Name: Reefshape : un système pour la collecte efficace et le traitement automatisé de données de photogrammétrie sous-marine de séries chronologiques pour la surveillance de l’habitat benthique (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-06-13T13:25:00.000+00:00
Duration: 13 min 35 s
Description: Découvrez le protocole ReefShape pour la photogrammétrie sous-marine automatisée et la surveillance des récifs coralliens. Cette méthode standardisée permet de collecter et traiter des données géoréférencées en série temporelle.

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Les récifs coralliens sont l’un des écosystèmes les plus riches en biodiversité et les plus importants sur le plan économique au monde et sont confrontés à des défis sans précédent liés au changement climatique, aux maladies, à la surpêche et à d’autres facteurs de stress 1,2,3. La surveillance des écosystèmes des récifs coralliens est particulièrement difficile en raison de leur emplacement souvent éloigné et des difficultés inhérentes à la recherche sous-marine. Par conséquent, les récifs ont toujours été sous-étudiés4. Il est essentiel de surveiller efficacement les récifs coralliens à plusieurs échelles spatiales allant de microbien5 à archipel6 et global7 pour comprendre leur déclin, ainsi que pour planifier, suivre et évaluer les efforts d’intervention8. L’imagerie photomosaïque est un outil devenu populaire pour surveiller l’état du benthos des récifs coralliens à l’échelle de dizaines à des centaines de mètres carrés, un terme désignant des cartes à haute résolution composées de photographies sous-marines assemblées qui se chevauchent9. Ces mosaïques permettent aux chercheurs d’imager une zone de récif plus grande que ce qui peut être capturé en une seule photo, d’où le terme d’imagerie à grande surface (LAI)10. Les mosaïques peuvent ensuite être analysées pour extraire des informations écologiques pertinentes, telles que le pourcentage de couverture corallienne, la taille de la colonie, la distribution des espèces et la composition benthique11. Les progrès de l’informatique et la disponibilité de logiciels prêts à l’emploi permettent désormais de réaliser ce processus à l’aide de la photogrammétrie de structure à partir du mouvement (SfM). SfM consiste à analyser les photos pour trouver des points de correspondance qui sont utilisés pour reconstruire l’orientation tridimensionnelle des photos et des points d’attache, permettant la création d’une réplique virtuelle précise du récif 12,13,14. Les études SfM/LAI sont devenues monnaie courante dans la recherche sur les récifs coralliens, permettant d’obtenir de nouvelles perspectives sur l’écologie des communautés coralliennes10, la complexité de l’habitat15,16, les réponses des communautés coralliennes aux événements de blanchissement17,18, les ouragans19 et la restauration des coraux20.
Plusieurs approches d’utilisation de l’IAL pour la surveillance des récifs coralliens ont été développées 21,22,23,24, ce qui a permis aux praticiens de tirer parti de la technologie d’offrir un large éventail de choix. Cependant, l’utilisation efficace de l’IAL dans la recherche sur les récifs coralliens est complexe et exige un effort d’apprentissage considérable. La maîtrise de la plongée sous-marine, de la navigation sous-marine, de la photographie sous-marine, de l’utilisation de logiciels, de la conservation et de la gestion de données est essentielle. De plus, l’expertise en écologie est fondamentale pour analyser et interpréter efficacement les produits de données. Les flux de travail existants ont tendance à se concentrer principalement sur l’acquisition d’images sans fournir de conseils suffisants pour les protocoles de séries chronologiques, la collecte de métadonnées (par exemple, la mise à l’échelle, la profondeur et l’emplacement) ou le traitement des données après le voyage sur le terrain : autant d’étapes essentielles pour une collecte de données précise et reproductible. Les coûts associés aux flux de travail LAI ont également tendance à être élevés, en utilisant des systèmes de caméra et des configurations informatiques coûteux. Les chercheurs ont toujours un grand besoin d’une méthodologie complète, simple et efficace, qui permette d’obtenir des données de qualité suffisante pour répondre à un large éventail de questions de recherche actuelles et futures. Nous y remédions en développant une approche robuste et efficace pour les LAI sous-marines qui réduit l’effort et la complexité du traitement et minimise les coûts tout en améliorant la qualité des données. Notre nouvelle approche permet une acquisition rapide, un traitement automatisé et l’alignement des séries chronologiques de l’imagerie afin de fournir des produits de données de haute qualité pour l’étude et l’analyse écologiques des récifs coralliens. Le coût total de démarrage de la mise en œuvre de cette approche est d’environ 5 000 à 8 000 USD (y compris le système de caméra, les matériaux, l’ordinateur dédié et le logiciel), selon que l’utilisateur peut accéder ou non aux tarifs éducatifs des logiciels de photogrammétrie. Grâce à l’application de nos méthodes, nous visons à aider les chercheurs sur les récifs coralliens à optimiser leurs efforts de collecte et de traitement des données, en permettant des flux de travail plus efficaces qui facilitent l’extraction et l’analyse rapides de données écologiques sur les récifs coralliens d’une importance cruciale.
