffer mit dem niedrigsten pH-Wert ein, der die höchste Konzentration an protoniertem Neutralrot aufweist.
-
Erfassen Sie ein Spektrum, das einen starken Peak aufweisen sollte. Identifizieren Sie die Wellenlänge, die dem höchsten Punkt dieses Peaks oder dem Maximum entspricht. Notieren Sie diese Wellenlänge in Ihrem Labornotizbuch als Lambda max für protoniertes freies Neutralrot.
-
Speichern Sie die Daten und entfernen Sie die Küvette. Notieren Sie die Absorption in Ihrem Notizbuch und sammeln Sie dann Spektren für die Küvetten 2 - 9 mit dem gleichen Verfahren.
-
Zeichnen Sie die Wellenlänge des isosbestischen Punktes in Ihrem Labornotizbuch auf. Das ist der Punkt, an dem sich alle Spektren bei einer einzigen Wellenlänge kreuzen. Wenn sich an dieser Stelle kein Spektrum kreuzt, leeren und reinigen Sie die Küvette, bereiten Sie eine frische Probe vor und versuchen Sie es erneut.
-
Sobald Sie mit dem Sammeln von Spektren für alle neun Küvetten fertig sind, speichern und exportieren Sie die Daten.
-
Erstellen Sie ein neues Experiment, um die Absorption über die Wellenlänge für das gebundene Neutralrot zu messen.
-
Setze eine neue Spitze in die 200-μL-Mikropipette ein und füge 75 μl Riboflavin-bindende Proteinlösung zu jeder Küvette, einschließlich des Rohlings, hinzu. Werfen Sie die Spitze aus, befestigen Sie die Küvettenkappen und drehen Sie die Küvette mehrmals um, um die Lösungen zu mischen.
-
Setzen Sie die Küvette 10 in das Spektralphotometer ein und stellen Sie sie als Lösungsmittelrohling ein.
-
Erfassen Sie ein Spektrum der Probe mit dem niedrigsten pH-Wert und identifizieren Sie die Wellenlänge, die dem Maximum des intensivsten Peaks entspricht. Notieren Sie es in Ihrem Labornotizbuch als Lambda-Max von protoniertem Neutralrot.
-
Erfassen Sie Spektren für die Küvetten 2 - 9 auf die gleiche Weise wie für die freien neutralen roten Proben. Notieren Sie die Intensitäten bei Lambda max für protoniertes Neutralrot in Ihrer Tabelle, zusammen mit der Wellenlänge am isosbestischen Punkt.
-
Wenn Sie fertig sind, speichern Sie Ihre Daten, exportieren Sie sie für eine spätere Analyse und schalten Sie das Spektralphotometer aus.
-
Räumen Sie alle Geräte weg und entsorgen Sie Ihre gebrauchten Pipettenspitzen in einem zugelassenen Abfallbehälter oder Mülleimer.
-
Entleeren Sie die Küvetten in das wässrige Pufferabfallbecherglas und spülen Sie die Küvetten in das Becherglas mit entionisiertem Wasser.
-
Entleeren Sie das überschüssige NaOH in den Grundabfall und spülen Sie den Messzylinder mit Wasser aus.
-
Spülen Sie den wässrigen Grundabfall zusammen mit dem anderen wässrigen Abfall mit reichlich Leitungswasser in den Abfluss.
-
Waschen Sie Ihre Glaswaren, Küvettenverschlüsse und Rührstäbchen gemäß den üblichen Verfahren Ihres Labors. Reinigen Sie Ihre Arbeitsflächen mit einem feuchten Papiertuch und werfen Sie gebrauchte Papiertücher und Labortücher in den Labormüll
.