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$$\longrightharp{xx}$$,
Unter Verwendung des hier vorgestellten Verfahrens ( Abbildung 11 ) wurden 60-Kanal-MEAs, die mit E17-Maus-Neuronalzellen plattiert wurden, inkubiert, bis die Kulturen die Arrays in einem gesunden Teppich von Zellen bedeckten (Abbildung 12 und Abbildung 3a ) . Nach 3 Wochen Inkubation bei 10% CO 2 und 37 ° C wurden die Kulturen auf spontane Aktivität unter Verwendung eines kommerziellen Aufzeichnungssystems (siehe Materialtabelle ) überprüft . Die Temperatur wurde bei 37 ° C während des Aufzeichnungsvorgangs unter Verwendung eines Temperaturreglers gehalten, da die Temperatur die neuronale Aktivität und die Brennrate beeinflusst.
Prüfung auf Aktivität
Spontan aktive Netzwerke weisen normalerweise unterschiedliche Signalmuster auf. Eine durchschnittliche aktive Kultur kann die Aktivität in einerCa. 40% der Elektroden. Von diesen aktiven Elektrodenstellen sind nahezu halbe Register-Spontansignale mit Brennraten von 5 - 10 Hz. Eine repräsentative Rasterkurve der spontanen Aktivität ist in Fig. 4a gezeigt . Die Häkchen markieren die Zeitstempel von Aktionspotentialen, die von 9 aktiven Elektroden während eines 20 s-Fensters mit einer Erfassungsrate von 25 kHz und einem Bandpassfilterbereich zwischen 300 Hz und 3 kHz aufgezeichnet wurden. Fig. 4b zeigt das Grundlinienrauschen und das gefilterte rohe extrazelluläre Signal während 8 Bursts von Aktivität vor dem Sortiervorgang. Um die Aktionspotentiale vom Rauschen zu trennen, werden die Schwellenwerte für jeden Kanal auf das 5-fache der Standardabweichung des Grundlinienrauschens eingestellt und über ein 500 ms-Fenster 15 berechnet.
Vor der Analyse wurden die aufgezeichneten Spikes für jede Elektrode offline sortiert, um zwischen physio zu unterscheidenLogische Aktivität und Stimulation Artefakte mit einem K-Mittel-Algorithmus und Prinzip-Komponenten-Analyse. Signale, die als physiologische Reaktionen identifiziert wurden, wurden zusammengefasst, um eine Populationsreaktion an jeder Elektrode zu erzeugen (Abbildung 13 und Abbildung 9 ) .
Ausbildung von neuronalen Netzen mit elektrischer Stimulation
Netzwerke wurden unter Verwendung einer elektrischen Stimulation trainiert, die auf die Kultur direkt durch die MEA-Elektroden unter Verwendung eines Stimulusgenerators angewendet wurde (siehe Tabelle der Materialien). In diesem Satz repräsentativer Ergebnisse wurde eine "L" -förmige Konfiguration bestehend aus 13 Elektroden verwendet (Abbildung 8 ), obwohl viele andere Konfigurationen angewendet werden können. Die Sondierungs- und Trainingsstimulation basierte auf Parametern, die in Ruaro et al. 14
Eine Grundlinie wurde zunächst durch Aufzeichnung von 5 min spontaner Aktivität vor der Stimulation eingestellt. Sobald die Grundlinie festgestellt wurde, wurde eine 5-minütige Vor-Trainings-Sondierungsstimulation, bestehend aus einem 0,5 Hz-Zweiphasen-Puls mit einer Pulsdauer von 200 μs und einer Pulsamplitude von 900 mV (Abbildung 7a ), über die ausgewählten Stimulationsstellen ( dh "L" -förmig). Ein Trainingsprotokoll wurde dann den Netzwerken alle 2 s unter Verwendung des gleichen Satzes von Elektroden verabreicht. Das Trainingssignal bestand aus 40 Pulszügen, die jeweils 100 biphasische Impulse mit einer 4-ms-Interpulsperiode, einer Pulsdauer von 200 μs und einer Pulsamplitude von 900 mV ( Fig. 7b und Fig. 7c ) enthielten. In dieser Trainingszeit folgte eine 5-minütige Nachschulphase, ähnlich der Vor-Training-Stimulation. Das Protokoll war dannMit einer 5-minütigen Aufnahme der post-stimulierenden spontanen Aktivität abgeschlossen.
