Los pasos críticos para un análisis proteómico exitosa y reproducible de los espermatozoides son: 1) la pureza del material de partida; 2) eliminación de sales y detergentes no deseados; 3) la desnaturalización de las proteínas en toda su extensión para permitir que la tripsina para digerir un alto rendimiento de proteínas y 4) reducir al mínimo la manipulación de la muestra para reducir la pérdida de péptido.
Con el fin de retrolavar éxito la cola del epidídimo, es esencial para localizar el área de la cual los espermatozoides se cerrará. En el caso de rata y ratones, esto es en el vértice de la superficie cóncava, en el medio de la región caudal del epidídimo (véase la figura 2A). Si uno viene más hacia el conducto deferente, retrolavado es más fácil y la tasa de éxito es generalmente más alta. Sin embargo, esto viene por la pérdida de número de espermatozoides. Alternativamente, si se intenta moverse más proximal a la corpus, a continuación, la cantidad de presión requerida para empujar los espermatozoides a través de la epididymcol conductos es a menudo tan alto, que los daños en el epidídimo se produce inevitablemente.
El retrolavado del epidídimo se realiza tradicionalmente usando agua saturada aceite mineral y una solución salina equilibrada en la propia jeringa como un medio para eliminar los espermatozoides 22-25. Ambos procedimientos son potencialmente problemática de LC-MS. En primer lugar, es probable que bloquear los nano-columnas nano-C18 que se utilizan básicamente en todo el mundo para el análisis y la atención proteómicos deben tomarse para que ninguno se lleva adelante en el procedimiento de mineral. Si esto ocurre, es imposible continuar y la muestra se pierde esencialmente. Esto se puede superar mediante el uso de BWW u otras soluciones salinas equilibradas en la jeringa, sin embargo, aunque esto tiene éxito, pronto reconoció que muchos de los espermatozoides móviles se vuelven tan pronto como la solución BWW entró en contacto y se mezcla con el caudal del epidídimo las células. Para evitar este problema, simplemente BackFlush los espermatozoides con el aire. No sólo es el qualdad de los espermatozoides comparable a la de los métodos basados en líquidos, pero la cantidad es idéntico.
Phosphoproteomics es quizás una de las pocas formas de establecer vías de señalización que se están produciendo en los espermatozoides después de la eyaculación. Una de las principales vías que estamos investigando es el proceso de capacitación. Los espermatozoides debe someterse a "capacitación" antes de que sea capaz de unirse a un huevo. En la práctica, esto se consigue básicamente mediante la incubación de los espermatozoides durante un período de tiempo (40 min ratón; rata 1,5 hr; humana 3-24 hr) en solución BWW con albúmina de suero. Previamente, nosotros y otros han demostrado un papel para varias quinasas implicadas en la capacitación. De interés, la supresión de la PKA μ II producen ratones cuyos espermatozoides nadar espontáneamente in vitro, pero no puede someterse a la hiperactivación 26. Este último es un sello distintivo de capacitación, por lo que cambiar su patrón de natación espermatozoides a partir de una velocidad alta, baja amplitud, a una bajavelocidad, alta amplitud de frecuencia de batido. Hemos demostrado quinasas de base que intervienen en este proceso incluyen PP60-CSRC (SRC) 13,27 c-sí 28 y c-ABL 14. Curiosamente, la inhibición de SRC detiene capacitación dependiente de la fosforilación de tirosina 13. Sin embargo, esto se puede superar con ácido ocadaico, lo que sugiere que SRC no está directamente implicada en la aparición general de fosforilación de la tirosina 29, pero puede regular una fosfatasa 29. El problema de usar BWW como medio para forzar espermatozoides de epidídimo es que una vez activado, los espermatozoides de ratón sólo toma unos 40 minutos para capacitar. Dado que el aislamiento de los espermatozoides puede tomar 5 min / ratón y, a menudo varios ratones se utilizan en un experimento, a continuación, será espermatozoides en diferentes etapas de madurez en el inicio del experimento. Para superar esto, la presión de aire puede ser utilizado para empujar los espermatozoides del epidídimo caudal dentro de una cánula de vidrio. No sólo son todos los inact espermaive y esencialmente tal como se les encontraron en el medio caudal, hace posible la comparación fosfoproteómica no móviles y móviles.
