Eine Kombination verschiedener Techniken, um die Datenerfassung von der Maus Gewebe zu maximieren wird vorgestellt.
Methodenartikel
Eine Kombination verschiedener Techniken, um die Datenerfassung von der Maus Gewebe zu maximieren wird vorgestellt.
Jenseits einzelnes Gen-Funktion, um tiefer Schnitt in Genregulationsnetzwerken erfordert mehrere Mutationen in einem einzigen Tier zusammen. Eine solche Analyse von zwei oder mehreren Genen muss mit in-situ-Hybridisierung von anderen Genen oder Immunhistochemie ihrer Proteine ergänzt werden, sowohl im Ganzen montiert entwickeln Organe oder Abschnitte für detaillierte Auflösung der zellulären und Gewebe Ausdruck Veränderungen. Kombinieren mehrerer Genveränderungen erfordert den Einsatz von cre oder flipase bedingt löschen Genen und zur Vermeidung von embryonaler Letalität. Erforderliche Zuchtprogramme drastisch verbessern Aufwand und die Kosten proportional zu der Anzahl der Gene mutiert, mit einem Ergebnis von sehr wenigen Tieren, die mit dem vollen Repertoire an genetischen Veränderungen gewünscht. Amortizing die große Menge an Aufwand und Zeit, diese wenigen kostbaren Exemplare, die Durchführung mehrerer Mutationen zu erhalten erfordert Gewebe-Optimierung. Darüber hinaus untersucht ein einzelnes Tier mit mehreren Techniken macht es einfacher, Gendeletion Defekte mit Expressionsprofile zu korrelieren. Wir haben eine Technik, um eine gründlichere Analyse eines bestimmten Tieres zu erhalten entwickelt, mit der Fähigkeit, mehrere verschiedene histologisch erkennbare Strukturen sowie Gen-und Protein-Expression aller analysieren aus der gleichen Probe in beiden ganze montiert Organe und Abschnitte. Obwohl Mäuse verwendet worden sind, um die Wirksamkeit dieser Technik demonstrieren kann es zu einer Vielzahl von Tieren angewendet werden. Dazu kombinieren wir lipophilen Farbstoff Tracing, whole mount in situ Hybridisierung, Immunhistochemie und Histologie, um die maximal mögliche Menge an Daten zu extrahieren.
1. Lipophile Dye Injection
Tissue Zubereitung:
Alle Gewebe Dissektionen und Manipulationen sind in Tiere in 4% Paraformaldehyd (PFA) in 0,1 M Phosphatpuffer (pH 7,4) durch transcardial Perfusion mit Schlauchpumpen mit entsprechend dimensionierten Nadeln fixiert durchgeführt. Gewebe kann in 4% PFA in den Kühlschrank gelagert werden für bis zu 6 Monaten. Alle Vorbereitungen und Manipulationen sind in 0,4% oder höher PFA bis Montage mit Glycerin für die Bildgebung durchgeführt. Diese Menge an PFA effektiv eliminiert RNasen und schont die RNA in situ Hybridisierung.
Dye Lagerung:
Alle Farbstoffe sollten in einem dunklen geschlossenes Fach gelagert werden, um die Luftzirkulation und der Exposition gegenüber hellem Tageslicht zu minimieren, da sie lichtempfindliche sind. Zur Vermeidung von Kreuzkontaminationen sollte ein separates Set von Instrumenten verwendet werden, um jeden Farbstoff zu behandeln.

Abbildung 1. Schematische Übersicht des Experiments. Das Ohr ist ausgesetzt für die Visualisierung aller Strukturen zu ermöglichen. Lipophiler Farbstoff wird dann injiziert und man ließ sie diffus. Nach der Diffusion unterschiedliche neuronale Populationen zu sehen gekennzeichnet durch die unterschiedlichen Farbstoffe werden. Als nächstes werden in-situ-Hybridisierung (Sox2) ist auf dem Ohr und Etiketten-mRNA-Expression durchgeführt. Die Immunhistochemie ist dann durchgeführt(Myo7, Tubulin), um die Proteinexpression zu visualisieren. Gefolgt von histologischen Schnitten, in denen beide in situ Hybridisierung und Immunhistochemie visualisiert werden können.