Das gleiche experimentelle Protokoll wurde auf eine Kontrollgruppe von Kulturen angewendet, um natürliche Schwankungen der Netzwerkreaktion zu berücksichtigen. Der einzige Unterschied im Kontrollprotokoll war jedoch die Anwendung einer Scheintrainingszeit, bei der kein aktuelles Trainingssignal verabreicht wurde.
Statistische Analysen der Datensätze ( dh Training gegen Kontrolle) wurden mit einer einseitigen ANOVA durchgeführt, wobei die Variable "Training" als Zwischenfaktor war. Die Latenz wurde als In-Subjekt-Faktor verwendet. Wenn signifikante Interaktion gefunden wurde, wurde Tukey's Post-hoc-Verfahren durchgeführt. Die Ergebnisse zeigten eine Vor-Trainings-Antwort innerhalb von 20 ms post-stimulus, obwohl der Bereich der Aktivität war inkonsistent nach der ersten Antwort. Allerdings zeigte die Post-Training-Aktivität nicht nur ar Esponse innerhalb der ersten 20 ms post-stimulus, wie es während des vortrainings gesehen wurde, aber es zeigte auch eine signifikante Aktivität von 30-50 ms post-stimulus (Abbildung 14 und Abbildung 15 ) 15 . Es gab auch eine statistisch signifikante Korrelation von "Spike-Frequenz" gegenüber "Zeit nach Stimulus" und "Spike-Zuverlässigkeit" gegenüber "Zeit nach Stimulus". "Spike-Zuverlässigkeit" kann definiert werden als die Wahrscheinlichkeit, eine Netzwerkantwort auf eine Stimulation zu sehen, wobei eine Antwort auf jeden Reiz einen Maximalwert von 1 zugewiesen wird. Abbildung 16 zeigt nahezu eine 50% ige Erhöhung der Spike-Frequenz sowie eine 30 -50% Erhöhung der Spike-Zuverlässigkeit für geschultes Netzwerk gegen die Kontrolle im Bereich von 20-50 ms nach-stimulus. Diese Ergebnisse deuten darauf hin, dass die Ausbildung die Netzdynamik grundlegend verändert hat.
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Abbildung 1 : Werkzeuge und Materialien, die für die Entfernung von Embryonen verwendet werden. ( A ) Eisgefülltes Tablett ( B ) Petrischalen gefüllt mit kaltem L-15 "Slush". ( C ) Papiertuch ( D ) Sprühflasche mit 70% Ethanol. ( E ) Feinzange (x2). ( F ) Kleine chirurgische Schere. ( G ) Blunt-Nase Daumenzange. ( H ) Große Schere. ( I ) Körpertasche Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 2 : Werkzeuge und Materialien für die Hirnabsaugung. ( A B ) Petrischale mit Embryoköpfen. ( C ) Folienbeschichtetes Zentrifugenröhrchen mit Speichermedium. ( D ) Inverted Glas Petrischale. ( E ) Autoklaviertes Filterpapier ( F ) Becher mit 70% Ethanol. ( G ) Kunststoffpipette ( H ) Iris Schere. ( I ) Feine Pinzette. ( J ) Dünner doppelendiger Spatel. ( K ) Papiertuch Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 3 : Optimale versus nicht-optimale Kulturen ( A ) zeigt einen gesunden Teppich von Zellen, die die Arrays abdecken, im Gegensatz zu ( B ),In denen es eine schlechte Zellproliferation gibt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 4 : Repräsentative Ergebnisse der spontanen Aktivität. ( A ) Repräsentatives Rasterplot der spontanen Aktivität Die Tick-Markierungen zeigen Aktionspotentiale an, die von 9 aktiven Elektroden während eines 20-s-Fensters mit einer Erfassungsrate von 25 kHz und einem Bandpassfilterbereich zwischen 3 kHz und 300 Hz aufgezeichnet wurden. ( B ) Repräsentativ gefiltertes extrazelluläres Aktionspotential von einer aktiven Stelle. Abbildung geändert aus Referenz 15 . Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version zu sehenN dieser Figur.