Manipulación para fosfoproteómica muestra debe mantenerse a un mínimo cuando se comparan los espermatozoides en dos estados funcionales diferentes. El uso de cloroformo metanol sobre otros métodos tradicionales de proteína precipitación 1) disminuye la necesidad de etapas de lavado adicionales, 2) quita casi todos los rastros de sales y grasas y 3) tiene una capacidad probada para precipitar las proteínas de baja abundancia sobre TCA 19. Se recomienda la precipitación de proteínas antes de la digestión con tripsina ya que no sólo hace esto ayuda para desnaturalizar la proteína (que ayuda a la digestión de tripsina), pero elimina muchos de los metabolitos MS-incompatibles presentes en la célula.
La comparación de fosfopéptidos de esperma se puede hacer en un número de maneras. En el nivel básico, una simple comparación de la fosfopéptido identificado en una muestra, para que en otromuestra en el proceso conocido como "conteo espectral" se puede hacer. Sin embargo la crítica ha sido en este enfoque básicamente porque los estudios proteómicos primeros estaban usando réplicas de baja (para una discusión más completa ver Lundren et al. 30). Un enfoque más sofisticado es mirar a la intensidad de la masa progenitora péptido y comparar esto con las otras muestras (comparación libre de etiquetas). En el ejemplo mostrado en la Figura 4, un péptido ausente de la de no móviles (Figura 4 arriba), pero presente en la motilidad (Figura 4 abajo) los espermatozoides de m / z 650-670 puede ser visto. Este proceso, denominado etiqueta basada en MS cuantificación libre es una estrategia sin etiquetas.
Una estrategia alternativa comúnmente utilizado para reducir la cantidad de carreras necesarias para la cuantificación proteómica es el uso de isótopos. Como la masa de un isótopo es diferente, el espectrómetro de masas puede ser utilizado para comparar las intensidades de la eluting péptidos. Sin embargo, a diferencia de la mayoría de los otros tipos de células, algunos marcaje isotópico no se puede aplicar a los espermatozoides. Por ejemplo, la adición de isótopos estables (un isótopo pesado se agrega a una muestra, mientras que una versión más ligera se agrega a otro) se puede utilizar en cultivo de tejidos. Cuando los isótopos se incorporen en la proteína, un análisis de proteómica se puede realizar mediante la combinación de las dos muestras (Multiplexing). Sin embargo, en el caso de los espermatozoides, esto no puede hacerse, simplemente en virtud del hecho de que 1) el etiquetado de isótopos requiere varios pasajes (hasta 8) en cultivo de tejidos y 2) las células de esperma no tiene la transcripción del gen nuclear y la traducción y por lo tanto, no pueden incorporar los isótopos en toda su proteína de todos modos. Una forma de evitar esto es ordenar ratones radiomarcados, sin embargo, estos son muy caros. Un enfoque alternativo es utilizar una etiqueta química. Esto se ha hecho cuando los ratones no capacitados se compararon con los ratones capacitados. En este caso, un D 0 D y una 3 -label se utiliza para distinguir entre una muestra y otra en el espectrómetro de masas 31. Otros enfoques pueden incluir el uso de iTRAQ (etiquetas isobáricas para cuantificación relativa y absoluta), con lo lisinas están etiquetados químicamente con diferentes isótopos de masas; iCAT (isótopo codificado marcador de afinidad) con lo cual cisteínas se etiquetan con diferentes isótopos de masas y etiquetado de agua pesada y ligera.
En cada caso, sin embargo, una cosa hay que tener en cuenta. El MS sólo informa lo que está presente en una muestra, y esto es un reflejo de todo lo que ha sucedido a la muestra hasta que punto. Reducción al mínimo de manipulación de la muestra mientras que maximiza el rendimiento en cada etapa es necesaria para un análisis proteómico éxito.