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Methodenartikel

Ein multimodales Bildgebungs-Framework zur Verbesserung der Phänotypisierung von lebenden markierungsfreien Brustkrebszellen

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DOI:

10.3791/68498

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22. August 2025

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In diesem Artikel

Zusammenfassung

Dieses Protokoll stellt einen multimodalen Ansatz dar, der Raman-Spektroskopie und tomographische Phasenmikroskopie für eine markierungsfreie, nicht-invasive Phänotypisierung lebender menschlicher Brustkrebszellen kombiniert. Es umfasst eine benutzerfreundliche, human-bias-freie Analysepipeline für eine schnelle, quantitative morphochemische Analyse, die detaillierte molekulare und strukturelle Einblicke mit Anwendungen in der Krebsforschung und Zellbiologie liefert.

Zusammenfassung

Wir präsentieren die multimodale konfokale Raman-Mikrospektroskopie (RS) und die tomographische Phasenmikroskopie (TPM) für die schnelle morphochemische Phänotypisierung menschlicher Brustkrebszellen (MDA-MB-231). Unter Ausnutzung der nicht-perturbativen Natur dieser fortschrittlichen Mikroskopietechniken haben wir detaillierte morphomolekulare Daten von lebenden, markierungsfreien Zellen in ihrer natürlichen physiologischen Umgebung erfasst. Es wurden humane verzerrungsfreie Datenverarbeitungspipelines entwickelt, um hyperspektrale Raman-Bilder (die Raman-Moden von 600 cm-1 bis 1800 cm-1 abdecken und eine breite Palette von molekularen Bindungen und subzellulären Strukturen einzigartig charakterisieren) sowie morphologische Daten aus dreidimensionalen Brechungsindex-Tomogrammen (die Messungen des Zellvolumens, der Oberfläche, des Fußabdrucks und der Sphärizität mit Nanometerauflösung ermöglichen) zu analysieren, neben Trockenmasse und Dichte). Durch die systematische Aufschlüsselung der reichhaltigen Einzelzelldetails, die RS und TPM liefern, zeigen wir auf quantitative Weise den Vorteil einer solchen multimodalen Mikroskopiemethode für die Phänotypisierung von tumoralen Brustkrebszellen. Unsere Tools bieten auch weitere Einblicke in die subzellulären Informationen, ohne dass Markierungen verwendet werden. Schließlich untersuchen und diskutieren wir alle einzigartigen oder korrelierten Informationen, die RS- und TPM-abgeleitete Datensätze enthalten. Wir glauben, dass unsere Tools und quantitativen Datenanalyse-Pipelines die Phänotypisierungsaufgaben in der biomedizinischen Forschung revolutionieren können, wenn eine schnelle und störungsfreie Methode an lebenden Zellen in Kultur benötigt wird, mit dem Potenzial für eine zukünftige Umsetzung in klinische und diagnostische Anwendungen.

Einleitung

Die Charakterisierung und Phänotypisierung von Zellen sind zentrale Aspekte der biomedizinischen Forschung1. Die Fähigkeit, Zellen sowohl auf morphologischer als auch auf molekularer Ebene zu charakterisieren, ist für das Verständnis der Zellfunktion, Differenzierung und Pathologie von größter Bedeutung 1,2,3. Es ist besonders interessant im Bereich der Onkologie, wo ein genaues Zellprofiling für die Tumordiagnose, die Bestimmung des Krankheitsstadiums und letztendlich die Identifizierung therapeutischer Ziele erforder....

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Protokoll

1. Vorbereitung der Probe

  1. MDA-MB-231-Zellen auf Quarz-Petrischalen säen.
    1. Platte MDA-MB-231 humane Brustkrebszellen auf 3,5 cm große Petrischalen mit Quarzglasboden.
    2. Die Zellen werden bei 37 °C in einer Umgebung mit 5 % CO2 inkubiert, bis sie vollständig mit der Oberfläche verbunden sind (mindestens 12 Stunden nach der Aussaat).
  2. Waschen Sie die Zellen und bereiten Sie die Messung vor.
    1. Entfernen Sie das Nährmedium von den Zellen, sobald sie an der Petrischale haften.
    2. Waschen Sie die Zellen vorsichtig mit phosphatgepufferter Kochsalz....