Abbildung 5 : Aufnahme Setup. ( A ) Stimulationsgenerator ( B ) Temperaturregler ( C ) Netzteil. ( D ) Verstärker. ( E ) Kopfstufe / Vorverstärker. ( F ) Capped MEA. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 6 : Schematische Darstellung des Ausbildungsprotokolls. Eine Anfangsbasislinie für 5 min und eine Sondenstimulation für 3 min aufzeichnen. Tetanische Stimulierung anwenden Für 90 s, die nicht aufgezeichnet ist. Auftragen und Aufzeichnen einer zweiten Sondenstimulation für 3 min und eine endgültige Grundlinie für 5 min. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 7 : Probing Stimulation und Training Signal Parameter. ( A ) Die Probing Stimulation besteht aus ± 900 mV bi-phasischen Impulsen, die mit einer Frequenz von 0,5 Hz verabreicht werden. ( B ) Pulszüge bestehen aus 100, ± 900 mV Bi-phasischen Impulsen bei einer Frequenz von 250 Hz. ( C ) Das Trainingssignal besteht aus 40 Pulszügen, die alle 2 s vergeben werden. Abbildung geändert aus Referenz 15 ."_blank"> Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 8 : Darstellung der "L" -Form-Konfiguration. Quadrate repräsentieren einzelne Elektroden von einer MEA. Blaue Quadrate zeigen Elektroden an, die für die Stimulation verwendet werden, während alle anderen für die Aufzeichnung verwendet werden. Abbildung geändert aus Referenz 15 . Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 9 : Unterscheidungseinheiten von Geräuschen und Stimulationsartefakten. Die mehreren oberen Tafeln ( A - D ) Die gelbe Wellenform ist hier die einzige Einheit. ( E ) Die grüne Wellenform ist die einzige Einheit. ( F ) Beispiel eines Kanals, der von einer Elektrode aufgezeichnet wurde, die auch für die Stimulation verwendet wurde, wobei keine Einheiten aufgrund der Verstärkersättigung vernünftigerweise detektiert werden können. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 10 : Post-Stimulus-Zeit-Histogramm (PSTH). Eine grafische Benutzeroberfläche (siehe Materialtabelle ) zeichnet die PSTHs entsprechend der Benutzereingabe auf ( dh PSTH , voreingestellter PSTH oder individuell)Kanal PSTH), was einen Überblick über das Stimulationsexperiment und einen sofortigen Vergleich zwischen den Post- und Pre-Stimulus-Dateien ermöglicht. Es zeigt auch die anfänglichen versus endgültigen PSTHs; Dies vergleicht die Netzwerkreaktion mit den ersten 6 und den letzten 6 Stimuli. Die GUI führt mehrere andere Funktionen wie Spike-Rate, Inter-Spike-Intervall, Spikes pro Burst, Inter-Burst-Intervall und Burst-Dauer für beide Stimulationsdateien und Dateien mit spontaner Aktivität durch. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 11 : Überblick über die Zellpräparation und Beschichtung. ( A ) Eine E17-schwangere Maus wird mit CO 2 euthanasiert. ( B ) Die Maus ist decapitatEd und der Uterus wird entfernt. ( C ) Die Embryonen werden freigesetzt und enthauptet. ( D ) Das Gehirn wird aus jedem Embryo extrahiert und die frontalen Lappen werden entfernt. ( E ) Die Zellen werden dissoziiert. ( F ) Die dissoziierten Zellen werden in Medium suspendiert. ( G ) Die suspendierten Zellen werden auf 60-Kanal-Multi-Elektroden-Arrays (MEAs) plattiert. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 12 : Neuronale Kulturen auf Mikroelektroden-Arrays. Embryonale Mausneuronen werden auf 60-Kanal-MEAs plattiert, die die gleichzeitige Aufzeichnung der neuronalen Aktivität über das Netzwerk von jeder Elektrode ermöglichen. (Abbildung modifiziertAus Referenz 15 ). