Es gibt zahlreiche intrazelluläre Ereignisse, die mit Aktuatoren, die auf Licht reagieren, manipuliert werden können und die für eine bimodale Aktivierung mit physikalischen und biologischen Lichtquellen zugänglich sind. Im Folgenden finden Sie Beispiele für die Verwendung eines photosensenden Kalzium-Integrators (Ca2+), einer lichtinduzierten Proteintranslokation, eines lichtempfindlichen Transkriptionsfaktors und einer lichtempfindlichen Rekombinase. Die Beispiele veranschaulichen die Möglichkeit, Biolumineszenz zur Aktivierung verschiedener Arten von Photorezeptoren zu verwenden. Die vorgestellten Experimente wurden nicht speziell in Bezug auf die Anwendung von Leuchtdioden (LED), die gewählte Luciferase oder in Bezug auf Konzentrationen und Zeitpunkt der Luciferin-Anwendung optimiert.
Die schnelle licht- und aktivitätsregulierte Expression (FLARE) ist ein optogenetisches System, das die Transkription eines Reportergens mit der Koinzidenz von erhöhtem intrazellulärem Ca2+ und Light23 ermöglicht (Abbildung 4A). Das Vorhandensein von Ca2+ ist erforderlich, um die Protease in die Nähe der Protease-Spaltungsstelle zu bringen, die nur mit Lichtstimulation zugänglich ist, was zur Freisetzung des Transkriptionsfaktors führt. HEK293-Zellen wurden zusammen mit den ursprünglichen FLARE-Komponenten, einem dualen Firefly (FLuc)-dTomato-Reporter-Konstrukt und einer membranverankerten Gaussia luciferase-Variante sbGLuc6 transfiziert. In Gegenwart von erhöhtem intrazellulärem Ca2+ durch die Exposition von Zellen bei 2 μM Ionomycin und 5 mM Calciumchlorid (CaCl2) führte die Anwendung von blauer LED zu einer robusten Expression des Fluoreszenzreporters im Vergleich zu Zellen, die im Dunkeln gelassen wurden, sowie zu der Expression von FLuc, die durch Messung der Lumineszenz unter Zugabe des FLuc-Substrats bestimmt wurde. D-Luciferin. Ähnliche FLuc-Expressionsniveaus wurden mit Biolumineszenz erreicht, die von sbGLuc bei der Anwendung des sbGLuc-Substrats (CTZ) zusammen mit Ionomycin und CaCl2 emittiert wurde. Beachten Sie, dass die Luciferasen, die zur Lichtaktivierung (sbGLuc) und zur Meldung der Wirkung der Lichtaktivierung (Transkription von FLuc) verwendet werden, nur Licht mit ihren jeweiligen Luciferinen (CTZ vs. D-Luciferin) erzeugen und nicht kreuzreagieren.
Verschiedene Komponenten wurden kombiniert, um ein lichtinduziertes Transkriptionssystem zu erzeugen, das auf der Heterodimerisierung von Kryptochromen basiert23,24 (Abbildung 4B). CRY2 wurde zu einer Protease verschmolzen, während das membrangebundene CIB mit der Protease-Spaltungsstelle und dem Transkriptionsfaktor verschmolzen wurde. Die lichtinduzierte Proteintranslokation setzte den Transkriptionsfaktor frei, was zur Expression von FLuc und dTomato führte, wie in Abbildung 4A gezeigt. Während das Vorhandensein der Transkriptionsfaktorkomponente allein zu einem erheblichen Hintergrundsignal führte, möglicherweise aufgrund einer spontanen Proteolyse, erhöhten sowohl das physikalische Licht (LED) als auch die Biolumineszenz (CTZ) die Expression von FLuc, gemessen in einem in vivo Bildgebungssystem (IVIS), robust.
In einer anderen Reihe von Experimenten wurde NanoLuc (Luciferin: Furimazin oder hCTZ) für die optogenetische Regulation der Transkription durch die Dimerisierung von CRY / CIB und dem photosensitiven Transkriptionsfaktor EL22225,26,27 eingesetzt. Abbildung 5A,B zeigt die Schaltpläne der verschiedenen Komponenten im dunklen und hellen Zustand und der Luziferase, die mit dem Lichtsensor co-transfiziert oder verschmolzen wird. Verschiedene Vergleiche sind in Abbildung 5C dargestellt. Biolumineszenz, induziert durch Zugabe von hCTZ zu HEK293-Zellen, die die Konstrukte exprimieren und nach 15 Minuten entfernen, war bei der Transkription von Reportern effizienter als 20 Minuten LED-Lichtexposition für CRY/CIB und EL222. Für CRY/CIB reichte eine Stunde LED-Belichtung aus, um ein Transkriptionsniveau zu erreichen, das mit 15 Minuten Biolumineszenz vergleichbar ist. Im Gegensatz dazu waren bei EL222 selbst 60 Minuten LED kaum halb so effektiv wie eine kurze Exposition gegenüber Biolumineszenz. Es gab keine signifikanten Unterschiede in der Transkriptionswirksamkeit zwischen den beiden Systemen, wenn sie co-transfiziert wurden, obwohl die Fusionsproteine von CRY/CIB effizienter waren als die von EL222. Für beide Systeme führten die Fusionsproteine zu signifikant höheren Transkriptionsraten als die co-transfizierten Komponenten. CRY/CIB zeigte im Vergleich zu EL222, das eine vernachlässigbare Hintergrundtranskription aufwies, durchweg höhere Hintergrundwerte bei der Fahrzeuganwendung. Steigende Konzentrationen von hCTZ allein hatten keinen Einfluss auf die Transkription des Reportergens.
