Forschungsartikel

Multimodell-interpretierbares maschinelles Lernen zur Vorhersage von Osteoporose bei Diabetes unter Verwendung einer großen elektronischen Gesundheitsaktendatenbank für die Intensivmedizin

DOI:

10.3791/71386

30. Juni 2026

In diesem Artikel

Zusammenfassung

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Dieses Protokoll beschreibt die Entwicklung und Bewertung eines interpretierbaren Ensemblebaum-basierten maschinellen Lernmodells, das routinemäßig gesammelte klinische Daten verwendet, um das Osteoporoserisiko bei Patienten mit Diabetes vorherzusagen.

Zusammenfassung

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Diabetes mellitus ist mit einer erhöhten Skelettfragilität und einem erhöhten Frakturrisiko verbunden; die frühe Erkennung von Osteoporose (OP) in diabetischen Populationen bleibt jedoch eine Herausforderung. Diese Studie hatte zum Ziel, mehrere Machine-Learning-(ML)-Modelle zur Vorhersage der OP bei Diabetespatienten zu entwickeln und zu vergleichen, deren klinischen Nutzen zu bewerten und die Modelltransparenz mittels SHapley Additive ExPlanations (SHAP) zu verbessern. Mit routinemäßig erhobenen demografischen und Labordaten aus der MIMIC-IV-Datenbank wurden mehrere ML-Algorithmen, darunter Baumensembles, Gradientensteigerung und lineare Baselines, trainiert und validiert. Die Modellleistung wurde umfassend mittels Diskriminierungsmetriken bewertet, einschließlich der Fläche unter der Empfänger-Betriebscharakteristiekkurve (AUC) und Präzisions-Rückruf-Analyse sowie Wahrscheinlichkeitskalibrierungskurven und Entscheidungskurvenanalyse (DCA), um den klinischen Nettonutzen zu bewerten. Das bestdurchschnittliche Modell wurde weiter mit SHAP interpretiert, um Feature-Beiträge sowohl auf globaler als auch auf individueller Ebene zu quantifizieren und zu visualisieren. Unter allen evaluierten Modellen zeigten Ensemblebaum-basierte Methoden eine verbesserte Leistung. Der ExtraTrees-Klassifikator erzielte die höchste Validierungsleistung (AUC = 0,862; durchschnittliche Genauigkeit = 0,866). Darüber hinaus zeigte das ausgewählte Modell eine ausgezeichnete Wahrscheinlichkeitskalibrierung (Brier-Wert = 0,154) und zeigte einen erheblichen klinischen Nettonutzen über eine breite Palette von Risikoschwellenwerten im DCA. Die SHAP-Analyse identifizierte Geschlecht und Alter als die einflussreichsten Prädiktoren, gefolgt von routinemäßigen hämatologischen und metabolischen Laborindikatoren. Lokale Erklärungen lieferten klinisch interpretierbare Einblicke in individuelle Vorhersagen. Ein interpretierbares, auf Ensemblebäumen basierendes Modell prognostiziert das OP-Risiko bei Patienten mit Diabetes effektiv unter Verwendung routinemäßig verfügbarer klinischer Variablen. Die Integration von SHAP verbessert die klinische Transparenz, und eine starke Kalibrierung in Verbindung mit positivem klinischen Nettonutzen unterstützt seine potenzielle Implementierung als zuverlässiges Entscheidungsunterstützungsinstrument für die frühe OP-Risikostratifizierung in diabetischen Populationen.

