Quelle: Dominique R. Bollino1, Eric A. Legenzov2, Tonya J. Webb1
1 Department of Microbiology and Immunology, University of Maryland School of Medicine…
1. Materialien
Puffer
ausrüstung
Materialien und Reagenzien
Assay Spezifische Reagenzien
2. Protokoll
Vorbereitung auf Antikörperfärbung
Säzellen
fixierung
Permeabilisierung
Blockieren
Primäre Antikörper-Inkubation
Hinweis: Wenn Sie nach mehr als einem Ziel suchen, stellen Sie sicher, dass die primären Antikörper unterschiedliche Isotypen sind. Die empfohlenen Antikörperkonzentrationen variieren zwischen den Herstellern und sollten vor der Anwendung titriert werden.
Sekundäre Antikörperinkubation
Hinweis: Die empfohlenen Antikörperkonzentrationen variieren je nach Hersteller und sollten vor der Anwendung titriert werden. Bei der Suche nach mehr als einem Ziel müssen sekundäre Antikörper mit verschiedenen Fluorophoren mit einzigartigen Anregungs-/Emissionsspektren konjugiert werden. Beachten Sie auch die Anregung/Emission des nuklearen Gegenflecks (d.h. DAPI) bei der Auswahl der Fluorophore. Die Fluorophorauswahl kann durch die Laserkonfiguration des verwendeten Konfokalmikroskops beeinflusst werden. Die Laserkonfiguration der Maschine bestimmt, welche Fluorophore für das Experiment geeignet sind.
3. Montage von Abdeckungen
4. Konfokale Bildgebung
Bildproben auf einem konfokalen Laserscanmikroskop. Für die in Abbildung 2 dargestellten Daten wurde die Nikon Eclipse Ti A1R mit der Software NIS Elements Advanced Research verwendet. Im folgenden Abschnitt wird das Verfahren zum Erfassen von Bildern mit der oben genannten Software beschrieben.
Die konfokale Fluoreszenzmikroskopie ist ein spezialisiertes bildgebendes Verfahren zur Lokalisierung eines Proteins oder Antigens von Interesse in einer Zell- oder Gewebeprobe, indem das Antigen mit einem Antikörper-konjugierten Fluoreszenzfarbstoff markiert und das Fluoreszenzsignal nachgewiesen wird. Sie bietet eine höhere räumliche Auflösung als die Weitfeld-Fluoreszenzmikroskopie, mit Hilfe von zwei Lochblenden, die in den Brennebenen der Objektivlinse platziert sind, was ihr den Namen konfokal gibt. Es ermöglicht dem Anwender, die Färbung auf subzellulärer Ebene zu visualisieren, wie z.B. die Unterscheidung zwischen Oberflächenmembranfärbung und intrazellulärer Färbung.
Ein konfokales Mikroskop folgt einem ähnlichen Grundprinzip wie ein klassisches Fluoreszenzmikroskop. Der Strahl einer Lichtquelle, in der Regel ein konfokaler Laser, wird von einem dichroitischen Spiegel reflektiert und durch eine Objektivlinse auf die Probe fokussiert. Dieses Licht regt die Fluorophore an, eine andere Wellenlänge zu emittieren, die durch die Objektivlinse und den dichroitischen Spiegel zurück zu einer Kamera oder einem Okular wandert.
