Preparación de los animales in vivo para IRM imágenes
1. La canulación quirúrgica
- Anestesiar la rata (rata Wistar macho, 200-300 g) con isoflurano (inducción de un 5% y luego se reduce a un 1,5-2% para el mantenimiento de la anestesia durante la preparación de los animales y de exploración) que figura en aire comprimido (21% O 2, BOC Reino Unido) . Asegúrese de que el animal está bien anestesiado y no muestra respuesta a una pizca dedo del pie. La arteria femoral y la vena se canuló para gases en sangre y mediciones de presión sanguínea y la administración del fármaco desafío respectivamente. Durante el procedimiento quirúrgico, la temperatura corporal del animal se controla y mantiene a través de una sonda rectal y una manta térmica (Harvard Apparatus).
- El animal anestesiado se coloca sobre una almohadilla de calentamiento bajo un microscopio de disección en decúbito dorsal. Afeitar el área de la mitad del muslo y limpiar la piel con alcohol. Haga una incisión de 2 cm de piel a lo largo del pliegue formado por el abdomen y el muslo derecho.La disección roma de los músculos aductores se utiliza para visualizar la arteria femoral vena y el nervio femoral. Separar cuidadosamente los vasos.
- Suavemente atar una ligadura de seda completamente alrededor del extremo distal del vaso y colocar otro lazo con medio de un nudo quirúrgico con holgura en el sitio proximal. Aplicar la tracción a ambos ligaduras, para ocluir el flujo sanguíneo en la porción media restante del buque expuesta entre las ligaduras. Hacer una pequeña incisión de aproximadamente un tercio de la circunferencia del vaso en esta parte del recipiente para permitir la inserción de una cánula PE-50 (0,54 mm de diámetro interno y 0.96mm para diámetro exterior en el caso de ratas macho adultas, de lo contrario 0,40 mm ID y 0,80 mm ED) en el recipiente.
- La cánula se debe insertar varios mm (al menos 5) en el recipiente. Una vez en el lumen, lavar una pequeña cantidad de solución salina heparinizada (15 UI / ml) a través del recipiente para evitar cualquier formación de coágulo de sangre. El bucle de seda proximal también se ligó completamente para fijar la cánula. Repita este procedimiento para el segundo recipiente. Pega la piel utilizando un adhesivo tisular Vetbond (3M UK plc, Bracknell, Reino Unido) cuando ambas cánulas están en su lugar. Véase la Figura 1 para la colocación exacta de las cánulas.
- Colocar el animal en una cama estereotáctica MR compatible (M2M Imaging Corp., EE.UU.) en una posición de decúbito prono. Mantener la cabeza del animal a través de la inserción de las barras de los oídos y un bar de los dientes. En este punto, el animal puede ser colocado en el escáner de resonancia magnética para obtener imágenes. El animal permanece anestesiado y es libre para respirar durante todo el procedimiento de las imágenes.
2. Monitoreo
Durante el procedimiento de imagen completa, varias respuestas fisiológicas deben ser constantemente monitoreados y se mantenga lo más constante posible. Esto es esencial, ya que estas respuestas pueden variar grandemente sobre la ventana mismo tiempo que la señal phMRI y también afecta a la señal de interés. También es importante, dado que el animal se colocó en el MAgnet y por lo tanto fuera de la vista y no susceptibles de control estándar de la profundidad de la anestesia (por ejemplo pizca dedo del pie), para asegurar una adecuada profundidad de la anestesia. Además, teniendo en cuenta que muchos medicamentos alteran los parámetros cardiovasculares como la hipertensión arterial, la medición de estos puntos es fundamental para garantizar la pueden tener en cuenta mundiales de efectos fisiológicos de la acción de la droga en los datos phMRI. Véase también la sección 4 para los valores de referencia y las respuestas esperadas a la infusión de 5 mg / kg de fluoxetina.
- La temperatura corporal se mantuvo a 37 ± 1,5 ° C por un sistema de calefacción de aire caliente (SA Instruments, Nueva York, EE.UU.). Tenga en cuenta que la RM puede afectar a la medición de temperatura, verifique esto con su propio sistema.
- Controlar y registrar la velocidad de respiración del animal usando un manguito respiratoria acoplado a un sensor de presión (SA Instruments, Nueva York, EE.UU.).