Einleitung

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Diabetes mellitus und Osteoporose (OP) sind sehr verbreitete chronische Erkrankungen, die zunehmend koexistieren und durch Zerbrechlichkeitsfrakturen, Behinderungen und Gesundheitskosten erhebliche Belastungen verursachen. Bei Patienten mit Typ-2-Diabetes (Typ-2D) ist das Bruchrisiko paradoxerweise erhöht, selbst wenn die flächenmäßige Knochenmineraldichte (BMD), gemessen durch die Dual-Energie-Röntgenabsorptiometrie (DXA), erhalten oder höher als erwartet ist, was zeigt, dass Knochenqualität und systemische Stoffwechselfaktoren wesentlich zur skelettalen Fragilitätbeitragen 1,2. Obwohl DXA der klinische Standard für die Diagnose des Fragestellers ist, bleiben seine Zugänglichkeit und Verbreitung in vielen Situationen begrenzt, und DXA-basierte Beurteilung kann das diabetesbedingte skelettale Risiko unterschätzen. Auf Bevölkerungsebene deuten meta-analytische Evidenz darauf hin, dass OP bei Menschen mit Diabetes häufig vorkommt, obwohl Prävalenzschätzungen zwischen Kohorten und klinischen Kontexten variieren3. Daher besteht ein akuter klinischer Bedarf und eine starke Motivation, pragmatische, skalierbare Risikoprognosetools zu entwickeln, die routinemäßig gesammelte klinische Daten nutzen, um Hochrisikopatienten früher zu identifizieren und so gezielte Screenings und individuelle Präventionsstrategien zu steuern.

In den letzten Jahren wurden maschinelles Lernen (ML) zunehmend eingesetzt, um komplexe, nichtlineare Beziehungen in klinischen Daten zu modellieren und OP-Risikoprädiktoren für Patienten mit Diabetes zu erstellen. Frühere Studien haben vielversprechende Diskriminierung mit Algorithmen wie Gradient Boosting, Support Vector Machines, neuronalen Netzen und nomogrammähnlichen Tools gezeigt. Insbesondere haben jüngste Fortschritte innovative Modellierungsstrategien erforscht, wie die Verschmelzung von ML mit Fuzzy-Logik, um OP- und diabetesbezogene Risiken anhand der modifizierbaren Faktoren 4,5,6 vorherzusagen. Es besteht jedoch eine bedeutende Forschungslücke: Viele bestehende Modelle wurden in eingeschränkten Untergruppen entwickelt (z. B. ausschließlich postmenopausale Frauen oder ältere T2D-Patienten) und innerhalb eines begrenzten Satzes von Kandidatenalgorithmen evaluiert, was Unsicherheit darüber lässt, welche Modellierungsoptionen für breitere diabetische Populationen und heterogene elektronische Gesundheitsakten (EHR) optimal sind. Darüber hinaus ist ein entscheidendes Hindernis für die klinische Einführung dieser leistungsstarken ML-Modelle ihre "Black-Box"-Natur, die das Vertrauen der Kliniker einschränkt und die Umsetzung in umsetzbare Entscheidungsunterstützung erschwert. SHapley Additive ExPlanations (SHAP) bietet eine Lösung, indem es Fall-Erklärungen bietet, wobei jede Vorhersage einzelnen Merkmalen anhand von Shapley-Werten zugeordnet wird, wodurch Kliniker überprüfen können, ob die Argumentation des Modells mit klinischer Plausibilität übereinstimmt.

Um diese Lücken zu schließen, entwickelten und validierten wir ein OP-Risikovorhersage-Framework für Patienten mit Diabetes mithilfe der Medical Information Mart for Intensive Care IV (MIMIC-IV) Critical Care EHR-Datenbank7. Die Neuheit dieser Studie liegt im umfassenden Benchmarking über mehrere ML-Modellfamilien hinweg, kombiniert mit transparenter SHAP-basierter Interpretierbarkeit innerhalb einer großen, klinisch komplexen diabetischen Kohorte. Im Gegensatz zu Studien, die auf einem einzigen Algorithmus basieren, wählt unser End-to-End-Ansatz systematisch das leistungsstärkste Modell auf der Grundlage rigoroser Validierung aus und liefert transparente, patientenbezogene Erklärungen. Dieses Rahmenwerk zielt darauf ab, sowohl robuste prädiktive Leistungen als auch klinisch umsetzbare Erkenntnisse zu liefern und eine frühere Risikostratifizierung für OP bei Patienten mit Diabetes zu unterstützen.

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Protokoll

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Datenquelle und Ethikerklärung
Diese retrospektive Studie nutzte Daten aus der MIMIC-IV (Version 3.1), einer öffentlich zugänglichen, de-identifizierten Intensivmedizin-EHR-Datenbank, die auf PhysioNet gehostet wird. Die Datenbank enthält demografische Informationen, Vitalzeichen, Labortests, Diagnosen, Verfahren und Medikamente.

