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Die Fähigkeit zur Abbildung der zerebralen Gefäße (von großen Schiffen auf Kapillaren) und Aufzeichnung des Blutflusses Dynamik im intakten Gehirn von lebenden Nagern ist eine leistungsstarke Technik. Mit In-vivo-2-Photonen-Mikroskopie durch ein Schädel-Fenster ist es möglich, Bild fluoreszierende Farbstoffe intravenös injiziert. Dies erlaubt es, Bild der kortikalen Gefäße und auch Messungen des Blutflusses erhalten. Diese Technik wurde ursprünglich von David Kleinfeld und Winfried Denk entwickelt. Die Methode kann verwendet werden, um den Blutfluss Dynamik während oder nach der zerebralen Ischämie zu studieren, in neurodegenerativen Erkrankungen, bei Hirntumoren oder in normale Physiologie des Gehirns. Zum Beispiel wurde verwendet, um zu untersuchen, wie Schlaganfall verursacht Veränderungen in den Blutfluss Richtung und Veränderungen in der roten Blutkörperchen Geschwindigkeit oder Fluss in und rund um den Infarkt. Hier zeigen wir, wie 2-Photonen-Mikroskopie zum Bild des Blutflusses Dynamik den Einsatz in der Großhirnrinde von Mäusen mit fluoreszierenden Farbstoffen in die Schwanzvene injiziert.