alle Verfahren, die Mäuse wurden von der University of Colorado-Anschutz Medical Campus institutionelle Animal Care und Use Committee genehmigt (91813(05)1D).
1. Tag1: primäre (1°) Immunostaining mit Bovine Serum Albumin (BSA) Blockierung
- an der Luft trocknen Gefrierschnitte Maus Megalosauridae Muskel (z. B. m. Tibialis anterior, Soleus) montiert auf aufgeladene Folien für ~ 30 min 11. zeichnen Sie einen Rahmen um die Abschnitte, die mit einem Stift hydrophobe Barriere PAP.
- Ort ~ 250 µL 5 % BSA/Phosphat gepufferte Kochsalzlösung (BSA/PBS) auf jeder Folie, unspezifische Antikörperbindung zu blockieren. Inkubieren Sie Folien bei Raumtemperatur für 1 h
- Beim Blocken, bereiten 01:50 Verdünnungen des 1° Antikörpers Überstand in 5 % BSA/PBS (alle Maus monoklonale Antikörper sind; siehe Tabelle 1- 6 ,- 12) 250 µL vorbereiten Lösung pro Folie. ICE 1° Antikörper Aktien und Verdünnungen behalten
Tabelle 1: Primärantikörper verwendet, um zu unterscheiden MyHCs.
- nach Aspiration von 5 % BSA/PBS blockierende Lösung hinzufügen 250 µL 1° Antikörper Verdünnung auf die entsprechenden Folien. Fügen Sie 250 µL 5 % BSA/PBS, sekundäre (2°) Antikörper nur negative Kontrolle gleitet.
- Inkubation bei 4 ° C für 24-48 h in einer feuchten Umgebung.
Hinweis: Eine Petrischale in Alufolie mit angefeuchtetes Filterpapier bedeckt als eine geeignete Inkubationszeit Kammer dienen können.
2. Tag 2:2 ° Immunostaining mit fluoreszierenden Antikörpern
- Aspirieren 1° Antikörperlösung oder 5 % BSA/PBS Kontrolllösung. Waschen alle Folien drei Mal 10 min mit 5 % BSA.
- Beim Waschen, vorbereiten 1: 200 Verdünnungen der gereinigten, Fluorophor konjugiert 2° Antikörper in 5 % BSA/PBS (siehe Tabelle 2, alle sind Ziege Anti-Maus). Bereiten Sie 250 µL Lösung pro Folie. Halten Sie 2° Fluorophor-konjugierten Antikörpern im Dunkeln auf Ice
Tabelle 2: Fluorophor-konjugierten Sekundärantikörper verwendet, um zu visualisieren primären Antikörper Anerkennung von MyHCs.
- nach Aspiration der dritten Anwendung von 5 % BSA/PBS blockierende Lösung, 250 µL 2° Antikörper Verdünnung auf alle Folien hinzufügen. 90 min bei Raumtemperatur in einem dunklen, feuchten Umgebung inkubieren.
- Aspirat 2° Antikörperlösung. Waschen alle Folien drei Mal 10 min mit 5 % BSA/PBS.
- Spülen mit PBS. Für 10 min. trocken
- Montieren das Deckglas mit eine befristete, niedrigviskose wässrige Eindeckmedium.
- Nach dem Trocknen die Folie Schnittflächen mit Nagellack versiegeln. Trocknen und bewahren Sie in einem dunklen Slidebox.
3. Folien mit Epifluoreszenz Microscopy Imaging
- reinigen Sie die Folien mit einem kleinen, 70 % Ethanol getränkten Lab-abwischen.
- Erhalten digitale Bilder von Immunostained Muskel Abschnitte mit einem Epifluoreszenz-Mikroskop mit einem fotografischen Apparat (siehe die Tabelle der Materialien) ausgestattet.
- Wählen Sie einen Bereich von ungefähr 1 mm 2 (10 X Objektiv, 1,4 NA).