Der Zugang zu MIMIC-IV erfordert eine akkreditierte Autorisierung sowie die Einhaltung der PhysioNet-Datennutzungsvereinbarung und der Schulungsanforderungen. Die Ermittler absolvierten die erforderliche Schulung und erhielten Zugang (Zertifikatsnummer: 68351548). Da die Datenbank de-identifiziert ist, analysierte diese Studie anonymisierte Daten und beinhaltete keinen direkten Kontakt mit Patienten; daher war eine informierte Einwilligung nicht erforderlich. Der vollständige, schrittweise ausführbare Modellierungs-Workflow ist in Abbildung 1 dargestellt.

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Abbildung 1. Gesamtmodellierung des Ablaufs für Osteoporose (OP) Risikovorhersage bei Patienten mit Diabetes. Schematische Darstellung der Studienpipeline, einschließlich Kohortenidentifikation, Datenextraktion, Feature Engineering, Multi-Modell-Benchmarking, Modellauswahl basierend auf Validierungsleistung und SHAP-basierter Interpretierbarkeit des Endmodells. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzusehen.

Untersuchung von Population und Datenextraktion
Die Daten wurden aus der Medical Information Mart for Intensive Care IV (MIMIC-IV) Datenbank mit einem Datenbankmanagement-Tool extrahiert. Um die Reproduzierbarkeit zu gewährleisten, werden die genauen SQL-Abfragen, einschließlich Tabellennamen und Filterungslogik für die Kohortenabrufe, in Supplementary File 1 bereitgestellt. Erwachsene Patienten (≥18 Jahre alt), bei denen Diabetes mellitus diagnostiziert wurde, wurden mit ICD-9-Codes (249, 250) und ICD-10 (E08–E13) identifiziert. Das primäre Ergebnis, OP, wurde mit ICD-9-Codes (733.x) und ICD-10-Codes (M80, M81, M82) definiert. Innerhalb der anfänglich zulässigen diabetischen Kohorte (n = 46.226) wurden 3.672 positive Ereignisse (Patienten mit OP) und 42.554 negative Ereignisse (Patienten ohne OP) identifiziert. Ein detailliertes Flussdiagramm zur Patientenauswahl und Abnutzung ist in Abbildung 2 dargestellt.

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Abbildung 2. Flussdiagramm der Patientenauswahl und Kohortenstruktur. Das Flussdiagramm veranschaulicht die schrittweise Kohortenableitung aus der MIMIC-IV (v3.1)-Datenbank. Erwachsene Patienten mit Diabetes mellitus wurden mit ICD-Codes identifiziert, gefolgt vom Ausschluss von Patienten mit Alter & LT; 18 Jahre, fehlende kritische Daten & gt; 30 % oder ungültige Unterlagen. Die letzte Kohorte wurde in OP (positive Ereignisse) und Nicht-OP (negative Ereignisse) unterteilt. Das Klassenungleichgewicht wurde mittels zufälliger Unterstichprobe behoben und SMOTE auf die Trainingsdaten angewendet, bevor die stratifizierte Datensatzaufteilung durchgeführt wurde. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzusehen.

Feature-Engineering
Um ein faires Benchmarking über mehrere ML-Algorithmen hinweg und eine präzise Reproduzierbarkeit sicherzustellen, wurde eine identische Abfolge von Vorverarbeitungsschritten angewendet: Merkmalauswahl, fehlende Wert-Imputation, kontinuierliche Merkmalskalierung, Klassenbalancierung und Datensatzaufteilung. Die vollständige Liste der Eingabefunktionen, einschließlich Variablennamen, Einheiten und Datenquellen, ist in Tabelle 1 detailliert dargestellt.

