Además, para el análisis de redes membrana TATS una serie de técnicas de biología celulares de uso común como intracelular de Ca 2 + de imágenes, electrofisiología patch-clamp, o estudios de dosis-respuesta farmacológica depende críticamente de alta calidad de aislamiento de células primarias de las aurículas o los ventrículos o seleccionar partes de tejido del corazón para permitir la caracterización de los miocitos cardíacos intactas diferenciadas, estructuralmente y fisiológicos maduros. Por lo tanto, la evaluación del aislamiento y la calidad de las células de AM y VM descritas en el apartado 1 son, en última instancia útil para muchas preguntas diferentes, incluyendo el análisis de redes TATS aquí descrito, que depende fundamentalmente de la membrana intacta y la integridad celular.
Figura 1 se presenta un manual paso a paso de las imágenes de cómo proceder con la disección de tejido cardíaco a partir de las cámaras auriculares en el corazón del ratón. Posteriormente, se preparan las cámaras ventriculares y el tabique und diseccionado según sea necesario. Selección y preparación de las piezas de tejido correctos precisa es importante establecer de forma fiable AM y VM aislamientos con suficiente pureza celular. Después de la digestión de colagenasa puede ser relativamente difícil identificar la línea correcta de la disección entre el tejido auricular y ventricular, sin embargo, una vez que las células AM y VM se mezclan en suspensión celular incontrolada, es imposible invertir la población de células mixtas. Por lo tanto, la orientación anatómica, visualización de tejidos 3D, una experiencia suficiente con la manipulación de tejidos digeridos, la correcta identificación de las piezas de tejidos específicos y sus líneas de disección, contribuirán al éxito de la celda de aislamiento.

Figura 1.Dissection de tejido auricular. (A) Frente a la parte anterior del corazón, dos s quirúrgicosutures fijar la aorta proximal al extremo tronco de una cánula de 21 G de acero. (B) Vista hacia los espectáculos básicos corazón restantes tejido pulmonar obstruir la vista cámara auricular durante la disección. LA, la aurícula izquierda; RA, aurícula derecha. (C) lungtissue restante y los grandes vasos fueron retirados para acceder a las cámaras auriculares. Lleno triángulo negro, la arteria pulmonar; triángulo estriado, las venas pulmonares; lleno triángulo blanco, la vena cava superior; triángulo en caja, vena cava inferior. (D) En primer lugar, la pared de la aurícula derecha se diseca mientras que las pinzas tienen el apéndice auricular. (E) Ver en la cavidad de la cámara auricular derecha. El triángulo negro marca el tabique interauricular intacto. (F) La disección se continúa para entrar en la cavidad de la cámara de la aurícula izquierda. (G) Después de la disección completa de las aurículas izquierda y derecha, las válvulas auriculoventriculares se hacen visibles. El aparato valvular fibrosa se diseca y se desecha a subsequently cosechar sólo el tejido muscular ventricular. vista (H) posterior de las aurículas izquierda y derecha aisladas. LA, la aurícula izquierda; RA, derecha atrium.Scale bares: 700 m.
Para determinar la calidad de los aislamientos de células, la Figura 2 proporciona ejemplos de células típicas durante la evaluación del rendimiento y la viabilidad de la varilla típica o miocitos intactas estriado en forma de ladrillo, tanto para AMS y máquinas virtuales. Poco dañado, visualmente discreto, así como las células gravemente dañadas con morfologías anormales excesivamente curvos, o células anormales en forma esférica, se pueden identificar fácilmente incluida la exclusión de azul de tripano como se describe en la sección 1.11. Mientras miocitos intactas siguen siendo brillantes y homogéneamente estriado cuando se expone a tripán azul extracelular, las células dañadas muestran típicamente múltiples vesículas de membrana y / o rápidamente se acumulan daños en la membrana que indica intracelularmente azul tripano. Sin embargo, el azul tripán por sí mismo puede dañar las células a través de unnecessarily larga incubación y evaluación inmediata de la calidad celular es, por tanto, obligatoria. Los ejemplos de las formas más evidentes de daño celular como contractura myofilament o daños en la superficie bruta de comprometer la integridad celular se muestran en las figuras 4C y 4D. Por favor haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2. Trypán tinción de células de exclusión con azul. Aislados (A) AM y las células (B) VM se mezclan en suspensión con azul de tripano y se visualizaron con un microscopio de luz invertida se muestra en 40Xmagnification. Nota thatabnormal células esféricas en (A) y (B), teniendo en azul tripán, que indicatesmembrane leakaGE y el daño estructural. En contraste, las células centralAM y VM con membranas intactas excluyen azul tripán como se muestra. Por otra parte, cabe destacar que AM intacto y las células VM muestran estrías sarcómero en todo su volumen celular, ampollas nomembrane y bordes afilados en los dos lados laterales y ambos discos intercalares. Las barras de escala: 20 m.
