Este protocolo describe un método de cribado de alto rendimiento basado en citometría de flujo para identificar fármacos de moléculas pequeñas que inhiben la activación de la integrina β2 en neutrófilos humanos.
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Este protocolo describe un método de cribado de alto rendimiento basado en citometría de flujo para identificar fármacos de moléculas pequeñas que inhiben la activación de la integrina β2 en neutrófilos humanos.
Este protocolo tiene como objetivo establecer un método para identificar pequeños antagonistas moleculares de la activación de integrinas β2, utilizando anticuerpos que informan de cambios conformacionales y citometría de flujo de alto rendimiento. El método también puede servir como guía para otros métodos de cribado de alto rendimiento basados en anticuerpos. Las integrinas β2 son moléculas de adhesión específicas de los leucocitos que son cruciales en las respuestas inmunitarias. Los neutrófilos dependen de la activación de la integrina para salir del torrente sanguíneo, no solo para combatir infecciones, sino también para estar involucrados en múltiples enfermedades inflamatorias. El control de la activación de la integrina β2 presenta un enfoque viable para el tratamiento de las enfermedades inflamatorias asociadas a los neutrófilos. En este protocolo, se utiliza un anticuerpo monoclonal, mAb24, que se une específicamente a la pieza principal de alta afinidad de las integrinas β2, para cuantificar la activación de las integrinas β2 en neutrófilos humanos primarios aislados. La N-formilmetionil-leucil-fenilalanina (fMLP) se utiliza como estímulo para activar las integrinas β2 de los neutrófilos. En este estudio se utilizó un citómetro de flujo de alto rendimiento capaz de procesar automáticamente muestras de placas de 384 pocillos. Los efectos de 320 sustancias químicas sobre la inhibición de la integrina β2 se evalúan en 3 h. A través de este enfoque, se pueden identificar moléculas que se dirigen directamente a las integrinas β2 o moléculas diana en la vía de señalización de activación de la integración iniciada por el receptor acoplado a la proteína G de adentro hacia afuera.
Muchas enfermedades inflamatorias se caracterizan por la infiltración de neutrófilos en el sitio de la hinchazón o lesión1. Para infiltrarse en estos tejidos, los neutrófilos deben completar la cascada de reclutamiento de neutrófilos, que implica la detención del endotelio, la extravasación a través de la pared del vaso y el reclutamiento en el tejido2. Los neutrófilos circulantes necesitan la activación de la integrina β2 para completar esta cascada, especialmente para la fase de detención. Por lo tanto, los fármacos inhibidores de integrinas que reducen la adhesión, la extravasación y el reclutamiento de neutrófilos pueden tratar eficazmente las enfermedades inflamatorias 3,4.
Las integrinas β2 han sido atacadas para enfermedades inflamatorias anteriormente. El efalizumab, un anticuerpo monoclonal dirigido directamente a la integrina αLβ2, se desarrolló para tratar la psoriasis5. Sin embargo, el efalizumab fue retirado debido a su efecto secundario letal: leucoencefalopatía multifocal progresiva resultante de la reactivación del virus JC 6,7. Las nuevas terapias antiinflamatorias basadas en integrinas deben considerar el mantenimiento de las funciones antiinfecciosas de los leucocitos para minimizar los efectos secundarios. Los efectos secundarios del efalizumab podrían deberse a la circulación prolongada de anticuerpos monoclonales en el torrente sanguíneo, lo que podría inhibir las funciones inmunitarias a largo plazo8. Un estudio reciente muestra que efalizumab media la reticulación αLβ2 y la internalización no deseada de las integrinas α4, proporcionando una explicación alternativa para los efectos secundarios9. Por lo tanto, los antagonistas de moléculas pequeñas de corta duración podrían evitar este problema.
Aquí se presenta un método de alto rendimiento para cribar antagonistas de integrinas β2 de moléculas pequeñas utilizando neutrófilos humanos. La activación de la integrina β2 requiere cambios conformacionales del ectodominio de la integrina para acceder y aumentar su afinidad de unión a su ligando. En el modelo canónico de navaja, el ectodominio de integrina doblada-cerrada primero se extiende a una conformación extendida-cerrada y luego abre su casco a una conformación extendida-abierta completamente activada10,11,12,13. También existe una vía alternativa que parte de la curva-cerrada a la curva-abierta y extendida-abierta, eventualmente 14,15,16,17,18,19. El anticuerpo conformacional específico mAb24 se une a un epítopo en el dominio humano similar a β2-I cuando la cabeza del ectodominio está abierta20,21,22,23.
