Ein Abonnement von JoVE ist erforderlich, um diesen Inhalt anzuzeigen. Melden Sie sich an oder beginnen Sie noch heute mit einer kostenlosen Testphase.

Methodenartikel

Myosin-spezifische Anpassungen von In-vitro-Fluoreszenzmikroskopie-basierten Motilitätsassays

5.7K Aufrufe

⸱

DOI:

10.3791/62180

⸱

4. Februar 2021

 ,  ,  ,  , 

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Hier wird ein Verfahren zur Exprimisierung und Reinigung von Myosin 5a vorgestellt, gefolgt von einer Diskussion seiner Charakterisierung, wobei sowohl Ensemble- als auch Einzelmolekül-In-vitro-Fluoreszenzmikroskopie-basierte Assays verwendet werden, und wie diese Methoden für die Charakterisierung von nichtmuskleärem Myosin 2b modifiziert werden können.

Zusammenfassung

Myosinproteine binden und interagieren mit filamentösem Aktin (F-Aktin) und kommen in Organismen im gesamten phylogenetischen Baum vor. Ihre Struktur und enzymatischen Eigenschaften sind an die jeweilige Funktion angepasst, die sie in Zellen ausführen. Myosin 5a geht prozessiv auf F-Aktin, um Melanosomen und Vesikel in Zellen zu transportieren. Umgekehrt fungiert das nichtmusklele Myosin 2b als bipolares Filament mit etwa 30 Molekülen. Es bewegt F-Aktin der entgegengesetzten Polarität in Richtung des Zentrums des Filaments, wo die Myosinmoleküle asynchron arbeiten, um Aktin zu binden, einen Kraftschlag zu verleihen und zu dissoziieren, bevor sie den Zyklus wiederholen. Nichtmuskleles Myosin 2b hat zusammen mit seinen anderen nichtmuskleären Myosin-2-Isoformen Rollen, die Zelladhäsion, Zytokinese und Spannungserhaltung umfassen. Die Mechanochemie von Myosinen kann durch die Durchführung von In-vitro-Motilitätstests mit gereinigten Proteinen untersucht werden. Beim Gleitaktinfilament-Assay werden die Myosine an eine mikroskopisch kleine Decklip-Oberfläche gebunden und translozieren fluoreszierend markiertes F-Aktin, das verfolgt werden kann. Im Einzelmolekül/Ensemble-Motilitätstest wird F-Aktin jedoch an einen Coverslip gebunden und die Bewegung fluoreszierend markierter Myosinmoleküle auf dem F-Actin beobachtet. In diesem Bericht wird die Aufreinigung von rekombinantem Myosin 5a aus Sf9-Zellen mittels Affinitätschromatographie skizziert. Im Anschluss skizzieren wir zwei fluoreszenzmikroskopiebasierte Assays: den Gleit-Aktin-Filament-Assay und den Inverted Motility Assay. Aus diesen Assays können Parameter wie Aktintranslokationsgeschwindigkeiten und Einzelmoleküllauflängen und -geschwindigkeiten mit der Bildanalysesoftware extrahiert werden. Diese Techniken können auch angewendet werden, um die Bewegung einzelner Filamente der nichtmuskleären Myosin-2-Isoformen zu untersuchen, die hier im Zusammenhang mit nichtmuskleärem Myosin 2b diskutiert werden. Dieser Workflow stellt ein Protokoll und eine Reihe quantitativer Werkzeuge dar, mit denen die Einzelmolekül- und Ensembledynamik von nichtmuskleären Myosinen untersucht werden kann.

Einleitung

Myosine sind Motorproteine, die Kraft auf Aktinfilamente ausüben, indem sie die Energie aus der Adenosintriphosphat (ATP)-Hydrolysenutzen 1. Myosine enthalten eine Kopf-, Hals- und Schwanzdomäne. Die Kopfdomäne enthält die Aktinbindungsregion sowie den Ort der ATP-Bindung und Hydrolyse. Die Halsdomänen setzen sich aus IQ-Motiven zusammen, die an Leichte Ketten, Calmodulin oder Calmodulin-ähnliche Proteinebinden 2,3. Die Schwanzregion hat mehrere Funktionen, die für jede Klasse von Myosinen spezifisch sind, einschließlich, aber nicht beschränkt auf die Dimerisierung von zwei schweren Ket....