Die erhöhte Auflösung eines konfokalen Mikroskops ist hauptsächlich auf das Vorhandensein von zwei Lochblenden zurückzuführen, bei denen es sich um sehr kleine Löcher handelt, durch die Licht auf dem Anregungs- und Emissionslichtweg dringt. Die Lochblenden sind strategisch in der Brennebene der Objektivlinse platziert. Wechseln wir nun zu einem Schema der Mikroskopanordnung in der Seitenansicht, um den Strahlengang zu überprüfen. Nach dem Durchgang durch die Anregungslochblende hat der Anregungslichtstrahl den Effekt, dass er von einem Brennpunkt ausgeht, was es der Objektivlinse ermöglicht, das Licht dann ebenfalls auf einen Punkt auf der Probe zu fokussieren. Der Emissionsstrahl von diesem Brennpunkt konvergiert an der Emissionslochblende, wodurch er durchgelassen werden kann. Während der Anregung werden nun auch Fluorophore innerhalb des Strahlengangs, oberhalb und unterhalb des Brennpunkts, leicht angeregt. Während das vom Brennpunkt ausgehende Emissionslicht durch die Lochblende fällt, konvergieren die Emissionen der unscharfen Punkte vor oder nach der Lochblende und werden daher blockiert, was zu einer verringerten Hintergrundfluoreszenz führt.
Der Anregungs-Emissions-Detektionszyklus muss für jeden Bildpunkt in der interessierenden Region wiederholt werden, was auf verschiedene Arten erfolgen kann. Beim konfokalen Laserscanning werden beispielsweise Galvanometer-Scanning-Spiegel verwendet, die das Anregungslicht in verschiedenen Winkeln ablenken. Daher wird der Lichtstrahl über die Probe in der XY-Ebene geschwenkt. Bei der konfokalen Spinning-Scheibe wird eine Scheibe mit einer Anordnung von Lochblenden verwendet, die sich dreht, um die Anordnung der Lochblenden zu verschieben. Auf diese Weise können jedes Mal mehrere kleine Bildpunkte in der Probe beleuchtet werden, die beim Drehen der Scheibe allmählich den gesamten Bereich abdecken. Infolge der Lochblenden stellt das XY-Bild am Detektor eine schmale Z-Ebene dar. Daher können Bilder aus einer Reihe aufeinanderfolgender Z-Ebenen gesammelt werden, die häufig als Z-Stapel bezeichnet werden. Aus diesen Bildern kann eine entsprechende Software eine 3D-Darstellung des Fluoreszenzsignalmusters in der Probe erzeugen.
In diesem Protokoll beobachten Sie die Immunfärbung von Mausfibroblasten, gefolgt von der Bildgebung an einem konfokalen Mikroskop, um ein Zelloberflächenprotein und ein lysosomales Protein unterschiedlich sichtbar zu machen.
Zu Beginn resuspendieren Sie die interessierenden Zellen mit sterilen Techniken in 500 Mikrolitern Wachstumsmedium pro Vertiefung und säen sie dann in die Vertiefungen eines Objektträgers mit vier Vertiefungen. Hier verwenden wir Maus-Fibroblasten, die transfiziert wurden, um das Antigen-präsentierende Molekül CD1d zu exprimieren. Damit die Zellen am Glas haften können, legen Sie den Objektträger in einen 5%igen Kohlendioxid-Inkubator bei 37 Grad Celsius und inkubieren Sie ihn über Nacht. Saugen Sie morgens das Medium aus jeder Vertiefung an und waschen Sie die Zellen dann einmal einige Sekunden lang mit 500 Mikrolitern PBS.
Um die Zellen zu fixieren, geben Sie 500 Mikroliter 1%ige Paraformaldehydlösung in jede Vertiefung und inkubieren Sie sie 15 Minuten lang bei Raumtemperatur. Sammeln Sie nach der Inkubation das Paraformaldehyd in einem geeigneten Behälter für gefährliche flüssige Abfälle und entfernen Sie dann alle Reste des Fixiermittels, indem Sie die Zellen einige Sekunden lang dreimal mit PBS waschen.
Um das Eindringen von Antikörpern in die Zellen zu ermöglichen, geben Sie 500 Mikroliter Permeabilisierungspuffer in jede Vertiefung und inkubieren Sie 15 Minuten lang bei Raumtemperatur auf der Bank. Waschen Sie die Zellen nach der Permeabilisierung dreimal kurz mit 500 Mikrolitern PBS. Geben Sie anschließend 500 Mikroliter Blockierungspuffer in jede Vertiefung und inkubieren Sie eine Stunde lang bei vier Grad Celsius, um eine unspezifische Antikörperbindung zu verhindern.
Bereiten Sie die primären Antikörper, Anti-CD1d und Anti-LAMP-1, in geeigneten Arbeitskonzentrationen vor. Aspirieren Sie dann den Puffer aus den Vertiefungen und bedecken Sie die Zellen in jeder Vertiefung mit 500 Mikrolitern verdünnter Primärantikörperlösung und inkubieren Sie den Objektträger dann über Nacht auf einer ebenen Fläche bei vier Grad Celsius. Am nächsten Morgen werden die Sekundärantikörper, in diesem Fall ein Anti-Maus- und ein Anti-Ratten-Antikörper mit unterschiedlichen Fluoreszenz-Tags, in einem Blockpuffer auf geeignete Arbeitskonzentrationen verdünnt. Als nächstes aspirieren Sie die primäre Antikörperlösung aus den Vertiefungen und waschen die Zellen dann viermal mit 500 Mikrolitern PBS. Geben Sie dann 500 Mikroliter der verdünnten Sekundärantikörperlösung in jede Vertiefung und inkubieren Sie eine Stunde lang bei Raumtemperatur im Dunkeln. Nach der Inkubation aspirieren Sie die Sekundärantikörperlösung und waschen Sie die Vertiefungen viermal mit 500 Mikrolitern PBS, um alle ungebundenen Sekundärantikörper zu entfernen.
Um die Proben nach der letzten Wäsche zu montieren, lösen Sie die Kammern vorsichtig vom Objektträger und entfernen Sie sie. Um das restliche PBS zu entfernen, halten Sie den Objektträger schräg über ein empfindliches Tuch und entfernen Sie die Flüssigkeit von den Rändern, ohne die Zellen zu berühren. Sobald das überschüssige PBS entfernt ist, geben Sie einen Tropfen Antifading-Eindeckmedium, das den Kernfleck DAPI enthält, auf jeden Zellabschnitt. Nehmen Sie als Nächstes ein 20 x 60 Millimeter großes Deckglas und senken Sie das Deckglas mit nur den Fingerspitzen langsam an beiden Kanten ab, wobei Sie darauf achten, dass sich keine Blasen über den Zellen bilden. Wischen Sie überschüssiges Montagemedium auf den Objektträgern mit einem zarten Arbeitstuch ab und lagern Sie die Objektträger bis zu einer Woche lang im Dunkeln bei Raumtemperatur.
Um mit dem Imaging der Zellen zu beginnen, klicken Sie zunächst auf das NIS-Software-Symbol auf dem Desktop. Sobald Sie sich im Steuerungsfenster befinden, klicken Sie oben auf die Registerkarte TiPad und wählen Sie das gewünschte Objektiv für die Bildgebung aus. Legen Sie dann den Objektträger mit den Zellen auf den Tisch und zentrieren Sie ihn unter der Linse. Richten Sie anschließend auf der Registerkarte A1plus Compact GUI neben der Registerkarte TiPad die Laser ein, die für die verwendeten Fluorophore geeignet sind. Klicken Sie auf das Zahnradsymbol, um das Menü mit den Farb- und Spektraleinstellungen zu öffnen. Sobald das Menü für die Farb- und Spektraleinstellungen geöffnet ist, wählen Sie die gewünschten Kanäle aus und stellen Sie den Laser für jeden Kanal ein. Wählen Sie dann die entsprechenden Emissionen im Dropdown-Menü unter dem ersten dichroitischen Spiegel aus. Klicken Sie anschließend im A1plus Compact GUI-Fenster auf Ch.Series, um die Linienkanalserie einzurichten, die festlegt, ob die verwendeten Laser gleichzeitig oder nacheinander auf die Probe feuern.
