Préparation d’îlots fœtaux de primates non humains congelés pour le séquençage combiné de l’ARN à noyau unique et du séquençage ATAC, et la métabolomique en vrac

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8 novembre 2024

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Darian T. Carroll¹ , Sarah R. Lindsley² , Melissa Kirigiti² , Alex Buko³ , Angela Jones⁴ , Paul Kievit² , Maureen Gannon¹^,⁵^,⁶^,⁷

¹Department of Molecular Physiology and Biophysics, Vanderbilt University, ²Division of Metabolic Health and Disease, Oregon National Primate Research Center, ³Human Metabolome Technologies (HMT) America, ⁴Vanderbilt Technologies for Advanced Genomics, Vanderbilt University Medical Center, ⁵Department of Medicine, Vanderbilt University Medical Center, ⁶Department of Veterans Affairs Tennessee Valley, ⁷Department of Cell and Developmental Biology, Vanderbilt University

Ce protocole décrit les procédures d’isolement de noyaux de haute qualité à partir d’îlots pancréatiques de primates non humains congelés pour une utilisation dans le séquençage simultané de l’ARN et le séquençage ATAC d’un seul noyau, tout en préservant la fraction cytosolique en vrac pour les analyses métabolomiques à partir des mêmes échantillons.