Générant des Homo - et xénogreffe entre la pastèque et la gourde pour l’étude des microARN froid-sensible

Lingping Wang; Xinyi Wu; Guojing Li; Xiaohua Wu; Dehui Qin; Ye Tao; Pei Xu

doi:10.3791/58242

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Article de méthode

Générant des Homo - et xénogreffe entre la pastèque et la gourde pour l’étude des microARN froid-sensible

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DOI :

10.3791/58242

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20 novembre 2018

Lingping Wang^*¹ , Xinyi Wu^*¹ , Guojing Li¹^,² , Xiaohua Wu¹ , Dehui Qin³ , Ye Tao⁴ , Pei Xu¹^,²

¹Institute of Vegetables, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, ²State Key Lab Breeding Base for Sustainable Control of Plant Pest and Disease, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, ³Institute of Horticulture, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, ⁴Shanghai Biozeron Biotechnology Co., Ltd

^* These authors contributed equally

Dans cet article

Résumé

Nous présentons ici un protocole détaillé pour faire efficacement des homo - et xénogreffe entre pastèque et gourde, en plus des méthodes de prélèvement d’échantillons de tissus, la génération de données et l’analyse des données, pour l’étude des microARN froid-sensible.

Résumé

MicroARN (miARN) est endogènes petit non-codantes ARN d’environ 20-24 nt, connus pour jouer un rôle important dans le développement de la plante et l’adaptation. Il y a une accumulation preuve montrant que les expressions de certains miARN sont modifiées lorsque la greffe, une pratique agricole couramment utilisée par les agriculteurs pour améliorer la tolérance des cultures aux stress biotiques et abiotiques. La gourde est une culture intrinsèquement résilience climatique par rapport aux nombreux autres cucurbitacées majeures, y compris le melon d’eau, rendant l’un des porte-greffes plus largement utilisés pour le second. La promotion récente de technologies de séquençage haut-débit a fourni de grandes possibilités d’enquêter sur les miARN froid-sensible et leurs contributions aux avantages hétérogreffe ; Pourtant, les procédures expérimentales adéquates sont une condition préalable à cet effet. Nous présentons ici un protocole détaillé pour générer efficacement des homo - et xénogreffe entre le melon d’eau froide-sensibles et la gourde résistant au froid, en plus des méthodes de prélèvement d’échantillons de tissus, la génération de données et l’analyse des données. Les méthodes présentées sont également utiles pour d’autres systèmes de plantes-greffe, d’interroger miRNA règlements sous différentes contraintes environnementales, comme la chaleur, la sécheresse et la salinité.

Introduction

Greffage a longtemps été employé comme une technique agricole pour améliorer la production agricole et la tolérance aux stress biotiques et abiotiques¹^,²^,³. Dans les systèmes heterografting, porte-greffes élites peuvent améliorer l’absorption de l’eau et les nutriments des plantes, renforcer la résistance aux agents pathogènes du sol et limiter les effets négatifs de la toxicité des métaux⁴^,⁵, qui peuvent conférer les greffons un patrimoine vigueur de la croissance et une tolérance accrue aux stress environnementaux. ....