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Viele zelluläre Prozesse wurden ausgiebig in 2 Dimensionen untersucht, wodurch ein kollektives Wissen über grundlegende zelluläre Signalmechanismen entsteht. Diese Studien vernachlässigen jedoch wichtige zelluläre Hinweise, die sie aus den strukturellen und mechanischen Eigenschaften der lokalen zellulären Mikroumgebung und der extrazellulären Matrix (EZM) erhalten. Um besser zu verstehen, wie Zellen in einem physiologischen Kontext interagieren, ist es wichtig, sie in 3-dimensionalen (3D) Assays zu untersuchen. Die ECM für diese 3D-Assays kann entweder aus Zellen gewonnen oder aus gereinigten Proteinen rekonstituiert werden. Unabhängig von der Quelle der EZM haben sich 3D-Matrix-Assays als von unschätzbarem Wert erwiesen, um zu verstehen, wie Zellen in der physiologischen Welt navigieren und interagieren. Zum Beispiel zeigen Zellen, die in 3D-Matrizen gezüchtet wurden, unterschiedliche Fortbewegungsmodi, die von der mechanischen Beschaffenheit ihrer umgebenden EZM abhängen, die in2D-Experimenten 4-6 nicht beobachtet werden. Darüber hinaus weisen in 3D kultivierte Zellen auch weniger und weniger ausgeprägte Stressfasern und fokale Adhäsionen auf als ihre Gegenstücke, die auf harten Oberflächen wie Glas oder Kunststoff gezüchtet wurden7.
Die Bedeutung von kontextbezogenen 3D-Assays beschränkt sich jedoch nicht nur auf die Zellmigration. Einige andere zelluläre Signalereignisse können nur mit Hilfe von 3D-Assays untersucht werden. Während der Gewebe- und Zelldifferenzierung liefert die Steifigkeit des extrazellulären Milieus und der EZM Signale, die morphogene Ereignisse beeinflussen können. So tritt die tubulogenese des Brustepithels nur in 3D-Matrizen mit geringer Steifigkeit auf, nicht aber in steifen Matrizen oder auf 2D-Substraten8,9. Wenn sie in steifen 3D-Matrizen kultiviert werden, nehmen dieselben Epithelzellen einen aberranten Phänotyp mit erhöhter Proliferation und Zellmembranvorsprüngen an, die durch veränderte FAK- und ERK-Signale angetrieben werden10. Es ist bekannt, dass viele andere Signalwege und zelluläre Prozesse in ähnlicher Weise von der Steifigkeit der lokalen zellulären Umgebung beeinflusst werden, und diese Signalkaskaden unterstreichen die Bedeutung der Untersuchung von Signalereignissen und des zellulären Phänotyps im Kontext geeigneter lokaler mechanischer Eigenschaften einer 3D-ECM.
Kollagen I ist ein besonders relevantes Protein für in vitro Studien, da es die am häufigsten vorkommende Komponente der EZM ist und für viele der mechanischen Eigenschaften der zellulären Mikroumgebung verantwortlich ist. Während es ursprünglich nur als Strukturprotein angesehen wurde, ist seine Rolle heute bekanntermaßen viel komplexer. Die Zusammensetzung, Architektur, Orientierung, Dichte und Steifigkeit der Kollagenfasern liefern ein konzentriertes Milieu an Signalinformationen5. Während des Fortschreitens bestimmter Krankheiten, wie z. B. chronischer Entzündungen und Tumorgenese, wird das Kollagennetzwerk dramatisch umgebaut2,11. Genauer gesagt bei Brustkrebs begleiten eine erhöhte Kollagenablagerung und Gewebesteifigkeit das Fortschreiten des Tumors und tragen wahrscheinlich dazu bei. Bei diesen frühen Tumoren erscheint das versteifte Kollagennetzwerk angespannt und ausgerichteter, so dass die meisten Fasern den wachsenden Tumor einkapseln2. Mit fortschreitendem Tumor reorganisiert sich das Kollagen weiter und Regionen des fibrillären Netzwerks orientieren sich senkrecht zur Tumorgrenze2,12. Die senkrechte Ausrichtung dient als prognostischer Biomarker, wenn diese Patienten ein schlechteres krankheitsfreies Fortschreiten und ein schlechteres Gesamtüberleben aufweisen1. Eine Erklärung für diese Korrelation ist, dass die schlechten Ergebnisse eine Folge der erhöhten Verbreitung von Tumorzellen durch persistente Zellmigration in ausgerichteten Kollagennetzwerken sind3.
