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Article de méthode

Imagerie 3D haute résolution de l'infection par le virus de la rage dans un tissu cérébral éclairci par solvant

10.8K vues

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DOI :

10.3791/59402

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30 avril 2019

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Dans cet article

Résumé

Les nouvelles techniques de compensation des tissus immunostaining-compatibles comme l'imagerie 3D ultime des organes éclaircis par solvant permettent la visualisation 3D de l'infection cérébrale du virus de la rage et de son environnement cellulaire complexe. D'épaisses tranches de tissu cérébral étiquetées par anticorps sont rendues optiquement transparentes afin d'augmenter la profondeur d'imagerie et de permettre l'analyse 3D par microscopie de balayage laser confocal.

Résumé

La visualisation des processus d'infection dans les tissus et les organes par immunolabeling est une méthode clé dans la biologie moderne d'infection. La capacité d'observer et d'étudier la distribution, le tropisme et l'abondance des agents pathogènes à l'intérieur des tissus d'organes fournit des données cruciales sur le développement et la progression de la maladie. À l'aide de méthodes de microscopie conventionnelles, l'immunolabeling est principalement limité aux sections minces obtenues à partir d'échantillons incrustés de paraffine ou congelés. Cependant, le plan d'image 2D limité de ces sections minces peut mener à la perte de l'information cruciale sur la structure complexe d'un organe infecté et le contexte cellulaire de l'infection. Les techniques modernes de compensation des tissus multicolores et immunostaining-compatibles offrent maintenant un moyen relativement rapide et peu coûteux d'étudier des piles d'images 3D à fort volume de tissus d'organes infectés par le virus. En exposant le tissu à des solvants organiques, il devient optiquement transparent. Cela correspond aux indices de réfraction de l'échantillon et conduit finalement à une réduction significative de la diffusion de la lumière. Ainsi, en combinaison avec de longs objectifs de distance de travail libre, de grandes sections de tissu jusqu'à 1 mm de taille peuvent être imaged par microscopie de balayage laser confocal e conthique conventionnelle (CLSM) à haute résolution. Ici, nous décrivons un protocole pour appliquer l'imagerie de tissu profond après dégagement de tissu pour visualiser la distribution de virus de rage dans les cerveaux infectés afin d'étudier des sujets comme la pathogénie de virus, la propagation, le tropisme, et la neuroinvasion.

Introduction

Les techniques d'histologie conventionnelles reposent principalement sur de fines sections de tissus d'organes, qui peuvent intrinsèquement fournir seulement des aperçus 2D dans un environnement 3D complexe. Bien que faisable en principe, la reconstruction 3D à partir de sections minces en série nécessite des pipelines techniques exigeants à la fois pour le découpage et l'alignement silico suivant des images acquises1. En outre, la reconstruction transparente des z-volumes après le découpage de microtome est critique car les artefacts mécaniques et computationnels peuvent rester en raison de l'enregistrement d'image sous-optimal causé par des p....

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Protocole

Le matériel cérébral archivé RABV-infecté et PFA-fixe a été employé. Les études expérimentales animales respectives ont été évaluées par le comité responsable de soins, d'utilisation et d'éthique des animaux du Bureau d'État de l'agriculture, de la sécurité alimentaire et de la pêche en Mecklembourg-Poméranie occidentale (LALFF M-V) et ont obtenu l'approbation avec les autorisations 7221.3-2.1-002/11 (souris) et 7221.3-1-068/16 (ferrets). Les soins généraux et les méthodes utilisées dans les expériences sur les animaux ont été effectués conformément aux lignes directrices approuvées.

CAUTION: Ce protocole utilise diverses substances toxique....

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Résultats

La combinaison de l'iDISCO14 et de l'uDISCO13 couplée à la Haute résolution CLSM fournit des aperçus profonds dans la résolution spatiotemporale et la plasticité de l'infection DE RABV du tissu cérébral et le contexte cellulaire environnant.

En utilisant l'immunostaining de la phosphoprotéine RABV (P), des couches complexes de cellules neuronales infectées peuvent être visualisées dans des sections épaisses du cerveau de souris (

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Discussion

La résurgence et le développement ultérieur des techniques de défrichement des tissus au cours des dernières années2,3,4,5,6,7,8, 9 (en) , 10 Ans et plus , 11 Ans, états-unis ( ,

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n'ont rien à révéler.

Remerciements

Les auteurs remercient Thomas C. Mettenleiter et Verena te Kamp d'avoir lu le manuscrit de façon critique. Ce travail a été soutenu par l'Initiative fédérale d'excellence de Mecklembourg Poméranie occidentale et le Fonds social européen (FSE) Grant KoInfekt (ESF/14-BM-A55-0002/16) et une subvention de recherche collaborative intra-muros sur les Lyssavirus à la Friedrich-Loeffler-Institut (Ri-0372).

....