2. In-situ-Hybridisierung
Falls Sie mit in-situ-Hybridisierung Start (nach dem Tracing mit lipophilen Farbstoffen wird es unmöglich sein) wollen, um Gewebe Vorbereitung verweisen in Teil 1. Jeder waschen, sofern nichts anderes angegeben, wird mit 2 mL der Lösung bei Raumtemperatur durchgeführt auf einem Wechselrichter / mixer. Achten Sie darauf, in eine saubere, RNase freie Umgebung zu arbeiten.
| Tabelle 1. Proteinase K-Verdau Zeit auf Maus Gewebe. | |
| AGE (embryonaler Tag) | TIME (min) |
| E8.5 | 6 |
| E9.5 | 10 |
| E10.5 | 13 |
| E11.5 | 15 |
| E12.5 | 17 |
| E14.5 | 18 |
| E16.5 + | 20 + |
* Die Proben können in diesem Stadium abgebildet werden und / oder nach der Immunhistochemie Schritt hinzugefügt wird (Teil 3).
Solutions:
3. Immunhistochemie
Schritte 1 und 2 kann entfallen, wenn Teil 2 wurde abgeschlossen sein. In diesem Fall stellen Sie sicher, dass alle Glycerin oder andere Montage-Medium gewaschen ist. Beachten Sie, dass nicht alle Antikörper noch in der Lage, ihre Epitop nach Proteinase K-Verdau zu erkennen. Wir haben eine kurze Liste von Antikörpern, die in Kombination mit in-situ-Hybridisierung in Säugetier-Gewebe verwendet werden können, wie sie ihre Spezifität zu behalten (siehe Tabelle 2).
Lösungen
| Tabelle 2. Antikörper, die Arbeit mit Proteinase K verdaut Gewebe. | ||
| Cat # | Artikel | Vender |
| 25-6790 | Anti-Myosin-VIIa Polyklonale | Proteus Biosciences |
| 25-6791 | Anti-Myosin-VI Polyklonale | Proteus Biosciences |
| 9661 | Cleaved Caspase-3 Polyklonale | Cell Signaling |
| T7451 | Anti-acetylierte Tubulin Monoclonal | Sigma |
| PRB-238C | ProX1 polyklonalen | Covance |
4. Histologie
Histologie kann nach Teil 1 eingeführt werden, um die Auflösung des lipophilen Farbstoff Tracing in dicken ganzen mounts wie jugendliche Gehirne oder nach Abschluss der Teile 2 und 3 zu erhöhen. Für die serielle Hirnschnitten empfehlen wir die Compresstome VF-700 Mikrotom (Precisionary Instruments Inc., Greenville, North Carolina), um eine einheitliche Wanddicke zu erhalten. Gefrierschnitte sind weniger optimal aufgrund der größeren Austritt von Farbstoff während des Schneidens Prozess 3. Vorbereitung der Schnittserien und Montage in Glycerin 4 ist die bevorzugte Methode des Tissue Vorbereitung, wenn ganze Halterungen oder Oberfläche steigt nicht erlauben eine angemessene Visualisierung von Gewebe regions of interest. Tissue kann auch nachträglich in Epoxidharz eingebettet und geschnitten werden bei 1-2 mu m Dicke mit Glas-oder Diamantmesser für TEM. Bei Verwendung dieser Technik die meisten Immunfluoreszenz bleiben und ist noch stabiler, nachdem Kunststoff eingebettet, jedoch werden alle lipophilen Tracing völlig zu diesem Zeitpunkt verloren, als sie lösen sich in Alkohol und Epoxidharz. Nehmen Sie vorsorglich als Proben lichtempfindlich sein wird, bis sie eingebettet sind.
Für Compresstome VF-700 Mikrotom Schnitte, folgen den Empfehlungen des Precisionary Instruments Inc.
