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Research Article
Francesca Boscolo Sesillo1,2,3, Alessandra Sacco2
1Graduate School of Biomedical Sciences,Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute, 2Development, Aging and Regeneration Program,Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute, 3Department of Obstetrics, Gynecology, and Reproductive Sciences, Division of Female Pelvic Medicine and Reconstructive Surgery,University California San Diego
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Ce protocole décrit une méthode reproductible pour l'isolement des cellules primaires de rhabdomyosarcoma de souris, de la formation et du traitement de la tumorsphere, et de la transplantation d'allogreffe commençant des cultures de tumorspheres.
Le rhabdomyosarcome (RMS) est le sarcome des tissus mous le plus courant chez les enfants. Bien que des efforts significatifs aient permis l'identification des mutations communes associées au RMS et aient permis la discrimination de différents sous-types de RMS, des défis majeurs existent toujours pour le développement de nouveaux traitements pour améliorer davantage le pronostic. Bien qu'identifié par l'expression des marqueurs myogéniques, il y a encore une controverse significative quant à savoir si RMS a des origines myogéniques ou non myogéniques, car la cellule d'origine est encore mal comprise. Dans la présente étude, une méthode fiable est fournie pour l'analyse de la tumorsphere pour la souris RMS. L'analyse est basée sur les propriétés fonctionnelles des cellules tumorales et permet l'identification de populations rares dans la tumeur avec des fonctions tumorigènes. On décrit également des procédures pour tester des protéines recombinantes, intégrant des protocoles de transfection avec l'essai de la tumorsphere, et évaluant des gènes candidats impliqués dans le développement et la croissance de tumeur. Décrit en outre est une procédure pour la transplantation allogreffe de tumorspheres dans les souris destinataires pour valider la fonction tumorigenic in vivo. Dans l'ensemble, la méthode décrite permet l'identification et l'essai fiables des populations tumorigenic rares de RMS qui peuvent être appliquées au RMS surgissant dans différents contextes. Enfin, le protocole peut être utilisé comme une plate-forme pour le dépistage des médicaments et le développement futur de la thérapeutique.
Le cancer est une maladie hétérogène; en outre, le même type de tumeur peut présenter différentes mutations génétiques dans différents patients, et dans un patient une tumeur est composée par des populations multiples des cellules1. L'hétérogénéité présente un défi dans l'identification des cellules responsables de l'initiation et de la propagation du cancer, mais leur caractérisation est essentielle au développement de traitements efficaces. La notion des cellules de propagation de tumeur (TPC), une population rare de cellules qui contribuent au développement de tumeur, a été précédemment examiné intensivement2. Malgré le fait que les TPC ont été caractérisés dans plusieurs types de cancer, l'identification des marqueurs pour leur isolement fiable demeure un défi pour plusieurs types de tumeur3,4,5,6 , 7 Annonces , 8 Annonces , 9 . Ainsi, une méthode qui ne repose pas sur des marqueurs moléculaires, mais plutôt sur des propriétés fonctionnelles du PTC(renouvellement élevé et capacité de croître dans des conditions de faible attachement), connue sous le nom d'analyse de formation de la tumorsphere, peut être largement appliquée pour le l'identification des TPC de la plupart des tumeurs. Fait important, cet analyse peut également être utilisé pour l'expansion des TPC et donc directement appliqué au dépistage des médicaments contre le cancer et des études sur la résistance au cancer1,10.
Le rhabdomyosarcome (RMS) est une forme rare de sarcome des tissus mous le plus fréquent chez les jeunes enfants11. Althoug RMS peut être histologiquement identifié par l'évaluation de l'expression des marqueurs myogéniques, la cellule d'origine de RMS n'a pas été unvocally caractérisée en raison des sous-types multiples de tumeur et de l'hétérogénéité élevée des stimulus développementals de tumeur. En effet, des études récentes ont suscité une discussion scientifique importante sur la question de savoir si le RMS est d'origine myogène ou non myogénique, suggérant que le RMS peut provenir de différents types de cellules selon le contexte12,13, 14 (en) , 15 Annonces , 16 Annonces , 17. De nombreuses études sur les lignées cellulaires rmS ont été réalisées en utilisant l'exemple de formation de la tumorsphère pour l'identification des voies impliquées dans le développement tumoral et la caractérisation des marqueurs associés à des populations fortement auto-renouveau 18 ans, états-unis qui , 19 ans, états-unis qui , 20 Ans, états-unis , 21.