En este caso, se utiliza mAb24-APC para determinar si las integrinas β2 están activadas. Para activar los neutrófilos y la integrina, se utiliza como estímulo en este protocolo la N-formilmetionil-leucil-fenilalanina (fMLP), un péptido quimiotáctico corto derivado de bacterias que puede activar las integrinas β2 de los neutrófilos24. Cuando fMLP se une a Fpr1 en los neutrófilos, se activan cascadas de señalización aguas abajo que involucran proteínas G, fosfolipasa Cβ y fosfoinositida 3-quinasa γ. Estos eventos de señalización finalmente resultan en la activación de la integrina a través de la vía de señalización de adentro hacia afuera18,25. Además de los antagonistas de moléculas pequeñas que se unen directamente a las integrinas β2 y evitan los cambios conformacionales de la activación de las integrinas26, con este método también se detectarían compuestos que pueden inhibir los componentes de la vía de señalización de activación de la integrina β2 de adentro hacia afuera. Los citómetros de flujo automatizados permiten un cribado de alto rendimiento. La identificación de nuevos antagonistas no solo puede profundizar nuestra comprensión de la fisiología de las integrinas, sino que también puede proporcionar información traslacional sobre la terapia antiinflamatoria basada en integrinas.
Se obtuvieron muestras de sangre entera heparinizadas de donantes humanos sanos no identificados después de obtener el consentimiento informado, según lo aprobado por la Junta de Revisión Institucional de UConn Health, siguiendo los principios de la Declaración de Helsinki. Se obtuvo el consentimiento informado de todos los donantes. Los criterios de inclusión/exclusión para este estudio se desarrollaron cuidadosamente para garantizar la idoneidad de los participantes y minimizar los riesgos potenciales. Los participantes elegibles tenían entre 18 y 65 años, eran de cualquier etnia, hablaban inglés con fluidez y eran capaces de dar su consentimiento informado. Entre los participantes excluidos se encontraban aquellos que no podían dar su consentimiento informado por sí mismos, como los que requerían un representante legalmente autorizado, las personas menores de 18 años o mayores de 65 años, las personas encarceladas y las mujeres embarazadas. Además, los participantes tenían que estar libres del uso de medicamentos antiinflamatorios y de afecciones inflamatorias. Las infecciones actuales o las afecciones inflamatorias crónicas o agudas en curso también fueron criterios de exclusión. Por último, las personas con antecedentes actuales o recientes de infección por COVID-19 no fueron elegibles para el estudio. Estos criterios se diseñaron para garantizar la seguridad y la idoneidad de los participantes y, al mismo tiempo, minimizar los posibles factores de confusión que podrían afectar los resultados del estudio.
1. Preparación de reactivos
2. Aislamiento de neutrófilos de sangre humana
3. Preparación de la placa de 384 pocillos
4. Tratamiento de las células
5. Citometría de flujo
6. Análisis de datos
Los datos de un cribado representativo de placas de 384 pocillos (Figura 4) revelaron que los controles negativos tenían un IMF de mAb24-APC de 3236 ± 110, mientras que los controles positivos tenían un MFI de mAb24-APC de 7588 ± 858. El factor Z' para esta placa es de aproximadamente 0,33, que está dentro de un rango aceptablede 31. Sin embargo, Z' requiere una validación adicional en ensayos secundarios.
Para normalizar los datos, todos los valores se escalaron para asignar un valor máximo de 1 a la media positiva y un valor mínimo de 0 a la media negativa. El factor Z' se someterá a una validación más rigurosa en ensayos secundarios. El punto de corte para esta placa se establece en 0,41, lo que significa que las muestras con un MFI relativo inferior a 0,41 se considerarán como aciertos que inhiben la activación de la integrina β2 inducida por fMLP en neutrófilos humanos. No se identificaron impactos de esta placa.
Para confirmar la efectividad del protocolo, se utilizaron Nexinhib20, que inhibe la activación de la integrina β2 antagonizando la función de Rac-1, y lifitegrast, que antagoniza directamente la integrina αLβ232,33. Sin embargo, los tiempos de incubación se ajustaron a una hora para Nexinhib20 y media hora para lifitegrast. Los datos resultantes de estos experimentos se normalizaron utilizando el mismo método de escalado descrito anteriormente. Estos puntos de datos se combinaron con los resultados de la placa y se analizaron colectivamente (Figura 4).