Photoaktivierbare Rekombinasen bieten ein vielseitiges Werkzeug für optogenomische Manipulationen. Wir testeten die Biolumineszenzaktivierung einer lichtempfindlichen Split-Cre-Rekombinase basierend auf dem Vivid-LOV-Protein iCreV28. Abbildung 6A zeigt ein Schema der verschiedenen Komponenten, sbGLuc, iCreV und einen lox-stop-lox Fluoreszenzreporter (tdTomato) vor und nach der Anwendung von CTZ. Die Ergebnisse der CTZ-Anwendung in Bezug auf Steuerungen (keine CTZ oder LED) sind in Abbildung 6B dargestellt. Es gibt einige Hintergrundausdrücke auch im Dunkeln (kein CTZ); In Gegenwart von CTZ wird die Expression jedoch robust über den Hintergrund erhöht und ähnelt der mit der LED-Anwendung induzierten.

Abbildung 1: Lichtversiegelter Inkubator. Kartonklappe, die das Licht des beleuchteten Bedienfelds bedeckt (oberer Pfeil). Lichtundurchlässige Abdeckung über der Glastür des Inkubators (unterer Pfeil), um die Zellen vor Lichteinwirkung zu schützen. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 2: Laminar-Flow-Haube, die von rotem Licht beleuchtet wird. Setup, das eine Standard-Laminar-Flow-Gewebekulturhaube zeigt, die von rotem Licht beleuchtet wird. Pfeil zeigt eine Standard-Desktop-Lampe mit einer roten Glühbirne an. Alle Manipulationen unter rotem Licht werden in einem ansonsten dunklen, lichtdichten Raum durchgeführt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 3: Lichtdichte Fächer um lebendzellige Bildgebungsmikroskope. Zwei Beispiele für Live-Cell-Imaging-Mikroskop-Setups, die die Verwendung entweder einer festen Box mit Kunststoffvorhängen nur auf der Vorderseite (linke Panels: oben und unten) oder schwarzen Vorhängen rund um das Imaging-Setup (rechte Panels: oben und unten) zeigen. Die Frontseiten in beiden Beispielen bleiben offen und aufgerollt, wenn sie nicht verwendet werden (obere Panels: links und rechts). Die vorderen schwarzen Vorhänge sind nach unten gerollt, um zu verhindern, dass Licht im Raum (z. B. Computerbildschirme) in den Bildgebungsbereich gelangt, wenn eine Biolumineszenzstimulation und/oder Bildgebung mit lebenden Zellen durchgeführt wird (untere Panels: links und rechts). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 4: Biolumineszenz zur Integration intrazellulärer Signalereignisse. (A) Schaltpläne der mit sbGLuc ko-transfizierten FLARE-Komponenten. In Gegenwart von Ca2+ und der daraus resultierenden Nähe der Protease zur Protease-Spaltungsstelle führt entweder Biolumineszenz oder LED zur Entfaltung von LOV, zur Exposition der Spaltstelle und zur Freisetzung des Transkriptionsfaktors. Die Zellen wurden LED (Tastverhältnis 33%, 2 s ein/4 s aus für 40 min; 3,5 mW Lichtleistung, 4,72 mW/cm2 Bestrahlungsstärke ) oder Biolumineszenz (100 μM CTZ Endkonzentration für 15 min) ausgesetzt oder im Dunkeln gelassen. Mikroskopische Aufnahmen von HEK293-Zellen, die die oben genannten Komponenten nach der Behandlung exprimieren, um den Ca2+- Spiegel und die Exposition gegenüber LED zu erhöhen (links). FLuc-Lumineszenz, gemessen in einem Luminometer, das die Exposition bei LED, Biolumineszenz (CTZ) oder links im Dunkeln (rechts) vergleicht. (B) Schematische Darstellung eines nicht Ca2+-abhängigen Transkriptionssystems, das mit sbGLuc co-transfiziert wurde. HEK293-Zellen in 4-Well-Platten wurden mit vier verschiedenen Anordnungen von Komponenten transfiziert, wie im Schaltplan dargestellt. Die Platten wurden entweder LED (Tastverhältnis 33%, 2 s ein/4 s aus für 40 min; 3,5 mW Lichtleistung, 4,72 mW/cm2 Bestrahlungsstärke ) oder Biolumineszenz (100 μM CTZ Endkonzentration) durch Zugabe von CTZ und 15 min eingeschaltet; Die Steuerplatten wurden im Dunkeln gelassen. Die