Name: Imaging von biologischem Gewebe durch Desorption Elektrospray-Ionisation-Massenspektrometrie (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2013-07-12T12:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 21 s
Description: Lernen Sie DESI-MS zur Abbildung chemischer Verteilungen in biologischen Geweben. Diese Methode ermöglicht die Analyse von Lipidmustern im Gehirngewebe mit minimaler Probenpräparation.

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Diese Arbeit wird durch ARRA NSF MRI Instrument Development Grant # 0923179 zu FMF unterstützt. Wir danken Aqua Asberry, Lab-Koordinator für die Parker H. Petit Institut für Bioengineering und Biowissenschaften Histologie Kern, für die Unterstützung bei Gewebe Schnitte.

1. Tissue Schnitte <ol><li> Shop-Flash-gefroren, ganz Gewebe in -80 ° C Gefrierschrank bis bereit zum Schneiden. </li><li> Lassen Sie die Gewebeprobe, um die Temperatur in der Kryomikrotom erreichen, bevor Schneiden (30 min). Legen Sie die Klinge und Probentemperatur bis -30 ° C. </li><li> Sobald Gewebe hat die Temperatur erreicht, die Handhabung der Probe mit einer Pinzette, geschnittene Vorder-oder Rückseite des Gehirns je nachdem, welcher Teil des Gehirns ist von Interesse für eine ausreichende Montagefläche (dh wenn die Vorderseite des Gehirns ist von primärer Bedeutung, montieren Rückseite des Gehirns auf Chuck). <ol><li> Bewerben ~ 0,5 ml Optimal Cutting Temperatur Compound (OCT, Tissue-Tek, Sakura) um Futter in der Mitte und mit einer Pinzette, halten Probe an Ort und Stelle in OCT bis sie erstarrt. Sobald Oktober ist komplett eingefroren, Mount Futter in Probenhalter. </li><li> Eine minimale Menge der OCT verwendet, um die Probe zu montieren ist bevorzugt (im Gegensatz zur Befestigung der Probe in einem Block der OCT wie allgemein in anderen histo getanlogische Verfahren), um die Verunreinigung der Probe zu minimieren. Kontamination der Probe durch OCT ist schädlich für die DESI-und Imaging-Verfahren aufgrund Ionensuppression. </li></ol></li><li> Typische Gewebeschnitten, die für MS Imaging Bereich von 12-18 &amp;mgr; m Dicke. § Gewebe an gewünschten Dicke innerhalb des empfohlenen Bereichs. Auftauen-mounten Sie jede geschnittene Gewebe durch leichtes Berühren eines Raumtemperatur-Mikroskop Objektträger über den Abschnitt. Sobald eine Probe montiert ist, seien Sie vorsichtig nicht, um das Gewebe Abschnitt berühren, wie es die chemischen Zusammensetzungen Ausschüttungen und wird sich ändern. </li></ol> Hinweis: Wir empfehlen die Montage von zwei Sektionen pro Folie, mit einem Abschnitt für die Optimierung und die andere für die Bildgebung. Sofern Teile sind nicht für den sofortigen Imaging, Speicher Folien in -80 ° C Gefrierschrank in einer Dia-Box bis zur Analyse bereit. <ol start="5"><li> Bei der Analyse gespeichert Abschnitte, entfernen Rutsche aus dem Gefrierschrank, sofort Vakuumexsiccator übertragen und erlauben ~ 15-20min zu tauen. Verlassen der Probe im Exsikkator länger trocknet die Probe und reduzieren DESI Effizienz. Die Optimierung der DESI-Ionenquelle mit der Gewebeprobe wird geschehen soll, wenn aufgetaut wurde jedoch im Interesse der Zeit dient die Zeitspanne, während der die Probe Auftauen als ideale Zeit für die Initialisierung des Gerätes. <ol><li> Verwendung von Acetonitril mit 1% Essigsäure als Lösungsmittel DESI auf der Spritzenpumpe mit einer Flussrate von 5 ml / min drehen. Eine geringere Fließgeschwindigkeit verringert sich die Auswirkungen vor Ort Seite der DESI-Spray und effektive Pixelgröße, aber eine höhere Fließgeschwindigkeit kann notwendig sein, für eine ausreichende Empfindlichkeit. Daher ist die Fließgeschwindigkeit (in der Regel 1-5 ml / min) sollte für jede Anwendung und der gewünschten Empfindlichkeit und Auflösung optimiert werden. Stellen Sie sicher, dass die Spritze genug Lösungsmittel für die komplette