1. Vorbereitung der biologischen Probe
- Präparation von lebenden Zellen
- Herstellung von adhärenten Zellen
- Seed in vitro-kultivierten oder frisch isolierten Zellen auf einem Glasboden-Spiegel (Greiner BioOne / Deutschland) und inkubieren sie bei 37 ° C und 5% CO 2 bis Zellhaftung abgeschlossen ist.
- Kulturmedium entfernen und danach vorsichtig waschen dreimal mit PBS vor Messung. Halten der Zellen mit PBS oder Zellkulturmedium während des gesamten Messverfahrens bedeckt.
- Herstellung von Zellen in Suspension
- Trennen in vitro-kultivierten Zellen nach Anspruch gemeinsame Protokolle (z. B. Trypsin-EDTA, Zellabschabung), zentrifugiert und die Zellen erneut zu suspendieren des erhaltenen Zellpellet wurde in PBS oder Zellkulturmedium.
- Übertragen Sie 100 ul der Zellsuspension (Konzentration: max. 100.000 Zellen / ml) auf einem Glasboden Gericht.
- Vorbereitung der natIVE-Gewebe
- Nach der Ernte der Gewebe, übertragen Sie sie auf sterile, eiskaltem PBS und bewahren Sie sie nicht länger als 12 Stunden bei 4 ° C oder auf Eis vor Messung. Frühere Experimente haben gezeigt, dass eine verlängerte Lagerzeit (kalte Ischämiezeit> 12 Stunden bei 4 ° C) im spektralen Veränderungen durch natürliche Abbauprozesse geführt.
- Die Messungen müssen mit dem Gewebe in PBS oder Medium bedeckt, um eine Beschädigung der ECM-Proteinen und Zellen aufgrund von Gewebe Trocknung vermeiden durchgeführt werden.
2. Raman-Spektrometer
Unsere maßgeschneiderten Raman-Spektrometer kombiniert eine Standard-Fluoreszenzmikroskop (Olympus IX 71) mit einem Raman-Spektrometer, die den direkten Vergleich von Hellfeld-und Fluoreszenz-Aufnahmen mit der Raman-Spektren ermöglicht. Die grundlegenden Einrichtung besteht aus einem 784 nm Diodenlaser (Toptica Photonik AG / Deutschland), ein Kerbfilter für die Trennung von der Raman-gestreute Licht von dem Anregungslicht, ein Mikroskop einnd einen Spektrographen (Kaiser Optical Systems Inc., Ann Arbor / USA) mit einer Charge Coupled Device (CCD-Kamera) für den Nachweis von spektralen Informationen (von Soft Imaging Systems / Deutschland F-View) optimiert.
3. Steuerung von Laser-Funktion
- Starten Sie die Software Andor Solis (Andor / Großbritannien) und stellen Sie die Temperatur des CCD-Kamera bis -60 ° C, um den Lärm durch thermisch induzierte Ströme in der Kamera zu minimieren.
- Legen Sie einen Silizium-Wafer auf dem Mikroskoptisch für die Kalibrierung.
- Schalten Sie den Laser und stellen Sie die Leistung auf 85 mW.
- Verwenden Sie die Software Zelle B (Olympus / Deutschland), um den Laser auf den Wafer zu konzentrieren, bis XY erscheint.
- Messen Sie den Silizium-Wafer mit einer einzigen Integrationszeit von 1 s mit einem 60x Objektiv Luft.
- Ändern der Einheit der x-Achse von Pixel-Zahl, um Raman-Verschiebung (cm -1) im Andor Solis Software.
- Variieren Sie den Laser-Fokus des Silizium-Peak bei 520 cm -1 indas gesammelte Spektrum, um die maximal mögliche Intensität dieser Raman-Band zu finden. Der Mindestbetrag zählt muss höher als 11.000, um eine erfolgreiche Kalibrierung haben.
4. Raman-spektroskopische Messungen
Alle Messungen werden bei Raumtemperatur durchgeführt.
- Grundeinstellungen
- Verwenden Sie einen 60x Wasserimmersionsobjektiv (Olympus / Deutschland) mit einer numerischen Apertur von 1,2, um das Spektrum der Proben zu sammeln.
- Ändern Sie die Einstellungen Akquisition bis 10 Integrationen / 10 Sekunden für insgesamt 100 Sekunden pro Messung.
- Messung der adhärenten Zellen
- Nehmen Sie den Glasboden Schüssel mit den Zellen und legen Sie es auf dem Mikroskoptisch.