Figura 1: Disposición de la placa para el cribado compuesto. Diagrama esquemático que ilustra la disposición de los compuestos de cribado y los controles en una placa de 384 pocillos. Los pocillos de control negativo se representan en azul (columnas 1 y 23) y los pocillos de control positivo se muestran en rojo (columnas 2 y 24). Los pozos de prueba están representados en color beige (columnas 3 a 22). Las flechas indican la secuencia de lectura de la placa. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Separación de neutrófilos utilizando medio de gradiente de densidad. Fotos representativas que demuestran la separación exitosa y no exitosa de neutrófilos utilizando un medio de gradiente de densidad. (A) Inicialmente, se colocan 4 ml de sangre en capas sobre 8 ml de medio de gradiente de densidad. (B) Después de la centrifugación, deben verse dos bandas turbias: la banda superior que contiene principalmente células mononucleares de sangre periférica (PBMC) y la banda inferior que contiene principalmente neutrófilos con algunos glóbulos rojos (RBC). La mayoría de los glóbulos rojos se peletizan en la parte inferior. (C) Una separación fallida en la que los glóbulos rojos no se peletizan y no se observa la banda de neutrófilos. Se requeriría una centrifugación adicional (10-30 min) para separar la banda de neutrófilos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Activación de neutrófilos mediante gráficos FSC/SSC. Gráficos representativos de dispersión directa (FSC) y dispersión lateral (SSC) que ilustran la estrategia de compuerta para identificar neutrófilos. (A) Los neutrófilos se clasifican en función del área de dispersión directa (FSC-A) y dispersión lateral (SSC-A) registrada por el citómetro de flujo. (B) Las celdas individuales se limitan aún más en función de la anchura (FSC-W) y la altura (FSC-H) de la dispersión directa, y (C) la anchura (SSC-W) y la altura (SSC-H) de la dispersión lateral. La escala de colores representa la densidad de celdas, pasando de rojo a amarillo, verde y azul a medida que disminuye la densidad. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Resultados de la detección en una placa representativa de 384 pocillos. Los resultados de la detección provienen de una placa representativa de 384 pocillos, que demuestra un factor Z' de 0,3. Los controles negativos y positivos se indican con puntos azules y rojos, respectivamente. Las muestras de prueba tratadas con varios compuestos se representan como puntos beige. La línea discontinua representa el límite de la intensidad media de fluorescencia (MFI) para identificar los resultados. Ninguno de los compuestos ensayados se identificó como antagonista de las integrinas β2, ya que todos los compuestos ensayados mostraron valores de IMF por encima de la línea de corte. Los resultados de experimentos independientes que probaron antagonistas de integrinas β2 conocidos con tiempos de incubación variables (Nexinhib20 durante 1 h, lifitegrast durante media hora) se agrupan para su presentación en esta figura. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
El inicio y la terminación de la estimulación y tinción de neutrófilos están determinados por la adición de neutrófilos y el fijador PFA. Por lo tanto, es fundamental garantizar el mismo intervalo de tiempo entre el pipeteo de neutrófilos o PFA en cada columna. Esto asegura que el tiempo de estimulación y tinción de los neutrófilos de cada pocillo permanezca constante. Debido a la corta vida útil de los neutrófilos, todo el experimento, desde la recolección de sangre de los donantes hasta la realización de la citometría de flujo, debe llevarse a cabo el mismo día. Los neutrófilos son muy sensibles a los cambios de temperatura y pueden activarse cuando se exponen a aumentos rápidos de temperatura, como la transición de 4 °C a temperatura ambiente o de temperatura ambiente a 37 °C. Además, según nuestra experiencia previa, la activación de la integrina β2 de neutrófilos inducida por fMLP no se produce cuando las células se almacenan en hielo o a 4 °C (datos no mostrados). Por lo tanto, antes de la fijación, la sangre entera y los neutrófilos deben mantenerse a temperatura ambiente o a 20 °C (durante la etapa de centrifugación de aislamiento). No coloque sangre entera ni neutrófilos en hielo.
La tinción de mAb24 en controles negativos debería producir resultados muy bajos. Si se observa un alto nivel de tinción de mAb24 en un experimento, compruebe lo siguiente: (1) si hubo un cambio significativo de temperatura durante el experimento antes de la fijación; (2) si había contaminación por fMLP o endotoxinas en el medio neutrófilo; (3) si la manipulación de la muestra fue demasiado agresiva, como la generación de burbujas durante el pipeteo y la mezcla.