Epoxy Embedding / Schnitte:
Lösungen
5. Repräsentative Ergebnisse

Abbildung 2. Lipophiler Farbstoff Platzierung und Bildgebung in einem Maus-Embryo. Drei verschiedene Wellenlängen lipophile Farbstoffe wurden injiziert und inkubiert, um die Visualisierung des Trigeminus (TN), N. glossopharyngeus (GN) und Vagus (VN) zentralen Projektionen zu ermöglichen. A) lipophiler Farbstoff Ablagerung in den peripheren Abschnitten von drei Hirnnerven Diffusion an den Hirnstamm ermöglichen für die Visualisierung ihrer zentralen Prozesse. NeurVue Maroon und VN:: NeuroVue Jade Der TN ist mit NeuroVue Red, GN gekennzeichnet. B) Gleiche Maus wie in (A) nach der Inkubation. Einige Diffusion kann mit Hellfeld-Mikroskopie zu sehen. C) Same Maus wie in (A und B). Das Hinterhirn wurde seziert und flach montiert. Einige Kennzeichnung der zentralen Prozesse der drei Nerven beschriftet mit Hellfeldmikroskopie gesehen werden. D) Die konfokale Bild (C). Bei Verwendung des konfokalen spezifischen Neuronen zu sehen ist, und die Verwendung von drei verschiedenen Farbstoffen erlaubt die Beurteilung der Verteilung der jeweiligen Bevölkerung in Bezug auf die anderen. Farbstoffe wurden nacheinander abgebildet. NeuroVue Jade wurde bei einer Anregung von 488 nm und Emission 500-550 nm abgebildet. NeuroVue Red wurde bei einer Anregung von 535 nm und Emission 550-600 nm abgebildet. NeuroVue Maroon wurde bei einer Anregung von 643 nm und Emission bei 650-700 nm abgebildet.

Abbildung 3. Schematische Darstellung des Experiments. Das Ohr ist ausgesetzt für die Visualisierung aller Strukturen zu ermöglichen. Lipophile Farbstoffdann injiziert und man ließ sie diffus. Nach der Diffusion unterschiedliche neuronale Populationen zu sehen gekennzeichnet durch die unterschiedlichen Farbstoffe werden. Als nächstes werden in-situ-Hybridisierung (SOX2) ist auf dem Ohr und Etiketten-mRNA-Expression durchgeführt. Die Immunhistochemie ist dann (Myo7, Tubulin) durchgeführt, um die Proteinexpression zu visualisieren. Gefolgt von histologischen Schnitten, in denen beide in situ Hybridisierung und Immunhistochemie visualisiert werden können.
In diesem Video zeigen wir eine Methode, um vier Techniken zu kombinieren, um die Datenerfassung und den Zusammenhalt durch die Korrelation von Daten innerhalb eines bestimmten Tieres (Abb. 3) zu maximieren. Dieser Ansatz verringert die Menge der Zucht und damit Zeit für die Veröffentlichung geeigneten Daten zu erhalten bei gleichzeitiger Verbesserung der Informationen über Co-Lokalisation und korrelative Wirkungen von Mutanten. Obwohl embryonalen Mäuse in diesem Video, erwachsenen Maus sowie andere Tiere wie Hühner, Xenopus und Zebrafisch eingesetzt wurden, können unter Verwendung dieser Techniken als gut. Bei Verwendung anderer Arten Proteinase K-Verdau kann verändert werden muss. Hier verwenden wir verschiedene fluoreszierende Farbstoffe NeuroVue gezielt Label bis zu drei neuronale Populationen von Interesse. Der Vorteil dieser Farbstoffe ist, dass sie in mutierten Mäusen, was problematisch sein kann, wenn sich ausschließlich auf die Immunhistochemie, die kann oder auch nicht durch die Mutationen analysiert werden betroffen sein können verwendet werden, und sie label Neuronen retrograd und anterograd 5. Eine aktuelle Studie hat auch die Anzahl der Neuronen Populationen, die gleichzeitig zu sechs 2 markiert werden können, erhöht. Danach können die lipophilen Farbstoff Verfolgung der gleichen Gewebe von Interesse dann mittels in-situ-Hybridisierung werden, für die Analyse der Gen-Transkription und können anschließend analysiert werden mittels Immunhistochemie für Protein-Verteilung. Letztere Analyse kann durch detaillierte Histologie, die zur Phänotypcharakterisierung 6 Fügen Sie können ergänzt werden. Diese multifaktoriellen Analyse hat das Potenzial, neue Erkenntnisse über korrelative Analyse gewinnen im gleichen Tier, die sonst möglicherweise unwahrscheinlich oder zumindest brauchen mehr umfangreiche Protokolle und Maus Zucht.