- Um ein besseres Signal zu erhalten und sicherzustellen, Reproduzierbarkeit, fokussieren Sie den Laser auf den Zellkern, drehen Sie das Mikroskop Licht aus und sammeln Sie das Spektrum.
- Messen eines Referenz-Spektrum des Hintergrundrauschens Esehr 10 Spektren durch Bewegen des Laserfokus neben der Zelle. Es ist wichtig zu bedenken, dass, wenn die Schärfe ein neuer Hintergrund für jede Tiefenschärfe müssen gesammelt werden.
- Messung von Zellen in Suspension
- Übertragen Sie 100 ul der Zellsuspension in den Glasboden Schüssel und legen Sie es auf das Mikroskop Bühne.
- Fokus des Lasers auf der Mitte der Zelle, drehen Sie den Mikroskop Licht aus und sammeln Sie das Spektrum.
- Messen eines Referenz-Spektrum des Hintergrundrauschens alle 10 Spektren durch Bewegen des Laserfokus neben der Zelle. Beim Wechsel des Fokus, muss ein neuer Hintergrund für die neue Tiefenschärfe erfasst werden.
- Die Messung der nativen Geweben
- Nehmen Sie die Probe und setzen Sie es in einem Glasboden Gericht. Der interessierende Bereich (ROI) ist ausgerichtet mit Blick auf den Boden der Schale.
- Füllen Sie die Schale mit PBS genug, um die Probe zu decken.
- Legen Sie ein Deckglas über die Probe, jede mov vermeidenement der Probe während der Messung.
- Stellen Sie den Laser-Fokus in die Struktur von Interesse (Tiefenauflösung ist Laser-und Gewebe-abhängig) und sammeln Sie die Spektren.
- Sammeln einer Referenz-Spektrum des Hintergrundrauschens alle 10 Spektren durch Bewegen des Laserstrahl auf aus dem gesamten Gewebebereich. Beim Wechsel des Fokus, muss ein neuer Hintergrund für die neue Tiefenschärfe erfasst werden.
- Die Messung der Immunfluoreszenz (IF)-markierten Kryoschnitten
- § frisch, Snap-gefrorenen Gewebeproben mit einem Standard-cryotom und montieren sie auf Silica-beschichtete Deckgläser.
- Färben der Kryoschnitte nach einem Routine-Protokoll für IF, die nur einen kurzen Fixierungsschritt (max. 10 Minuten mit 4% Paraformaldehyd) und unter Verwendung geeigneter Antikörper für die Detektion des Proteins von Interesse.
- Führen Raman-Messungen Fokussierung in dem Bereich, wo Fluoreszenz auftritt.
- Elastin Abbauversuche
- Place die ventricularis der Schweine seziert Aortenklappensegel (Elastin-reich, Blut anströmseitigen Schicht des Herzens Klappensegel) mit Blick auf die Unterseite der Glasboden Gericht.
- Messen Sie die nativen Gewebe als "nicht inkubierten Kontrolle" bei 30 zufällig gewählten Punkten in der gesamten Gewebeoberfläche mit Schwerpunkt in den fibrillären Strukturen.
- Teilen Sie die Probe in 3 Abschnitte und legen Sie sie in separate 2,5 ml Eppendorf-Röhrchen mit 2 ml einer Elastase-Lösung (5 U / ml, Worthington / Deutschland) gefüllt.
- Inkubieren Sie das Gewebe entweder 15 oder 30 Minuten bei 37 ° C
- Nach einer Inkubationszeit von entweder 15 oder 30 Minuten, entfernen Sie das Gewebe von der Eppendorf-Röhrchen und waschen Sie vorsichtig mit PBS, um vollständig zu stoppen der enzymatischen Reaktion.
- Messen Sie jede Probe bei 30 zufällige Punkte, wobei der Schwerpunkt in den fibrillären Strukturen.
5. Datenverarbeitung und-analyse
- Raman-Spektren Verarbeitung
Die Vorbehandlung dererzeugten Spektren erfolgte mit OPUS-Software (Bruker Optik GmbH / Deutschland). - Um Störsignale aus dem Glas und Medium sowie zu reduzieren, um Variationen von Veränderungen in der Ausrichtung während der Messung zu vermeiden, subtrahiert die entsprechenden Hintergrund-Spektrum von dem gesammelten Spektren.
- Reduzieren Sie die Spektren der Wellenzahl Region zwischen 400-1800 cm -1, die die höchste Menge an Informationen bietet.
