En la tumorigénesis de mama, la etapa metastásica de la enfermedad representa la mayor amenaza para el individuo afectado. Las células mamarias normales con genotipos alterados ahora poseen la capacidad de invadir y sobrevivir en otros tejidos. En este protocolo, se extirpan los tumores mamarios de ratón y se preparan las células primarias a partir de los tumores. Las células aisladas de este procedimiento están disponibles para experimentos de perfiles genéticos. Para que la metástasis tenga éxito, estas células deben ser capaces de intravasarse, sobrevivir en circulación, extravasarse a órganos distantes y sobrevivir en ese nuevo sistema de órganos. Los pulmones son el objetivo típico de la metástasis del cáncer de mama. Se ha descubierto un conjunto de genes que median la selectividad de la metástasis en el pulmón. Aquí describimos un método para estudiar la metástasis pulmonar a partir de un modelo de ratón modificado genéticamente. Además, se incluye otro protocolo para analizar fibroblastos embrionarios de ratón (MEFs) a partir del embrión de ratón. Las células MEF del mismo tipo animal proporcionan una pista sobre la expresión génica de células no cancerosas. Juntas, estas técnicas son útiles en el estudio de la tumorigénesis mamaria de ratón, sus mecanismos de señalización asociados y las vías de las anomalías en los embriones.