Los timoes fetales co-cultivados fueron seccionados para analizar si las células de linaje T derivadas de iPSC pueden migrar a los lóbulos timicos. Los lóbulos de control no sembrados tenían una arquitectura tisular caracterizada por una red epitelial timómica similar a la astrocíta17,desplegada de células ENDógenas CD3+. Por otro lado, los lóbulos timáticos sembrados con células T inmaduras derivadas de iPSC fueron repoblados con células CD3+ mononucleares, lo que indica la migración de células T inmaduras derivadas de iPSC a los lóbulos (Figura2A).
Células T que migranen y maduraron dentro del microambiente timico posteriormente salidadas como iTE. Para probar su caracterización fenotípica, se realizó un análisis citométrico de flujo de timocitos C57BL6, células T inmaduras derivadas de Pmel iPSC (extratímica) y células que salen de los lóbulos timicos (iTE). Las células T extratímicas en OP9/DLL1 mostraron células T CD4+CD8+ (DP) y células T CD8SP sin expresión del marcador de selección positivo MHC-I, mientras que iTE tenía una población clara de fenotipo de células CD8-SP MHC-I+ T, lo que indica su paso exitoso a través de la selección positiva antes de salir de los lóbulos timáticos. iTE expresa constantemente MHC-I y CD62L, que son marcadores asociados con alta competencia proliferativa, producción de citoquinas, supervivencia periférica, y afectación linfoide18,19,20. Este fenotipo es consistente con los timocitos M2 SP que son la población más madura de células T positivas individuales en el timo20,lo que sugiere que iTE ha pasado por un programa de desarrollo timémico normal (Figura3). Para monitorear la eficiencia de la generación de iTE, se aislaron las células que habían expulsado de lóbulos timicos individuales. En el día 7, los lóbulos timáticos generaron un promedio de 1 x 103 CD8SP en vivo CD45.1+ CD3+ iTE por día (Figura3B). Una tasa similar de producción de iTE se observa desde el día 6 hasta el día 12 de la cocultura timmica 3D.
Se analizaron la activación dependiente del antígeno y la secreción de citoquinas para observar las propiedades funcionales de las células T inmaduras derivadas del iPSC educadas tímicamente. En presencia de un péptido irrelevante (nucleoproteína), Pmel-iTE no liberó cantidades significativas de TNF-o, IL-2 o IFN-o. Cuando se estimuló con el péptido cognado para las células T de Pmel (hgp100), Pmel-iTE liberó cantidades robustas de TNF-- e IL-2, mientras que también produce cantidades bajas de IFN-o (Figura4), lo que indica que iTE con educación timica puede reconocer su péptido cognado y secretamente citkines efector con un perfil similar al de los emigrantes timicos recientes naturales (RTE).
Para examinar las diferencias transcripcionales entre las células de linaje T derivadas de iPSC diferenciadas en OP9/DLL1 con o sin educación timica (es decir, iTE frente a células T extratímicas), se realizó un análisis ARN-seq en estas dos poblaciones y se comparó a la de las células de linaje DP T diferenciadas usando OP9/DLL1 (DP) y células primarias ingenuas CD8+ Pmel T. La expresión de 102 genes que desempeñan un papel crucial en la ontogenia de células T, la activación de thymocitos y la formación de la memoria se analizaron15,20,21,22. Un análisis de componentes principales de esas cuatro poblaciones estudiadas demostró que las células T DP y CD8SP generadas extralíticamente se agruparon, mientras que iTE se agruparon más cerca de las células T ingenuas (Figura5). Colectivamente, estos datos demuestran que iTE tiene un fenotipo más cercano a las células T ingenuas que las células de linaje T generadas por métodos extratímicos.

Figura 1 : Descripción esquemática de la diferenciación de iPSC a iTE utilizando OP9/DLL1 y cultivo timico 3D. El protocolo implica tres pasos de diferenciación separados; (Izquierda) de células iPSC a células de linaje hematopoyético en OP9/DLL1 (día 0 a 6), (Medio ) de células de linaje hematopoyéticas a células T inmaduras en OP9/DLL1 con citoquinas (días 6 a 16–21), y (derecha) de células T inmaduras (día 16–21) a iTE utilizando un sistema de cultivo timico 3D. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2 : Inmunohistoquímica de lóbulos timáticos sembrados con células T inmaduras derivadas de iPSC. Parte superior: Tinción de H&E de un lóbulo timico con y sin sembración de células T inmaduras derivadas de iPSC. De la segunda parte superior a la inferior: imágenes confocales de los lóbulos seccionados teñidos con DAPI (núcleo), CD3 (célula T) y fusión. Barras de escala a 100 m. Por favor, haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3 : iTE muestra un fenotipo de células T post-tímicos. (A) análisis FACS de timocitos, células T extratímicas (sistema de cocultivo OP9/DLL1) y Pmel-iTE. Las células vivas estaban cerradas en CD45 congénico+. Las poblaciones de CD8 SP se analizaron más a fondo para la expresión CD62L y MHC-I. (B) Número medio de CD8SP CD45.1 iTE producido durante la noche por lóbulo 7 días después de la pre-sembración. Se recopilaron datos de 12 experimentos independientes. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4 : iTE produce varias citoquinas mediante estimulación específica del antígeno. Análisis FACS de la producción intracelular de citoquinas por iTE. iTE fueron co-cultivados con APC precargados con péptido irrelevante (nucleoproteína) o cognado (hgp100) durante tres días. Los números mostrados en los cuadrantes superiores derecho indican los porcentajes de citoquinas productoras de iTE. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5 : El análisis del transcriptoma entero revela un cambio en la expresión del gen iTE hacia un CD8 ingenuo + Programa de células T. Análisis de componentes principales (PCA) de datos RNA-seq de células DP, CD8 extraitmicos SP, iTE y células T ingenuas. (Análisis de 102 genes relacionados con la diferenciación timmica utilizando la base de datos pública GSE105110) 15. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.