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 13 : Sortierprogramm zum Sortieren der Wellenformen aus jedem Kanal. Das Sortierprogramm (siehe Materialtabelle ) lädt eine Datendatei und zeigt alle anfänglich für jeden Kanal erfassten Einheiten an. Eine von mehreren Methoden wird ausgewählt, um Signale bestimmten Einheiten zuzuordnen. In diesem Beispiel wurde der K-Mittel-Clustering-Algorithmus ausgewählt und die gelbe Einheit (mit der Bezeichnung "Einheit a" im unteren Fenster) identifiziert. Ein anderes Programm (siehe Materialtabelle ) wird dann verwendet, um die .nex-Datei in eine .mat-Datei zu exportieren, die die Eingabedatei für die benutzerdefinierte GUI ist (siehe Ong> Werkstofftabelle und Abbildung 10 ). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 14 : Geänderte Netzwerkaktivität in Reaktion auf Stimulation nach einem Trainingszeitraum. Repräsentative Raster-Handlung von acht Elektroden. Die vertikale rote Linie gibt die Zeit des Stimulus an, und die schwarzen Markierungen markieren Aktionspotentiale. Im Vor-Training ( A ) gibt es eine sofortige Reaktion auf den Stimulus-Puls über Kanäle. Im Posttraining ( B ) zeigt das Netzwerk eine verlängerte Aktivitätsreaktion sowie die sofortige Reaktion auf die Stimulation 15 ..jove.com / files / ftp_upload / 55726 / 55726fig14large.jpg "target =" _ blank "> Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 15 : Ausgebildete Netzwerke haben signifikant veränderte Spike-Frequenzen. Die Häufigkeit des Netzes, das für die Steuerungsnetze spritzt, wird berechnet, indem die Anzahl der Spikes über 50 ms unmittelbar nach jeder Stimulation und Division durch diesen Zeitraum integriert wird. Dargestellt ist der Durchschnitt von 12 trainierten und 10 Kontrollnetzwerken (die Fehlerbalken zeigen den Standardfehler des Mittelwertes an). Das Sternchen (*) gibt eine statistische Differenz ( p-Wert <0,05) zwischen den beiden Datensätzen an. Abbildung geändert aus Referenz 15 . Bitte klicken Sie hier um eine lar zu sehenVersion dieser Figur.

Abbildung 16 : Synaptisch vermittelte Responses werden in trainierten Netzwerken signifikant modifiziert. ( A ) Die Spike-Zuverlässigkeit, gemessen in 10 ms-Bins und normalisiert auf die Steuerungsnetze, zeigt keine Änderung für die direkte Aktivierung von Neuronen in der Nähe von Elektroden (0-20 ms). Es gibt also keinen statistischen Unterschied zwischen Kontrollen und ausgebildeten Netzwerken für diese Bins. Auf der anderen Seite werden die länger-Latenz-Reaktionen (30-50 ms) synaptisch vermittelt, was anzeigt, dass diese Methode eine detailliertere Untersuchung der Zuverlässigkeit als in Abbildung 15 vorsieht. ( B ) Die Populationsspike-Frequenz wiederholt das Verhalten der Zuverlässigkeit und zeigt keine Modifikation für die direkte Aktivierung (0-20 ms), während ein statFür die längerfristigen Reaktionen (30-50 ms) wird ein signifikanter Unterschied festgestellt. Dieses Verhalten steht im Einklang mit den gemittelten Ergebnissen in der vorherigen Abbildung 15 . Die Fehlerbalken sind der Standardfehler des Mittelwerts, berechnet für 10 Steuerungsnetzwerke und 12 geschulte Netzwerke. (*) P-Wert <0,05; (**) p-Wert <0,001. Abbildung geändert aus Referenz 15 . Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.
| Menge | Artikel |
| 1 | Autoklavierte Glasreagenzflasche (mindestens 100 mL) |
| 20 | 15 ml sterile Zentrifugenröhrchen |
| 1 | 10 ml sterile serologische Pipette |
| 4 | 25 ml sterilE serologische pipette |
| 2 | 50 ml sterile serologische Pipette |
| 1 | Zentrifugenröhrchen |
| 150 mL | Steriles DI-Wasser |
| 5 mg | Poly-D-lysin-Durchstechflasche |
Tabelle 1: PDL-Vorbereitung - Liste der Materialien und Reagenzien.