MerkmaleGesamt
(n = 14.688)
Trainingsset
(n = 9.546)
Validierungsmenge
(n = 2.204)
Testsatz
(n = 2.938)
P-Wert
Geschlecht0.345
Männlich6222 (42.36%)4045 (42.37%)935 (42.42%)1242 (42.27%)
Weiblich8466 (57.64%)5501 (57.63%)1269 (57.58%)1696 (57.73%)
Alter0,28 (−0,40, 0,94)0,28 (−0,43, 0,94)0,23 (−0,46, 0,89)0,28 (−0,39, 0,95)0.1655
Rote Blutkörperchen−0,14 (−0,79, 0,49)−0,13 (−0,79, 0,49)−0,17 (−0,83, 0,48)−0,14 (−0,76, 0,49)0.3641
Hämatokrit−0,14 (−0,81, 0,52)−0,13 (−0,80, 0,52)−0,14 (−0,87, 0,51)−0,16 (−0,81, 0,52)0.3709
Hämoglobin−0,12 (−0,79, 0,52)−0,12 (−0,79, 0,51)−0,15 (−0,86, 0,53)−0,13 (−0,78, 0,52)0.3616
RDW−0,16 (−0,59, 0,45)−0,17 (−0,59, 0,46)−0,14 (−0,59, 0,45)−0,17 (−0,60, 0,42)0.5803
Phosphat−0,14 (−0,60, 0,38)−0,15 (−0,61, 0,38)−0,11 (−0,57, 0,38)−0,13 (−0,56, 0,34)0.415
MCV0,05 (−0,50, 0,63)0,06 (−0,50, 0,65)0,03 (−0,49, 0,65)0,02 (−0,50, 0,59)0.5408
Magnesium−0,10 (−0,52, 0,37)−0,10 (−0,52, 0,37)−0,10 (−0,52, 0,37)−0,09 (−0,50, 0,37)0.7797
Weiße Blutkörperchen−0,16 (−0,47, 0,21)−0,16 (−0,47, 0,20)−0,15 (−0,48, 0,25)−0,16 (−0,46, 0,20)0.6856
Anionenlücke−0,12 (−0,64, 0,45)−0,13 (−0,64, 0,45)−0,07 (−0,61, 0,48)−0,13 (−0,64, 0,45)0.1217
Kreatinin−0,30 (−0,48, 0,01)−0,30 (−0,48, 0,01)−0,30 (−0,46, 0,01)−0,30 (−0,48, −0,00)0.3323
MCH0,11 (−0,48, 0,62)0,12 (−0,48, 0,62)0,11 (−0,47, 0,62)0,09 (−0,48, 0,61)0.5195
Thrombozytenzahl−0,09 (−0,61, 0,49)−0,09 (−0,61, 0,49)−0,08 (−0,62, 0,47)−0,10 (−0,62, 0,48)0.9709
MCHC−0,00 (−0,59, 0,59)−0,00 (−0,60, 0,59)−0,00 (−0,57, 0,58)0,00 (−0,57, 0,60)0.9263
Chlorid0,05 (−0,54, 0,64)0,05 (−0,52, 0,65)0,03 (−0,59, 0,62)0,07 (−0,52, 0,62)0.4675
Kalium−0,07 (−0,67, 0,53)−0,09 (−0,67, 0,53)−0,07 (−0,67, 0,53)−0,07 (−0,62, 0,53)0.3071
Natrium0,05 (−0,56, 0,60)0,05 (−0,55, 0,60)−0,00 (−0,60, 0,60)0,07 (−0,57, 0,61)0.3492
Harnstoffstickstoff−0,28 (−0,60, 0,29)−0,28 (−0,60, 0,29)−0,26 (−0,59, 0,31)−0,28 (−0,59, 0,25)0.6826
Gesamtcalcium0,02 (−0,61, 0,59)0,02 (−0,61, 0,59)−0,01 (−0,59, 0,56)0,01 (−0,61, 0,60)0.8203

Tabelle 1. Basismerkmale und technische Merkmale der Studienkohorte. Kategoriale Variablen werden als n (%) dargestellt. Stetige Variablen werden als Median (Interquartilbereich) standardisierter Werte dargestellt. P-Werte wurden berechnet, um die Verteilungen über die Trainings-, Validierungs- und Testsets mit geeigneten statistischen Tests zu vergleichen.

