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Methodenartikel

Kombination von menschlichen Organoiden und Organ-on-a-Chip-Technologie zur Modellierung der intestinalen regionsspezifischen Funktionalität

26K Ansichten

DOI:

10.3791/63724

5. Mai 2022

* These authors contributed equally

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Biopsie-abgeleitete Darmorganoide und Organ-on-a-Chips-Technologien werden zu einer mikrophysiologischen Plattform kombiniert, um die regionsspezifische Darmfunktionalität zu rekapitulieren.

Zusammenfassung

Die Darmschleimhaut ist eine komplexe physikalische und biochemische Barriere, die eine Vielzahl wichtiger Funktionen erfüllt. Es ermöglicht den Transport, die Aufnahme und den Stoffwechsel von Nährstoffen und Xenobiotika und erleichtert gleichzeitig eine symbiotische Beziehung mit der Mikrobiota und begrenzt die Invasion von Mikroorganismen. Die funktionelle Interaktion zwischen verschiedenen Zelltypen und ihrer physikalischen und biochemischen Umgebung ist für die Etablierung und Aufrechterhaltung der Homöostase des Darmgewebes von entscheidender Bedeutung. Die Modellierung dieser komplexen Wechselwirkungen und der integrierten Darmphysiologie in vitro ist ein gewaltiges Ziel mit dem Potenzial, die Art und Weise, wie neue therapeutische Ziele und Arzneimittelkandidaten entdeckt und entwickelt werden, zu verändern.

Organoide und Organ-on-a-Chip-Technologien wurden kürzlich kombiniert, um humanrelevante Darmchips zu erzeugen, die geeignet sind, die funktionellen Aspekte der Darmphysiologie und Pathophysiologie in vitro zu untersuchen. Organoide, die aus den Biopsien des Dünndarms (Zwölffingerdarm) und des Dickdarms gewonnen werden, werden in das obere Kompartiment eines Organchips gesät und dehnen sich dann erfolgreich als Monoschichten aus, während die unterschiedlichen zellulären, molekularen und funktionellen Merkmale jeder Darmregion erhalten bleiben. Gewebespezifische mikrovaskuläre Endothelzellen des menschlichen Darms werden in das untere Kompartiment des Organchips integriert, um die epithelial-endotheliale Schnittstelle nachzubilden. Diese neuartige Plattform erleichtert die luminale Exposition gegenüber Nährstoffen, Medikamenten und Mikroorganismen und ermöglicht Untersuchungen des Darmtransports, der Permeabilität und der Wirt-Mikroben-Interaktionen.

Hier wird ein detailliertes Protokoll für die Etablierung von Darmchips, die den menschlichen Zwölffingerdarm (Zwölffingerdarmchip) und Dickdarm (Dickdarmchip) darstellen, und deren anschließende Kultur unter kontinuierlicher Strömung und peristaltisartigen Verformungen bereitgestellt. Wir demonstrieren Methoden zur Beurteilung des Arzneimittelstoffwechsels und der CYP3A4-Induktion im Zwölffingerdarmchip anhand prototypischer Induktoren und Substrate. Schließlich bieten wir ein Schritt-für-Schritt-Verfahren für die In-vitro-Modellierung von Interferon-gamma (IFNγ)-vermittelter Barrierestörung (Leaky-Gut-Syndrom) in einem Dickdarmchip an, einschließlich Methoden zur Bewertung der Veränderung der parazellulären Permeabilität, Veränderungen der Zytokinsekretion und transkriptomischer Profilierung der Zellen innerhalb des Chips.

Einleitung

Der menschliche Darm ist ein komplexes und multitaskingfähiges Organ, das sich selbst regenerieren kann. Es ist in den Dünn- und Dickdarm unterteilt. Die Hauptfunktion des Dünndarms besteht darin, die aus dem Magen kommende Nahrung weiter zu verdauen, alle Nährstoffe aufzunehmen und die Rückstände an den Dickdarm weiterzugeben, der das Wasser und die Elektrolyte zurückgewinnt. Der Dünndarm ist weiter in mehrere anatomisch unterschiedliche Regionen unterteilt: Zwölffingerdarm, Jejunum und Ileum, von denen jede angepasst ist, um bestimmte Funktionen zu erfüllen. Zum Beispiel hilft der Zwölffingerdarm, den Speisebrei (Mageninhalt) abzubauen, um die richtige Aufnahme von ....

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Protokoll

HINWEIS: Alle Zellkulturen sollten mit einer geeigneten aseptischen Technik gehandhabt werden.

Die in dieser Studie verwendeten humanen Darmorganoide wurden von der Johns Hopkins University bezogen und alle Methoden wurden in Übereinstimmung mit genehmigten Richtlinien und Vorschriften durchgeführt. Alle experimentellen Protokolle wurden vom Johns Hopkins University Institutional Review Board (IRB #NA 00038329) genehmigt.