- Registrar la presión arterial invasiva utilizando un transductor de presión (TSD104A, Biopac Systems Corp., EE.UU.) y periódicamente retirar unad analizar muestras de gases en sangre arterial (Rapidlab, Siemens de diagnóstico) a través de la arteria femoral canulado en imágenes para vigilar PCO 2 arterial y la presión parcial de oxígeno (PO 2).
- El uso de la vena femoral canulada como la línea de infusión principal para el reto farmacológico (fluoxetina (hidrocloruro de fluoxetina de Sigma-Aldrich, Reino Unido) de 5 mg / kg, se disolvió en solución salina).
En vivo de imágenes
Una representación esquemática de la configuración experimental RMf se da en la Figura 2.
3. Los parámetros de imagen
- Una vez que el animal se encuentre en el interior del escáner y sigue mostrando las respuestas fisiológicas estables, las imágenes se puede iniciar. En nuestros estudios, hemos utilizado un 4,7 T animal pequeño sistema de resonancia magnética (Agilent Technologies) con una cuadratura cilíndrica de transmisión / recepción bobina de RF con un diámetro interior de 72 mm (M2M Imaging Corp., EE.UU.). Hacer una imagen avión de reconocimiento de tres a ap correctamenteOSICIÓN del cerebro en el centro del campo de vista RM y utilizar la corrección de cuña localizada (secuencia fastmap) para mejorar la homogeneidad del campo magnético en el cerebro.
- Para cada animal, en primer lugar adquirir un volumen de T2 imagen anatómica para el registro y la segmentación. Se utilizó una secuencia de eco de espín turbo con longitud de los trenes de eco = 8; tamaño de la matriz = 256 x 256; FOV = 50 x 50 mm 2; con la adquisición intercalada de 30 rebanadas coronales contiguas con un espesor de 1 mm, centrada 8 mm caudal al borde posterior del bulbo olfatorio, medias = 4; TR / TE = 5112/60 ms.
- Asegúrese de que el animal de sus respuestas fisiológicas son constantes antes de iniciar la exploración phMRI. Para la adquisición de series de tiempo, se utilizó el mismo T2 secuencia turbo eco de espín con longitud de los trenes de eco = 16; matriz tamaño = 128 x 128; con la adquisición intercalada de 20 cortes contiguos con un espesor de 1 mm centrada en la misma posición; TR / TE = 4915/60 ms. En total, se adquirieron 32 puntos en el tiempo con uncquisition tiempo de 158 segundos por volumen de series de tiempo y un tiempo de ciclo total de 84 min. El primer volumen se utiliza como un "escaneo ficticio" para hacer frente a los efectos de saturación de T1 y no se utiliza en el análisis de datos. Otras secuencias fMRI como eco de gradiente o eco imagen planar (PAI) secuencias también pueden ser utilizados. Asegúrese de que para evaluar la estabilidad de la señal de la secuencia de elección antes del inicio de su experimento.
- Adquirir una serie de volúmenes de referencia, antes de administrar el medicamento desafío. Sugerimos al menos 10 minutos de la adquisición de línea de base en condiciones estables. Inicie la infusión a la misma hora para todos los animales. En nuestro protocolo, se inició la administración al comienzo de la novena volumen (después de aproximadamente 21 exploración basal min). Después de la infusión, la adquisición de imágenes continuó durante otros 60 minutos (32 volúmenes en total). Asegúrese de que el período posterior a la infusión es el tiempo suficiente para visualizar los cambios y alcanzar el estado de equilibrio o la recuperación de la señal, dependiendo de su investigación Questiel y su opción de desafío de las drogas.
- Cuando la adquisición de imágenes se termine, quite el animal desde el escáner. Realizar una medición de la tensión final de gas para garantizar la estabilidad de los parámetros de gases en sangre, y para permitir la evaluación de los efectos del fármaco sobre la fisiología básica.
Proceso de datos
4. Las respuestas fisiológicas
Espera las respuestas fisiológicas al desafío dependen de la droga elegida. A continuación, los valores de referencia generalmente aceptados (de las ratas macho adultas) y las respuestas esperadas a la infusión intravenosa de 5 mg / kg de fluoxetina se dan.
- La tasa de respiración debe ser estable a 45-75 respiraciones por minuto. El reto farmacológico de la fluoxetina induce un aumento a corto (15-20%) en la tasa de respiración.
