Dieses Protokoll ermöglicht die Quantifizierung von OCR und ECAR ganzer Zebrafischventrikel. Wir validierten die Überlebensfähigkeit der Ventrikel in einer ex vivo Umgebung, indem wir unverletzte Wildtyp-KCL-Ventrikel im Analyzer ohne jegliche medikamentöse Behandlung inkubierten (Abbildung 3A). Die Daten zeigen, dass die Ventrikel eine stabile OCR und ECAR aufweisen, die für mindestens 180 Minuten deutlich höher sind als die Basismessungen der leeren Bohrlöcher (Abbildung 3A). Diese Daten deuten darauf hin, dass die Ventrikel eine normale Atemfunktion und Überlebensfähigkeit in diesem ex vivo Setting zeigen.
Wir führten mehrere OCR-Messungen mit unterschiedlichen Arzneimittelkonzentrationen und Medienformulierungen durch, um die optimale Dosierung für die Ventrikel zu bestimmen (Abbildung 3B). Wir beobachteten einen leichten Anstieg der OCR-Faltenänderung (FCCP/basal) bei Verwendung der Kombinationen [Oligomycin] 10 μM, [FCCP] 8 μM und [Rotenon/Antimycin] 25 μM, sowie einen leicht größeren Anstieg von [Oligomycin] 50 μM, [FCCP] 30 μM und [Rotenon/Antimycin] 45 μM (Abbildung 3B). Daher haben wir für unsere Experimente mit letzteren Konzentrationen übergegangen. Da der Ventrikel eine 3D-Struktur ist, ist es möglich, dass die Medikamente stark auf die äußeren Zellen des Gewebes wirken, ohne die Zellen auf der luminalen Seite des Ventrikels zu erreichen. Um dies zu beheben, führten wir einen Permeabilisierungsschritt durch, bei dem wir die Herzen mit Saponin 0,5 % für 30 Minuten vor der Inkubation in DMEM (10 mM Galactose, 1 mM Pyruvat, 4 mM Glutamin) behandelten. Dies führte zu einer anhaltenden Reduktion des OCR und zum Ausbleiben des erwarteten Anstiegs nach der FCCP-Injektion (Abbildung 3C), was darauf hindeutet, dass die Herzen metabolisch versagten. Folglich haben wir die Ventrikel für unsere Experimente nicht permeabilisiert.
Außerdem präsentieren wir hier die normalisierten Spuren aus unserem ursprünglichen Experiment8. Indem wir die natürliche Variation des regenerativen Potenzials von sieben Wildtyp-Zebrafischstämmen nutzten, identifizierten wir mdh1ab, die zytosolische Malatdehydrogenase 1Ab, die eine positive Wirkung auf die Regeneration durch Kardiomyozyten-Redifferenzierung hat. Um diese Erkenntnis zu bestätigen, produzierten wir transgene Zebrafische, die mdh1ab auf kardiomyozytenspezifische Weise überexprimierten (mdh1ab cOE) und kontrollierten das grüne fluoreszierende Protein (GFP cOE). Wir haben ihre Ventrikel kryoinisiert, sie mit 14 dpci aufgenommen und ihren Stoffwechsel mit dem Mito-Stresstest untersucht (Abbildung 3D). Die Oligomycin-Behandlung veränderte die OCR nicht signifikant, obwohl ein leichter Anstieg des ECAR beobachtet wurde. Die Injektion von FCCP in die Medien führte zu einem erwarteten Anstieg von OCR und ECAR, wobei die mdh1ab cOE-Proben die höchste maximale Atemkapazität aufrechterhielten (Abbildung 3D). Schließlich führte Rotenon/Antimycin in beiden Gruppen zum vollständigen Stillstand des Stoffwechsels. Insgesamt ermöglichte uns diese Methode, signifikante Unterschiede in der metabolischen Kapazität der überexprimierenden Ventrikel und zwischen sieben verschiedenen Wildtyp-Zebrafischstämmenzu identifizieren.

Abbildung 1: Glukosestoffwechsel während eines Mito-Stresstests. (A) Schematische Darstellung des Glukosestoffwechsels. Glukose gelangt über die GLUT-Transporter in die Zelle und wird durch Glykolyse in Pyruvat umgewandelt. Laktatdehydrogenase (LDH) wandelt Pyruvat in Laktat um, und die entstehenden Protonen werden aus der Zelle ausgeschieden. Pyruvat wird in Acetyl-CoA umgewandelt und gelangt in den Mitochondrien- und TCA-Zyklus, um die respiratorische Elektronentransportkette in der inneren mitochondrialen Membran zu betreiben. Die Inhibitoren der Komplexe I, III und V sowie der Entkoppler FCCP sind rot gekennzeichnet. Elektronen, die durch die respiratorische Elektronentransportkette übertragen werden, werden durch blaue Pfeile bezeichnet, die schließlich zur Umwandlung von Sauerstoff und Protonen in Wasser führen. (B) Mito-Stresstestergebnisse schematisch. Die basale Atmung wird in Magenta beobachtet. Bei der Oligomycin-Injektion sinkt die OCR, was die Berechnung der ATP-gebundenen Atmung (grün) sowie des Protonenlecks (orange) ermöglicht. FCCP erhöht die OCR auf die maximale Atemkapazität der Zellen (blau). Rotenon und Antimycin A-Injektionen führen zum Stillstand der mitochondrialen Atmung und ermöglichen nur nicht-mitochondriale Atmung (Grey). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzusehen.