Transkription des FLuc-Reporters wurde in einem IVIS gemessen. IVIS-Bilder von repräsentativem Geschirr sind auf der linken Seite gezeigt; Strahlungsmessungen von mehreren Replikaten, die auf die dunklen Bedienelemente basieren, sind auf der rechten Seite dargestellt. Maßstabsleiste = 100 μm. Abkürzungen: FLARE = Fast light- and activity-regulated expression; LOV = Licht-Sauerstoff-Spannungs-Erfassung; LED = Leuchtdiode; CTZ = Coelenterazin; FLuc = Glühwürmchen-Luciferase; dTom = dTomato; CRY2 = Kryptochrom 2; CRY2PHR = CRY2-Photolyase-Homologie-Region; CIB1 = Ca2+- und Integrin-bindendes Protein 1; CIBN = N-Terminus von CIB1; IVIS = in vivo Bildgebungssystem. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 5: Biolumineszenz für die treibende Transkription . (A) Schematische Darstellung zweier photoaktivierbarer Transkriptionssysteme in ihrem dunklen und hellen Zustand. (B) NanoLuc wurde entweder co-transfiziert oder mit den abgebildeten lichtempfindlichen Einheiten verschmolzen (N-NanoLuc-CRY-GalDD-C; N-NanoLuc-VP16-EL222-C). (C) Vergleiche beider Systeme in Bezug auf Lichtquellen, Konstruktdesign und Signal-Rauschen. Die Zellen wurden einer LED (Tastverhältnis 33%, 2 s Ein/4 s aus für 40 min; 3,5 mW Lichtleistung, 4,72 mW/cm2 Bestrahlungsstärke) oder einer Biolumineszenz für 15 min (100 μM hCTZ Endkonzentration; außer wenn unterschiedliche Konzentrationen festgestellt werden) ausgesetzt. Dunkle Platten wurden im Inkubator zwischen der anfänglichen Umwandlung von Plasmiden und der FLuc-Messung unberührt gelassen; VEH, Kennzeichen wurden genauso behandelt wie diejenigen, die hCTZ erhielten, aber stattdessen erhielten sie Fahrzeuge. Unterschiede in den Transkriptionsniveaus: hCTZ, co-transfizierte CRY vs. EL222 - nicht signifikant; hCTZ, Luciferase - Photoproteinfusion CRY vs. EL222 - p < 0,005; hCTZ, CRY Co-Transfection vs. Fusion - p < 0,005; hCTZ, EL222 Co-Transfektion vs. Fusion - p < 0,01; Fahrzeug, CRY vs. EL222 - p < 0,05. Abkürzungen: UAS = Upstream Activating Sequence; LED = Leuchtdiode; CTZ = Coelenterazin; FLuc = Glühwürmchen-Luciferase; CRY = Kryptochrom; CIB = Ca2+- und Integrin-bindendes Protein; VEH = Fahrzeug. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 6: Biolumineszenz für die optogenomische Manipulation. (A) Schematische Darstellung der biolumineszenzgetriebenen optogenomischen Manipulation unter Verwendung von sbGLuc, den gespaltenen iCreV-Komponenten und einer LSL-Reporterkassette vor und nach der Anwendung von Licht. (B) HEK293-Zellen wurden mit Plasmiden lipofektiert und dann im Dunkeln gehalten. Vierundzwanzig Stunden später wurden die Zellen 30 min lang mit nur Medium (kein CTZ) oder mit CTZ (100 μM Endkonzentration) oder mit LED (Tastverhältnis 25%, 5 s on/15 s off für 5 min; 14,81 mW Lichtleistung, 20 mW/cm2 Bestrahlungsstärke) als Positivkontrolle behandelt. Mikroskopische Aufnahmen der tdTomato-Fluoreszenz unter Verwendung der angegebenen Bedingungen. Maßstabsleiste = 100 μm. Abkürzungen: LSL = lox-stop-lox; CTZ = Coelenterazin; LED = Leuchtdiode; VVD = Lebendig. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Tabelle 1: Biolumineszenzaktivierung von Photorezeptoren. Bitte klicken Sie hier, um diese Tabelle herunterzuladen.
Tabelle 2: Richtlinien für die Beschichtung und Transfektion von Zellen in verschiedenen Formaten. Bitte klicken Sie hier, um diese Tabelle herunterzuladen.
Tabelle 3: Verhältnisse verschiedener Plasmide für die Transfektion. Bitte klicken Sie hier, um diese Tabelle herunterzuladen.
Tabelle 4: Injektionswege, -volumina und -konzentrationen von Luciferin für In-vivo-Anwendungen (25 g Maus). Bitte klicken Sie hier, um diese Tabelle herunterzuladen.