| Menge | Artikel |
| 1 | 50 ml sterile Zentrifugenröhrchen |
| 10 | 15 ml sterile Zentrifugenröhrchen |
| 2 | 1 ml sterile serologische Pipette |
| 2 | 50 ml sterile serologische Pipette |
| 1 | Zentrifugenröhrchen |
| 1 mL | PhosphatPuffersalzlösung (PBS) |
| 1 mg | Laminin |
Tabelle 2: Lamininpräparation - Liste der Materialien und Reagenzien.
| Menge | Artikel |
| 1 | Autoklavierte Glasreagenzflasche (mindestens 100 mL) |
| 20 | 15 ml sterile Zentrifugenröhrchen |
| 1 | 10 ml sterile serologische Pipette |
| 4 | 25 ml sterile serologische Pipette |
| 2 | 50 ml sterile serologische Pipette |
| 1 | Zentrifugenröhrchen |
| 150 mL | Steriles DI-Wasser |
| 5 mg | Poly-D-lysin-Durchstechflasche |
Tabelle 3: Speichermedium Vorbereitung - Liste der Materialien und Reagenzien.
| Menge | Artikel |
| 44 ml | DMEM mit einer stabilen Form von L-Glutamin (siehe Tabelle der Materialien) |
| 1 mL | Serumfreie Ergänzung für neuronale Zellkultur (siehe Tabelle der Materialien) |
| 2,5 ml | Pferdeserum |
| 100 & mgr; l | Ascorbinsäure [4 mg / ml] |
| 2,5 ml | Fetales Rinderserum (FBS) |
| 0,5 ml | Pen Strep (optional) |
| 1 | 50 ml sterile Zentrifugenröhrchen |
| 2 | 25 ml sterile serologische Pipette |
| 2 | 10 ml sterile serologische Pipette |
| 2 | 1 ml sterile serologische Pipette |
| 1 | 250 mL Filter |
Tabelle 4: DMEM 5/5 Medium Vorbereitung - Liste der Materialien und Reagenzien.
| Menge | Artikel |
| 49 mL | DMEM mit einer stabilen Form von L-Glutamin (siehe Tabelle der Materialien) |
| 1 mL | Serumfreie Ergänzung für neuronale Zellkultur (siehe Tabelle der Materialien) |
| 100 & mgr; l | Ascorbinsäure [4 mg / ml] |
| 0,5 ml | Pen Strep (optional) |
| 1 | 50 ml sterile Zentrifugenröhrchen |
| 2 | 25 ml sterile serologische Pipette |
| 2 | 1 ml sterile serologische Pipette |
| 1 | 250 mL Filter |
Tabelle 5: DMEM + Medium Vorbereitung - Liste der Materialien und Reagenzien.
| Menge | Artikel |
| 1 | Papain 140 U / Durchstechflasche |
| 1 | Dnase 1.260 U / Durchstechflasche |
| 7 mL | DMEM + (gekühlt) |
| 5 ml | DMEM 5/5 (erwärmt) |
| 10 & mgr; l | Trypanblau |
| 2 | Skalpellklingen |
| 1 | 35 mm sterile Petrischale |
| 4 | 15 ml sterile Zentrifugenröhrchen |
| 2 | 5 ml sterile Kryo-Rohre |
| 2 | 2 ml sterile Kryo-Röhrchen |
| 1 | 50 ml sterile Zentrifugenröhrchen |
| 1 | Mikrozentrifugenröhrchen |
| 2 | Große Bohrung Transferpipette |
| 3 | Kleine Bohrung Transferpipette |
| 5 | 2 ml sterile serologische Pipette |
| 5 | 1 ml sterile serologische Pipette |
| 2 | 10 μl sterile Mikropipettenspitzen |
| 1 | 1000 μl sterile Mikropipettenspitzen |
| 1 | Hemocytometer-Chip |
Tabelle 6: Zelldissoziation - Liste der Materialien und Reagenzien