Lorsque l'on étudie les principes physiques qui régissent les systèmes vivants, les approches bottom-up permettent un expérimentateur de contrôler la composition du système et d'autres paramètres qui ne sont pas faciles à manipuler dans les systèmes à base de cellules-1. Pour les procédés membranaires, Giant vésicules unilamellaires (GUVs, diamètre ~ 1-100 um) se sont révélés être un système biomimétique très utile 2-7 comme ils sont bien adaptés pour les études de microscopie et micromanipulation 8-10. Bien qu'il existe de nombreux protocoles différents pour produire GUVs, la plupart tombent dans deux catégories - émulsion à base approches 11,12 et techniques basées sur la réhydratation d'un film lipidique 13-16. Dans les procédés à base d'émulsion, les dépliants interne et externe des membranes GUV sont assemblés de manière séquentielle à partir de monocouches lipidiques aux interfaces eau / huile. Cette approche est idéale pour encapsuler des protéines solubles avecdans les GUVs, et pour former GUVs avec dépliant composition lipidique asymétrique. Cependant, GUVs formés à partir d'émulsions peuvent conserver des traces de solvant qui changent les propriétés mécaniques de la membrane 17, et l'approche ne est pas particulièrement bien adapté à la reconstitution trans-membranaire des protéines.
Modes de réhydratation du film reposent sur le fait que le séchage (déshydratation) provoque de nombreux mélanges de lipides pour former un empilement multi-lamellaire de membranes. Si cette pile est ensuite mise en contact avec un tampon aqueux, les membranes de la pile se déplacent en dehors des flux de solvant entre eux et à la surface de l'empilement, les membranes individuelles peuvent se détacher pour former GUVs 13,18 (ainsi un véritable zoo de d'autres objets lipidiques). Cependant, même pour les compositions de tampons et de lipides optimales, cette méthode classique "de gonflement spontanée" a un rendement relativement faible des GUVs sans défaut. Une méthode largement utilisée pour stimuler le rendement de GUVs sans défaut est "électroformation221 ;, dans laquelle un champ de courant alternatif (AC) est appliquée pendant le film réhydratation. Bien que le mécanisme reste mal comprise, "électroformation" peuvent donner des rendements de GUV spectaculaires (> 90% dans des circonstances favorables) pour faible teneur en sel des tampons de concentration (<5 mM) 14,19, et peut même travailler dans des tampons physiologiques (~ 100 mm) en utilisant une fréquence plus élevée (par rapport à 500 Hz 10 Hz) de champ en courant alternatif et des électrodes en platine 15. Une approche alternative pour augmenter le rendement de GUVs sans défaut est "assisté gel gonflant", dans lequel la solution lipidique est déposé sur un substrat de gel polymère plutôt que le passif (par exemple, le verre, PTFE) substrats utilisés dans "gonflement spontanée classique ». Lorsque le film lipidique / gel résultant est réhydraté, GUVs peuvent former rapidement même pour les tampons physiologiques 16,20.
Toutes ces méthodes peuvent produire GUVs lipidiques seule qui peuvent être utilisés pour étudier la membrane associée phénomènes tels que lainteraction entre les protéines solubles et les membranes. Cependant, à incorporer une protéine trans-membranaire dans GUVs, des modifications importantes sont nécessaires pour garantir que la protéine reste dans un état fonctionnel tout au long de la procédure de reconstitution. Bien que les solutions de lipides dans des solvants organiques (par exemple, le chloroforme, le cyclohexane) sont idéales pour produire des films lipidiques, les protéines transmembranaires sont généralement seulement stable lorsque leur domaine transmembranaire hydrophobe est incorporé dans une bicouche lipidique, ou entouré par une micelle de détergent ( par exemple, lors de la purification des protéines). Ainsi, le matériau de départ pour une reconstitution est typiquement membranes natives, la protéine purifiée dans une solution de détergent ou de petites vésicules contenant des protéines unilamellaires (Proteo-SUV) et / ou des vésicules multilamellaires (protéo-MLV) formés par élimination du détergent dans le présence de lipides. La plupart des méthodes d'intégrer ces protéines membranaires en GUVs se répartissent en trois catégories.
Insertio directn: protéine trans-membranaire en suspension dans le détergent est mélangé avec des lipides, seuls GUVs préformés, légèrement détergentes solubilisées, et le détergent ensuite éliminé en utilisant BioBeads 21. Bien que conceptuellement simple, cette méthode nécessite un contrôle précis de la concentration en détergent, comme une trop forte concentration de détergent puisse dissoudre les GUVs pendant trop faible peut entraîner une concentration de la protéine ou l'agrégat de se dérouler.