Tras el éxito registrado rendimientos de aislamiento, los teléfonos de las máquinas virtuales de 5 x 10 mayo a 10 junio se puede esperar de una sola digestión corazón de ratón. El rendimiento de AMS es significativamente inferior en el orden de 3 x 10 03 al 03 x 10 4, azul de tripano en forma de barra con exclusión de las células. En contraste con VM, AM aislamientos ocasionalmente fallan incluso en manos expertas. Paso 1.11 resume los procedimientos de cómo estimar el rendimiento de las células sanas aisladas en suspensión. Además, determinar las dimensiones de celda promedio a través de paso 1.13, como se muestra en la Figura 3 para AM individuo o aislamientos de células VM o para comparar AM frente a las poblaciones de células VM de lado a lado (según sea necesario). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3.Bright análisis de campo morfométricos de los miocitos cardíacos. El contorno VM fue detectado por las herramientas de análisis de imágenes que se describen en el paso 1.13. Utilice la herramienta de selección poligonal visualmente marca y definir la frontera extracelular celda definida por la membrana de la superficie exterior para su análisis. Anuncio de la región seleccionada de interés (ROI) al gestor de retorno de la inversión seguida por las mediciones de distancia 1D. Para los estudios comparativos de AM versus dimensiones VM, es útil para documentar la longitud de la célula, la anchura, y la zona, y para calcular la longitud: anchura.
nt "> Para membranas fluorescencia TATS mancha ya sea en células AM o VM, el tinte de membrana integral-ANEPPS di-8 se utiliza como se describe en la sección
2, seguido por microscopía confocal, que dio lugar a las imágenes representativas de las redes TATS mostrados en
las figuras 4A y
4B. Además,
la Figura 4A muestra la correspondiente imagen de luz transmitida de un AM intacta de lado a lado de la imagen confocal con TATS (para la adquisición de imágenes véase la sección
3). Tal como se describe a paso
1,12, la integridad de la membrana y la superficie morfológica de vida miocitos se juzga a través de las imágenes de luz transmitidos. La región amplificada de la señal de di-8-ANEPPS destaca la morfología subyacente de la red en TATS de AMS, caracterizado por abundante axiales (longitudinales) túbulos de membrana. En contraste, la morfología TATS de máquinas virtuales saludable como se muestra en
la Figura 4B se caracteriza por un número aproximadamente similares, con un axiald componentes transversales. Por el contrario,
las figuras 4C y
4D muestran ejemplos de los miocitos cardíacos dañados que deben ser excluidos de los nuevos análisis. En particular, la célula AM en
la Figura 4C se contrae como se evidencia por una longitud del sarcómero anormalmente corta de 1,2 micras y una red irregular, distorsionada TATS mientras que la célula VM en
la Figura 4D muestra múltiples vesículas de membrana (algunos destacan por triángulos rojos), indicando las interrupciones de membrana , lo que puede ocurrir en la membrana de la superficie exterior, sino también en las membranas TATS.