El protocolo actual emplea mAb24 para informar de la apertura del cabezal de la integrina β2. Teóricamente, KIM127, un anticuerpo monoclonal que informa de la extensión de las integrinas β2 34,35, puede utilizarse junto con mAb24 para evaluar de forma exhaustiva la conformación de las integrinas β2. Sin embargo, la relación señal-ruido de la tinción con KIM127 (1,5 a 2 veces) no es tan favorable como la de mAb24 (5 a 10 veces), que normalmente no proporciona un factor Z' satisfactorio en el ensayo en placa de 384 pocillos. En el ensayo en placa de 96 pocillos, las muestras se pueden lavar antes de realizar la citometría de flujo, lo que reduce las señales de fondo derivadas de anticuerpos solubles. Por lo tanto, el ensayo basado en KIM127 se puede realizar en el ensayo de placa de 96 pocillos, que tiene un rendimiento más bajo en comparación con el ensayo de placa de 384 pocillos.
Dado que este método utiliza la intensidad de la fluorescencia como lectura para evaluar el efecto inhibidor de la integrina de los fármacos, algunos fármacos fluorescentes pueden interferir con los resultados. Además, los fármacos tóxicos que inducen la muerte de los neutrófilos dentro del período de estimulación de 10 minutos también parecerán informar de la inhibición de la integrina. Los fármacos que inhiben la degranulación de los neutrófilos suprimirán la expresión general de la integrina β2. Estos inhibidores de la degranulación también se identificarán en nuestro cribado. Por lo tanto, es necesario un cribado secundario con otros controles para confirmar los efectos inhibidores de los resultados. Se hace referencia a las pantallas secundarias como un medio para validar y determinar el mecanismo de acción de los aciertos. Además de repetir las pruebas de mAb24, se evaluará la expresión total de CD18 en la superficie celular utilizando un anticuerpo anti-CD18 pan-humano. El nivel de integrina β2 activada, medido por mAb24, se normalizará por la expresión total de CD18. Esto nos permitirá determinar si el mecanismo de acción del agente implica antagonizar la activación de integrinas y/o inhibir la expresión de CD18 en la superficie celular. También se debe realizar un ensayo de viabilidad en el cribado secundario para excluir cualquier efecto tóxico de los golpes.
Este protocolo tiene limitaciones. En primer lugar, mAb24 es capaz de detectar el dominio β2 tipo I solo en los casos en que la integrina se encuentra en un estado de alta afinidad. Por lo tanto, no puede identificar antagonistas alostéricos similares a α/β I, como el lifitegrast, a través de la disminución de la unión de mAb24. Lifitegrast induce más unión a mAb2432 y muestra un valor de MFI anormalmente aumentado con mAb24 (Figura 4). Para estos valores anormales, es posible que se necesiten otros ensayos para verificar si estos resultados son antagonistas alostéricos similares a los de α/β I, como el lifitegrast. En segundo lugar, el factor Z' para este ensayo no es óptimo y podría mejorarse mediante el uso de pipeteo y agitación automáticos. Desafortunadamente, nuestro laboratorio carece del equipo necesario para probar esta hipótesis. La duplicación o triplicación de los ensayos será útil para identificar falsos positivos y negativos en caso de que el factor Z' no pueda mejorarse aún más con los métodos anteriores. Además, puede ser beneficioso extender el tiempo de incubación para identificar más golpes, como se observó con el conocido inhibidor de la activación de la integrina β2 Nexinhib20, que requiere una hora de incubación para producir efectos inhibidores. Este estudio se centró en la identificación de agentes de acción rápida. Los investigadores deben tener en cuenta que pueden modificar el tiempo de incubación para adaptarlo a sus necesidades específicas.
Hasta donde sabemos, este es el primer método de cribado de alto rendimiento para los antagonistas de las integrinas β2. Este enfoque podría utilizarse para identificar compuestos de moléculas pequeñas que se unen directamente a las integrinas β2 y prevenir los cambios conformacionales que conducen a estados de integrina de afinidad intermedia/alta, similares a los antagonistas sin propiedades "agonísticas" descritos recientemente para las integrinas αIIbβ3 y α4β126. Los neutrófilos son críticos en muchas enfermedades inflamatorias, como la lesión por isquemia-reperfusión miocárdica 36, la sepsis37 y las enfermedades autoinmunes38,39. Los fármacos de moléculas pequeñas pueden ofrecer más flexibilidad en el tratamiento de estas enfermedades en comparación con los fármacos basados en anticuerpos. Los resultados de nuestra pantalla podrían proporcionar tratamientos potenciales para enfermedades inflamatorias.