La méthode décrite ici, que nous nommons « ReefShape », présente trois innovations principales : (1) l’utilisation de marqueurs de contrôle au sol semi-permanents fixés au substrat pour permettre le géoréférencement automatique et l’alignement des séries chronologiques des ensembles de données, (2) l’utilisation d’un levé personnalisé basé sur une application pour faciliter la collecte et le formatage des données de localisation, et (3) la mise en œuvre d’un processus scénarisé complet conçu pour automatiser entièrement le pipeline de photogrammétrie, réduisant considérablement le travail humain pendant la phase de traitement qui est utilisé dans d’autres protocoles LAI 20,21,22,23. À l’instar de ces autres protocoles LAI, ReefShape s’appuie sur l’utilisation d’Agisoft Metashape25 (ci-après dénommé « le programme de photogrammétrie ») pour le traitement photogrammétrique et utilise en outre l’application gratuite pour smartphone ESRI Survey12326(ci-après dénommée « l’application d’enquête ») pour la collecte de données de localisation. Ce protocole est conçu pour être simple mais robuste, ne nécessitant pas de systèmes multi-caméras24 ou de levés géodésiques complexes13 tout en répondant à l’objectif de fournir des données de haute qualité, définies comme des modèles 3D terminés, des photomosaïques et des modèles numériques d’élévation avec une géométrie, une échelle et une position précises ; une résolution et une netteté suffisantes pour identifier visuellement les organismes benthiques à l’échelle de l’espèce ou du genre ; pas de lacunes ou de trous majeurs dans les données ; couleur précise ; et dans le cas de données de séries chronologiques, un alignement correct entre les points temporels. L’approche spécifique décrite ici fournit un cadre pour la collecte et le traitement des données afin d’atteindre ces objectifs.
Grâce aux progrès de l’apprentissage automatique, nous prévoyons que de nouveaux outils d’analyse seront développés pour une extraction plus rapide et plus précise des données écologiques à partir de photomosaïques. Par conséquent, nous concentrons nos efforts sur la collecte d’images sous-marines de haute qualité et l’automatisation du pipeline de photogrammétrie, laissant les analyses spécifiques en grande partie aux utilisateurs de ce protocole en fonction de leurs propres besoins. Ce processus scénarisé, destiné à être largement applicable à la communauté de recherche sur les récifs coralliens, comprend des options d’exportation de produits de données formatés en tant que GeoTIFF de spécifications variables adaptées aux logiciels SIG courants et à TagLab, une application spécialement conçue pour l’annotation rapide des orthomosaïques des récifs coralliens27.
Présentation du protocole La méthode ReefShape se décompose en deux phases principales : la collecte de données in situ et le traitement des données sur ordinateur. La méthode est fonctionnelle pour des parcelles de ~25 m2 à &gt;1000 m2, avec une profondeur allant de ~1 m à 30 m. Il a été démontré que des parcelles de 300-400m2 sont idéales pour capturer efficacement la diversité corallienne des récifs des Caraïbes28. Cependant, il a été constaté que les parcelles de plus de ~100 m2 peuvent être difficiles à naviguer pour les arpenteurs novices. Par conséquent, une taille de parcelle de 10 m x 10 m est décrite dans le protocole comme point de départ, mais nous n’avons pas l’intention de contraindre les utilisateurs avec cette suggestion. Il est plutôt suggéré aux utilisateurs de choisir la taille de leur parcelle en fonction de leur propre expérience et de leurs besoins en matière de recherche. Le processus de collecte des données reste effectivement le même pour n’importe quelle taille de parcelle choisie.
