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Article de méthode

Surveillance des interactions GPCR-MD-arrestin1/2 dans les systèmes de vie en temps réel pour accélérer la découverte de médicaments

6.3K vues

DOI :

10.3791/59994

28 juin 2019

Dans cet article

Résumé

Les interactions GPCR-MD-arrestin sont un domaine émergent dans la découverte de médicaments par gpCR. Des méthodes précises, précises et faciles à mettre en place sont nécessaires pour surveiller de telles interactions dans les systèmes vivants. Nous montrons un test de complémentarité structurelle pour surveiller les interactions GPCR-MD-arrestin dans les cellules vivantes en temps réel, et il peut être étendu à n'importe quel GPCR.

Résumé

Les interactions entre les récepteurs couplés à la protéine G (GpCR) et les arrestins sont des processus vitaux ayant des implications physiologiques de grande importance. À l'heure actuelle, la caractérisation de nouveaux médicaments en vue de leurs interactions avec les arrestins et autres protéines cytosoliques est extrêmement précieuse dans le domaine de la découverte de médicaments par GPCR, en particulier lors de l'étude de l'agonisme biaisé du GPCR. Ici, nous montrons l'application d'un nouveau test de complémentarité structurelle pour surveiller avec précision les interactions récepteur-arrestin dans les systèmes vivants en temps réel. Cette méthode est simple, précise et peut être facilement étendue à n'importe quel GPCR d'intérêt et a également l'avantage qu'elle surmonte les interactions non spécifiques en raison de la présence d'un promoteur de faible expression présent dans chaque système vectoriel. Cet analyse de complémentarité structurelle fournit des caractéristiques clés qui permettent une surveillance précise et précise des interactions récepteur-arrestin, ce qui le rend approprié dans l'étude de l'agonisme biaisé de tout système GPCR ainsi que GPCR c-terminus 'phosphorylation codes écrits par différents GPCR-kinases (GRKs) et des modifications post-traductionnelle des arrestins qui stabilisent ou déstabilisent le complexe récepteur---arrestin.

Introduction

Les GPCR représentent la cible de près de 35 % des médicaments actuels sur le marché1,2 et une compréhension claire de leur pharmacologie est cruciale dans le développement de nouveaux médicaments thérapeutiques3. L'un des aspects clés de la découverte de médicaments par le GPCR, en particulier pendant le développement d'agonistes biaisés, est la caractérisation de nouveaux ligands vers les interactions récepteur-arrestin4 et les interactions de l'arrestine avec d'autres protéines cytosoliques telles que comme clathrine5.

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Protocole

1. Stratégie de conception d'apprêt

  1. Concevoir des amorces pour introduire des gènes d'intérêt dans pBiT1.1-C [TK/LgBiT], pBiT2.1-C [TK/SmBiT], pBiT1.1-N [TK/LgBiT] et pBiT2.1-N [TK/SmBiT] Vectors.
  2. Sélectionnez au moins l'un de ces trois sites comme l'une des deux enzymes de restriction uniques nécessaires au clonage directionnel en raison de la présence d'un codon d'arrêt dans le cadre qui divise le site multicloing comme le montre la figure 111.
  3. Incorporez la séquence de nucléotide dans les amorces, comme le montre le tableau 1, pour coder les résidus de liaison indiq....

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Résultats

Utilisant la procédure présentée ici, les interactions entre un GPCR prototypique et deux isoformes de '-arrestin ont été surveillées. Des constructions de récepteurs de peptides (GLP-1r) ont été faites à l'aide d'amorces contenant des sites de restriction d'enzymes NheI et EcoRI et clonées dans les vecteurs pBiT1.1-C [TK/LgBiT] et pBiT2.1-C [TK/SmBiT] alors que dans le cas de l'arrêt ins, deux vecteurs supplémentaires ont été pBiT1.1-N [TK/LgBiT] et pBiT2.1-N [TK/SmBiT] utilisant les sites de restriction enzymatiques Bg.......