Cependant, en dépit du potentiel d'analyse de formation de tumorsphere pour identifier des cellules de RMS d'origine, une méthode fiable qui peut être employée sur les cellules primaires de RMS n'a pas encore été décrite. Dans ce contexte, une étude récente de notre groupe a utilisé un test optimisé de formation de tumorsphere pour l'identification des cellules rmS d'origine dans un modèle de souris de dystrophie musculaire de Duchenne (DMD)22. Plusieurs types de cellules prétumorigènes, isolés des tissus musculaires, sont testés pour leur capacité à se développer dans des conditions de faible attachement, permettant l'identification des cellules souches musculaires comme cellules d'origine pour RMS dans des contextes dystrophiques. Décrit ici est un protocole reproductible et fiable pour l'analyse de formation de la tumorsphère (Figure 1), qui a été utilisé avec succès pour l'identification des populations cellulaires extrêmement rares qui sont responsables du développement de la souris RMS.
Le logement, le traitement et le sacrifice des souris ont été effectués selon le protocole approuvé de l'IACUC du Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute.
1. Préparation de réactif
2. Isolement et culture cellulaires
3. Dérivation de la tumorsphere
4. Traitement de la tumorsphere avec des protéines recombinantes
5. Traitement de la tumorsphere avec plasmides surexpression
6. Préparation de la tumorsphere pour la transplantation d'allogreffe
Détection des tumorspheres
L'isolement cellulaire a été optimisé pour obtenir l'hétérogénéité maximale des populations cellulaires présentes dans le tissu tumoral. Tout d'abord, puisque les tissus isolés présentaient des zones morphologiquement différentes, afin d'améliorer les chances d'isoler des populations de cellules rares uniformes, l'échantillonnage a été effectué à partir de plusieurs zones de la tumeur(figure 1A, premier panneau sur la gauche). Deuxièmement, la dissociation mécanique des échantillons récoltés a été effectuée tout en maintenant l'homogénéité dans la taille du tissu haché, malgré différentes résistances qui auraient pu être présentes dans les échantillons (figure 1A, troisième et quatrième panneau de la gauche ). Selon le matériau de départ (agressivité tumorale, âge et génotype de la souris, emplacement tumoral), la récupération des cellules du stress mécanique du processus d'isolement peut varier, allant de 3-7 jours(figure 1A, dernier panneau sur la droite). Pour améliorer la survie et la croissance cellulaires, les médias doivent être modifiés le lendemain de l'isolement, puis tous les 2 jours. Cela permettra d'éliminer les débris et les cellules mortes accumulées au cours du processus d'isolement qui pourraient affecter la viabilité cellulaire. L'évaluation de la formation de la tumorsphère devrait commencer après que les cellules ont été passées au moins une fois pour assurer une viabilité optimale lorsqu'elles sont placées dans des cultures de suspension(figure 1B, premier panneau à gauche). Dans nos mains, des résultats optimaux ont été obtenus à partir de cellules du passage 2 (P2)(figure 1C, premier et deuxième panneau sur la gauche). Ce passage spécifique a été choisi après plusieurs tests. Quand les cellules de P0 ont été plaquées dans des conditions de bas-attachement, elles ont formé un petit nombre de tumorspheres comparés aux passages postérieurs, probablement dû aux débris cellulaires toujours présents après isolement. Dans les passages postérieurs, différents modèles de formation de tumorsphere ont été observés et attribués à la sélection qui se produit après de nombreux passages dans la culture. Lorsque différentes lignées cellulaires sont comparées, il est suggéré de commencer à partir du même passage.
La discrimination entre les tumorspheres et les amas cellulaires est d'une importance fondamentale pour la quantification de l'analyse. Figure 1C (les deux derniers panneaux à droite) montre clairement les différences morphologiques entre une tumeursphere (à gauche) et un amas cellulaire (à droite). Les tumorspheres dérivent d'une seule cellule qui a une capacité élevée de se renouveler et de se développer dans des conditions de faible attachement (les deux caractéristiques des TPC). En effet, le développement de la tumorsphere indique le potentiel de tumorigenicity. Cependant, cet exemple est effectué in vitro indépendamment des indices dérivés de l'organisme tout entier; ainsi, pour valider le potentiel tumorigène des cellules in vivo,des expériences de transplantation d'allogreffes devraient être effectuées (Figure 1D).