Lorsqu’une parcelle est établie pour la première fois, l’arpenteur commence par fixer de façon permanente quatre étiquettes de marqueurs uniques comportant des cibles photogrammétriques codées (Figure 1D) sur le substrat à chaque coin (Figure 2), à l’aide d’un ordinateur de plongée pour mesurer la profondeur de chaque marqueur. Des barres d’échelle codées (Figure 1E) sont temporairement placées à l’intérieur de la parcelle, et des photos faisant face au substrat sont collectées par le plongeur avec un seul appareil photo sans miroir et un objectif rectiligne grand angle positionné à 1,5 m - 2 m au-dessus du récif, nageant dans un motif de « tondeuse à gazon » à double croisement, similaire à d’autres protocoles établis 11,21,24,. L’ensemble du processus (y compris la première configuration et la photographie) peut généralement être réalisé en une seule plongée, bien que plusieurs plongées puissent être nécessaires pour des parcelles plus profondes ou plus grandes. Après la photographie, l’arpenteur utilise une unité GPS Bluetooth montée sur un dispositif de flottaison (figure 1C) et un téléphone intelligent pour collecter des points GPS à la surface au-dessus de chaque marqueur d’angle à l’aide d’un formulaire personnalisé dans l’application d’arpentage, qui envoie ensuite les données de référence par e-mail à l’utilisateur dans une feuille de calcul préformatée. Lors des levés de parcelles suivants, l’arpenteur ne collecte pas de données de référence ni n’installe de marqueurs et doit seulement localiser et nettoyer les marqueurs d’angle existants et collecter des photos, ce qui simplifie le processus de collecte de données de séries chronologiques.
Pour le traitement des données, un ensemble de scripts Python personnalisés a été développé qui s’interfacent avec le programme de photogrammétrie pour automatiser le pipeline (Figure 3), un processus qui nécessite normalement une intervention humaine à plusieurs endroits. Les principales étapes de traitement du pipeline automatisé comprennent la création d’un nuage de points de rattachement et l’estimation des positions des caméras, la construction d’un modèle de maillage 3D du récif, la construction d’un modèle numérique d’élévation (MNE) 2,5D, la construction d’une photomosaïque orthorectifiée 2D et la définition d’une région d’intérêt (ROI) délimitée par les quatre marqueurs d’angle (Figure 4). Dans ce flux de travail, l’utilisateur saisit les photos et les données de référence dans une interface graphique (figure supplémentaire 1) au début du traitement, plutôt que d’avoir à passer par de nombreuses étapes avant d’ajouter manuellement des données de référence et de générer des produits de données, comme c’est souvent le cas dans d’autres flux de travail 21,22,23,24. Pour le traitement de séries chronologiques, les marqueurs d’angle permanents facilitent l’alignement automatique des points temporels, éliminant ainsi le besoin d’alignement manuel. L’utilisation d’un flux de travail standardisé et scénarisé permet d’assurer la cohérence des données et d’économiser des efforts humains importants lors du traitement, en particulier dans les projets comportant de nombreux points temporels. Une suite de scripts autonomes est également incluse pour automatiser diverses tâches de traitement, y compris le calcul d’un rapport surface/surface plane 3D, une mesure importante pour évaluer la complexité structurelle des récifs19,29.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67343/67343fig01.jpg"> 
Figure 1 : Principaux matériaux requis pour la partie collecte de données de ce protocole. (A) appareil photo sans miroir avec objectif rectiligne grand angle, (B) boîtier sous-marin avec port dôme pour s’adapter à l’appareil photo/objectif, (C) dispositif de planche de bord GPS Bluetooth, (D) marqueurs d’angle codés automatiquement détectables pour le contrôle permanent du terrain et le géoréférencement, et (E) barres d’échelle codées utilisées pour définir la taille du modèle. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67343/67343fig01large.jpg" target="_blank">Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.</a>