Optimierung und Bildgebung bei gegebenen Durchsatz enthält. </li><li> Nachdem das Lösungsmittel erscheint tropft aus der Quelle Spitze, am Stickstoff Zerstäubergases drehen mit einem pressure von 160 psi. </li><li> Schalten Sie die Hochspannungs-Stromversorgung verbunden Ionenquelle Anwendung 3.600 V. </li></ol></li><li> Montieren Sie den Schieber auf der Bühne und Bewegung beginnen Ionenquelle und MS-Optimierung </li></ol> 2. DESI Optimization <ol><li> Die DESI-System besteht aus einer Quelle Sonde (siehe Abbildung 2), eine Spritze und Pumpe oder alternative Lösungsmittel Delivery-System, komprimierten Stickstoff, Übersetzung Probertisch und montieren. Fahren Sie mit DESI Quelle Optimierung einmal das Massenspektrometer hat für die entsprechende Massenbereich und Analyten abgestimmt worden. <ol><li> Wenn die Source-Komponenten nicht auf noch nicht eingeschaltet, um Abschnitte 1.5.1-3 für Richtungen beziehen. </li><li> Die Variablen in diesen Abschnitten sind für die Bildgebung von biologischen Geweben empfohlen. Allerdings sollten diese Variablen für verschiedene Arten von Gewebe oder Probe zu optimieren. Alternative Lösungsmittel, Strömungsgeschwindigkeiten, Zerstäubergases Drücke und Spannungen haben für Imagi gemeldetng von biologischen Geweben. 16-18 </li></ol></li><li> Stellen Sie sicher, dass zunächst die DESI-Quelle wird nicht berühren die Glasplatte, und nicht in jedem Teil des Gewebes Abschnitt gerichtet. Dadurch wird sichergestellt, dass die Sonde nicht in der ersten Optimierung beschädigt und nicht kontaminieren Teil der Einrichtung durch den Kontakt mit der Gewebeprobe. <ol><li> Eine gute Ausgangsposition ist mit der Spitze 3 mm von der Probenoberfläche und 5 mm von der MS Kapillareinlass, mit der Sonde in einem Winkel von 55 ° in Bezug auf die Probenoberfläche. Die innere Kapillare des DESI Sonde sollte erstrecken ~ 1 mm über den äußeren Kapillare. Alle diese Parameter optimiert werden. </li></ol></li><li> Die MS-Schnittstelle Kapillare sollte eine Sammlung Winkel von ca. 15 ° gegenüber der Oberfläche der Probe für eine optimale Übertragung von Ionen. Stellen Sie die Höhe der Bühne, so dass die MS Kapillare schwebt über der Oberfläche der Probe; die Kapillare sollte &lt;1 mm von der Oberfläche, so nah wie möglichohne sie zu berühren. </li><li> Ausrichten DESI Sonde in der X-Dimension in bezug auf die MS Kapillareinlass so dass sie direkt in einer Linie sind. </li><li> Passen Sie die y-und z-Positionen der DESI Quelle für optimale Empfindlichkeit mit der zusätzlichen Gewebeschnitt. Beachten Sie, dass die DESI Fühler bei einer Probenfläche gerichtet ist, wird es schließlich zu desorbieren und zu ionisieren sämtliche Analyten in diesem Bereich und das Signal wird nach und nach abnehmen, wenn dies geschieht. Darstellende diesen Schritt so schnell wie möglich ist wichtig. <ol><li> Daher gesamten Optimierungsprozess, muss die Probe unter dem Sprühkopf bewegt werden, um sicherzustellen, dass frische Probe analysiert wird und dass alle Änderungen in Signal aufgrund Quelle Optimierung, nicht Probe Erschöpfung sind. Allerdings, wenn man bedenkt, dass die vielfältigen chemischen Zusammensetzung der verschiedenen Regionen des Gewebes, ein direkter Vergleich der Ionenintensität über den gesamten Gewebeschnitt nicht ganz genau. Der Thalamus des Gehirns bietet eine einigermaßen großformatigen Bereich mitkonsequenter chemische Zusammensetzung, aber noch nicht perfekt gleichmäßig. Alternativ kann eine Kennzeichnung der roten Sharpie, die den Farbstoff Rhodamin 6G enthält ([M] +, m / z 443), auf dem Objektträger von der Probe eine starke MS Reaktion DESI und kann auch für die Optimierung verwendet werden, aber Angesichts der unterschiedlichen Form und Probe Analyten können diese Bedingungen noch nicht zu einem idealen Aufbau für biologisches Gewebe korreliert. </li><li> Empfohlene y