Le modèle de tumeur sous-cutanée traditionnelle est de moins de idéales pour étudier le cancer colorectal. Des modèles de souris orthotopique de cancer colorectal, qui disposent de plus en plus les cellules cancéreuses à leur emplacement naturel, de reproduire la maladie humaine avec une grande fidélité. Deux techniques peuvent être utilisées pour établir ce modèle. Les deux techniques sont similaires et nécessitent une anesthésie de la souris et la laparotomie pour l'exposition du caecum. Une technique consiste à injection d'une suspension de cellules du cancer colorectal dans le mur caecal. Les cellules cancéreuses sont d'abord mises en culture, récoltés quand subconfluentes et préparée comme une suspension cellulaire unique. Un petit volume de cellules est injecté lentement pour éviter les fuites. L'autre technique consiste à la greffe d'un morceau de tumeur sous-cutanée sur le caecum. Une souris avec une tumeur sous-cutanée préalablement établi colorectal est euthanasié et la tumeur est enlevée en utilisant une technique stérile. La pièce est divisée tumorale en petits morceaux pour la transplantation d'une autre souris. Avant la transplantation, le mur du cæcum est légèrement endommagé afin de faciliter l'infiltration des cellules tumorales. Le temps de développer des tumeurs primaires et des métastases hépatiques varie en fonction de la technique, la lignée cellulaire, et des espèces de souris utilisée. Ce modèle de souris orthotopique est utile pour étudier l'évolution naturelle du cancer colorectal et le test de nouveaux agents thérapeutiques contre le cancer colorectal.