Biopsie-abgeleitete Darmorganoide und Organ-on-a-Chips-Technologien werden zu einer mikrophysiologischen Plattform kombiniert, um die regionsspezifische Darmfunktionalität zu rekapitulieren.
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Methodenartikel
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Biopsie-abgeleitete Darmorganoide und Organ-on-a-Chips-Technologien werden zu einer mikrophysiologischen Plattform kombiniert, um die regionsspezifische Darmfunktionalität zu rekapitulieren.
Die Darmschleimhaut ist eine komplexe physikalische und biochemische Barriere, die eine Vielzahl wichtiger Funktionen erfüllt. Es ermöglicht den Transport, die Aufnahme und den Stoffwechsel von Nährstoffen und Xenobiotika und erleichtert gleichzeitig eine symbiotische Beziehung mit der Mikrobiota und begrenzt die Invasion von Mikroorganismen. Die funktionelle Interaktion zwischen verschiedenen Zelltypen und ihrer physikalischen und biochemischen Umgebung ist für die Etablierung und Aufrechterhaltung der Homöostase des Darmgewebes von entscheidender Bedeutung. Die Modellierung dieser komplexen Wechselwirkungen und der integrierten Darmphysiologie in vitro ist ein gewaltiges Ziel mit dem Potenzial, die Art und Weise, wie neue therapeutische Ziele und Arzneimittelkandidaten entdeckt und entwickelt werden, zu verändern.
Organoide und Organ-on-a-Chip-Technologien wurden kürzlich kombiniert, um humanrelevante Darmchips zu erzeugen, die geeignet sind, die funktionellen Aspekte der Darmphysiologie und Pathophysiologie in vitro zu untersuchen. Organoide, die aus den Biopsien des Dünndarms (Zwölffingerdarm) und des Dickdarms gewonnen werden, werden in das obere Kompartiment eines Organchips gesät und dehnen sich dann erfolgreich als Monoschichten aus, während die unterschiedlichen zellulären, molekularen und funktionellen Merkmale jeder Darmregion erhalten bleiben. Gewebespezifische mikrovaskuläre Endothelzellen des menschlichen Darms werden in das untere Kompartiment des Organchips integriert, um die epithelial-endotheliale Schnittstelle nachzubilden. Diese neuartige Plattform erleichtert die luminale Exposition gegenüber Nährstoffen, Medikamenten und Mikroorganismen und ermöglicht Untersuchungen des Darmtransports, der Permeabilität und der Wirt-Mikroben-Interaktionen.
Hier wird ein detailliertes Protokoll für die Etablierung von Darmchips, die den menschlichen Zwölffingerdarm (Zwölffingerdarmchip) und Dickdarm (Dickdarmchip) darstellen, und deren anschließende Kultur unter kontinuierlicher Strömung und peristaltisartigen Verformungen bereitgestellt. Wir demonstrieren Methoden zur Beurteilung des Arzneimittelstoffwechsels und der CYP3A4-Induktion im Zwölffingerdarmchip anhand prototypischer Induktoren und Substrate. Schließlich bieten wir ein Schritt-für-Schritt-Verfahren für die In-vitro-Modellierung von Interferon-gamma (IFNγ)-vermittelter Barrierestörung (Leaky-Gut-Syndrom) in einem Dickdarmchip an, einschließlich Methoden zur Bewertung der Veränderung der parazellulären Permeabilität, Veränderungen der Zytokinsekretion und transkriptomischer Profilierung der Zellen innerhalb des Chips.
Der menschliche Darm ist ein komplexes und multitaskingfähiges Organ, das sich selbst regenerieren kann. Es ist in den Dünn- und Dickdarm unterteilt. Die Hauptfunktion des Dünndarms besteht darin, die aus dem Magen kommende Nahrung weiter zu verdauen, alle Nährstoffe aufzunehmen und die Rückstände an den Dickdarm weiterzugeben, der das Wasser und die Elektrolyte zurückgewinnt. Der Dünndarm ist weiter in mehrere anatomisch unterschiedliche Regionen unterteilt: Zwölffingerdarm, Jejunum und Ileum, von denen jede angepasst ist, um bestimmte Funktionen zu erfüllen. Zum Beispiel hilft der Zwölffingerdarm, den Speisebrei (Mageninhalt) abzubauen, um die richtige Aufnahme von ....
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HINWEIS: Alle Zellkulturen sollten mit einer geeigneten aseptischen Technik gehandhabt werden.
Die in dieser Studie verwendeten humanen Darmorganoide wurden von der Johns Hopkins University bezogen und alle Methoden wurden in Übereinstimmung mit genehmigten Richtlinien und Vorschriften durchgeführt. Alle experimentellen Protokolle wurden vom Johns Hopkins University Institutional Review Board (IRB #NA 00038329) genehmigt.