- La presión arterial debe ser constante y entre 100-150 mmHg (Biopac Systems Corp., Goweta, EE.UU.). El desafío fluoxetina induce una caída corta pero empinada de aproximadamente 20% de la presión arterial.Esto debería recuperarse en 5-10 minutos. Esto se muestra en la Figura 3.
- Los valores de gases en sangre debe ser estable (medir por lo menos dos veces) y dentro de los rangos siguientes antes de comenzar la exploración phMRI: pCO 2, 35-45 mmHg; PO 2, 80-130 mmHg, pH, 7,35 a 7,45. Compruebe siempre estos valores de nuevo después de la exploración para ver si el animal se mantuvo estable y para permitir la evaluación de los efectos del fármaco sobre la fisiología básica. Altas pCO 2 valores inducir vasodilatación y por lo tanto se evitará ver los cambios de señal BOLD.
- Asegúrese de que el animal se encuentra en un nivel continuo y constante de la anestesia (2 ± 0,25%; los niveles más altos puede causar la depresión de la reactividad vascular cerebral y menor la anestesia insuficiente y por lo tanto el movimiento), antes de iniciar la exploración phMRI y lo más importante, evitar que los ajustes en la régimen de la anestesia (por ejemplo,% de isoflurano y / o el flujo de gas) durante la adquisición de la imagen funcional, ya que esto también podría afectar a la señal BOLD.
5. Preprocesamiento de datos de resonancia magnética
A continuación se describen varios pasos en el pre-procesamiento de los datos de RM con el fin de optimalize los datos para el análisis estadístico. Mencionamos las herramientas que se utilizan en nuestro laboratorio, sin embargo muchas herramientas diferentes están disponibles.
5.1 Preparación de datos
- Coloque las imágenes en bruto en el formato de archivo correcto para el software de análisis de resonancia magnética que usted prefiere usar (o NIfTI1.1 Analyze7.5 formato para los programas de FSL). Varios programas gratuitos convertidor de archivos están disponibles en línea. Dependiendo del escáner utilizado, puede ser necesario construir primero un 3D (exploración anatómica) o 4D (phMRI exploración) de la imagen de todos los cortes 2D separadas. Esto puede hacerse utilizando un programa de procesamiento de imagen, tales como ImageJ 1.
- Con el fin de asegurar la compatibilidad con los algoritmos de análisis diseñadas para su uso con los datos en humanos (por ejemplo, los programas de FSL), el tamaño de voxel tiene que ser multiplicado por un factor 10 (esto también se puede hacer utilizando, por ejemplo ImageJ). En nuestro estudio, esto se tradujo en un tamaño de voxel de 3,91 x 3,91 x 10 mm 3.
- Inspeccione visualmente las imágenes de las irregularidades en la orientación, artefactos, y el movimiento. Tenga cuidado de no utilizar las exploraciones con objetos claros o movimiento excesivo en sus análisis, ya que le distorsionar los resultados.
- La orientación de todos los análisis deben ser similares entre las imágenes anatómicas y funcionales y en concordancia con el cerebro de referencia utilizado. En nuestro estudio, hemos utilizado el modelo de cerebro de rata estereotáctica descrito por Schwarz 14. La FSL comando fslswapdim se puede utilizar para reorientar.
5.2 Propuesta de corrección de
- Para corregir los artefactos de movimiento de la serie 4D en tiempo, se utilizó la herramienta de corrección de movimiento McFlirt (corrección de movimiento lineal utilizando FMRIB la herramienta de registro de imagen, que forma parte de la biblioteca de software de FMRIB, www.fmrib.ox.ac.uk / FSL ). MCFLIRT es una intra-modal de movimiento de corrección de herramienta de des-igned para su uso en la serie de tiempo de resonancia magnética funcional y basada en la optimización y las técnicas de registro utilizadas en FLIRT, una herramienta totalmente automatizada para lineal (afín) intermodal de registro de imágenes del cerebro. Siempre revise más tarde si el resultado es satisfactorio.
5.3 Segmentación del cerebro
- Eliminar todo el tejido no-cerebro de una imagen de toda la cabeza tanto para la serie de tiempo 4D como la imagen anatómica 3D. Para ello se utilizó la herramienta de FSL BET (Brain Extraction Tool v 2.1, que forma parte de la biblioteca de software de FMRIB, www.fmrib.ox.ac.uk / FSL ). Los ajustes por defecto se han desarrollado para su uso con cerebros humanos y, por tanto no es ideal para el cerebro de rata. Se utilizaron los siguientes parámetros: umbral de la intensidad fraccional, f = 1,0; gradiente vertical en el umbral de la intensidad fraccional, g = 0,1; radio y la cabeza (en mm), r = 175 para la mayoría de los animales. Si es necesario, puede optimizar los valores de cada sujeto.