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Ergebnisse

Wir haben einen Workflow für die markierungsfreie morpho-chemische Charakterisierung lebender Zellen auf Basis von konfokalem RS und TPM beschrieben. Wir testeten die Fähigkeit des vorgeschlagenen Arbeitsablaufs, die molekulare Zusammensetzung und morphologische Parameter der humanen Brustkrebszelllinie MDA-MB-231 zu erreichen (Abbildung 1).

MDA-MB-231-Zellen wurden auf Petrischalen mit Quarzglasboden ausgesät. Ein speziell angefertigtes konfokales Raman-Mikroskop.......

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Diskussion

Wir präsentierten einen multimodalen Ansatz und eine unkomplizierte Analysepipeline, die zwei fortschrittliche, markierungsfreie Bildgebungsverfahren integriert: RS und TPM. Der beschriebene Arbeitsablauf ermöglichte eine schnelle, nicht-invasive morpho-chemische Phänotypisierung von lebenden menschlichen Brustkrebs-Einzelzellen (MDA-MB-231), ohne dass eine externe Markierung erforderlich war.

RS ist eine zerstörungsfreie Technik, die die Charakterisierung der.......

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Offenlegungen

Die Autoren erklären, dass keine Interessenkonflikte bestehen.

Danksagungen

Diese Forschung wurde durch das Progetto Rocca der MIT-Italy Foundation, NIH-Stipendien (P41EB015871, UH3CA275687, R01DC021326), Apollon (Seoul, Südkorea) und das National Cancer Center, Korea (NCC-24H1170) finanziert. Leonardo Bianchi würdigt die Verleihung eines Postdoktorandenstipendiums des Progetto Rocca für die Durchführung gemeinsamer Forschungsarbeiten am Massachusetts Institute of Technology und am Politecnico di Milano.

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
CCD-KameraPrinceton InstrumentePIXIS 100BR eXcelonDetektor für Raman-Streusignale.
Software zur Steuerung von CCD-KamerasPrinceton InstrumenteLichtFeld
Dauerstrich-Ti-Saphir-Laser (Wellenlänge: 785 nm)Spektren-Physik3900 SEs wird für die Raman-Mikroskopie-Anregung verwendet.
Dichroitischer SpiegelThorLabs (Englisch)DMSP750BSiegroitischer 749-nm-Spiegel, lenkt die 785-nm-Raman-Anregung auf die Probe ab, filtert Fluoreszenz- und Hellfeldsignale heraus.
Fötales RinderserumThermo Fisher ScientificA5256701
Gehäuse des FluoreszenzmikroskopsOlympIX83
Laser (Wellenlänge: 532 nm)Spektren-PhysikJahrtausende eVPumplaser für 785-nm-Ti-Saphir-Lasersystem.
MATLAB-SoftwareMathWorks (Englisch)2023a
MDA-MB-231 ZelllinieATCCHTB-26
NIR-SpektrografAndrorHolospec HS-HSG-785-LFEs wird für die spektrale Analyse von rückgestreutem Licht verwendet.
Objektiv (60-fach; 1,2 NA Wasserimmersion)OlympUPLSAPO60&mal;
Inkubationskammer auf der BühneTokai-Trefferstxg-welsx-set
Open-Source-Software zur Steuerung von Mikroskopen&Mikro; ManagerMikro-Manager-2.0
Penicillin-Streptomycin (10.000 U/ml)Thermo Fisher Scientific15140122
Phenolfreies DMEM/F-12Thermo Fisher Scientific21041025
Phosphatgepufferte KochsalzlösungGibco10-010-023
Petrischalen mit QuarzglasbodenWaken B TechnikSF-S-D12
Raman-Software zur DatenanalyseRamApp (Englisch)Webbasiertes Tool für die hyperspektrale Datenverarbeitung von Raman.
sCMOS-KameraHamamatsu PhotonikOrca Flash 4.0 v2
SpritzenpumpeChemyxFusion 720
Tomographisches PhasenmikroskopTomocube, Inc.HT-2HKommerzielles System zur Gewinnung quantitativer Phasenbilder.
TPM-Software zur DatenanalyseTomocube, Inc.TomoStudioSoftware zur Analyse von Daten der tomographischen Phasenmikroskopie (TPM).

Referenzen

  1. Gosnell, M. E., et al. Quantitative non-invasive cell characterisation and discrimination based on multispectral autofluorescence features. Sci Rep. 6 (1), 23453(2016).
  2. Bresci, A., et al.

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Nachdrucke und Genehmigungen

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