Kontinuierliche Variablen mit wiederholten Messungen wurden anhand des arithmetischen Mittelwerts innerhalb des gesamten Intensivaufenthaltszeitraums aggregiert, um pro Patient einen einzigen Merkmalsvektor zu erhalten. Variablen mit einer Fehlwirkungsrate von über 30 % wurden ausgeschlossen. Für die verbleibenden numerischen Variablen wurden fehlende Werte mit dem K-Nearest Neighbors (KNN)-Algorithmus (n_neighbors = 5, Gewichte = 'einheitlich') imputiert. Kategoriale Variablen wurden mit der häufigsten Kategorie imputiert und anschließend mittels binärer Abbildung transformiert, wobei alle unsichtbaren Kategorien einen Vektor von Nullstellen zugewiesen erhielten.

Kontinuierliche Variablen wurden mit der z-Score-Skalierungsformel standardisiert (). Merkmale mit null Varianz wurden vor der Skalierung explizit entfernt. Alle Vorverarbeitungsparameter (μ und σ.) wurden streng auf dem Trainingsset geschätzt und konsistent auf die Validierungs- und Testsätze angewendet.

Angesichts des starken Klassenungleichgewichts (3.672 vs. 42.554) wurde eine hybride Ausgleichsstrategie ausschließlich auf die Trainingsdaten angewandt, um überhöhte Leistungsschätzungen zu vermeiden. Zunächst wurde eine zufällige Unterstichprobe verwendet, um die Mehrheits-Negativ-Klasse zu reduzieren und ein Verhältnis von 1:2 (positiv:negativ) zu erreichen (was 7.344 negative Stichproben ergibt). Anschließend wurde die Synthetic Minority Over-sampling Technique (SMOTE) auf die positive Klasse angewendet, um ein endgültiges 1:1-Balance-Verhältnis (7.344 vs. 7.344)8 zu erreichen.

Schließlich wurde die Kohorte auf Patientenebene in Trainingsgruppen (65 %), Validierungsgruppen (15 %) und Testgruppen (20 %) mittels stratifizierter Stichprobe aufgeteilt. Um alle Zufallsprozesse bei Imputation, Balancing und Spaltung streng zu kontrollieren, wurde ein globaler Zufallsseed (random_state = 42) durchgesetzt.

Modellarchitektur
Um das am besten geeignete prädiktive Modell für das OP-Risiko bei Patienten mit Diabetes zu identifizieren, wurde ein groß angelegtes Benchmarking-Framework verwendet, um 70 ML-Algorithmusvarianten unter einem identischen Datenrepräsentations- und Bewertungsprotokoll zu vergleichen. Kandidatenmodellfamilien umfassten regularisierte lineare Klassifikatoren, Support Vector Machines (SVMs), kNN, Baumensembles, Gradient Boosting-Architekturen und Mehrschicht-Perzeptronen 9,10,11,12,13,14,15,16,17.

Anstelle einer traditionellen Gittersuche wurde die Hyperparameteroptimierung durchgeführt, indem vordefinierte, robuste Konfigurationen über diese 70 Modellvarianten im Training Split ausgewertet wurden. Die Auswahl basierte ausschließlich darauf, die Fläche unter der Empfänger-Betriebscharakteristik (ROC)-Kurve (AUC) auf dem Validierungssatz zu maximieren. Das endgültig leistungsfähige Modell wurde mit n_estimators = 200 konfiguriert, wobei andere Parameter auf den Standardeinstellungen des in der Materialtabelle aufgeführten Softwarepakets blieben. Evaluationskennzahlen, darunter AUC, Genauigkeit, F1-Score, Präzision und Abruf, wurden mit einer Standard-Wahrscheinlichkeitsschwelle von 0,5 berechnet.

Zur Unterstützung der klinischen Transparenz wurde SHAP auf das ausgewählte Modell mit der TreeExplainer-Methode angewendet. Angesichts der baumbasierten Natur des endgültigen Modells wurden exakte, pfadabhängige Erwartungswerte als Hintergrundkonfiguration verwendet.

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Ergebnisse

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Leistungsvergleich des Modells
Um den optimalen prädiktiven Ansatz für OP bei Patienten mit Diabetes zu identifizieren, wurden mehrere ML-Modelle systematisch verglichen. Ein regularisierter linearer Klassifikator (logistische Regression) wurde als Basissteuerungsmodell aufgenommen. Der Gesamtleistungsvergleich ist in den Abbildungen 3–6 zusammengefasst. In allen evaluierten Modellen übertroffen ensemblebaumbasierte Methoden die lineare Baseline hinsi...