6. Datos Analysis
Objetivo del análisis estadístico de los datos de RM es determinar los voxels que exhiben variación adicional atribuible al desafío de las drogas de una manera estadísticamente robusto. Diversos enfoques metodológicos disponibles para este, así como paquetes de software numerables. La elección que haga depende de la disponibilidad del software y el conocimiento / experiencia en su laboratorio y su pregunta de investigación específica. A continuación te damos un método sugerido que se utiliza en nuestro laboratorio.
6.1
- Antes de analizar los datos de resonancia magnética, determina un modelo lineal general (GLM) para que los datos se instalarán. Esto puede ser un simple cuadrado de encendido-apagado modelo (apagado para el pre-droga y el post-infusión de la droga) o un modelo específico basado en los datos. Hemos utilizado el programa Estimular 21 para determinar un modelo GLM basado en datos.
- Realizar una muestra de dos t-test (por ejemplo, en Estimular) en todos los volúmenes de referencia frente a todos los volúmenes después del desafío. Si lo desea, deje out el primer volumen (s) y el volumen durante el cual se le da el desafío, ya los que no puede representar el estado estacionario de imágenes. Posteriormente, discrimina todos los voxels con más de un cambio de cierta% respecto al valor basal. Hemos utilizado todos los voxels con el cambio más del 1%.
- A continuación, la media del tiempo de evolución en todos estos voxels, que ya le da una impresión de la forma del modelo. De esta manera se puede determinar si el desafío 1) tiene un efecto inmediato o retardado, 2) si y cuando el efecto alcanza una meseta y / o pico y, 3) si o cuando el efecto disminuye de nuevo durante el curso temporal del escanear. Los ejemplos se muestra en la Figura 4A y 4B.
6.2
El siguiente paso es entonces para probar estadísticamente el momento en bruto 4D imagen serie de cada animal contra el modelo GLM anterior establecido. Para ello, se utilizó el programa de FSL FEAT (FMRI herramienta de análisis de expertos, v5.98) 17,24. Sin embargo, otras herramientas de análisis de resonancia magnética funcional son disponible también. Dentro de la herramienta de análisis, un análisis de primer nivel tiene que ser configurado. Esto requiere los siguientes pasos:
- Asegúrese de utilizar la misma configuración para cada animal. Usted puede optar por eliminar los primeros (dos) volúmenes antes de su análisis, ya que el estado de equilibrio de imagen no puede ser alcanzado sin embargo, en ese punto. Establecer el TR, este es el tiempo (en segundos) entre el comienzo de cada volumen sucesivo. Puesto que usted está buscando en los efectos que podría durar el tiempo de ciclo completo, no hay necesidad de establecer un filtro de paso alto o bajo.
- Espacialmente suavizar los datos con el fin de reducir el ruido y mejorar la relación señal a ruido (SNR). Elegimos un kernel FWHM de 8 mm.
- Ahora ejecuta el modelo GLM deseado en sus datos. Esta es su principal variable explicativa (EV), es decir, la forma de onda que se está probando sus datos en contra. El GLM que se determinó en base a nuestros propios datos puede verse en la Figura 4C. También existe la posibilidad de añadir adicional confundir EV tales como los parámetros de movimiento,ruido de baja frecuencia (deriva del escáner) o incluso de los parámetros fisiológicos como la presión arterial para eliminar fisiológicas generales de drogas de efectos.
Dentro de FEAT: Uso CINE prewhitening. Añadir derivada temporal. En la pestaña de contrastes y las pruebas F, establecer un contraste. Para convertir un EV sola en una imagen estadística de Z, establezca su valor en contraste con el 1. Esto le da todos los voxels en el que puede ser su evolución en el tiempo de manera significativa se explica por el GLM. Establecer el valor a -1 dará la activación negativa.
- Después de realizar la prueba estadística inicial, la imagen estadístico resultante debe ser umbralizadas para mostrar que los voxels o grupos de voxels se activan en un nivel de significación particular. Corrección de comparaciones múltiples se realizaron debido a la gran cantidad de voxels del cerebro a prueba. La hazaña del programa FSL utiliza un sistema automatizado de cluster basado en la corrección de comparaciones múltiples basado en el GRF (campo de Gauss al azar) la teoría 25.