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
s forts
Alcool benzyliqueAlfa Aesar41218Réactif nettoyant
Benzoate de benzyleSigma-AldrichBB6630-500MLRéactif nettoyant
DiméthylsulfoxydeCarl Roth4720.2Tampons divers Éther
diphényliqueSigma-Aldrich240834-100GRéactif d’élimination
DL-&alpha ;-TocophérolAlfa AesarA17039Sérum d’âne antioxydant
Bio-RadC06SBZRéactif bloquant
GlycineCarl Roth3908.2Réduction de fond
Sérum de chèvreMerckS26-100MLRéactif bloquant
Héparine sel sodiqueCarl Roth7692.1Contexte réduction
Solution de peroxyde d’hydrogène (30 %)Carl Roth8070.2Blanchiment des échantillons
MéthanolCarl Roth4627.4Prétraitement
des échantillons ParaformaldéhydeCarl Roth0335.3Poudre cristalline pour faire une solution fixatrice
Azoture de sodiumCarl RothK305.1Prévention de la croissance microbienne dans les solutions mères
tert-butanolAlfa Aesar33278Déshydratation d’échantillons pour l’élimination des tissus
TO-PRO-3Thermo FisherT3605Coloration aux acides nucléiques
Triton X-100Carl Roth3051.2Détergent
Tween 20AppliChemA4974,0500Détergent
Divers
5 mL réaction tubesEppendorf0030119401Tubes d’échantillons
Lamelle, circulaire (diamètre : 22 mm)Marienfeld0111620Partie de la chambre d’imagerie
Lamelle, circulaire (diamètre : 30 mm)Marienfeld0111700Partie de la chambre d’imagerie
Aiguille hypodermique (27 G x ¾ ; ” [0,40 mm x 20 mm])B. Braun4657705Remplissage de la chambre d’imagerie avec une solution éclaircissante
Caoutchouc de silicone RTV-1WackerElastosil E43Adhésif pour l’assemblage de la chambre d’imagerie
Ultimaker CPE 2,85 mm transparentUltimaker8718836374869Filament copolyester pour imprimante 3D pour l’impression de pièces de la chambre d’imagerie
Équipement technique et logiciel
Imprimante 3DUltimakerUltimaker 2+Impression de la chambre d’imagerie
Système automatisé d’immersion dans l’eauLeica15640019Pompe à eau contrôlée par logiciel
Agitateur orbital de paillasseElmiDOS-20MIncubation d’échantillons à température ambiante (~ 150 tr/min)
Agitateur orbital de paillasse, chaufféNew Brunswick ScientificG24 Environmental ShakerÉchantillon d’incubation à 37 ° ; C (~ 150 tr/min)
Microscope confocal à balayage laserLeicaDMI 6000 TCS SP5Microscope confocal inversé pour l’imagerie d’échantillons
FijiNIH (ImageJ)Logiciel open source (v1.52h)Package de traitement d’images basé sur ImageJ
Objectif à immersion dans l’eau à longue distance de travailLeica15506360HC PL APO 40x/1.10 W motCORR CS2
VibratomeLeicaVT1200SProcesseur
DellPrecision 7920: Intel Xeon Gold 5118
GPU : Nvidia Quadro P5000
RAM : 128 Go 2666 MHz DDR4
SSD : 2 To
strong>Anticorps primaires
Goat anti-RABV NFriedrich-Loeffler-InstitutSérum polyclonal monospécifique de chèvre anti-RABV N, généré par immunisation de chèvre avec la nucléoprotéine N
de RABV exprimée par baculovirus et purifiée par His-tag Dilution : 1:400
Anticorps polyclonal anti-GFAP de lapinDakoZ0334(RRID :AB_10013382)
Dilution : 1:100
Anticorps polyclonal de lapinAbcamab32454(RRID :AB_776174)
Dilution : 1:250
Vaccin anti-RABV de lapin P 160-5Friedrich-Loeffler-InstitutSérum polyclonal monospécifique de lapin anti-RABV P, généré par immunisation de lapin avec la phosphoprotéine P RABV exprimée par le baculovirus et purifiée par His-tag (voir référence 23 : Orbanz et al., 2010)
Dilution : 1:1 000
Anticorps secondaires
âne anti-chèvreIgG Thermo Fisher Scientificselon conjugué fluorophoreHautement absorbé par < croisé> Dilution : 1:500
IgG anti-souris d’âneThermo Fisher Scientificselon fluorophore conjuguéHautement absorbé par
Dilution : 1:500
IgG anti-lapin d’âne ThermoFisher Scientificselon fluorophore conjuguéHautement absorbé
Dilution : 1:500
IgG anti-souris de chèvreThermo Fisher Scientifiqueselon fluorophore conjuguéHautement absorbé croisé
Dilution : 1:500
IgG anti-lapin de chèvreThermo Fisher Scientificdépendant du fluorophore conjuguéHautement absorbé croisé
Dilution : 1:500
<

Références

  1. Pichat, J., Iglesias, J. E., Yousry, T., Ourselin, S., Modat, M. A Survey of Methods for 3D Histology Reconstruction. Medical Image Analysis. 46, 73-105 (2018).
  2. Chung, K., et al. Structural and molecular interrogation of intact biological systems. Nature. 497

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Réimpressions et autorisations

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