Trennung zwischen Quelle Spitze und Kapillareinlass: ~ 4 mm, empfohlen z Trennung zwischen Spitze und Probenoberfläche: ~ 1,5 mm. Obwohl diese Parameter wird etwas anders für jede Versuchsanordnung. </li><li> Unter Berücksichtigung der Geometrie und der Winkel der Sonde, zu berücksichtigen, dass die y-und z-Dimension Positionen miteinander verbunden in Bezug auf die effektive Übertragung von Lösungsmittel und Analyt-haltigen Tröpfchen sind zu nehmen. Eine Veränderung einer Variablen erfordert eine nachträgliche Änderung in der anderen, die gleiche Sprayaufprall Position zu halten undihre Übertragung Winkeln. </li></ol></li><li> Stellen Sie den Abstand der inneren Kapillare extrudiert aus der äußeren Kapillare der Quelle für maximale Empfindlichkeit und minimale Auswirkungen Punktgröße. Achtung: Stellen Sie sicher, dass die hohe Spannung ausgeschaltet ist, während Sie diese Einstellung vornehmen. </li><li> Die Quelle Geometrie wird als optimal betrachtet werden, wenn das maximale Signal beobachtet wird. <ol><li> Die Variablen in den Abschnitten 2.5-2.6 optimiert sind miteinander verbunden, damit die Einstellung eines inhärent erfordern die Neujustierung des anderen, um den erforderlichen Source-sample-Einlaufgeometrie oder Anpassung der Bedingungen in Abschnitt 1.5.1 diskutiert pflegen- 3. </li></ol></li><li> Zusätzlich kann ein Heizelement umgebenden Transferkapillare dem Massenspektrometer Empfindlichkeit durch Erleichterung Desolvatisierung der geladenen Analyten Tröpfchen während der Ionisation erzeugt verbessern. Hier verwenden wir ein Seil gewickelt Heizung rund um den Transfer-Kapillare auf 100 ° C. </li></ol> 3. Tissue Imaging <ol><li> Während der Bildgebung, bewegt sich der Probenhalter die Probe unter der Sonde und DESI MS Einlasskapillare und alle anderen Komponenten stationär bleiben. Die Bewegung Parameter der Bühne sollte basierend auf DESI Auswirkungen plume Größe und optimale Empfindlichkeit gewählt werden. <ol><li> Eine größere Auswirkung plume wird in einer höheren Ionenintensität, da mehr Probe desorbiert führen, jedoch für die Bildgebung, wird es auch in einer größeren Pixelgröße und damit schlechter Bildauflösung führen. </li></ol></li><li> Die Übersetzung der Bühne in diesem Experiment verwendet ist die Heimat gebaut und von einem LabView-Programm, das für die Kontrolle der Rasterung Geschwindigkeit und Zeilenabstand für ein Bild mit vorgegebenen Abmessungen ermöglicht. Die Bühne Motion Control VI in diesem Experiment verwendet wird, ist es bei omnispect.bme.gatech.edu. Alternativ könnte ein im Handel erhältliches DESI Quelle und Bühne wie die automatisierte 2D Omni Spray Quelle Prosolia Inc. (Indianapolis, IN USA) verwendet werden. <ol><li> Für Hirngewebe eintypische Bild Größe ist 10 x 15 mm, und in Anbetracht der Bühne Bewegung Parameter verwendet, wird das Bild dauert ca. 3 Stunden. <ol><li> Programmieren Sie die LabView VI oder gleichwertig Steuerungssoftware für die gewünschte Bildgebung Bedingungen, mit einer Bühne Scangeschwindigkeit von 80 um / sec und Zeilenabstand zwischen den Zeilen von 200 um. Bei Verwendung des Omni Spray Quelle sollte Fahrparameter einer Scangeschwindigkeit von 100-200 um / sec und einem Linienabstand von 200 um eingestellt werden. Beachten Sie, dass diese Bewegung Parameter geändert werden abhängig von der Anzahl der gewünschten Pixel in jeder Dimension und notwendige Empfindlichkeit werden. <ol><li> Ein kleinerer Zeilenabstand ist gezeigt worden, um die Bildqualität zu verbessern, mit der Scan-Geschwindigkeit mit weniger Einfluss. 