1. Herstellung der Zellkulturreagenzien

  1. Bereiten Sie das menschliche Organoid-Wachstumsmedium gemäß den Anweisungen des Herstellers (Materialverzeichnis

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Ergebnisse

Abbildung 1D fasst die Zeitleiste der Darmchipkultur zusammen und veranschaulicht die intestinalen Endothelzellen und Organoide vor und nach der Aussaat auf dem Chip. Darüber hinaus zeigt es die deutlichen morphologischen Unterschiede zwischen dem Zwölffingerdarm und den Dickdarmchips, die durch das Vorhandensein der zottenartigen Formationen im Zwölffingerdarmchip hervorgehoben werden und repräsentativ für die Dünndarmarchitektur sind.

Abbild.......

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Diskussion

Die Kombination von Organ-on-a-Chip-Technologie und Darmorganoiden verspricht eine genaue Modellierung der menschlichen Darmphysiologie und Pathophysiologie. Hier stellen wir ein einfaches und robustes Schritt-für-Schritt-Protokoll (in Abbildung 1 dargestellt) für die Etablierung des Darmchips bereit, der biopsiebasierte Dünndarm- oder Kolonepithel- und intestinale mikrovaskuläre Endothelzellen enthält, die in einem mikrofluidischen Gerät kokultiviert werden. Diese chipbasierte Simulation de.......

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Offenlegungen

Gauri Kulkarni, Athanasia Apostolou, Lorna Ewart, Carolina Lucchesi und Magdalena Kasendra sind aktuelle oder ehemalige Mitarbeiter von Emulate Inc. und können Eigenkapital halten. Emulate Inc. ist das Unternehmen, das die Organchip-Geräte herstellt und Patente veröffentlicht hat, die für die in diesem Artikel genannte Arbeit relevant sind.

Danksagungen

Wir danken Professor Mark Donowitz für die Bereitstellung der aus der Darmbiopsie gewonnenen Organoide und Brett Clair für die Entwicklung der wissenschaftlichen Illustrationen des Chip-, tragbaren und Kulturmoduls. Der Rest der wissenschaftlichen Illustrationen wurde mit dem BioRender erstellt.

