Studien zum Verständnis der Übertragung von transmissiblen spongiformen Enzephalopathien (TSEs, Prionenkrankheiten) zwischen Spezies sind insofern eine Herausforderung, als sie typischerweise auf langwierigen und kostspieligen in vivo Tierprovokationsstudien beruhen. Eine Reihe von In-vitro-Assays wurden entwickelt, um die Messung von Prionen-Artenbarrieren zu unterstützen, wodurch der Tierverbrauch reduziert und schnellere Ergebnisse als bei Tier-Bioassays erzielt werden. Hier stellen wir das Protokoll für einen schnellen In-vitro-Prionen-Assay vor, der als Conversion Efficiency Ratio (CER)-Assay bezeichnet wird. In diesem Assay wird zelluläres Prionprotein (PrPC) aus einem nicht infizierten Wirtsgehirn sowohl bei pH 7,4 als auch bei 3,5 denaturiert, um zwei Substrate zu produzieren. Wenn das pH 7,4-Substrat mit einem TSE-Erreger inkubiert wird, wird die Menge an PrPC, die in einen Proteinase K (PK)-resistenten Zustand umgewandelt wird, durch die Speziesbarriere des ursprünglichen Wirts gegenüber dem TSE-Erreger moduliert. Im Gegensatz dazu wird PrPC im Substrat mit einem pH 3,5 von jedem TSE-Wirkstoff falsch gefaltet. Durch den Vergleich der Menge an PK-resistentem Prionprotein in den beiden Substraten kann eine Abschätzung der Speziesbarriere des Wirts vorgenommen werden. Wir zeigen, dass der CER-Assay die bekannten Prionen-Artenbarrieren von Labormäusen korrekt vorhersagt und zeigen als Beispiel einige vorläufige Ergebnisse, die darauf hindeuten, dass Rotluchse (Lynx rufus) anfällig für den Erreger der chronischen Auszehrungskrankheit des Weißwedelhirsches (Odocoileus virginianus) sein könnten.