25 Allerdings ist es von Bedeutung ist zu beachten, dass diese nicht unbedingt auf und verbesserte Bildauflösung, wie das ist stark abhängig von Auswirkungen vor Ort Größe. Eine langsamere Scan-Geschwindigkeit und kleineren Zeilenabstand deutlich erhöhen wird die Zeit der Analyse und müssen deshalb optimiert werdenmiert auf jede Art von Gewebe oder Muster. </li></ol></li><li> Mit dem MS Spektrenerfassung auf 1 gesetzt scan / sec, und das Bild als 1 Pixel / Scan erstellt, definiert die Bühne Geschwindigkeit die Pixelgröße in der x-Dimension, während der Zeilenabstand bestimmt die Pixelgröße in y-Dimension. Obwohl die wahre Pixelgröße des Bildes größer ist als dieser aufgrund sprühen Ausbreitung ermöglicht langsamere Bewegung mehr Zeit für die Desorption und Detektion von Analyten. </li></ol></li><li> Geben Verzeichnispfad und Dateinamen für Position und Zeit Dateien, die bei Bildern im LabView VI aufgenommen werden. </li></ol></li><li> In Vorbereitung für massenspektrometrische Datenerfassung, berechnen die Gesamtzeit für die Bildgebung erforderlich. Das Labview Programm von unserer Gruppe verwendet automatisch stellt diesen Wert, aber wenn alternativen Steuerung verwendet wird, ist diese Berechnung erforderlich, dass die MS Datenerfassung Einstellungen. <ol><li> Bei Verwendung eines Omni Spray automatisierten Quelle und Stufe wird jede Zeile des Bildes nach erworbeneinzelnen läuft. Die Zeit pro Zeile und die Anzahl der Zeilen, die für Given Imaging Dimensionen werden anhand der Omni Spray-Software eingegeben werden in das Massenspektrometer Software. </li></ol></li><li> Stellen Sie sicher, dass das Massenspektrometer Scangeschwindigkeit 1 Spektrum / sec ist, und stellen Sie das Instrument Übernahme Zeit, um die gesamte Zeit berechnet übereinstimmen. <ol><li> Set spektralen Scan-Geschwindigkeit bis 1 Spektrum / sec. </li><li> Daten erfassen in PROFIL-Modus und stellen Sie sicher, dass die m / z-Bereich für die jeweilige Art von Interesse ist. Beachten Sie, dass DESI produziert auch mehrfach geladene Analyten, wie in ESI. </li><li> Set Akquisition Zeit zu Zeit durch Gesamtbild LabView angegebenen Anforderungen. </li></ol></li><li> Positionieren Sie den Spray Auswirkungen Fleck in der linken oberen Bereich des abzubildenden. </li><li> Beginnen Erwerb von MS-Daten und Bühne Bewegung gleichzeitig. </li><li> Nach Abschluss der Datenerfassung, zurückzukehren Massenspektrometer Standby-Modus. </li><li> Schalten Sie Hochspannung von DESI Quelle. </li><li> Drehen off Stickstoffgas. </li><li> Schalten Sie Spritzenpumpe. </li></ol> 4. Bildverarbeitung <ol><li> Massenspektrometrische Daten müssen in Kombination mit Phase Zeit und Positionsdaten als Textdateien gespeichert durch LabView &quot;gefaltet&quot; werden in ein 2D-Bild korreliert Koordinaten der Pixel mit der zugehörigen Spektren. Die hier präsentierten Bilder wurden unter Verwendung Matlab-basierte Software, die frei verfügbar ist: omnispect.bme.gatech.edu. Wenn die Daten erworben werden, mit der Omni Spray Quelle wird die Firefly Daten-Konvertierungs-Software verwendet, um die Daten-Cube für die Bild-Visualisierung in BioMAP (www.maldi-msi.org) erstellen. </li><li> Für die Daten der Jeol AccuTOF Massenspektrometer erworben, werden die aufgezeichneten Chromatogramm. CDF-Format zur weiteren Analyse exportiert werden. <ol><li> Mit der DataManager innerhalb MassCenter, zuerst konvertieren erfassten Daten an gebildetem Schwerpunkt Daten (Tools → Konvertieren Acquistion Daten an Centroid). Dann Export von Daten in. CDF-Format unter Verwendung der Tastenkombination Strg + Umschalt + E folgefolgt von Extras → Exportieren. </li></ol></li><li> Laden Sie die roh. Cdf Massenspektraldaten und die beiden Textdateien, Position und Zeit, um die OmniSpect Website. Firefly-verarbeiteten Bilddaten visualisiert werden in BioMAP. <ol><li> Die weitere Verarbeitung der Daten inklusive statistischer Auswertung von nicht-negative Matrix-Faktorisierung oder Plotten eines einzelnen Ions von Interesse können direkt auf der Website vorgenommen werden. </li><li> Alternativ kann die Rohdaten Würfel zur Analyse in Matlab exportiert werden. </li></ol></li></ol>