- Ansicht Alexa 488 konjugiert 2° Antikörper Fluoreszenz über eine 505 nm lang-Pass-Filter. Anzeigen der Fluoreszenz durch Anregung von Alexa 594 konjugiert 2° Antikörper über einen 595 nm lang-Pass-Filter erzeugt. Digitalisieren von Bildern mit einem PC-Computer mit einem kompatiblen imaging-Software ausgestattet. Gehören die Maßstabsleiste von imaging-Software für die spätere Analyse.
4. Analyse von Bildern mit Fidschi
Hinweis: bevor Sie mit der Analyse, Fidschi (frei von den National Institutes of Health, Bethesda, MD erhältlich) über https://imagej.net/Fiji/Downloads installiert werden muss. Auch, wird das Makro in diesem Prozess verwendet in der Ergänzenden Datei bereitgestellt. Legen Sie die Makrodatei in einem leicht zugänglichen Verzeichnis.
- Last ein Hellfeld Bild eines ausgewählten Bereichs in Fidschi. Navigieren Sie zu Plugins → Segmentierung → trainierbar Weka Segmentierung.
- Um die zelluläre Bereiche des Abschnitts, vorschreiben zeichnen Sie eine Linie auf einer Faser, und klicken Sie auf " Klasse 1 hinzufügen ". Dann zeichnen Sie eine Linie auf den Raum zwischen den Fasern, und klicken Sie auf " Klasse 2 hinzufügen " anlässlich der extrazellulären Domänen. Wiederholen Sie, bis in jeder Klasse gibt es 5-10 Etiketten.
- Klick Zug Sichter. Auf die daraus resultierenden roten und grünen Overlay mehr Beschriftungen manuell hinzufügen (siehe Punkt 4.2), nicht falsch segmentierte Stücke des Bildes, wenn nötig. Wiederholen Sie, bis die Fasern (rot) aus dem Raum zwischen den Fasern (grün) entsprechend getrennt werden.
- Klicken Sie " erhalten Wahrscheinlichkeit " und speichern Sie das Bild in einem neu beschrifteten Ordner.
- Wiederholen Sie das oben beschriebene Verfahren (Schritte 4.2 4.3) mit dem fluoreszierenden Bild vom gleichen Feld übernommen. Beschriften Immunostained Fasern als " Klasse 1 " und alle nicht-fluoreszierende Regionen als " Klasse 2 ". Speichern Sie die resultierende Wahrscheinlichkeit Karte im selben Ordner wo das verarbeitete Hellfeld-Bild gespeichert.
- Öffnen Sie eine der zuvor gespeicherten Wahrscheinlichkeit Karten in Fidschi. Zeichnen einer geraden Linie auf der Skala von der imaging-Software zur Verfügung gestellt. Gehe zu analysieren → Maßstab festlegen. Ändern Sie die Parameter (d.h., bekannten Abstand und Einheit der Länge) auf ihre entsprechenden Werte als von der Maßstabsleiste gegeben, dann überprüfen Sie die " Global " Feld, um den Maßstab für jedes Bild zu standardisieren.
- Navigieren zu Plugins → Makros → laufen → Tyagi Et Al. Faser Quantifizierung macro.ijm (siehe die Zusätzliche Datei). Sofort erscheint ein Navigationsbereich. Öffnen Sie das Bild ' s Host Ordner; ein Dialogfeld wird angezeigt. Für jedes Dialogfeld ändern Sie die " Hintergrund " Dropdown-Wert zu " Licht. "
Hinweis: der Ordner wird nun mit Bildern der Faser Umrisse und Tabellenkalkulationsdateien Software der Ergebnisse (CSA und Feret Durchmesser sind am relevantesten, gefüllt Quantifizierung der Faser Morphologie; gemessenen Parameter gesetzt Messungen analysieren einstellbar). Faser Morphologie Daten generiert durch die Pore-Analysefunktion von Fidschi Tabellenkalkulation Software-Dateien für beide Leuchtstoff- und hellen Bereich Bilder automatisch übertragen werden.
- Berechnet den Anteil der Fasern mit dem Ausdruck einer bestimmten MyHC in einem Feld dividiert die Anzahl der Fluoreszierende Fasern im Feld durch die Anzahl der insgesamt Fasern in das entsprechende Hellfeld Bild.