Validation du traitement des protéines recombinantes
Avant de mettre en place le traitement tumorspheres, la concentration optimale à laquelle la protéine d'intérêt déclenche un effet sur les cellules tumorales doit être déterminée. Pour ce faire, il est nécessaire d'évaluer le niveau d'expression des gènes cibles en aval de la protéine (figure 2). Une recherche de littérature sur PubMed a été effectuée avant de déterminer les gènes cibles à tester par qRT-PCR. Dans le cas où la protéine d'intérêt a été montrée pour moduler différentes voies en aval, la sélection de plusieurs gènes associés à chacune de ces voies devrait être exécutée. Par exemple, Flt3l (Fms-like tyrosine kinase 3) a été montré pour moduler la signalisation STAT5 dans la leucémie myéloïde aigue, induisant l'expression en aval de p21, c-Myc, et CyclinD1 (figure 2)27. En outre, l'expression de Flt3l est nécessaire pour la différenciation des cellules dendritiques de médiation de l'activation de stat3 voie de signalisation28. Pour évaluer l'activité de STAT3, l'expression Socs3 et CyclinD1 a été vérifiée (figure 2). L'analyse des résultats a montré un effet dépendant de la dose du traitement de protéine recombinante sur certains des gènes examinés (p21, CyclinD1, et Socs3), alors que d'autres n'ont pas été affectés (c-Myc). Il est important de déterminer les gènes en aval sensibles à la protéine d'intérêt dans la tumeur spécifique testée pour une évaluation fiable de l'efficacité du traitement.
Optimisation du protocole de transfection plasmide
Pour établir un protocole efficace pour la transfection plasmide et d'autres essais de formation de la tumorsphere, les effets de la transfection sur les cellules tumorales adhérentes ont été testés (Figure 3A). Le traitement de réactif de transfection a été exécuté suivant le protocole du fabricant, et deux quantités différentes du réactif ont été examinées. L'efficacité a été évaluée à l'utilisation d'un plasmide de journaliste de GFP. Dans nos mains, nous avons observé une efficacité de transfection plus élevée en utilisant des quantités plus faibles du réactif (Figure 3A). En effet, des concentrations plus élevées conduisent à une augmentation de la mort cellulaire, à partir de 48 h et de venant plus évidente après 72 h à partir du moment de la transfection. Le même protocole de transfection n'était pas efficace dans les cellules en suspension, car l'accumulation des cellules mortes et des débris cellulaires est devenue évidente 24 h après le début du traitement, indiquant la viabilité cellulaire diminuée. Pour surmonter ce défi technique, un protocole en deux étapes a été utilisé : effectuer la transfection sur les cellules adhérentes, les détacher 24 h après le traitement, et les suspendre pendant 7 jours de plus. Les tumorosphères témoins exprimaient en effet le GPF à la fin de l'expérience (Figure 3B).

Figure 1 : Isolement de cellules de tumeur, dérivation de tumorsphere, et transplantation. (A) Représentation schématique de la section 2 du protocole (isolement des cellules tumorales). Chaque étape clé du protocole est résumée. (B) Représentation schématique de la section 3 du protocole (dérivation des tumorspheres). Chaque étape clé du protocole est résumée. (C) De gauche à gauche : image en champ lumineux de cellules tumorales isolées au passage 2 (P2) à faible grossissement (barre d'échelle de 50 m) et grossissement élevé (barre d'échelle de 50 m); image de champ lumineux d'une tumeursphere dérivée des cellules de tumeur après 30 jours dans la culture de suspension (barre d'échelle ' 250 'm), et image lumineuse de champ d'un groupe de cellules formé à partir des cellules de tumeur après 30 jours dans la culture de suspension (barre d'échelle ' 50 'm). (D) Représentation schématique de la section 6 du protocole (transplantation d'allogreffe de la tumorsphère). Chaque étape clé du protocole est résumée. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 2 : Validation des gènes cibles en aval pour déterminer la concentration de protéines recombinantes. résultats qRT-PCR pour l'évaluation de la concentration de traitement de Flt3l. ANOVA bidirectionnel a été exécuté. L'importance est montrée pour la comparaison avec le contrôle non traité. (p 'lt; 0.05; 'p 'lt; 0.01; 'p 'lt; 0.001; n '3). Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 3 : Mise en place du protocole de transfection des tumorspheres. (A) Images représentatives du champ lumineux et fluorescentes des cellules tumorales traitées avec une faible (en haut) ou une concentration élevée (en bas) de réactif de transfection (0,75 l ou 1,5 l dans 24 plaques de puits) (barre d'échelle de 50 m). (B) Image représentative des tumorspheres formées à partir de cellules traitées au plasmide GFP, 7 jours après le placage des cellules en suspension (barre d'échelle de 50 m). Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
Les auteurs n'ont rien à révéler.