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
Dünndarm Mikrovaskuläre Endothelzellen des menschlichen DarmsAlphaBioRegenALHE150,5 Zellen M/ml ; kryokonservierter
Dickdarm Mikrovaskuläre Endothelzellen des menschlichen DarmsAlphaBioRegenALHE160,5 Zellen M/ml ; kryokonservierte
biopsieabgeleitete menschliche Duodenal-OrganoideJohn Hopkin's University-Die Organoide wurden von Professor Mark Donowitz (Institutional Review Board Number: NA_00038329) zur Verfügung gestellt.
Aus Biopsien gewonnene menschliche Dickdarm-OrganoideJohn Hopkin'sUniversity-DieOrganoide wurden von Professor Mark Donowitz (Institutional Review Board Number: NA_00038329) zur Verfügung gestellt.
Zoë CM-1 & Handel;   Kulturmodulemulieren Inc.-Kulturmodul
Orb-HM1™   Emulation von Hub-Modulen Inc.-5% CO2, Vakuumdehnung und Stromversorgung
Chip-S1™ DehnbareChip-Emulation Inc.-Organ-Chip-Pod
& Handel; Portable Moduleemulieren Inc.-Tragbares Modul
UV-Lichtkasten-Emulate Inc.--
Chip CradleEmulate Inc.-1 pro quadratische Kulturschale
Steriflip®-HV FilterEMD MilliporeSE1M003M000,45  μ M  PVDF-Filter
Quadratische Zellkulturschale (120 x 120 mm)VWR82051-068-Handheld
  Vakuum  AspiratorCorning4930 -
Aspirieren  PipettenCorning / Falcon3575582 mL,  Polystyrol, einzelnbsp; verpackte
Aspirationsspitzen -Steril (autoklaviert)
Serologisch  Pipetten -2 mL, 5 mL,  10 ml,  und  25 ml  Endotoxinarm, sterile
PipetteP20, P200,   P1000  und Standard-Mehrkanalpipetten
  Tipps P20, P200,  und  P1000.
Konische Rohre ( Eiweiß  LoBind® Röhren)Eppendorf0030122216;   003012224015 mL, 50 mL Röhrchen
Eppendorf  Rohre®   lo-bindEppendorf0224310811,5 mL Röhrchen
96 Wells schwarz wandige Platte-für die Analyse der epithelialen Permeabilität
Mikroskop (mit Kamera)-Für Hellfeldmikroskop Bildgebung
Wasserbad (oder Kügelchen)-Auf 37° einstellen C
Vakuum-Einrichtung --Minimum  Druck: -70 kPa
ZellschaberBiotium220033
T75 KolbenBD Falcon353136Zellkulturkolben
Emulate Reagenz-1 ( ER-1)Emulate Inc.-Chip-Beschichtungslösung
Reagenz emulieren-2 ( ER-2)Emulate Inc.-Chip-Beschichtungslösung
Dulbecco' s PBS  (DPBS)Corning21-031-CV1X
Wasser in ZellkulturqualitätCorningMT25055CV
TrypanblauSigma93595Für die Zellzählung
TryplE  ExpressThermoFisher  Wissenschaftliche12604013Organoide  Dissoziation  und Endothelzellen  Ablösung  Lösung
Advanced DMEM/F12ThermoFisher  Wissenschaftliche12634028Medium
IntestiCult&Handel; Organoides Wachstumsmedium (Mensch)Stammzelltechnologien06010Organoides Wachstumsmedium
Endothelzellwachstumsmedium MV 2PromocellC-22121Endothelmedium
Fötales Rinderserum (FBS)SigmaF4135Serum
Primocin™  InvivoGenANT-PM-1antimikrobielles Mittel
Attachment Factor™Cell Systems4Z0-210Beschichtungslösung für Kolben
Matrigel - Wachstumsfaktor reduziertCorning356231Solubilisierte Basalmembranmatrix
Kollagen IVSigmaC5533ECM-Komponente
FibronektinCorning356008ECM-Komponente
Y-27632Stammzelltechnologien72304Organoid-Medienergänzung
CHIR99021Reprocell04-0004-10Organoid-Medienergänzungsmittel
Cell Recovery SolutionCorning354253Basement Mebran Matrix Dissoziationslösung
Rinderserumalbumin (BSA)SigmaA957630%, steril
Wasser in ZellkulturqualitätCorningMT25055CVsteril, Wasser
DMSO SigmaD2650Lösungsmittel
3KDa Dextran Cascade BlueInvitrogenD713210 mg Pulver
Rifampicin (RIF)SigmaCat# R3501CYP-Induktor
TestosteronhydratSigmaT1500CYP-Substrat
1,25-Dihyroxy Vitamin D3 (VD3)SigmaCat# D1530CYP-Induktor
Acetonitril mit 0,1% (v/v) AmeisensäureSigma159002LCMS-Stop-Lösung
IFNγPeprotech300-02
4% Paraformaldehyd (PFA)EMS157-4Fixiermittel
Triton-X 100SigmaT8787
Normales Eselserum (NDS)Sigma566460
Anti-OccludinThermoFisher  Scientific33-1500Tight Junctions Marker
Anti-Claudin 4ThermoFisher  Scientific36-4800Tight Junctions Marker
Anti-E-CadherinAbcamab1416epithelial Adherens Junctions
Marker Anti-VE-CadherinAbcamab33168endothelial adhärente Verbindungen
Marker Anti-Zonula Occludens 1 (ZO-1)Thermo Fischer339194Tight Junctions Marker
DAPIThermoFisher  Scientific62248Kernfärbung
2-MercaptoethanolSigmaM6250
PureLink RNA Mini KitInvitrogen12183020RNA Lyse-, Isolierungs- und Aufreinigungskit
SuperScript™ IV VILO & Handel; Master MixInvitrogen11756050reverse Transkriptase-Kit
TaqMan™ Fast Advanced Master MixApplied Biosystems4444557qPCR Reagenz
QuantStudio™ 5 Real-Time PCR SystemApplied BiosystemsA28573Real-time PCR cycler
18S PrimerThermoFisher ScientificHs99999901_s1Eukaryotic 18S rRNA
CYP3A4 PrimerThermoFisher ScientificHs00604506_m1Cytochrom  Familie 3 Unterfamilie A Mitglied 4
Pierce™ Coomassie Plus (Bradford) Assay KitThermoFisher Scientific23236Proteinquantifizierungskit
MSD Tris LysepufferMeso Scale DiagnosticsR60TX-3Proteinlysepuffer
Gespaltenes/Gesamt Caspase-3 Ganzzell-Lysat KitMeso Scale DiagnosticsK15140DCaspase 3 Nachweiskit
V-PLEX Vascular Injury Panel 2 Human KitMeso Scale DiagnosticsK15198D
V-PLEX Human Proinflammatory Panel II (4-Plex)Mesoskala DiagnostikK15053D
Zeiss LSM 880
Zeiss LD plan-Neofluar 20x/0.40 Korr M27Zeiss-20XFernobjektive
Zeiss AXIOvert.A1Zeiss-Hellfeldmikroskop
Zeiss LD A-Plan 10X/0.25 Ph1Zeiss-10XObjektive
Zeiss-Konfokalmikroskop

Referenzen

  1. Fritz, A., et al. Expression of clinically relevant drug-metabolizing enzymes along the human intestine and their correlation to drug transporters and nuclear receptors: An intra-subject analysis. Basic and Clinical Pharmacology and Toxicology. 124 (3), 245-255 (2019).
  2. Okumura, R., Takeda, K.

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Nachdrucke und Genehmigungen

Schlagwörter

Darm ChipDarmbarriereEpithelmonolayerparazellul re Permeabilit tArzneimittelmetabolismusCYP3A4 InduktionWirt Mikroben InteraktionInterferon Gamma