Abbildung 2: Mikroplatten-Layout der Sensorpatrone und der Inselerfassung. (A) Bild des Deckel-Sensor-Kartuschen-Hydro-Booster-Utility-Platten-Komplexes (oben) und der umgekehrten Sensorkartusche (unten). Schuppenbalken: 1 cm. (B) Bild einer Insel-Mikroplatte, die mit Zebrafischventrikeln beladen ist. Die roten Kreise kennzeichnen die leeren Brunnen, die keine Ventrikel enthalten, und dienen während der Analyse als Hintergrundkorrektur. Skalenbalken: 1 cm. (C) Schematische Darstellung des Portlayouts im XFe24-Sensormodul. Port A enthält Oligomycin, B enthält FCCP und C enthält die Rotenon/Antimycin-Mischung. Port D kann leer bleiben oder ein zusätzliches Medikament hinzugefügt werden. S bezeichnet den Sensoranschluss, der keine Flüssigkeit enthalten darf, um den Analysator nicht zu beschädigen. (D) Repräsentatives Bild eines Zebrafischventrikels am Boden des Brunnens, umschlossen vom Gitter (links) und ohne Gitter (rechts). Skalenbalken: 5 mm. (E) Schematischer Querschnitt der Mikroplatte der Inselaufnahme, die einen Ventrikel, das Gitter (gelb) und die Sensorkartusche (grün) enthält. P bezeichnet die Anschlüsse und S den Sensor. Die wellenförmige Linie steht für das Medium. (F) Das Insel-Capture-Bildschirm-Einführungstool. Skalenleiste: 1 cm. (G) Normalisierungs-Tab-Symbol auf der Analyseoberfläche. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzusehen.

Abbildung 3: Repräsentative OCR- und ECAR-Messungen der Zebrafischventrikel. (A) Repräsentative OCR- und ECAR-Spuren unverletzter Wildtyp-Zebrafischventrikel (KCL-Stamm), die nicht mit den im Test verwendeten Inhibitoren behandelt wurden (n = 2, rote Linie). Die Spuren, die aus leeren Bohrlöchern entstehen, die kein biologisches Material enthalten, werden in Grau dargestellt (n = 4); OCR, zweiseitige wiederholte Messungen ANOVA, Zeitfaktor P = 0,0200, Zeit × Bohrlochinteraktion P = 0,0196, Bohrlochfaktor P < 0,0001, Gruppenfaktor P < 0,0001; ECAR zweiweg-wiederholte Messungen ANOVA, Zeitfaktor P = 0,1323, Zeit × Bohrlochinteraktion P = 0,0216, Bohrlochfaktor P = 0,0009, Gruppenfaktor P<0,0001; Die Daten werden als Mittelwert ± SEM dargestellt. (B) OCR-Faltungsänderung bei verschiedenen Arzneimittelkonzentrationen und verwendeten Medien. Einweg-ANOVA (P = 0,0032) mit Tukeys Mehrfachvergleichstest. [O] 5 μM, [F] 4 μM, [RA] 2 μM, n = 6; [O] 10 μM, [F] 8 μM, [RA] 25 μM, n = 8; [O] 25 μM, [F] 16 μM, [RA] 45 μM, n = 8; [O] 50 μM, [F] 30 μM, [RA] 45 μM, n = 8; [O] 100 μM, [F] 60 μM, [RA] 90 μM, n = 8. O, Oligomycin; F, FCCP; RA, Rotenon/Antimycin. (C) Spuren von saponin-permeabilisierten Ventrikeln (rot, n = 4) im Vergleich zu unbehandelten Ventrikeln (grau, n = 4); zweiseige wiederholte Messungen ANOVA, Zeitfaktor P < 0,0001, Zeit × Probeninteraktion P < 0,0001, Behandlungsfaktor P < 0,0001, Stichprobenfaktor P = 0,824; Daten präsentiert als Mittelwert ± SEM. OCR-Maximum der saponinbehandelten Ventrikel im Vergleich zu unbehandelten Ventrikeln; ungepaarter Schüler-T-Test (P = 0,0850). (D) Repräsentative OCR- und ECAR-Spuren von mdh1ab cOE (rot, n = 8) und GFP cOE (grau, n = 8) 14dpci Ventrikeln. OCR, zweiseitige wiederholte Messungen ANOVA, Zeitfaktor P < 0,0001, Zeit × Probeninteraktion P < 0,0001, Genotypfaktor P < 0,0001, Stichprobenfaktor P = 0,1098; ECAR, zweiseitige wiederholte Messungen ANOVA-Zeitfaktor P < 0,0001, Zeit × Probeninteraktion P = 0,7507, Stichprobenfaktor P = 0,2154, Genotypfaktor P < 0,0001. Daten adaptiert aus Lekkos et al., 20258 und als Mittelwert ± SEM dargestellt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzusehen.