Elektrophoretischer Mobilitäts-Shift-Assay zum Nachweis von Transkriptionsfaktor-DNA-Komplexen

0 Aufrufe • 4:31 Min. • July 8th, 2025

Regulatorische Proteine, wie Transkriptionsfaktoren, erkennen und binden an spezifische DNA-Sequenzen in Promotorregionen und regulieren so die Genexpression.

Um spezifische Transkriptionsfaktor-DNA-Wechselwirkungen unter Verwendung des elektrophoretischen Mobilitätsverschiebungsassays nachzuweisen, beginnen Sie mit einem Röhrchen, das einen gewünschten Transkriptionsfaktor und spezifische kurze, infrarote, fluoreszierende Farbstoff-markierte DNA-Sonden in einem Bindungspuffer enthält. Inkubieren Sie im Dunkeln, um das Photobleichen des Farbstoffs zu verhindern.

Die Ionenstärke und der pH-Wert des Puffers bieten geeignete Bedingungen für den Transkriptionsfaktor, um spezifische Bindungssequenzen auf der DNA-Sonde zu identifizieren und zu binden. Magnesiumionen im Puffer stabilisieren die Protein-DNA-Komplexe zusätzlich.

Fügen Sie der Mischung einen geeigneten Ladefarbstoff hinzu, um den Fortschritt der Elektrophorese sichtbar zu machen. Laden Sie diese Mischung und die DNA-Sonden in die Vertiefungen eines vorgefertigten, nicht denaturierenden Polyacrylamidgels.

Führen Sie die Elektrophorese im Dunkeln durch.

Das angelegte elektrische Feld bewirkt, dass sich ungebundene, negativ gel

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