Um zu verstehen, wie Zellen spezifisch auf Ausrichtung und Organisation reagieren, die bei der Tumorprogression beobachtet wird, ist es notwendig, sowohl zufällige als auch ausgerichtete 3D-Kollagenmatrizen für Experimente zu erzeugen. Es gibt drei grundlegende Methoden, um die Ausrichtung innerhalb von fibrillären Netzwerken zu induzieren. Bei der ersten Technik wird ein dehnungsinduzierendes Gerät verwendet, bei dem das Kollagen zwischen zwei Punkten zusammengezogen oder gedehnt wird, um eine Ausrichtung zu erzeugen. Fasern, die parallel zur Kraftachse verlaufen, werden straff gezogen, während Fasern, die senkrecht zur Achse stehen, zusammengedrückt und geknickt werden. Während dehnungsinduzierte Techniken in der Regel eine hervorragende Ausrichtung bieten, erfordert dieser Ansatz sperrige Geräte, die nicht ohne weiteres an viele Plattformen angepasst werden können3,13. Alternativ kann ein zellinduzierter Stamm erzeugt werden, indem lokalisierte Pfropfen von Zellen platziert werden, die sich anschließend zusammenziehen und das Kollagenausrichten 13. Diese Methode hat das Problem, dass sie variabel ist, da sich viele Parameter ändern können. Das zweite Verfahren nutzt magnetische Kügelchen und ein Magnetfeld während der Polymerisation, um die Kollagenausrichtung zu induzieren13,14. Mit dieser Methode können mit einfachen Geräten gute Ergebnisse erzielt werden, aber es erfordert die Verwendung von Antikörpern oder einer anderen Methode, um das Polymer zu magnetisieren. Daher kann es etwas teuer in der Anwendung sein, und die Steifigkeit des Kollagengels wird möglicherweise durch die erhöhten Verbindungen im Netzwerk verändert. Darüber hinaus sind die bei diesem Prozess verwendeten magnetischen Kügelchen oft autofluoreszierend, was für bildgebende Experimente problematisch ist. Schließlich kann die Ausrichtung durch die mikrofluidischen PDMS-Kanäle3,15,16 erzeugt werden. Bei dieser Methode wird die Kollagenausrichtung erreicht, indem polymerisierendes Kollagen durch kleine mikrofluidische Kanäle fließt. Diese mikrofluidischen Kanäle können in einer Vielzahl von Designs hergestellt werden und sind leicht an viele Plattformen anpassbar. Darüber hinaus sind sie sehr wirtschaftlich, da aufgrund ihrer geringen Größe sehr geringe Mengen an Kollagen und anderen Reagenzien verwendet werden.
Hier ist ein einfaches Protokoll für die Einbettung von Zellen in ein 3-dimensionales, fibrilläres Kollagen-Hydrogel. Darüber hinaus ist eine fortschrittlichere Technik, bei der PDMS-Mikrofluidikkanäle verwendet werden, um die Organisation und Ausrichtung der Kollagenmatrix zu steuern, ebenfalls vorgesehen. Dieses Protokoll lässt sich leicht an viele Plattformen anpassen und kann reproduzierbar sowohl ausgerichtete als auch zufällige Kollagenmatrizen für die Untersuchung der Zellmigration, Zellteilung und anderer zellulärer Prozesse in einer 3-dimensionalen, physiologischen Mikroumgebung erzeugen.