Ce protocole décrit une méthode reproductible pour l'isolement des cellules primaires de rhabdomyosarcoma de souris, de la formation et du traitement de la tumorsphere, et de la transplantation d'allogreffe commençant des cultures de tumorspheres.
Ce travail a été soutenu par la subvention ag-NS-0843-11 de la Ellison Medical Foundation et par la subvention pilote des NIH au sein de la subvention de soutien du Centre de cancérologie de l'INC P30CA030199 à A.S.
| Réactif de dissociation cellulaire Accutase | Gibco | A1110501 | Détacher les cellules adhérentes et dissocier les sphères tumorales |
| Celigo | Nexcelom | Celigo | Cytomètre d’image sur plaque pour cellules adhérentes et en suspension |
| Colgénase, Type II | Life Technologies | 17101015 | Enzyme de digestion tissulaire |
| Dispase II, protéase | Life Technologies | 17105041 | Enzyme de digestion tissulaire |
| DMEM Milieu à haute teneur en glucose | Gibco | 11965092 | Composant des cellules tumorales Milieu |
| DMEM/F12 | Gibco | 11320033 | Composant du milieu tumosphérique |
| EDTA | ThermoFisher | S312500 | Composant du tampon FACS |
| Protéine de souris recombinante EGF | Gibco | PMG8041 | Composant du milieu |
| tumosphériqueFACSAria II Cytométrie en flux | BD Biosciences | 650033 | Trieur de cellules activées par fluorescence |
| Sérum de veau fœtal | Omega Scientific | FB-11 | Composant des cellules tumorales media |
| Agent anesthésique Fluriso (Isofluornae) | MWI Vet Supply | 502017 | Réactif anesthésique pour animaux |
| FxCycle Violet Stain | Life Technologies | F10347 | Discriminer les cellules vivantes et mortes |
| Goat Serum | Life Technologies | 16210072 | Composant du tampon FACS |
| Ham F10 Media | Life Technologies | 11550043 | Composant du tampon FACS |
| Horse Serum | Life Technologies | 16050114 | Composant du milieu d’isolement cellulaire |
| Réactif de transfection Lipofectamine 3000 | Réactif | ||
| de transfection ThermoFisher L3000015Matrigel membrane matrice | Corning | CB40234 | Fournit un soutien aux cellules |
| contaminées N-2 Supplemtns (100X) | Gibco | 17502048 | Composant du milieu tumosphérique |
| Néomycine-Polymyxine B Sulfates-Bacitracine Zinc Zinc Pommade ophtalmique | MWI Vet Supply | 701008 | Pommade oculaire |
| PBS | Gibco | 10010023 | Composant du tampon FACS et utilisé pour le lavage des cellules |
| pEGFP-C1 | Addgene | 6084-1 | GFP plasmide |
| Pénicilline - Streptomyocine | Life Technologies | 15140163 | Composant de la tumosphère et des cellules tumorales média |
| Recombinant Humain &beta ; FGF-basic | Peprotech | 10018B | Composant du milieu tumosphérique |
| Souris recombinante Flt-3 Ligand Protein | R& D Systems | 427-FL-005 | Protéine recombinante |
| Trypan blue | ThermoFisher | 15250061 | Discriminer les cellules vivantes et mortes |