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Protokoll

1. Proteinreinigung

  1. Zelllyse und Proteinextraktion
    1. Bereiten Sie einen 1,5-fachen Extraktionspuffer basierend auf Tabelle 1 vor. Filtern und lagern bei 4 °C.
    2. Beginnen Sie mit dem Auftauen der Zellpellets auf Eis. Während die Pellets auftauen, ergänzen Sie 100 ml Extraktionspuffer mit 1,2 mM Dithiothreitol (DTT), 5 μg/ ml Leupeptin, 0,5 μM Phenylmethylsulfonylfluorid (PMSF) und zwei Proteaseinhibitortabletten. Bleibe auf Eis.
    3. Sobald das Pellet aufgetaut ist, fügen Sie 1 ml des ergänzten Extraktionspuffers pro 10 ml Zellkultur hinzu. Wenn die Zellpellets beispielsweise aus 500 ml Zellkultur gebildet wurden, fügen S....

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Ergebnisse

Die Reinigung von Myosin kann durch die Durchführung der Reduktion der Natriumdodecylsulfat-Polyacrylamid (SDS-PAGE)-Gelelektrophorese wie in Abbildung 2gezeigt bewertet werden. Während diese Zahl das letzte, postdialysierte Myosin darstellt, kann SDS-PAGE an Aliquoten aus den verschiedenen Phasen des Reinigungsverfahrens durchgeführt werden, um alle Produkte zu identifizieren, die an den Überstand verloren gehen. Myosin 5a HMM hat ein Band im Bereich von 120-130 kDa und das nicht-muslimisch.......

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Diskussion

Hier wird ein Workflow zur Aufreinigung und In-vitro-Charakterisierung von Myosin 5a und nichtmuskleärem Myosin 2b vorgestellt. Diese Reihe von Experimenten ist nützlich, um die mechanochemischen Eigenschaften von gereinigten Myosinkonstrukten schnell und reproduzierbar zu quantifizieren. Obwohl die beiden hier gezeigten Myosine nur zwei konkrete Beispiele aus den vielen Möglichkeiten sind, können die Bedingungen und Techniken mit etwas Schneiderei auf die meisten Myosine und auf viele andere Motorproteine angewendet wer.......

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Offenlegungen

Die Autoren erklären keinen Interessenkonflikt.

Danksagungen

Wir danken Dr. Fang Zhang für die technische Unterstützung bei der Vorbereitung der Reagenzien, die für die Erfassung dieser Daten verwendet werden. Diese Arbeit wurde durch die NHLBI/NIH Intramural Research Program Fonds HL001786 an J.R.S.

....

