Här beskriver protokollet hur man utför dubbelmärkning av immunofluorescens med hjälp av primära antikroppar uppfödda i samma art för att studera värdpatogeninteraktioner. Det kan också inkludera den tredje antikroppen från en annan värd i detta protokoll. Detta tillvägagångssätt kan göras i alla celltyper och patogener.