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Tinción de la membrana Figura 4.Live de la fibrilación ventricular intacto y myocitos. correspondiente se enciende y confocal de imágenes de la vida transmitidos di-8-ANEPPS manchada intacto (A) AM y células (B) VM. En contraste, un AM dañado parcialmente contraída y, potencialmente, con una longitud del sarcómero de 1,2 micras se muestra en (C). Miocitos contratados típicamente muestran una anormalmente acortan y estructuras TATS distorsionados, por lo tanto, excluidos de los nuevos análisis. Otro indicador importante para los defectos de la membrana celular son vesículas de membrana (triángulos rojos) como se muestra en una máquina virtual en (D). Vesículas de membrana representan estructuras de la membrana de la superficie dañada y células con ampollas deben ser excluidos de los nuevos análisis TATS. Además, la máquina virtual muestra el daño grave al parecer falta una pieza completa de su parte inferior izquierda (marcado con asterisco). En resumen, mediante la comparación de la luz transmitida y confocal de imágenes, las células de morfología y intacto superficie se documenta y se combinan con información de la señal fluorescente. Marcas 'N' nuCLEI omitido en el análisis de la mancha de la membrana TATS. Las barras amarillas indican magnifican ROIs de la misma imagen confocal presentado anteriormente. Las barras de escala:. 10 m Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Las imágenes confocales de membranas TATS con una relación suficiente de señal a ruido como se muestra en las Figuras 4A y 4B se aceptan para su posterior análisis cuantitativo. El análisis de membrana TATS se basa en datos esqueletizadas derivados de los componentes de señal rectilíneas fluorescentes. Figura 5 muestra el diagrama de flujo de trabajo de los pasos de procesamiento de imágenes individuales que se describen en detalle los pasos 4.3 a 4.5. Estos pasos producen imágenes que representan esqueletizadas TATS rectilíneas redes de membrana como se muestra para cada aislado VM (Figura 5A) y células AM (Fifigura 5B).

Figura 5.Workflow para esqueletización de imágenes TATS fluorescentes. Etapas de procesamiento de imagen que conducen a una imagen esqueletizada de la red TATS están representados por ejemplos individuales de la imagen paso a paso tanto para un di-8-ANEPPS tiñeron VM (A) y AM (B). Para la etapa de procesamiento de imagen individual, por favor refiérase a la sección 4. Nota diferencias en barras de escala:. 20μm (A) y 10μm (B) Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Un paso crítico en el procesamiento de imágenes, determinar el umbral adecuado para la binarización de datos tal como se describe en la sección 4.5.6. La imagen binaria resultante debe incluir sólo los verdaderos señales de la membrana de la red TATS pero no estructuras falsas obtenidas por umbral errónea de la señal de ruido de fondo. Sin embargo, es importante que el umbral es lo suficientemente baja para detectar todos los verdaderos estructuras TATS tales que los componentes TATS verdaderos no se pierden erróneamente durante el análisis de imagen. Figura 6 ilustra el proceso de cómo seleccionar el umbral durante binarización de datos. Mientras que un umbral de 40, como se muestra en las Figuras 6B y 6C parece apropiado para detectar todas las verdaderas estructuras TATS individualmente, por ejemplo, la elección de un umbral más alto, de 60, como se muestra en la Figura 6A no detecta estructuras de membrana más débil axiales (ATS) como se indica por triángulos amarillos . En contraste, la elección de un umbral inferior, por ejemplo, de 20, como se muestra en la Figura 6D conduce a la detección errónea de ruido de fondo estructuras TATS como falsos positivos como se indica portriángulos amarillos.

Figura 6.How para determinar el umbral de la señal durante skeletonizing de TATS datos de la imagen. Los ejemplos muestran esqueletos TATS cada generados para diferentes umbrales durante binarización de datos (que se describen en el paso 4.5). Las imágenes superiores muestran los ajustes de umbral usando Fiji. Las imágenes de menor: superposición de imágenes esqueletizadas la imagen de fluorescencia de entrada correspondiente con y regiones magnificados como se indica. Un umbral por ejemplo, alto, 60 aplicado en (A), aparentemente, no es adecuado para detectar todos los verdaderos estructuras TATS según lo indicado por los triángulos amarillos en la sección ampliada. Un umbral de 40 aplicado en (B) y (C) detecta todas las estructuras TATS correctamente y no detecta el ruido de fondo, mientras que por ejemplo un umbral bajo., 20 en (D) identifica erróneamente el ruido de fondo como estructuras TATS y por lo tanto produce falsos positivos señales de estructuras de membrana no existentes. Señales de falsos positivos se indican con triángulos amarillos en el recuadro ampliada. Por favor haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
El plug-in "Analizar Skeleton (2D / 3D)" apoya el análisis detallado de las estructuras TATS esqueletizados. Una vez ejecutado, el plugin se generará una tabla de datos con los siguientes parámetros: esqueleto #branches, #junctions, # voxels de punto final, longitud media rama, puntos #triple, puntos #quadruple, y la máxima longitud de la rama. Para una descripción detallada de todos los parámetros de salida posibles consulte tohttp: //fiji.sc/wiki/index.php/AnalyzeSkeleton y artículos conexos 29-31. Una salida típica tabla de datos se muestra en la Figura 7A.