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
1 mL SpritzeBD309628
2 M CaCl2 LösungVWR10128-558
2 M MgCl2 LösungVWR10128-298
27 Gauge NadelBecton Dickinson309623
5 M NaCl LösungKD MedicalRGE-3270
EssigsäureThermoFisher Scientific984303
AmylacetatLadd Research Industries10825
Anti-FLAG M2 Affinity GelMillipore SigmaA2220https://www.sigmaaldrich.com/content/dam/sigma-aldrich/docs/Sigma/Bulletin/a2220bul.pdf
ATPMillipore SigmaA7699
Biotinyliertes G-AktinCytoskeleton, Inc.AB07
RinderserumalbuminMillipore Sigma5470
bPEG-silanLaysan Bio, IncBiotin-PEG-SIL-3400-1g
Bradford ReagenzkonzentratBio-Rad5000006
CalmodulinPMID: 2985564
CatalaseMillipore SigmaC40
Cell Line (Sf9) in SF-900 II SFMThermoFisher Scientific11496015http://tools.thermofisher.com/content/sfs/manuals/bevtest.pdf https://tools.thermofisher.com/content/sfs/manuals/bactobac_man.pdf
Zirkuläres Filterpapier - GleittestMillipore SigmaWHA1001125
Zirkuläres Filterpapier - Invertierter AssayMillipore SigmaWHA1001090
cOmplete, EDTA-freie Proteasehemmer-TablettenMillipore Sigma5056489001Dies sollte bei 4 μC gelagert werden. Die Tabletten können direkt verwendet oder als 25-fache Stammlösung rekonstituiert werden, indem 1 Tablette in 2 mL destilliertem Wasser aufgelöst wird. Die resultierende Lösung kann bei 4 Grad gelagert werden. C für 1-2 Wochen oder mindestens 12 Wochen bei -20°C. 
Konzentrationsröhrchen (100.000 MWCO)EMD Millipore CorporationUFC910024Die MWCO des Röhrchens ist nicht unbedingt eine Einheitsgröße, solange die MWCO kleiner ist als das gesamte Molekulargewicht des zu reinigenden Proteins. Das NM2b wurde mit einer 100.000 MWCO-Röhre und das M5a mit einer 30.000 MWCO-Röhre konzentriert.
Coomassie Brilliant Blue R-250 FarbstoffThermoFisher Scientific20278
Deckglas-RackMillipore SigmaZ688568-1EA
strong>Deckgläser: Gleitend wirkender Filament-AssayVWR International48366-227
Deckgläser: Invertierter Motilitäts-Assay Azer ScientificES0107052
Dialyseschlauch (3500 Dalton MCWO)Fischer Scientific08-670-5ADer Durchmesser des Dialyseschlauchs kann variieren, aber der MWCO sollte gleich sein. Das hierin verwendete NM2b wurde in einem 18-mm-Dialyseschlauch dialysiert. Die Röhrchen können in einer 20%igen Alkohollösung bei 4 °C gelagert werden.
DL-DithiothreitolMillipore SigmaD0632
Double-Sided TapeOffice Depot909955
DYKDDDDK PeptideGenScriptRP10586Dies kann in einem Puffer gelöst werden, der 0,1 M NaCl, 0,1 mM EGTA, 3 mM NaN<>3 und 10 mM MOPS (pH 7,2) enthält. Dies kann bei -20 ° C gelagert werden. C wie 300 µ L aliquots. 
EGTAMillipore SigmaE4378
Elution ColumnBio-Rad761-1550Diese können wiederverwendet werden. Spülen Sie die Säule zum Reinigen mit 2-3 Säulenvolumina PBS und destilliertem Wasser. Kühlen Sie die Säule bei 4°; C vor Gebrauch.
EthanolFischer ScientificA4094
G-AktinPMID: 4254541G-Aktin-Bestand kann bei 200 μm gelagert werden; M in Flüssigkeit N2.
GlucoseMillipore SigmaG8270
GlucoseoxidaseMillipore SigmaG2133
Glycin Pufferlösung, 100 mM, pH 2-2,5, 1 LSanta Cruz Biotechnologysc-295018
HaloTagPromegaG100A
HClMillipore Sigma320331
KClFischer ScientificP217-500
Pipettenspitzen mit großer ÖffnungFischer Scientific02-707-134
Leupeptin-Protease-InhibitorThermoFisher Scientific78435
Mark12 Ungefärbte StandardleiterThermoFisher ScientificLC5677
MethanolMilliporeSigma MX0482
MethylcelluloseMillipore SigmaM0512
ObjektträgerFischer Scientific12-553-10