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</ol>

Die Autoren erklären, dass sie keine finanziellen Interessen haben.

Die Optimierung der DESI Quellgeometrie ist entscheidend für eine erfolgreiche MSI Experimente. Die mehreren Variablen, die zur Ausrichtung des Systems unmittelbar auf Empfindlichkeit und Auflösung. Wenn während der Optimierung, hat der Experimentator Schwierigkeiten bei der Beschaffung Signal, empfehlen wir die Verwendung rot Sharpie Stelle auf der Folie als Maßstab gezeichnet; der Farbstoff Rhodamin 6G, m / z 443, erzeugt ein starkes Signal in der positiven Ionen-Modus und kann verwendet werden für anfängliche Optimie...

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Rachel V. Bennett
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Rachel V. Bennet

Erratum: Imaging of Biological Tissues by Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry

Untargeted Bildgebung mittels Massenspektrometrie ermöglicht die Übernahme von chemischen Informationen für die Entdeckung und Hypothesen-generierenden Anwendungen. Gezielte Bildgebung eines bekannten chemischen von Interesse auf der anderen Seite kann eine erhöhte Empfindlichkeit und Selektivität durch spezifische Verfahren Entwicklung zu erleichtern. Massenspektrometrie Imaging (MSI) wird am häufigsten auf Gewebe mit MALDI, 1 Sekundärionen-Massenspektrometrie (SIMS), 2 und Umgebungstemperatur Ionisation Techniken, einschließlich Desorption Elektrospray-Ionisation (DESI), 3 Laserablation-Elektrospray-Ionisation (LAESI), 4 durchgeführt, 5 und flüssigen Mikro-junction-Oberfläche Probenahmesonde (LMJ-SSP). 6 In MALDI und SIMS, müssen die Proben physikalisch aus der Probe entfernt werden, und müssen flach und dünn, wie sie im Hochvakuum analysiert. MALDI erfordert Beschichtung der Probe mit einer Strahlung absorbierenden Matrix, das Hinzufügen einer zusätzlichen und umständlich Schritt zur Probenvorbereitung. SIMShat die höchste laterale Auflösung, aber Beschuss mit hochenergetischen Teilchen verursacht umfangreiche molekulare Fragmentierung. Deshalb füllen MSI durch Umgebungslicht Methoden eine Nische, wo weiche Analyse mit minimaler Probenvorbereitung ist wünschenswert. Doch bis heute werden alle Methoden noch durch das Erfordernis der flachen Probe Flächen begrenzt. DESI verwendet eine pneumatisch unterstützte aufgeladen Lösungsmittel Spray an der Probenoberfläche gerichtet zu desorbieren und zu ionisieren Analyten. 7 Das Arbeitsmodell für die Desorption und anschließende Ionisation durch DESI als &quot;Tropfen Pick-up-Modell&quot; bekannt ist. 8-10 Die geladenen primären Tröpfchen hergestellt von der DESI Sonde mit der Oberfläche kollidiert, Benetzung und Ausbildung einer Dünnschicht, in die der Analyt durch eine Fest-Flüssig-microextraction Mechanismus 8 Nachfolgende Tröpfchenkollisionen ergeben Impulsübertragung und Start des zweiten Tröpfchen, die das Material von der Oberfläche entnommen wird aufgelöst . 9,10 Letztlich GasPhase Ionen sind vermutlich durch ESI Fortsätze nach dem Ionenverdampfung, Ladung Rückstand Modelle oder andere Modelle, 11 hergestellt werden, wobei der genaue Ionenbildung Verfahren DESI erst noch zu experimentell bewiesen. 12 DESI Empfindlichkeit ist stark abhängig von der Löslichkeit der Analyt in dem Solvens, wie Desorption beruht auf der lokalisierten microextraction. 13 In Verbindung mit einem Software-gesteuerten Probentisch verwendet, wird die Probe mit unidirektional Spur Schrittmotors unter der DESI Ionisationselektrode abgetastet und durch den Zeitbereich, m / z Informationen mit der chemischen Spezies räumliche Verteilung (Fig. 1) korreliert. Seit dem ersten proof of principle DESI-MSI Experiment von Van Berkel und Kertesz im Jahr 2006 berichtet, hat 14 die Technik deutlich gereift 15 mit gemeldeten Anwendungen in der Analyse von Lipiden, 3,16 Drogenmetaboliten 17,18 disease Biomarker, 19 Hirngewebe, 3,18,20 Lungengewebe, 18 Nierengewebe, 18 Hodengewebe, 18 Nebennieren, 17 Dünnschichtchromatographieplatten, 21 und Algen Oberflächen. 22. Die Routine Auflösung von Bildern von DESI-MSI erhaltene 100-200 um, die letztlich durch die wirksame Fläche durch das Spray extrahiert wird bestimmt, sondern Auflösungen so niedrig wie 40 um berichtet worden. 23-25 ​​Solche Auflösung und einfache Analyse macht DESI-MSI geeignet für die schnelle und einfache Analyse von biologischen Gewebeproben mit Oberflächen im Bereich 0,5-5 cm 2, so dass der Erwerb von wertvollen Geodaten besser zu verstehen biologischen Prozessen 26. Hier wird als ein Beispiel für eine typische DESI-MSI-Anwendung, überprüfen wir die Einzelheiten des Verfahrens für die Durchführung einer erfolgreichen Experiment mit bildgebenden von Lipiden im Rattenhirn Gewebe. Die beiden wichtigsten Schritte in dem Protokoll sind dieGewebepräparation 27 und DESI Optimierung der Ionenquelle, wie unten beschrieben.