1. Herstellung der Zellkulturreagenzien
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Abbildung 1D fasst die Zeitleiste der Darmchipkultur zusammen und veranschaulicht die intestinalen Endothelzellen und Organoide vor und nach der Aussaat auf dem Chip. Darüber hinaus zeigt es die deutlichen morphologischen Unterschiede zwischen dem Zwölffingerdarm und den Dickdarmchips, die durch das Vorhandensein der zottenartigen Formationen im Zwölffingerdarmchip hervorgehoben werden und repräsentativ für die Dünndarmarchitektur sind.
Abbild.......
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Die Kombination von Organ-on-a-Chip-Technologie und Darmorganoiden verspricht eine genaue Modellierung der menschlichen Darmphysiologie und Pathophysiologie. Hier stellen wir ein einfaches und robustes Schritt-für-Schritt-Protokoll (in Abbildung 1 dargestellt) für die Etablierung des Darmchips bereit, der biopsiebasierte Dünndarm- oder Kolonepithel- und intestinale mikrovaskuläre Endothelzellen enthält, die in einem mikrofluidischen Gerät kokultiviert werden. Diese chipbasierte Simulation de.......
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Gauri Kulkarni, Athanasia Apostolou, Lorna Ewart, Carolina Lucchesi und Magdalena Kasendra sind aktuelle oder ehemalige Mitarbeiter von Emulate Inc. und können Eigenkapital halten. Emulate Inc. ist das Unternehmen, das die Organchip-Geräte herstellt und Patente veröffentlicht hat, die für die in diesem Artikel genannte Arbeit relevant sind.
Wir danken Professor Mark Donowitz für die Bereitstellung der aus der Darmbiopsie gewonnenen Organoide und Brett Clair für die Entwicklung der wissenschaftlichen Illustrationen des Chip-, tragbaren und Kulturmoduls. Der Rest der wissenschaftlichen Illustrationen wurde mit dem BioRender erstellt.
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| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| Dünndarm Mikrovaskuläre Endothelzellen des menschlichen Darms | AlphaBioRegen | ALHE15 | 0,5 Zellen M/ml ; kryokonservierter |
| Dickdarm Mikrovaskuläre Endothelzellen des menschlichen Darms | AlphaBioRegen | ALHE16 | 0,5 Zellen M/ml ; kryokonservierte |
| biopsieabgeleitete menschliche Duodenal-Organoide | John Hopkin's University | - | Die Organoide wurden von Professor Mark Donowitz (Institutional Review Board Number: NA_00038329) zur Verfügung gestellt. |
| Aus Biopsien gewonnene menschliche Dickdarm-Organoide | John Hopkin's | University-Die | Organoide wurden von Professor Mark Donowitz (Institutional Review Board Number: NA_00038329) zur Verfügung gestellt. |
| Zoë CM-1 & Handel; Kulturmodul | emulieren Inc. | - | Kulturmodul |
| Orb-HM1™ Emulation von Hub-Modulen | Inc. | - | 5% CO2, Vakuumdehnung und Stromversorgung |
| Chip-S1™ Dehnbare | Chip-Emulation Inc. | - | Organ-Chip-Pod |
| & Handel; Portable Module | emulieren Inc. | - | Tragbares Modul |
| UV-Lichtkasten-Emulate | Inc. | - | - |
| Chip Cradle | Emulate Inc. | - | 1 pro quadratische Kulturschale |
| Steriflip®-HV Filter | EMD Millipore | SE1M003M00 | 0,45 μ M PVDF-Filter |
| Quadratische Zellkulturschale (120 x 120 mm) | VWR | 82051-068-Handheld | |
| Vakuum Aspirator | Corning | 4930 | - |
| Aspirieren Pipetten | Corning / Falcon | 357558 | 2 mL, Polystyrol, einzelnbsp; verpackte |
| Aspirationsspitzen | - | Steril (autoklaviert) | |
| Serologisch Pipetten | - | 2 mL, 5 mL, 10 ml, und 25 ml Endotoxinarm, sterile | |
| Pipette | P20, P200, P1000 und Standard-Mehrkanalpipetten | ||
| Tipps | P20, P200, und P1000. | ||
| Konische Rohre ( Eiweiß LoBind® Röhren) | Eppendorf | 0030122216; 0030122240 | 15 mL, 50 mL Röhrchen |
| Eppendorf Rohre® lo-bind | Eppendorf | 022431081 | 1,5 mL Röhrchen |
| 96 Wells schwarz wandige Platte | - | für die Analyse der epithelialen Permeabilität | |
| Mikroskop (mit Kamera) | - | Für Hellfeldmikroskop Bildgebung | |
| Wasserbad (oder Kügelchen) | - | Auf 37° einstellen C | |