GUV / Proteo-SUV Fusion: protéines dans Proteo-VUS est combiné avec, lipides seulement GUVs préformés et la fusion est facilitée avec des peptides fusogènes spéciales 22 ou 21 détergent. Typiquement, la mesure de la fusion est Limited soit GUVs avec une densité faible en protéines.
La déshydratation / réhydratation: un film lipidique contenant des protéines est formée par la déshydratation partielle d'un protéo-SUV (ou protéo-MLV) et GUVs solution est ensuite cultivée comme pour un film lipidique pure. Le défi évident est de protéger la protéine pendant la dehydrati partielleà l'étape 23, mais la méthode a été utilisée avec succès pour reconstituer les protéines transmembranaires telles que bactériorhodopsine, calcium-ATPase, intégrine et VDAC en GUVs 7,23 - 25.
Cet article décrit les protocoles de déshydratation / réhydratation pour faire GUVs contenant le canal potassique voltage-dépendants, KvAP, de la Archaea, Aeropyrum pernix hyper-thermophile. KvAP a un degré élevé d'homologie tension eucaryote dépendants canaux potassiques 26 et une structure cristalline connue 27 , ce qui en fait un bon modèle pour étudier le mécanisme de déclenchement de la tension. La production des Proteo-VUS a été décrite en détail précédemment, et ne fait pas partie de ce tutoriel 26,28,29. Fait important, KvAP Proteo-SUV ne ont pas à être produit pour chaque préparation d'GUV, car ils peuvent être stockés dans de petites aliquotes (par exemple, 10 pi) à -80 ° C pendant des périodes de temps prolongées (> 1 an). Électroformationou gonflement assisté gel peut alors être utilisé pour développer des GUVs KvAP Proteo-VUS (ou proteo-MLV).
Les principales étapes du protocole de électroformation sont illustrés sur la figure 1. Gouttelettes d'une solution de SUV contenant la protéine sont déposées sur des fils de platine (voir figure 2). La déshydratation partielle de la suspension de SUV conduit à la formation d'un film de protéine de lipide par la fusion des SUV. Au cours de la réhydratation, un champ en courant alternatif est appliqué aux électrodes afin d'aider les couches lipidiques pour délaminer et former GUVs. Un champ de 10 Hz fonctionne bien lorsque vous utilisez "pauvre en sel" (<5 mM) tampon de réhydratation 28 et GUVs prennent plusieurs heures à se développer. En revanche, les tampons physiologiques (contenant environ 100 mM de sel) bien travailler avec une tension inférieure, 500 Hz champ AC mais nécessitent un prolongée (~ 12 h) Période de 15 gonflement. Cette méthode est basée sur un protocole antérieur utilisant ITO glisse 24, mais utilise une suite de chambre personnaliséeaining deux fils de platine comme le montre la figure 2 (voir la discussion pour plus de détails de conception et des suggestions pour simple, chambres improvisé).
La figure 3 illustre le procédé de gonflement assisté gel. Le protocole fonctionne bien avec des tampons ayant des concentrations salines physiologiques, est rapide et produit GUVs avec une distribution plus homogène de protéines. Toutefois, le rendement des isolés GUVs, apparemment sans défaut (ce est à dire, la membrane GUV est uniforme à longueur échelles optiques et ne englobe pas tous les objets) est plus faible, mais il fournit un nombre suffisant de patch-clamp et les expériences de micro-manipulation . Cette méthode est basée sur un protocole utilisant un gel d'agarose pour produire GUVs lipidiques seule 16 et nécessite un équipement moins spécialisé que la méthode de électroformation.
La caractérisation de GUVs avec la microscopie de fluorescence est décrite, ainsi que des modes opératoires utilisant un patch-clamp configuration standardmesurer l'activité KvAP dans "inside-out" excisées patches membranaires.
Croissance GUVs contenant des protéines peuvent être plus difficile que GUVs lipidiques seule. En particulier, le rendement en GUV finale peut dépendre sensible sur exactement comment la solution de SUV est déposé et déshydraté pour former l'empilement de membrane. Pour une personne sans expérience antérieure avec GUVs, il peut être utile d'augmenter premier GUVs lipidiques uniquement suivant un protocole classique 15,16 dans lequel le film de la membrane est formée par dépôt de lipides dans un solvant organique. Une fois le protocole classique fonctionne bien, dépôt SUV et déshydratation partielle peuvent être maîtrisés à l'aide VUS lipidiques seule, qui sont également très utile lors du réglage du protocole pour une nouvelle composition lipidique. Lorsque GUVs poussent fiable de VUS de lipides seulement, il ne est alors qu'une petite étape pour produire GUVs contenant des protéines de Proteo-VUS.