Konfokale Bilder wurden an der University of Iowa Carver Center for Imaging erhalten. Die Finanzierung wurde von einem SBIR Zuschuss (MH079805) zu BF Zusätzliche Unterstützung für die Zucht der Mäuse für dieses Projekt wurde von NIDCD (5R01DC00559007) zu BF zur Verfügung gestellt
| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| In-situ-Hybridisierung: | |||
| PC DIG-Wasch- und Blockpuffer-Set | Roche Group | 1585762 | |
| Premix 20x SSC-Puffer | Roche Group | 1666681 | |
| Proteinase K 20 mg/ml | Ambion | AM2546 | |
| Diethylpyrocarbonat (DEPC) | Research Products International Corp. | D43060 | |
| Formamid | Sigma-Aldrich | F9037 | |
| Dextransulfat | Research Products International Corp. | D20020 | |
| BM Purple | Roche Group | 11442074001 | |
| Anti-Dig-AP-Fab-Fragmente | Roche Group | 11093274910 | |
| RNase A-Enzym 10 mg/ml | Fermentas | EN0531 | |
| RNase Away | Research Products International Corp. | 7003 | |
| Lachssperma-DNA 10 mg/ml | Invitrogen | 15632-011 | |
| Stericup-Filtereinheit 0,22μm; 500 ml | EMD Millipore | SCGVU05RE | |
| Filterpapierscheiben 0,2μm; 25 mm | Whatman, GE Healthcare | 6780-2502 | |
| Phosphatgepufferter Salzlösung (PBS), pH 7,4, in Beuteln | Sigma-Aldrich | P-5368 | |
| Immunhistochemie: | |||
| Ziegen-Serum | Sigma-Aldrich | G9023 | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8532 | |
| H–chst-Farbstoff | Polysciences, Inc. | 9460 | |
| Histologie: | |||
| Poly/Bed 812 Einbettmedium/DMP-30-Kit | Polysciences, Inc. | 08792-1 | |
| Propylenoxid | Sigma-Aldrich | 110205 | |
| Glutaraldehydlösung 50 % | Fisher Scientific | G151 | |
| DPX-Montagemedium | Fluka | 44581 | |
| Rüttler | MidSci | 55D1114 | |
| Heizblock | Fisher Scientific | 11-715-125D | |
| Rotator | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 400110Q | |
| Brutschrank, eingestellt auf 60° | Fisher Scientific | 11-690-625D | |
| Farbstoffmarkierung: | |||
| Mikroscheren | Geuder | G-19775 | |
| Feinzangen | E.M.S | 72680-F | |
| NeuroVue-Farbstoff: Maroon, Rot, Jade | MTTI | FS-100(1,2,6) | |
| 1x phosphatgepufferte Salzlösung (PBS) | Sigma-Aldrich | P-5368 | |
| Präparationsmikroskop | Leica Microsystems | M205 FA | |
| Brutschrank, eingestellt auf 36° | Fisher Scientific | 11-690-506DQ | |
| Konfokales Mikroskop | Leica Microsystems | LSM 510 | |
| Objektträger | Surgipath | 00240 | |
| Deckgläser | Surgipath | 00106 | |
| RPI | Glycerin | G22025-0.5 | |
| Paraformaldehyd (4 % und 0,4 %) | Fisher Scientific | T353-500 |