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Artículo de método

Los ensayos basados ​​en la microscopía para la selección de alto rendimiento de los factores del huésped que participan en

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DOI:

10.3791/54263

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5 de agosto de 2016

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* These authors contributed equally

En este artículo

Resumen

Se describen dos ensayos para el cribado de alto rendimiento basado en microscopía de los factores del huésped implicados en la infección por Brucella. El ensayo de entrada detecta los factores del huésped necesarios para la entrada de Brucella y el ensayo de punto final los necesarios para la replicación intracelular. Si bien es aplicable para enfoques alternativos, el cribado de siRNA en células HeLa se utiliza para ilustrar los protocolos.

Resumen

Las especies de Brucella son patógenos intracelulares facultativos que infectan a los animales como sus huéspedes naturales. La transmisión al hombre es más comúnmente causada por el contacto directo con animales infectados o por la ingestión de alimentos contaminados y puede conducir a infecciones crónicas graves.

Brucella puede invadir las células fagocíticas profesionales y no profesionales y replica dentro del retículo endoplasmático (ER) -derivado vacuolas. Los factores del huésped requeridos para entrar en las células huésped Brucella, la evitación de la degradación lisosomal, y la replicación en el compartimiento ER-como siguen siendo en gran parte desconocido. A continuación se describen dos ensayos para identificar los factores del huésped implicados en la entrada de Brucella y replicación en células HeLa. Los protocolos describen el uso de ARN de interferencia, mientras que los métodos de detección alternativos se podrían aplicar. Los ensayos se basan en la detección de bacterias marcadas con fluorescencia en la etiqueta fluorescente células huésped utilizando automatizadoLa microscopía de campo amplio. Las imágenes fluorescentes se analizaron mediante un análisis de tuberías imagen normalizada en CellProfiler que permite solo de puntuación infección basado en células.

En el ensayo de punto final, la replicación intracelular se mide dos días después de la infección. Esto permite que las bacterias tráfico a su nicho replicativo en que se inicia la proliferación alrededor de 12 horas después de la entrada de bacterias. Brucella que se han establecido con éxito un nicho intracelular se hace un enérgico han proliferado en el interior de las células huésped. Puesto que las bacterias intracelulares serán más numerosos que en gran medida las bacterias no replicativos extracelulares o intracelulares individuales, una cepa que expresa constitutivamente GFP se puede utilizar. La señal de GFP fuerte se utiliza entonces para identificar las células infectadas.

Por el contrario, para el ensayo de entrada es esencial diferenciar entre intracelular y las bacterias extracelulares. Aquí, se utiliza una codificación de cepa para una GFP inducible por tetraciclina. Inducciónde GFP con la inactivación simultánea de bacterias extracelulares por gentamicina permite la diferenciación entre intracelular y bacterias extracelulares en base a la señal de GFP, con sólo las bacterias intracelulares ser capaz de expresar GFP. Esto permite la detección robusta de bacterias intracelulares individuales antes de que se inicie la proliferación intracelular.

Introducción

Las especies de Brucella son gram-negativos, patógenos intracelulares facultativos pertenecientes a la clase de α-proteobacterias. Causan abortos e infertilidad en sus huéspedes naturales tales como vacas, cabras, ovejas o que resulta en graves pérdidas económicas en las zonas endémicas. La brucelosis es una de las enfermedades zoonóticas más importantes en todo el mundo que causan más de medio millón de nuevos casos de infección humana por año 1. La transmisión a humanos es causada generalmente por el contacto directo con animales infectados o por la ingestión de alimentos contaminados, tales como la leche no pasteurizada. Los síntomas d....

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Protocolo

Nota: Todo el trabajo con cepas de Brucella abortus en vivo debe ser realizado dentro de un laboratorio de bioseguridad de nivel 3 (NBS3) teniendo en cuenta todas las normas requeridas y las precauciones de seguridad.

1. Preparación de las placas de detección y cultivo de bacterias y células

  1. Preparación de Brucella abortus cultivos iniciadores
    1. Racha de Brucella abortus 2308 (B. abortus) de -80 ° C leche stock en una placa de agar tripticasa de soja (TSA) que contiene 50 mg / ml de kanamicina (TSA / Km). Incubar la placa durante 3-4 días a 37 ° C. Utilice Brucella abortus cep....

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Resultados

La Figura 1A muestra un ejemplo de análisis de imágenes se utiliza para identificar automáticamente las células infectadas en el ensayo de punto final. se identificaron núcleos de las células HeLa teñidas con DAPI, se calcularon una peri-núcleo de anchura 8 píxeles que rodea el núcleo, y un cuerpo celular Voronoi por extensión del núcleo por 25 píxeles. Puesto que las bacterias proliferan principalmente en el espacio peri-nuclear, la intensidad de GFP en este área de la .......

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Discusión

Los patógenos bacterianos han desarrollado numerosas estrategias para manipular las células huésped eucariotas en su beneficio. Los patógenos que causan infecciones agudas a menudo muestran una rápida proliferación que se acompaña de una alarma significativa del sistema inmunológico y pérdida de viabilidad de las células infectadas. Por el contrario, Brucella y otros patógenos que causan infecciones crónicas logran establecer interacciones duraderas dentro de las células huésped. Por lo tanto, las bacterias nece.......

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Divulgaciones

Los autores declaran no tener conflictos de intereses.