Starten Sie danach den Scanvorgang, indem Sie auf das Pfeiltipp-Symbol oben klicken. Klicken Sie zu diesem Zeitpunkt, während das Bild live ist, im A1plus Compact GUI-Fenster auf die Schiebeskala und ändern Sie die Lochblendengröße, um sicherzustellen, dass unscharfes Licht begrenzt wird. Stellen Sie als Nächstes die Hochspannungs- und Offset-Einstellungen unter jedem Laser auf ein geeignetes Niveau ein, indem Sie die Schiebeskalen verwenden, um die Erkennung der spezifischen Färbung zu ermöglichen und gleichzeitig mögliche Hintergrundflecken zu begrenzen. Wenn eine positive Färbeprobe verfügbar ist, beginnen Sie mit der Abbildung dieser Probe für jeden Kanal, um sicherzustellen, dass die Lasereinstellungen ein optimales Signal-Rausch-Verhältnis ergeben. Nachdem Sie die optimalen HV- und Offset-Werte für jeden Laser eingestellt haben, klicken Sie auf die Registerkarte ND-Erfassung und wählen Sie dann das Z-Symbol aus, um die Parameter für die z-Serie einzurichten.
Wenn Sie als Nächstes ein Live-Bild des Beispiels aufnehmen, legen Sie zunächst den unteren Rand des Bildes fest, indem Sie den unteren Rand des Bildes suchen und auf die untere Schaltfläche klicken. Suchen Sie dann die obere Position des Beispiels und klicken Sie auf die obere Schaltfläche. Legen Sie die Schrittweite fest, indem Sie entweder die bevorzugte Schrittgröße in Mikrometern für jeden Schritt eingeben oder indem Sie angeben, wie viele Schritte insgesamt erforderlich sind. Um die gewünschte Größe/Pixelauflösung des Bildes auszuwählen, klicken Sie auf das Aiplus Compact GUI-Fenster und wählen Sie unter dem Größensymbol die gewünschte Auflösung aus.
Um das Rauschen des Bildes zu verringern, können Sie das Dropdown-Menü neben dem Theta-Symbol auswählen, um die ausgewählte Anzahl von Bildern zu mitteln. Klicken Sie anschließend im Menü ND-Erfassung auf die Registerkarte Jetzt ausführen, um mit der Bildgebung der Probe zu beginnen. Nachdem das Imaging abgeschlossen ist, speichern Sie das Bild, indem Sie auf Datei und dann auf Speichern unter klicken, wodurch die Bilddatei mit der Erweiterung dot-nd2 exportiert wird. Wiederholen Sie abschließend den Vorgang für jede der anderen Proben.
In diesem Experiment wurden Mausfibroblasten, die das Oberflächenglykoprotein-Gen CD1d exprimieren, fixiert, immungefärbt und auf einem konfokalen Mikroskop abgebildet. Dieses Bild zeigt einen einzelnen Ausschnitt eines Z-Stapels bei 40-facher Vergrößerung, in dem CD1d rot gefärbt ist. Die Probe wurde mit LAMP-1, einem lysosomalen Marker, in grün gefärbt. Die Kernfärbung DAPI wurde verwendet, um die Zellkerne zu zeigen.