| Vakuum-Einrichtung | - | - | Minimum Druck: -70 kPa |
| Zellschaber | Biotium | 220033 | |
| T75 Kolben | BD Falcon | 353136 | Zellkulturkolben |
| Emulate Reagenz-1 ( ER-1) | Emulate Inc. | - | Chip-Beschichtungslösung |
| Reagenz emulieren-2 ( ER-2) | Emulate Inc. | - | Chip-Beschichtungslösung |
| Dulbecco' s PBS (DPBS) | Corning | 21-031-CV | 1X |
| Wasser in Zellkulturqualität | Corning | MT25055CV | |
| Trypanblau | Sigma | 93595 | Für die Zellzählung |
| TryplE Express | ThermoFisher Wissenschaftliche | 12604013 | Organoide Dissoziation und Endothelzellen Ablösung Lösung |
| Advanced DMEM/F12 | ThermoFisher Wissenschaftliche | 12634028 | Medium |
| IntestiCult&Handel; Organoides Wachstumsmedium (Mensch) | Stammzelltechnologien | 06010 | Organoides Wachstumsmedium |
| Endothelzellwachstumsmedium MV 2 | Promocell | C-22121 | Endothelmedium |
| Fötales Rinderserum (FBS) | Sigma | F4135 | Serum |
| Primocin™ | InvivoGen | ANT-PM-1 | antimikrobielles Mittel |
| Attachment Factor™ | Cell Systems | 4Z0-210 | Beschichtungslösung für Kolben |
| Matrigel - Wachstumsfaktor reduziert | Corning | 356231 | Solubilisierte Basalmembranmatrix |
| Kollagen IV | Sigma | C5533 | ECM-Komponente |
| Fibronektin | Corning | 356008 | ECM-Komponente |
| Y-27632 | Stammzelltechnologien | 72304 | Organoid-Medienergänzung |
| CHIR99021 | Reprocell | 04-0004-10 | Organoid-Medienergänzungsmittel |
| Cell Recovery Solution | Corning | 354253 | Basement Mebran Matrix Dissoziationslösung |
| Rinderserumalbumin (BSA) | Sigma | A9576 | 30%, steril |
| Wasser in Zellkulturqualität | Corning | MT25055CV | steril, Wasser |
| DMSO Sigma | D2650 | Lösungsmittel | |
| 3KDa Dextran Cascade Blue | Invitrogen | D7132 | 10 mg Pulver |
| Rifampicin (RIF) | Sigma | Cat# R3501 | CYP-Induktor |
| Testosteronhydrat | Sigma | T1500 | CYP-Substrat |
| 1,25-Dihyroxy Vitamin D3 (VD3) | Sigma | Cat# D1530 | CYP-Induktor |
| Acetonitril mit 0,1% (v/v) Ameisensäure | Sigma | 159002 | LCMS-Stop-Lösung |
| IFNγ | Peprotech | 300-02 | |
| 4% Paraformaldehyd (PFA) | EMS | 157-4 | Fixiermittel |
| Triton-X 100 | Sigma | T8787 | |
| Normales Eselserum (NDS) | Sigma | 566460 | |
| Anti-Occludin | ThermoFisher Scientific | 33-1500 | Tight Junctions Marker |
| Anti-Claudin 4 | ThermoFisher Scientific | 36-4800 | Tight Junctions Marker |
| Anti-E-Cadherin | Abcam | ab1416 | epithelial Adherens Junctions |
| Marker Anti-VE-Cadherin | Abcam | ab33168 | endothelial adhärente Verbindungen |
| Marker Anti-Zonula Occludens 1 (ZO-1) | Thermo Fischer | 339194 | Tight Junctions Marker |
| DAPI | ThermoFisher Scientific | 62248 | Kernfärbung |
| 2-Mercaptoethanol | Sigma | M6250 | |
| PureLink RNA Mini Kit | Invitrogen | 12183020 | RNA Lyse-, Isolierungs- und Aufreinigungskit |
| SuperScript™ IV VILO & Handel; Master Mix | Invitrogen | 11756050 | reverse Transkriptase-Kit |
| TaqMan™ Fast Advanced Master Mix | Applied Biosystems | 4444557 | qPCR Reagenz |
| QuantStudio™ 5 Real-Time PCR System | Applied Biosystems | A28573 | Real-time PCR cycler |
| 18S Primer | ThermoFisher Scientific | Hs99999901_s1 | Eukaryotic 18S rRNA |
| CYP3A4 Primer | ThermoFisher Scientific | Hs00604506_m1 | Cytochrom Familie 3 Unterfamilie A Mitglied 4 |
| Pierce™ Coomassie Plus (Bradford) Assay Kit | ThermoFisher Scientific | 23236 | Proteinquantifizierungskit |
| MSD Tris Lysepuffer | Meso Scale Diagnostics | R60TX-3 | Proteinlysepuffer |
| Gespaltenes/Gesamt Caspase-3 Ganzzell-Lysat Kit | Meso Scale Diagnostics | K15140D | Caspase 3 Nachweiskit |
| V-PLEX Vascular Injury Panel 2 Human Kit | Meso Scale Diagnostics | K15198D | |
| V-PLEX Human Proinflammatory Panel II (4-Plex) | Mesoskala Diagnostik | K15053D | |
| Zeiss LSM 880 | |||
| Zeiss LD plan-Neofluar 20x/0.40 Korr M27 | Zeiss-20X | Fernobjektive | |
| Zeiss AXIOvert.A1 | Zeiss-Hellfeldmikroskop | ||
| Zeiss LD A-Plan 10X/0.25 Ph1 | Zeiss-10X | Objektive |
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