Agradecimientos

Este trabajo fue apoyado por las subvenciones 51RT 0_126008 y 51RTP0_151029 para los proyectos de Investigación y Desarrollo Tecnológico (IDT) InfectX y TargetInfectX, respectivamente, en el marco de SystemsX.ch, la Iniciativa Suiza para la Biología de Sistemas. Agradecemos las 310030B_149886 de subvenciones de la Fundación Nacional Suiza para la Ciencia (SNSF). El trabajo de S.H.L y A.C. fue apoyado por el Programa Internacional de Doctorado "Fellowships for Excellence" del Biozentrum. Simone Muntwiler es reconocida por su asistencia técnica. Nos gustaría agradecer a Dirk Bumann por proporcionar pNF106 y a Jean Celli por pJC43 y pJC44.

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Agar de soja tríptico (TSA)BD236950
Caldo de soja tríptico (TSB)Fluka22092
Sulfato de kanamicinaSigma-Aldrich60615
Leche
Frasco de 250 ml con tapónde rosca Corning8396
DMEMSigma-AldrichD5796
Fetal Suero de ternera (FCS)Gibco10270inactivada por calor
(0,5%)Gibco15400-05410x solución madre, diluida 1:10 en PBS
Scepte 2.0 Cell CounterMerck MiliporePHCC20060Se pueden utilizar dispositivos de recuento de células alternativos
Greiner CELLSTAR Placa de 384 pocillosSigma-AldrichM2062
Papel de aluminio pelableCostar6570
Dispensador de reactivos: "Multidrop 384 Recomponent Dispenser"puede utilizar el dispensador de reactivosThermo Scientific5840150
Reactivo de transfección: "Lipofectamine RNAiMAXInvitrogen13778-150
Lavadora de placas automatizada: "Lavadora de placas ELx50-16"BioTekELX5016Esta lavadora de placas contiene un colector de 16 canales adecuado para placas de 384 pocillos. Cabe en un armario de bioseguridad y tiene una tapa que cubre la placa durante el lavado, lo que reduce el riesgo de producción de aerosoles. Se pueden utilizar arandelas de placas alternativas con características similares.
gentamicinaSigma-AldrichG1397
clorhidrato de anhidrotetraciclinaSigma-Aldrich37919100 μ La solución de g/ml en etanol al 100% se mantiene a -20 °C; C protegido de la luz en papel de aluminio
PBSGibco20012
ParaformaldehídoSigma-AldrichP6148Disolver en tampón HEPES de 0,2 M, pH 7,4. Almacenar a -20 ° C y descongele fresco el día antes de usar. Atención, el PFA es tóxico por inhalación, en contacto con la piel y si se ingiere.
HEPESSigma-AldrichH3375
Triton X-100Sigma-AldrichT9284
DAPIRoche10236276001
SiRNA CodificadoDharmaconD-001810-10
Kif11 siRNADharmaconL-003317-00
ARPC3 siRNADharmaconL-005284-00
Brucella abortus 2308
pJC43 (apHT::GFP)Celli et al.12
pAC042.08 (apht::d sRed, tetO::tetR-GFP)Construcción: pJC44 4 fue digerida con EcoRI seguida de la generación de extremos romos con enzima Klenov y posterior digestión con SalI. TetR-GFP se amplificó a partir de pNF106 utilizando los cebadores prAC090 y prAC092. Después de la digestión con SalI, el producto TetR-GFP se ligó al vector pJC44 digerido.
Imprimación prAC090Sigma-AldrichTTT TTG AAT TCT GGC AAT TCC GAC GTC TAA GAA
ACC Primer prAC092Sigma-AldrichTTT TTG TCG ACT TTG TCC TAC TCA GGA GAG CGT
TC HeLa CCL-2ATCCCCL-2
ImageXpressMicro Molecular Devices Microscopioautomatizado de imágenes celulares equipado con una etapa Z motorizada de precisión. Se pueden emplear sistemas alternativos para la microscopía automatizada y componentes alternativos para el hardware y el software que se especifican a continuación.
de enfoque automático láser de alta velocidad 1-2300-1037
CFI Super Fluor 10X objetivoNikon MRF00100N.A 0.50, W.D 1.20 mm, Prisma DIC: 10X, Fotometría con resorte
Cámara CCD monocromática CoolSNAP HQDispositivos moleculares 1-2300-10601.392 x 1.040 píxeles de imagen, 6,45 x 6,45 y micro; m píxeles, digitalización de 12 bits
Software MetaXpressMolecular Devices 9500-0100
LUI-Spectra-X-7LumencorSPECTRA X, V-XXX-YZ, Motor ligero. Se utilizan las siguientes fuentes de luz: violeta (DAPI), cian (GFP), verde/amarillo (RFP)
Excitador de banda única para DAPISemrockFF01-377/50-25
Emisor de banda única para DAPISemrockFF02-447/60-25
dicroico de banda única para DAPISemrockFF409-DI03-25x36
Excitador de banda única para GFPSemrockFF02-472/30-25
Emisor de banda única para GFPSemrockFF01-520/35-25
dicroico de banda única para GFPSemrockFF495-DI03-25x36
Excitador de banda única para RFPSemrockFF01-562/40-25
Emisor de banda única para RFPSemrockFF01-624/40-25
dicroico de banda única para RFPSemrockFF593-DI03-25x36
desnatada Tripsina-EDTA Se Alternative.Dispositivos moleculares ,

Referencias

  1. Pappas, G., Papadimitriou, P., Akritidis, N., Christou, L., Tsianos, E. V. The new global map of human brucellosis. Lancet Infect Dis. 6, 91-99 (2006).
  2. Atluri, V. L., Xavier, M. N., de Jong, M. F., den Hartigh, A. B., Tsolis, R. E. Interactions of the human pathogenic Brucella species with their ....

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