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Diskussion

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In dieser Studie wurden mehrere ML-Algorithmen systematisch verglichen, um ein optimales Vorhersagemodell für OP bei Patienten mit Diabetes zu identifizieren. Ensemblebaumbasierte Methoden, insbesondere das ExtraTrees-Modell, zeigten eine verbesserte Diskriminierung, eine zuverlässige Wahrscheinlichkeitskalibrierung und einen größeren klinischen Nettonutzen im Vergleich zu linearen Baselines und anderen Algorithmenfamilien. Diese Ergebnisse zeigen, dass nichtlineare Wechselwirkungen und ...

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Offenlegungen

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Die Autoren erklären, dass die Forschung ohne kommerzielle oder finanzielle Beziehungen durchgeführt wurde, die als potenzieller Interessenkonflikt ausgelegt werden könnten.

Danksagungen

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Die Autoren danken dankbar für die finanzielle Unterstützung des Nantong Municipal Science and Technology Project (Zuschussnummer JC2023039) und das Social Development Guidance Program des Nantong Science and Technology Bureau (Zuschussnummer MSZ2023054).

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Materialien

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Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
CatBoostYandexv1.2 (oder anwendbar)Für kategorische Merkmale optimierter Gradient-Boosting-Algorithmus
imbalanced-learn (SMOTE)Scikit-learn Contribv0.11 (oder anwendbar)Bibliothek zur Durchführung der synthetischen Minoritäts-Oversampling-Technik zur Klassenausgleichung
LightGBMMicrosoft Corporationv4.0 (oder anwendbar)Auf Entscheidungsbäumen basierendes Gradient-Boosting-Framework
MatplotlibMatplotlib Development Teamv3.7 (oder anwendbar)Visualisierungsbibliothek zum Erstellen von Grafiken und Leistungskurven
MIMIC-IV Clinical DatabasePhysioNetv3.1Öffentlich verfügbares elektronisches Gesundheitsakten-Datenset für die Intensivpflege, das als Datenquelle verwendet wird
Navicat PremiumPremiumSoft CyberTech Ltd.v17.0Datenbankverwaltungstool zur SQL-basierten Datenextraktion
NumPyNumPy Developersv1.24 (oder anwendbar)Bibliothek für numerische Berechnungen, die für Array-Operationen und Datenverarbeitung verwendet wird
OpenPyXLEric Gazoni, Charlie Clarkv3.1 (oder anwendbar)Bibliothek zum Lesen und Schreiben von Excel-Dateien
PandasPandas Development Teamv2.0 (oder anwendbar)Bibliothek zur Datenmanipulation und -analyse für strukturierte Datensätze
PostgreSQLPostgreSQL Global Development Groupv14 (oder anwendbar)Relationales Datenbanksystem zur Abfrage und Verwaltung von MIMIC-IV-Daten
PythonPython Software Foundationv3.8+ (oder anwendbar)Programmiersprache zur Datenverarbeitung, Modellierung und Analyse
Scikit-learnScikit-learn Developersv1.3 (oder anwendbar)Bibliothek für maschinelles Lernen zur Modellentwicklung, Vorverarbeitung und Bewertung
SciPySciPy Developersv1.10 (oder anwendbar)Bibliothek für wissenschaftliches Rechnen zur statistischen Analyse
SeabornMichael Waskomv0.12 (oder anwendbar)Bibliothek zur statistischen Datenvisualisierung für verbesserte grafische Ausgaben
SHAP (SHapley Additive exPlanations)Scott Lundbergv0.42 (oder anwendbar)Framework zur Interpretation von Modellvorhersagen mithilfe von Feature-Attributionswerten
XGBoostDMLC (Distributed Machine Learning Community)v2.0 (oder anwendbar)Häufig verwendeter Gradient-Boosting-Algorithmus für strukturierte Datenmodellierung
```

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Schlagwörter

MedicineAlldiabetes mellitusosteoporosisMachine learningExtraTreesExplainable Artificial IntelligenceRisk predictionBone fragility

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