<table><tbody><tr><td>Reagenzien</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Tissue-Tek O.C.T. Compound</td><td>Sakura-Finetek</td><td>4583<</td><td>a href="http://www.sakuraeu.com/products/showitem.asp?cat=11&amp; subcat=48" target="_blank">http://www.sakuraeu.com/products/showitem.asp?cat=11&amp; subcat=48</a></td></tr><tr><td>Acetonitril</td><td>EMD</td><td>AX0156-6</td><td>OmniSolv, LC-MS-Qualität</td></tr><tr><td>Essigsäure</td><td>Sigma Aldrich</td><td>695092-500 ml</td><td></td></tr><tr><td>AusrüstungKryostat-Mikrotom</td><td></td><td></td><td></td></tr> <tr><td></td><td>Thermo Scientific</td><td>CryoStar* NX70</td><td>Jedes verfügbare Mikrotom kann für die Gewebeschnitte verwendet werden <a href=" http://www.thermoscientific.com/ecomm/servlet/productsdetail?productId=13958375&groupType=PRODUCT&searchType=0&storeId=11152&from=search&ca=cryostar" target="_blank"> http://www.thermoscientific.com/ecomm/servlet/productsdetail?productId=13958375&groupType=PRODUCT&searchType=0&storeId=11152&from=search&ca=cryostar</a></td></tr><tr><td>Omni Spray&#174; DESI Sprühkopf</td><td>Prosolia Inc.</td><td></td><td>Kann auch das 2-D Omni Spray verwenden&#174; Source-Kit anstelle des Zusammenbaus von Komponenten des Imaging-Experiments <a href=" http://www.prosolia.com/sources.php" target="_blank"> http://www.prosolia.com/sources.php</a></td></tr><tr><td>Hochspannungs-Netzteil</td><td>Stanford Research Systems, Inc.</td><td>PS350/5000V-25W</td><td><a href="http://www.thinksrs.com/products/PS300.htm" target="_blank">http://www.thinksrs.com/products/PS300.htm</a></td></tr><tr><td>Seilheizung, RTD, Steuerung</td><td>Omega</td><td></td><td><a href="http://www.omega.com/toc_asp/subsectionSC.asp?subsection=M02&amp; book=Heizungen" target="_blank">http://www.omega.com/toc_asp/subsectionSC.asp?subsection=M02&amp; book=Heizungen</a></td></tr><tr><td>Labview</td><td>National Instruments</td><td>Version 7.1</td><td></td></tr><tr><td>Translationsstufe</td><td>Prior Scientific</td><td>Optiscan II</td><<td>a href="http://www.prior.com/productinfo_auto_motorized_optiscan.html" target="_blank">http://www.prior.com/productinfo_auto_motorized_optiscan.html</a></td></tr><tr><td>AccuTOF Massenspektrometer</td><td>JEOL</td><td>JMS-T100LC</td><td>Kann jedes Massenspektrometer verwenden, das mit einer erweiterten Kapillarschnittstelle für Atmosphärendruck ausgestattet ist</td></tr></tbody></table>

imaging von biologischem gewebe durch desorption elektrospray-ionisation-massenspektrometrie

Imaging of Biological Tissues by Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry

Massenspektrometrie Imaging (MSI) bietet ungezielte molekularen Informationen mit der höchsten Spezifität und räumlicher Auflösung für die Untersuchung von biologischen Geweben zu den hundert bis zehn Mikrometer-Skala. Wenn unter Umgebungsbedingungen durchgeführt wird Probe Vorbehandlung überflüssig und vereinfacht damit das Protokoll unter Beibehaltung der hohen Qualität der erhaltenen Informationen. Desorption Elektrospray-Ionisation (DESI) ist ein Spray auf Umgebungstemperatur MSI Technik, die für die direkte Entnahme von Oberflächen im Freien, auch in vivo ermöglicht. In Verbindung mit einem Software-gesteuerten Probentisch verwendet, wird die Probe unter der DESI Ionisationselektrode gerastert und in den Zeitbereich, m / z Informationen mit der chemischen Spezies räumliche Verteilung korreliert. Die Genauigkeit der DESI-MSI Ausgang hängt von der Quelle Ausrichtung und Positionierung in Bezug auf die Probenoberfläche und Massenspektrometer Einlass. Hier prüfen wir, wie man Gewebeschnitte für DESI vorzubereiten imaging und zusätzlichen experimentellen Bedingungen, die direkt auf die Bildqualität. Insbesondere beschreiben wir das Protokoll für die Bildgebung von Rattenhirn Gewebeschnitten durch DESI-MSI.

Abbildung 3 zeigt ein repräsentatives Spektrum von einer unbehandelten Rattenhirn Abschnitt erhalten. Im positiven Modus wird das Massenspektrum von Phosphatidylcholine aufgrund ihres hohen Ionisierungseffizienz (zurückzuführen auf die positiv geladenen quaternären Ammoniumgruppen) dominiert. Die gesamte Ionenbild der Gewebeschnitt ist auch in Fig. 3 gezeigt, mit umfangreicher Signal über den gesamten Abschnitt des Gehirns. Key Lipide erfasst sind in Tabelle 1 durch Ver...

Desorption Elektrospray-Ionisations-Massenspektrometrie (DESI-MS) ist eine Methode, mit der Umgebungsluft Proben, einschließlich biologischen Geweben, mit minimaler Probenvorbereitung abgebildet werden kann. Durch Rastern der Probe unterhalb der Ionisationselektrode, bietet dieses Spray-basierte Technik ausreichender räumlicher Auflösung auf molekularen Eigenschaften von Interesse in Gewebeschnitten zu erkennen.

Imaging von biologischem Gewebe durch Desorption Elektrospray-Ionisation-Massenspektrometrie

Mass spectrometry imaging (MSI) provides untargeted molecular information with the highest specificity and spatial resolution for investigating biological ...

Das übergeordnete Ziel des folgenden Experiments besteht darin, die räumliche Verteilung von Chemikalien in einem biologischen Gewebe mithilfe einer ambienten Massenspektrometrie-Technik abzubilden. Dies wird erreicht, indem der pneumatisch unterstützte Sprühstrahl von DESI verwendet wird, um die im Gewebe vorhandenen Moleküle zu desorbieren und zu ionisieren. Im zweiten Schritt wird die DESI-Ionenquelle kontrolliert über die Probenfläche gescannt.Anschließend wird die massenspektrometrische Information mit der räumlichen Bewegung des Probenstadiums korreliert, um die Intensität der Ionen als Funktion der X- und Y-Position darzustellen. Letztendlich entsteht so ein chemisches Bild. Die Ergebnisse zeigen, dass es basierend auf den Massenspektrometrie-Bildern ausgewählter Lipidionen charakteristische Verteilungen von Lipiden in umhülltem Hirngewebe zwischen grauer und weißer Substanz gibt.Obwohl diese Methode Einblicke in die chemische Verteilung in biologischen Geweben ermöglichen kann, ist sie auch für eine Vielzahl anderer Systeme geeignet, darunter Dünnschichtchromatographieplatten, Oberflächenreaktionen von Mineralien und marine Algen. Vor Beginn dieses Verfahrens muss das Geweb

imaging-biological-tissues-desorption-electrospray-ionization-mass

Research

Forschung

JoVE Journal

Bioengineering

Biotechnik

Laser-Ablation Elektrospray-Ionisation (LAESI) ist eines Atmosphärendruck-Ionenquelle für die Massenspektrometrie. Im Imaging-Modus, ein mittleres Infrarot-Laser-Sonden die Verteilung der Moleküle über einen Gewebeschnitt oder einen Biofilm. Diese Technik stellt einen neuen Ansatz für die unterschiedlichsten bioanalytische Untersuchungen unter nativen experimentellen Bedingungen durchgeführt.

Atmosphärische Molecular Imaging von biologischen Geweben und Biofilme durch LAESI Massenspektrometrie

Dithranol (DT, 1,8-Dihydroxy-9 ,10-dihydroanthracen-9-on) wurde zuvor als ein MALDI-Matrix für die Gewebeabbildung für kleine Moleküle berichtet wurde, Protokolle für die Verwendung von DT für die MALDI-Imaging von endogenen Lipiden auf die Hier werden Oberflächen von Gewebeschnitten von Positiv-Ionen-MALDI-MS auf einem ultrahochauflösenden Quadrupol-FTICR Instrument zur Verfügung gestellt.