- Bei Bedarf Normalisierung der Spektren der maximalen Spitze. Die Normalisierung Faktoren aus den Intensitätsschwankungen und systematische Ausfälle, die Vereinfachung der Nachweis von strukturellen Veränderungen in der Probe-Spektren.
- Führen Sie eine Baseline-Korrektur, um die Vergleichbarkeit zwischen verschiedenen Experimente zu erhöhen.
- Raman-Spektren Analyse
Die Raman-Spektren wurden mit Hilfe der PCA mit The Unscrambler (CAMO / Norwegen) Software. Diese multivariate Analyse erkennt Unterschiede und Gemeinsamkeiten innerhalb der spektralen DatenSets. Jedes Spektrum wird als ein einzelner Punkt in einem mehrdimensionalen Raum auf den gesammelten Zählungen für jeden Raman-Verschiebung der Basis aufgetragen. Jedes Prinzip Komponente (PC) beschreibt eine bestimmte Menge der gesamten Informationen in den Originaldaten enthalten. Der erste PC ist derjenige, der die höchste Quelle der Variation enthält. Jeder PC enthält folgende, in Ordnung, weniger Informationen als die vorherige. Jede Variable hat einen Wert und eine Beladung auf jedem PC. Durch Auftragen PCs (= Scores), können wichtige Zusammenhänge Probe ausgesetzt sein. Die Belastungen beschreiben den Beitrag jedes analysierte Variable an die PCA. - Beschriften Sie jede Gruppe von Messungen durch die Schaffung von Zeile reicht für jede Probe-Gruppe.
- Verwenden Sie die folgenden Grundeinstellungen für das PCA: Kreuzvalidierung, die NIPALS Algorithmus, keine Rotation und die Analyse starten. Diese Einstellungen sind abhängig von Spektren.
- Führen Sie die PCA.
6. Repräsentative Ergebnisse
Raman-spECTRA von anhaftenden Zellen erzeugt weisen oft ein niedriges Signal-Rausch-Verhältnis und eine geringe Signalintensität (Abb. 1). 11 Aufgrund der Tatsache, dass der Laserfokus in der Nähe der Glasboden, der Einfluss der Störung eingestellt werden muss Glas-Signal ist recht hoch, was Maskierung der eigentlichen Probe-Signal. Folglich könnte die Probe Signal minimiert oder sogar beseitigt werden während eines nachfolgenden Abzug des Hintergrunds. Somit ziehen wir es vor Zellen in Suspension zu verwenden für unsere Raman-spektroskopische Analyse, wie sie den Nachweis von mehr detaillierte spektrale Informationen möglich ist. Jedoch zeigen die Spektren von adhärenten und Suspensionszellen die gleichen Haupt-Peaks unterscheiden sich nur in ihrer Intensität.
Zur Charakterisierung der verschiedenen Zelltypen innerhalb einer Suspension, ist keine Vorbehandlung erforderlich. Die mittlere Raman-Spektren und Standardabweichung von menschlichen Fibroblasten, mesenchymale Stammzellen (MSCs), Chondrozyten und Keratinozyten in Suspension gemessenenin Abbildung 2 dargestellt. Alle Raman-Spektren sind ähnlich strukturiert, mit Gipfeln, die aus typischen Biomolekülen wie Proteinen, Nukleinsäuren und Lipiden (siehe Tabelle 1). Für 12 dieser Zelltypen, der Spektralbereich zwischen 600 und 1800 cm -1 enthält die meisten relevanten spektralen Informationen, durch die deutliche Unterschiede zwischen den verschiedenen Zelltypen (Abb. 2A) nachweisbar. Beispielhafte, betonte wir ein Spektralbereich (1280-1350 cm -1) zeigt klare strukturelle Unterschiede, die zugeordnet werden Molekülschwingungen von Kollagen und Lipiden ist. Im Gegensatz dazu sind morphologische Analysen nicht geeignet für die Identifizierung und Unterscheidung der meisten Zellen (2B-I). Während der Unterschied zwischen Chondrozyten und Hautzellen zu beobachten ist (Abb. 2D, H gegen B, F und E, I), sind Fibroblasten und MSCs schwer zu trennen unter ausschließlicher Verwendung von Hellfeld-micrsocopieren (Abb. 2 B, F gegen C, G). 13