<table><tbody><tr><td>0,3m de longueur 1/2 » Tuyau en PVC</td><td>générique</td><td>N/A</td><td>pour kit GPS</td></tr><tr><td>1 » Capuchon de table en PVC</td><td>générique</td><td>N/A</td><td>pour kit GPS</td></tr><tr><td>Douille réductrice en PVC 1/2 » à 1 »</td><td>générique</td><td>N/A</td><td>pour le kit GPS</td></tr><tr><td>12mm f/2.0 AF Objectif à monture E</td><td>Samyang</td><td>SYIO12AF-E</td><td>également vendu sous la marque Rokinon</td></tr><tr><td>2 » cannelé tige rond clous de maçonnerie ronds</td><td>générique</td><td>N/A</td><td>pour l’installation d’un marqueur d’angle</td></tr><tr><td>Carte SD UHS-1 V30 256 Go</td><td>SanDisk</td><td>SDSDXXD-256G-ANCIN</td><td>Carte SD UHS-1 la plus rapide possible Ruban</td></tr><tr><td>à mesurer de 30 m recommandée (en option)</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>pour la configuration du tracé</td></tr><tr><td>Feuille acrylique, 3 mm d’épaisseur, coupée à 80 mm x 580 mm (3x)</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>matériau de la barre d’échelle</td></tr><tr><td>Plateau de caméra en aluminium</td><td>KitDive</td><td>N/A</td><td>s’adapte au boîtier de l’appareil photo et aide à tenir la caméra</td></tr><tr><td>Ensemble de marqueurs d’angle sous-marins avec cibles de photogrammétrie imprimées</td><td>N/A</td> N<td>/</td><td>A sur mesure, contacter l’auteur pour plus de détails</td></tr><tr><td>Le papier d’imprimante laser étanche Duracopy</td><td>Rite in the Rain</td><td>6511</td><td>peut être remplacé par du papier autocollant imperméable</td></tr><tr><td>E6000 époxy</td><td>générique</td><td>N/A</td><td>pour kit GPS</td></tr><tr><td>GLO2 Bluetooth GPS</td><td>Garmin</td><td>010-02184-01</td><td>d’autres options existent, GLO2 est l’appareil</td></tr><tr><td>photo sans miroir ILCE a6700</td> le plus économique Appareil photo <td></td><td>Sony ILCE6700/B</td><td>a6700 préféré, a6600 ou a6400 sont des options à faible coût</td></tr><tr><td>Imprimante laser</td><td>N/</td><td>A N/</td><td>A n’importe quelle imprimante laser (pas à jet d’encre)</td></tr><tr><td>Metashape Professional Edition</td><td>Agisoft</td><td>N/A</td><td>logiciel requis</td></tr><tr><td>Carte plastique (environ 1mm x 5mm x 5mm)</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>pour le kit GPS, peut également utiliser une carte de crédit ou similaire mise au rebut, coupée en deux.</td></tr><tr><td>Smartphone</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>tout smartphone raisonnablement moderne, pour la collecte de données GPS</td></tr><tr><td>Sony A6700 Sea Frogs 40M/130FT Boîtier étanche avec acrylique 6" Dome Port V.1</td><td>SeaFrogs</td><td>N/A</td><td>si vous utilisez des appareils photo a6600 ou a6400, remplacez-le par un boîtier SeaFrogs approprié</td></tr><tr><td>Super colle</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>pour la création d’un kit GPS et d’une barre d’échelle</td></tr><tr><td>Planche de natation de style fitness</td><td>Speedo</td><td>877530050021SZ</td><td>pour kit GPS, marque sans importance</td></tr><tr><td>Ordinateur de plongée de style montre</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>pour collecter les profondeurs des marqueurs d’angle</td></tr><tr><td>Pochette étanche</td><td>Xuniea</td><td>W-1188</td><td>marque sans importance, pour s’adapter à l’appareil GPS</td></tr><tr><td>Pochette pour téléphone étanche</td><td>Pelican</td><td>PP048884</td><td>marque sans importance, pour s’adapter au smartphone</td></tr></tbody></table>

reefshape : un système pour la collecte efficace et le traitement automatisé de données de photogrammétrie sous-marine de séries chronologiques pour la surveillance de l’habitat benthique

Reefshape: A System for the Efficient Collection and Automated Processing of Time-Series Underwater Photogrammetry Data for Benthic Habitat Monitoring