Dithranol als Matrix für Matrix Assisted Laser Desorption / Ionisation Imaging auf einem Fourier-Transformations-Ionen-Zyklotron-Resonanz-Massenspektrometer

Hier präsentieren wir Protokolle zur Durchführung sowohl der Umgebungsmassenspektrometrie-Bildgebung (MSI) von Geweben als auch der In-situ-Live-Einzelzell-MS (SCMS)-Analyse mit der Einzelsonde, einem miniaturisierten multifunktionalen Gerät für die MS-Analyse.

Anwendungen der Einzel-Sonde: Mass Spectrometry Imaging und Einzelzellanalyse unter Umgebungsbedingungen

Eine massenspektrometrische Bildgebungsquelle (MSI), die bei Atmosphärendruck betrieben wird, wurde durch Kopplung von Laserdesorption im mittleren Infrarot und Elektrospray-Nachionisation entwickelt. Als energieabsorbierende Matrix wurde eine exogene Eismatrix verwendet, um die resonante Desorption von gewebebezogenem Material zu erleichtern. Dieses Manuskript enthält ein Schritt-für-Schritt-Protokoll für die Durchführung der IR-MALDESI MSI bei einer Ganzkörper-Neugeborenenmaus.

Ganzkörper-Massenspektrometrie Imaging durch Infrarot-Matrix-assistierte Laser-Desorptions-Elektrospray-Ionisations (IR-MALDESI)

Dieses Protokoll beschreibt eine reproduzierbare und zuverlässige Methode für die Sublimation-basierte Erstellung von Formalin fixiert Gewebe für bildgebende Massenspektrometrie bestimmt.

Optimale Vorbereitung von Formalin fixiert Proben für Peptid-Matrix basierten Assisted Laser Desorption/Ionisierung Massenspektrometrie Imaging-Workflows

In diesem Artikel werden Beispielvorbereitungsmethoden für eine einzigartige Echtzeitanalysemethode auf der Grundlage der Umgebungsmassenspektrometrie vorgestellt. Mit dieser Methode können wir die biologischen Moleküle in vivo in echtzeit ohne spezielle Vorbehandlungen analysieren.

Probenvorbereitung für Probe Elektrospray-Ionen-Massenspektrometrie

In dieser Studie wird eine Reihe von Methoden zur Aufbereitung von DESI-MSI-Proben aus Pflanzen vorgestellt und ein Verfahren der DESI-Montageinstallation, MSI-Datenerfassung und -verarbeitung detailliert beschrieben. Dieses Protokoll kann unter verschiedenen Bedingungen angewendet werden, um räumliche Metabolominformationen in Pflanzen zu erhalten.

Visualisierung von Metaboliten, die im räumlichen Metabolom der Traditionellen Chinesischen Medizin mit DESI-MSI identifiziert wurden

Dieses Protokoll beschreibt die Einzelzell-Massenspektrometrie-Bildgebung von OVCAR-8-Zellen unter Verwendung von Desorptionselektrospray-Ionisation, gekoppelt mit Orbitrap-Massenspektrometern für hochauflösende metabolomische Analysen.

Einzelzell-Massenspektrometrie-Bildgebung mit Desorptions-Elektrospray-Ionisation gekoppelt an Orbitrap-Massenspektrometer

Sekundäre Elektrospray Massenspektrometrie (SESI-MS) ermöglicht die Detektion von flüchtigen organischen Verbindungen (VOC), ohne dass für jede Vorbehandlung der Probe. Dieses Protokoll enthält Anweisungen für die schnelle (innerhalb von Minuten) Charakterisierung von bakteriellen VOCs mit SESI-MS.

Charakterisierung Bakterielle Flüchtige mit Secondary Elektrospray-Ionisation-Massenspektrometrie (SESI-MS)

Zerstörungsfreie Volumen-Visualisierung können nur von tomographischen Techniken, von denen die am effizientesten ist die x-ray micro-Computertomographie (CT) erreicht werden.

Hochauflösende 3D Imaging von Ex-Vivo Biologische Proben von Micro-CT

Lernen Sie DESI-MS zur Abbildung chemischer Verteilungen in biologischen Geweben. Diese Methode ermöglicht die Analyse von Lipidmustern im Gehirngewebe mit minimaler Probenpräparation.

Imaging von biologischem Gewebe durch Desorption Elektrospray-Ionisation-Massenspektrometrie

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