Raman-spektroskopische Analyse von nativem Gewebe, insbesondere von ECM-Proteine, erfordert, dass ein ROI kann durch Hellfeld-Abbildung visualisiert, um in der Lage, auf die jeweilige Struktur zu konzentrieren. Für die Zuordnung eines Proteins an einer spezifischen Fingerabdruck-Spektrum, erzeugten wir Raman-Spektren von kommerziell erhältlichen reinen Proteinen und immunhistologisch gefärbten Gefrierschnitte. Hier haben wir festgestellt, das Fingerabdruck-Spektren der elastischen Fasern in nativen Geweben Vergleich lyophilisierten Elastin und Immunfluoreszenz-gefärbten Kryoschnitten Verwendung eines Antikörpers gegen Elastin. Da jedoch Elastin verfügt über eine hohe Autofluoreszenz, die in den Raman-Spektren reflektiert wird, ist die Datenanalyse Herausforderung (3A). Um das systematische Versagen aufgrund von Probe-spezifische Eigenschaften wie Autofluoreszenz, eine angemessene Verarbeitung der Datenmengen zu reduzieren, ist von entscheidender Bedeutung. In unseren Daten einalyses, verwendeten wir Normierung auf die deutlich höhere Signalintensität des reinen Proteins Elastin beseitigen und so, konnten wir vergleichbare Raman-Spektren zu erzeugen (3B). Elastin ist eines der stabilsten ECM-Proteine im Körper und ist daher sehr schwer abbaubar. 14. In unserem experimentellen Aufbau, Abbau induzierte Elastin wir bei gesunden Schweinen Aortenklappensegel indem eine enzymatische Verdauung. Die Anwendung der multivariaten Analyse PCA, identifizierten wir signifikante Unterschiede zwischen den Raman-Spektren von enzymatisch behandelten Proben und native Steuerelemente (Abb. 3C). Diese spektralen Unterschiede wurden in der Lade-Spektrum bei 861, 1003 und 1664 cm -1 beobachtet. Erwartete strukturelle Veränderungen der Elastin-Fasern durch längere Belichtungszeiten zu Elastase wurden von HART-Färbung (Abb. 4), die ebenfalls in deutlicher trennbar Punktzahl Cluster wurden reflektiert (Abb. 3C) gezeigt.

Abbildung 1. Mittlere Raman-Spektren von freistehenden und adhärente Fibroblasten.

2. (A) Mittlere Raman-Spektren und Standardabweichung von vier verschiedenen primären isolierten Zelltypen (Fibroblasten, MSCs, Chondrozyten und Keratinozyten). Der Rahmen unterstreicht den Spektralbereich von 1280 - 1350 cm -1 mit strukturellen Unterschieden. (BE) Hellfeld-Bilder von Einzelhäusern (B) Fibroblasten, (C) MSCs, (D) und Chondrozyten (E) Keratinozyten. Maßstabsbalken entspricht 20 um. (FI) Hellfeld-Abbildungen von den anhängenden (F) Fibroblasten, (G) MSCs, (H) Chondrozyten und (I) Keratinozyten. Scale-bar gleich 200 um.

Abbildung 3. (A) Raman-Spektren ohne Normalisierung der lyophilized Elastin (blaue Linie), Immunfluoreszenz (IF)-markierten Kryoschnitten (orange Linie) und elastischen Fasern (rote Linie) im nativen Aortenklappensegel gemessen. Die hohe Signalintensität von lyophilisierten Elastin wird durch Autofluoreszenz verursacht. (B) Raman-Spektren nach der Normalisierung, um systemische Fehler zu beseitigen. (C) Spielstände und Belastungen der Vergleich zwischen unbehandelten Kontrollgruppe (rot) und enzymatisch abgebaut (blau und grün) elastischen Fasern innerhalb der nativen Gewebe.

Abbildung 4. Hirschzungenfarn gefärbten Schweinen Aortenklappensegel. Elastische Fasern sind visualisiert in schwarz. (A) und (B) zeigen unbehandelten Kontrollgruppe und (C) und (D) zeigen Gewebeproben, die dem Elastin abbauenden Enzym Elastase für 30 Minuten ausgesetzt wurden.
| Wellenzahl in cm -1 | Belegung 12 |
| 717-719 | CN | Phospholipide |
| 785-788 | DNA / RNA-Basen, OPO-Backbone | DNA / RNA |
| 1003 - 1005 | Phenylalanin | Protein |
| 1220-1280 | Amid-III | Protein |
| 1445-1447 | CH 2 | Protein / Lipid |
| 1655-1680 | Amid IC = C | Protein-Lipid |
Tabelle 1. Raman-Banden, die in Spektren aller Zelltypen (Fibroblasten, MSCs, Chondrozyten und Keratinozyten) erkannt werden.