- Por último, los datos deben ser espacialmente normalizaron a una imagen de referencia, con el fin de realizar las estadísticas de grupo. Primero registrar los datos funcionales a los animales de la imagen cerebral se extrajo anatómica y luego a la imagen de referencia. Se utilizó la plantilla de cerebro de rata estereotáxica descrito por Schwarz 14 como un cerebro de referencia.
- Después de esto, los análisis de primer nivel de todos los animales se pueden combinar en un nivel superior (grupo) análisis estadísticos. Esto depende en gran medida el diseño de su propio estudio y preguntas de investigación.
6.3
Después de esto, los análisis de primer nivel de todos los animales se pueden combinar en un nivel superior (grupo) análisis estadísticos. Esto depende en gran medida el diseño de su propio estudio y preguntas de investigación.
6.4
Respuestas fisiológicas de drogas pueden ser acopladas o correlacionada con la señal de RM, si se desea. Véase también la sección 6.2.3 sobre la adición de confundir la EV.
7. Los resultados representativos
ove_content "> Cuando la droga estimulante (5 mg / kg iv fluoxetina) entra en el sistema vascular, una respuesta fisiológica clara debe ser visible en la tasa de respiración (arriba) y la presión arterial (abajo). Estas respuestas normalizar en una media de 5-10 minutos . En la
Figura 3 esta caída en la presión arterial es claramente visible.
El curso de la señal promedio de tiempo debe mostrar una línea de base relativamente estable, y un claro efecto de la recusación. Preferiblemente, no debe haber ninguna deriva desafío-independiente de la señal. Un ejemplo representativo de un curso de señal promedio de tiempo se puede ver en la Figura 5A. Los artefactos, como la depresión respiratoria / falla o los cambios en la anestesia son a menudo claramente visible en la señal. La depresión respiratoria afectará negativamente a la señal en todo el cerebro. Esto puede verse en la Figura 5B.
Después de análisis de primer nivel, el patrón de activación se espera que sea principalmente positiva y localizaciónTed en regiones específicas solamente (es decir, las áreas corticales, el hipocampo, el hipotálamo y el tálamo, ver Figura 6). Si el cerebro se desactiva, esto es a menudo una indicación de la anestesia demasiado profunda y / o falta de oxígeno durante la exploración. Un ejemplo de esto puede verse en la Figura 6B.

Figura 1. Localización de colocación de las cánulas en la arteria y la vena femoral.

Figura 2 Representación esquemática de la configuración de RMN;. Todo el equipo tiene que ser no ferromagnético y está conectado a un sistema de módulo que permite la adquisición de imágenes cerrada evitando interferencias de movimiento debido a la respiración y / o latidos del corazón. La temperatura corporal también está regulada a través de un módulo de calentamiento para supervisar y controlar la temperatura de los animales durante la exploración. Haga clic aquí para ampliar la imagen .

Figura 3. Ejemplo representativo de los datos de presión arterial. Hay una caída clara en la presión arterial visibles directamente después del inicio de la infusión (barra roja). Los valores normales se alcanzan de nuevo dentro de 10 minutos. después de la administración desafío.

Figura 4. Un patrón) esperado de activación mediante el programa de análisis de resonancia magnética Estimular (rojo es la activación positiva, el azul es la activación negativa). B) Por supuesto el tiempo promedio de todos los voxels activados (cambio ≥ 1% del valor basal) en todos los animales. C) Ejemplo del modelo GLM resulta en FSL / FEAT. Click aquí para ver más grande figura.

Figura 5.
- Ejemplo de activación positiva. El curso temporal en los voxels activados (rojo) está siguiendo aproximadamente la forma del modelo GLM. La infusión de la droga comenzó alrededor de momento el punto 8.
- Ejemplo de activación negativa en todo el cerebro después de la anestesia demasiado profundo. El curso temporal de los voxels activados negativa (azul) muestran una disminución general de la señal y ningún efecto de la impugnación es visible.
Haga clic aquí para ver más grande la figura .

Figura 6.
- Se espera patrón de activación después de un análisis de primer nivel. La activación de los conglomerados de voxels (rojo ayEllow), sólo en áreas específicas del cerebro.
- Ejemplo de patrón de "malo" de activación. La activación del cerebro entero negativo (azul) en el mismo animal que en la figura 5B.