Longitud esqueleto Total por retorno de la inversión:
Σ (x #branches rama longitud promedio) = 5155 px = 515,5 micras
La longitud total del esqueleto puede ser normalizada para el área de imagen. Para el ejemplo mostrado en la figura 7 la longitud normalizada del esqueleto 0.64μm / m 2 y la suma de todas las uniones se calculan como se muestra a continuación:
Normalizada la longitud del esqueleto:
515,5 m / 803,6 m 2 = 0.64 m / m 2
Número normalizado de uniones:
155 uniones / 803.6 m 2 2

Figura salida de datos 7.Automated de imágenes esqueletizados. (A) Una hoja de cálculo de datos típico generado por el 'Analizar Skeleton (2D / 3D)' plug-in de la imagen skeletonized muestra en (B). Para una descripción detallada de los posibles parámetros de salida consulte http://fiji.sc/wiki/index.php/AnalyzeSkeleton . Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Los pasos de procesamiento de imágenes descritos en 4.5 y se ilustran en la Figura 5 pueden ser automatizadas usando un macro Fiji proporcionado como Código complementario Archivo 4.3 y 4.4. La macro puede ser ventajoso para el análisis de grupos de conjuntos de datos completos, por ejemplo mediante la preparación de pilas de imagen de entrada individuales para cada grupo de tratamiento independiente para el análisis automatizado utilizando los comandos de macro.
La estrategia de software descrito permite además el análisis de orientación red TATS para todos los componentes. Para ello, utilice el plugin "direccionalidad" (http://fiji.sc/Directionality) 29,31 que produce datos de histograma que muestra la distribución de la orientación de todos los TATS orientaciones componentes. Si el eje x de la imagen de entrada se corresponde con el eje principal de una célula AM o VM dado, el axial (longitudinal) componentes TATS estará representada por el bin 0 °, mientras que los componentes transversales estarán representados por el 90 y# 176; bin. Figura 8 muestra direccionalidad ejemplar histogramas de imágenes TATS esqueletizadas para una máquina virtual (8A) frente a un (8B) de células AM. Mientras que el histograma direccionalidad de una máquina virtual típica muestra una distribución doble pico a 0 ° y 90 °, el histograma AM muestra un único pico dominante a 0 °. Estos ejemplos están de acuerdo con las observaciones anteriores de que los componentes individuales de TATS máquinas virtuales se distribuyen casi a partes iguales entre los túbulos T y A-túbulos, mientras que los componentes TATS en los AM pueden estar compuestos predominantemente de A-túbulos.

Figura histograma direccionalidad 8.Representative de TATS redes de células individuales. Histogramas Direccionalidad se generaron a partir de imágenes esqueletizadas de VM individuales (A) versus AM (B Por favor haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
| El tampón de perfusión | mM |
| NaCl | 120.4 |
| KCl | 14.7 |
| KH 2 PO 4 | 0,6 |
| Na 2 HPO 4 | 0,6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO3 | 4.6 |
| Taurina | 30 |
| 2,3-Butanedione-monoxima | 10 |
| Glucosa | 5.5 |
| pH 7,4 |
| Tampón de digestión | mM (si no se especifica) |
| NaCl | 120.4 |
| KCl | 14.7 |
| KH 2 PO 4 | 0,6 |
| Na 2 HPO 4 | 0,6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO3 | 4.6 |
| Taurina | 30 |
| 2,3-Butanedione-monoxima | 10 |
| Glucosa | 5.5 |
| La colagenasa de tipo II | 600 U / ml |
| pH 7,4 |
| Tampón de parada | mM (si no se especifica) |
| NaCl | 120.4 |
| KCl | 14.7 |
| KH 2 PO 4 | 0,6 |
| Na 2 HPO 4 | 0,6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO3 | 4.6 |
| Taurina | 30 |
| 2,3-Butanedione-monoxima | 10 |
| Glucosa | 5.5 |
| CaCl 2 | 0.0125 |
| de suero bovino de ternero | 10% |
| pH 7,4 |
Tabla 1.Buffer solutiones. El contenido de las tres soluciones tampón fisiológicas diferentes para el aislamiento de células y la imagen se resumen.