In einem zusammengesetzten Bild, in dem die drei verschiedenen Kanäle verschmolzen sind, resultiert das Erscheinungsbild von Gelb aus der Überlappung der roten und grünen Kanäle und zeigt einen Bereich an, in dem CD1d und LAMP-1 in den Lysosomen kolokalisiert sind. Bereiche, in denen nur eine Farbe vorhanden ist, weisen auf das Vorhandensein von CD1d oder LAMP-1 ohne Co-Lokalisierung hin. Dieses Bild zeigt ein 3D-Rendering der Zellen, die aus Bildern erstellt wurden, die im Z-Stapel aufgenommen wurden, und diese Methode ermöglichte die Erstellung einer Seitenansicht dieser Zellgruppe. Das folgende Bild zeigt einen Ausschnitt aus dem Z-Stapel bei 100-facher Vergrößerung, der die Expressionsmuster dieser beiden Proteine im Detail zeigt. Das rosa umrandete Feld auf der rechten Seite des Bildes zeigt den Querschnitt der X-Koordinate an, die durch die rosa Linie im Bild gekennzeichnet ist, die die Seitenansicht an der rosa Linie darstellt. In ähnlicher Weise zeigt das blau umrandete Feld am unteren Rand des Bildes den Querschnitt der Y-Koordinate, die durch die blaue Linie im Bild gekennzeichnet ist und die Vorderansicht an der blauen Linie darstellt. Das 3D-Rendering des Z-Stapel-Bildes ermöglicht es Benutzern, das Bild in 3D anzuzeigen und alle X-, Y- und Z-Ebenen zu visualisieren. Dies kann verwendet werden, um die Co-Lokalisation der verschiedenen Färbungen in verschiedenen Regionen innerhalb der Zelle zu untersuchen.
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Q1: How does confocal microscopy achieve better resolution than wide-field fluorescence microscopy?
Confocal microscopy uses two strategically placed pinholes at the focal planes of the objective lens to block out-of-focus light. While wide-field microscopy detects fluorescence from above and below the focal plane, creating hazy background, confocal pinholes allow only light from the focal point to reach the detector. This eliminates background fluorescence and dramatically improves both spatial resolution and image contrast.
Q2: What role do pinholes play in confocal microscope imaging?
Pinholes are small holes positioned on both the excitation and emission light paths at the focal plane of the objective lens. The excitation pinhole makes the light beam appear to originate from a focal point, enabling precise focusing. The emission pinhole blocks divergent light from out-of-focus regions, allowing only in-focus fluorescence to pass through to the detector, resulting in reduced background and improved image clarity.
Q3: How can confocal microscopy distinguish between surface and intracellular protein localization?
Confocal microscopy achieves subcellular resolution by collecting images from narrow Z planes using pinholes that eliminate out-of-focus light. This enables visualization at the subcellular level, allowing researchers to differentiate between surface membrane staining and intracellular staining. The technique can reveal whether proteins are located on the cell surface or within specific organelles like lysosomes.
Q4: What is a Z-stack and how is it used in confocal microscopy?
A Z-stack is a series of consecutive images collected from adjacent focal planes throughout the depth of a sample. Because confocal pinholes restrict detection to narrow Z planes, images can be acquired sequentially from top to bottom of the specimen. Specialized software then processes these Z-stack images to generate a three-dimensional depiction of the fluorescence signal pattern, enabling visualization of protein localization in all spatial dimensions.
Q5: Why is sample fixation preferred over live cell imaging for confocal microscopy?
Fixed cells are preferred for confocal Z-stack imaging because acquiring multiple images from numerous Z planes is time-consuming and challenging with live cells. Live cells are difficult to maintain healthy during extended imaging, and their organelles constantly move, compromising image quality and 3D reconstruction accuracy. Fixed cells preserve cellular morphology and remain stationary, allowing reliable collection of high-quality image series.
Q6: How do secondary antibodies with distinct fluorescent tags enable multi-protein visualization?
When imaging multiple cellular targets, primary antibodies from different species are used to label each antigen. Fluorophore-conjugated secondary antibodies, each with unique excitation and emission spectra, then bind to their respective primary antibodies. This allows the confocal microscope to distinguish signals from different proteins using separate laser channels, enabling simultaneous visualization and co-localization analysis of multiple antigens within the same cell.
Q7: What does co-localization indicate when visualizing multiple stained proteins in confocal images?
Co-localization occurs when two or more proteins occupy the same cellular region, appearing as color overlap in merged confocal images. For example, when red and green fluorescent signals overlap, they produce yellow, indicating that both proteins are present in the same subcellular compartment. This technique reveals functional relationships between proteins, such as whether CD1d traffics through lysosomal compartments marked by LAMP-1.