El método actual es un cribado de alto rendimiento basado en anticuerpos fluorescentes. Dado que los anticuerpos reporteros de activación también están disponibles para β1 40,41,42,43,44, αIIbβ3 45,46 y αL integrinas 47,48,49,50, este método puede extenderse a la identificación de antagonistas para otrasintegrinas. Un anticuerpo conformacionalmente sensible como HUTS-21, que se une al dominio híbrido β1 51,52,53, se ha utilizado en un cribado de alto rendimiento para identificar antagonistas alostéricos muy tardíos del antígeno-4 (VLA-4, integrina α4β1) 54. El presente método de cribado también puede modificarse y ampliarse para encontrar fármacos que inhiban o promuevan la expresión de otros receptores de superficie, como los compuestos que aumentan la expresión superficial del regulador de la conductancia transmembrana de la fibrosis quística (CFTR) en las células de la fibrosis quística (FQ). En la FQ, las mutaciones múltiples conducen a un mal plegamiento de CFTR, lo que resulta en la ausencia de expresión de CFTR en la membrana celular55. Se ha demostrado que los fármacos de moléculas pequeñas restauran la expresión de CFTR56. Para las modificaciones del protocolo, es necesario aumentar el tiempo de incubación de los fármacos a varias horas para permitir que se produzcan cambios en la expresión de las proteínas.
Los autores declaran que no hay intereses financieros contrapuestos.
Agradecemos al Dr. Evan Jellison y a la Sra. Li Zhu del núcleo de citometría de flujo de UConn Health por su ayuda con la citometría de flujo, a la Dra. Lynn Puddington del Departamento de Inmunología de UConn Health por su apoyo a los instrumentos, a la Sra. Slawa Gajewska y al Dr. Paul Appleton del núcleo de investigación clínica de UConn Health por su ayuda en la obtención de muestras de sangre. Agradecemos al Dr. Christopher "Kit" Bonin y a la Dra. Geneva Hargis de la Facultad de Medicina de UConn por su ayuda con la redacción científica y la edición de este manuscrito. Esta investigación contó con el apoyo de subvenciones de los Institutos Nacionales de Salud, el Instituto Nacional del Corazón, los Pulmones y la Sangre (R01HL145454), el Instituto Nacional de Ciencias Médicas Generales (P20GM121176), EE. UU., un Premio al Desarrollo Profesional de la Asociación Americana del Corazón (18CDA34110426) y un fondo inicial de UConn Health. La figura 1 se creó con BioRender.com.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| Pipetas de 16 canales | Thermo | 4661090N | Instrument |
| Placa de 384 pocillos | Greiner | 784201 | Materiales APC |
| anti-humano CD11a/CD18 (LFA-1) Clon de anticuerpos: m24 | BioLegend | 363410 | Reactivos |
| Bravo Plataforma automatizada de manejo de líquidos | Agilent | 16050-102 | 384 manipulador de líquidos multicanal |
| Centrífuga | Eppendorf | Modelo 5810R | Instrumento |
| FlowJo | Becton, Dickinson & Empresa | NA | Software |
| Solución de Albúmina de Suero Humano (25%) | GeminiBio | 800-120 | Reactivos |
| Lifitegrast | Thermofisher | 50-208-2121 | Reactivos |
| Nexinhib20 | Tocris | 6089 | Reactivos |
| N-Formyl-Met-Leu-Phe (fMLP) | Sigma | F3506 | Reactivos |
| Solución de paraformaldehído al 16% | Ciencias de la Microscopía Electrónica | 15710 | Reactivos |
| Cubos de placas | Eppendorf | UL155 | Accesorio |
| Agitador de placas | Fisher | 88-861-023 | Instrument |
| PolymorphPrep | PROGEN | 1895 (1114683 anterior) | Reactivos |
| Placas de compuestos de Prestwick Chemical Library (10 mM) | Prestwick Chemical Libraries | Ver19_384 | 1520 moléculas pequeñas, 98% comercializado medicamentos aprobados (FDA, EMA, JAN y otras agencias aprobados) |
| RPMI 1640 Medio, sin rojo fenol | Reactivos Gibco | 11-835-030 | |
| Rotor de cucharón oscilante | Eppendorf | A-4-62 | Rotor |
| ZE5 Analizador de células | Bio-Rad Laboratories | modelo ZE5 | Instrumento |
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