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Discussion

En utilisant la méthode présentée ici, les interactions entre n'importe quel GPCR et '-arrestin1'2 peuvent être surveillées dans des systèmes de vie en temps réel en utilisant cet analyse de complémentation structurale GPCR---arrestin. À cet égard, nous avons pu observer un recrutement différentiel entre les deux isoformes de l'arrêt-arrêt par le GLP-1r (UN GPCR prototypique de classe B), nous avons également observé une dissociation du complexe récepteur--arrestin quelques minutes après avoir atteint le maximum signal l.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs ne déclarent aucun intérêt concurrent.

Remerciements

Ces travaux ont été soutenus par des subventions du Programme de recherche (NRF- 2015M3A9E7029172) de la National Research Foundation of Korea (NRF) financée par le Ministère des sciences, des TIC et de la Planification future.

....

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Antibiotiques pénicilline streptomycineWelgeneLS202-02Pénicilline/Streptomycine
Incubateur bactérienJEIO TechIB-05G(Air-Jacket),
Base Milieu de culture cellulaireWelgeneLM 001-05DMEM Milieu de culture cellulaire
Milieu de transfection de culture cellulaireGibco31985-070Milieu
Incubateur CO2NUAIRE NU5720Incubateur CO2 à chaleur directe
Bain d’eau numériqueLab TechLWB-122DBain d’eau numérique tech de laboratoire
ADN Lecture d’épreuve de polyméraseELPIS BiotechEBT-1011polymérase
CosmogenetechCMP0112miniprepLaboPass Kit de purification Mini
ADN Taq PolyméraseEnzynomicsP750nTaq ADN polymérase
Restriction enzymatique BglIINew England BiolabsR0144LBglII
Tampon de restriction enzymatiqueNew England BiolabsB72045CutSmart 10X
Restriction enzymatique EcoRINew England BiolabsR3101LEcoRI-HF
Restriction enzymatique NheINew England BiolabsR01315NheI
Restriction enzymatique XhoINew England BiolabsR0146LXhoI
Sérum de veau fœtalGibco Canada12483020Gel de sérum de bovin fœtal
/PCR DNA MiniKitReal Biotech CorporationKH23108HiYield Gel/PCR DNA MiniKit
Ligase ELPISBiotechEBT-1025T4 DNA Ligase
Microscope optiqueOlympusCKX53SFCKX53 Microscope Olympus
réactif de transfection lipidiqueInvitrogen11668-019Lipofectamine 2000
LuminomètreBiotek/Fisher Scientific12504386Synergy 2 Lecteurs de microplaques multimodes
Système NanoBiTPromegaN2014NanoBiT PPI MCS Système de démarrage
Substrat nanoluciférase PromegaN2012Nano-Glo Système de dosage de cellules vivantes
PCR ThermocycleurEppendorf6336000015Master cycler Nexus SX1
Poly-L-lysineSigma AldrichP4707-50MLSolution de poly-L-lysine
Trypsin EDTAGibco25200-056Trysin EDTA 10X
Culture de globules blancs 96 plaques de puitsCorning3917Plaque de dosage 96 plaques de puits
de culture cellulaire Optimem 1X PfU Kit de purification d’ADN

Références

  1. Sriram, K., Insel, P. A. GPCRs as targets for approved drugs: How many targets and how many drugs? Molecular Pharmacology. 93 (4), 251-258 (2018).
  2. Hauser, A. S., Attwood, M. M., Rask-Andersen, M., Schiöth, H. B., Gloriam, D. E. Trends in GPCR ....

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Réimpressions et autorisations

Mots-clés

Interactions GPCR b ta arrestineessai de compl mentation structurelled couverte de m dicaments ciblant les GPCRtude de l agonisme biaisisoformes de la b ta arrestineprotocole de construction de plasmidestechnique de mesure de la luminescenceexp riences d ajout de ligandscourbes dose r ponse