MOPSFischer ScientificBP308-100<
strong>mPEG-silaneLaysan Bio, IncMPEG-SIL-2000-1g
Myosin Light Chain KinasePMID: 23148220FLAG markiertes MLCK kann auf die gleiche Weise gereinigt werden, wie das FLAG-markierte Myosin hier gereinigt wurde.
NaN3Millipore SigmaS8032
NeutrAvidinThermoFisher Scientific31050
NitrocelluloseLadd Research Industries10800<
NuPAGE 4 bis 12% Bis-Tris Mini Protein Gel, 15-wellThermoFisher ScientificNP0323PK2
NuPAGE LDS-Probenpuffer (4X)ThermoFisher ScientificNP0007
Phosphatgepufferte Kochsalzlösung, pH 7,4ThermoFisher Scientific10010023
PMSFMillipore Sigma78830PMSF kann als 0,1 M Stammlösung in Isopropanol hergestellt und in 4 μC gelagert werden. Die Zugabe von Isopropanol führt zu einer Kristallfällung, die durch Rühren bei Raumtemperatur aufgelöst werden kann. Unmittelbar vor der Verwendung kann PMSF tropfenweise zu einer schnell rührenden Lösung bis zu einer Endkonzentration von 0,1 mM hinzugefügt werden.
RasierklingenOffice Depot397492
Rhodamine-PhalloidinThermoFisher ScientificR415Stock kann in 100% Methanol auf eine Endkonzentration von 200 μm verdünnt werden.
Sf9 MediaThermoFisher Scientific12658-027Dies sollte bei 4°C gelagert werden. Die Haltbarkeit beträgt 18 Monate ab Herstellungsdatum.
Gewebekulturschale - GleittestCorning353025Jede Gewebekulturschale kann ca. neun Deckgläser aufnehmen.
Gewebekulturschale - Invertierter AssayCorning353003Jede Gewebekulturschale kann ca. vier Deckgläser aufnehmen.
Glatt 200 & Mikro; L PipettenspitzenThomas Scientific1158U38
EQUIPMENT
ZentrifugeThermoFisher Scientific75006590
MikroskopNikonModell: Eclipse Ti mit H-TIRF-System mit 100x TIRF Objektiv (N.A. 1.49)
MikroskopkameraAndorModell: iXon DU888 EMCCD-Kamera (1024 x 1024 Sensorformat)
Mikroskop Environmental Control BoxTokai HITCustom Thermobox
Mikroskop-LasereinheitNikonLU-n4 Vier-Laser-Einheit mit Festkörperlasern für 405 nm, 488 nm, 561 nm und 640 nm
Mid Bench ZentrifugeThermoFisher ScientificModell: CR3i
Misonix SonicatorMisonixXL2020
Optima Max-Xp Tabletop UltracentrifugeBeckman Coulter393315
Plasma-CleanerDiener electronic GmbH + Co. KGSystem Typ: Zepto
Sonicator Probe (3,2 mm)Qsonica4418
Standard InkubatorBinderModell: 56
Waverly Tube MixerWaverlyTR6E
SOFTWARE
ImageJ FIJIhttps://imagej.net/Fiji/Downloads<
strong>FAST (Version 1.01)http://spudlab.stanford.edu/fast-for-automatic-motility-measurementsFAST ist für Mac OSX und Linux basierte Systeme verfügbar.
Image Stabilizer Pluginhttps://imagej.net/Image_Stabilizer
ImageJ TrackMatehttps://imagej.net/TrackMate
<>Imaging SoftwareNIS Elements (AR-Paket)
http://www.cs.cmu.edu/~kangli/code/Image_Stabilizer.html
https://github.com/turalaksel/FASTrack
https://github.com/turalaksel/FASTrack/blob/master/README.md
< mit strong> File:TrackMate-manual.pdf

Referenzen

  1. Sellers, J. R. Myosins: A diverse superfamily. Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Cell Research. 1496 (1), 3-22 (2000).
  2. Cheney, R. E., Mooseker, M. S. Unconventional myosins. Current opinion in cell biology. 4 (1), 27-35 (1992).
  3. Rhoads, A. R., Friedberg, ....

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Nachdrucke und Genehmigungen

Weitere Artikel entdecken

Myosin-Motilitätsassaysgleitende Aktinfilamenteinvertierter MotilitätsassayNicht-Muskel-Myosin 2bMyosin 5a-AufreinigungAktinfilament-TrackingEinzelmoleküldynamikTotalreflexionAffinitätschromatographie