Un ensemble de données chronologiques LAI a été collecté à l’aide de cette méthodologie au récif de Simms Point, au large de l’extrémité sud-ouest de New Providence, aux Bahamas. Les figures 4, 5, 6 et 4 supplémentaires illustrent toutes les résultats de cette expérience. Le réseau de référence a été mis en place et les premières images ont été collectées en janvier 2023. Il a été rephotographié en août 2023, lors d’une grave vague de chaleur marine, afin d’évaluer la gravité du blanchissement des coraux. Les deux points temporels ont été traités à l’aide du script de flux de travail ReefShape complet, sans qu’aucune intervention de l’utilisateur ne soit requise dans les étapes intermédiaires. Le premier point temporel impliquait 1 299 images, qui ont toutes été alignées avec succès, avec une altitude de nage moyenne de 1,8 m au-dessus du substrat, une résolution native du sol de 0,567 mm/px (normalisée à 0,5 mm/px), une zone de couverture totale de 208 m2 (mesurée par la surface à l’intérieur des marqueurs d’angle), un rapport de surface 3D/2D de 2,887, Une erreur de reprojection de 1,12 px, une précision totale de géolocalisation interne de 30,6 cm et une erreur d’échelle de 1,4 mm. L’ensemble du processus, avec les paramètres par défaut dans le script Full ReefShape, a pris 8 h 23 min, en utilisant un ordinateur de bureau datant d’environ 2018 avec un processeur à 6 cœurs, 32 Go de RAM et un GPU discret de 8 Go (coût total ~1 500 USD). Un ordinateur de bureau 2024 avec un processeur à 14 cœurs, 64 Go de RAM et un GPU discret de 24 Go (coût total ~4 000 USD) a traité le même graphique en 1 h 58 min au total. Le deuxième time-point, comprenant 1 974 / 1 974 images alignées, a pris 7 h 45 min sur l’ancien ordinateur de bureau de 2018.
La figure 5 montre une section agrandie des deux points temporels et de l’analyse de base du blanchissement des coraux réalisée dans le TagLab27, montrant l’utilité de ce processus pour analyser l’évolution de l’habitat benthique au fil du temps. Les résultats de l’analyse ont indiqué que plus de 90 % des individus de nombreuses espèces de coraux ont connu un blanchissement complet, confirmant la gravité de l’événement, tandis que d’autres espèces ont connu un blanchissement minime ou nul, ce qui donne un aperçu des modèles de résilience au sein de la communauté corallienne. Les deux points temporels (figure 5) montrent des images de haute qualité, avec une netteté et une résolution suffisantes pour l’identification experte des organismes benthiques au niveau de l’espèce ou du genre. La balance des blancs est correctement réglée et il n’y a pas de zones significatives de flou, de trous de données ou d’autres artefacts, ce qui indique que le protocole a réussi à fournir efficacement les données nécessaires à l’étude de la dynamique de l’écologie benthique des récifs coralliens. La figure 6 (en haut) montre un zoom avant de ce graphique à titre d’exemple d’imagerie de haute qualité par rapport à un ensemble de données de mauvaise qualité (en bas) qui ne répond pas aux exigences de qualité des données, où les artefacts d’image entravent l’extraction des données écologiques. L’ensemble de données de mauvaise qualité a été collecté avec des réglages de caméra incorrects (balance des blancs incorrecte entraînant une teinte générale rouge et une ouverture trop ouverte entraînant un flou) et un chevauchement insuffisant des photos en raison d’une mauvaise navigation du plongeur, soulignant l’importance de l’acquisition d’images (protocole section 2).
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67343/67343fig05.jpg"> 
Figure 5 : Résultats représentatifs montrant des images de séries chronologiques et les contours des colonies de coraux d’une parcelle photographiée avant et pendant un épisode de blanchissement, montrant la précision de l’alignement automatique obtenue avec notre protocole et l’utilité de ces données pour suivre les changements benthiques au fil du temps. (A) montre l’image de janvier 2023 pour le site de Simms Point à New Providence, aux Bahamas, (B) l’image d’août 2023, (C) les colonies de coraux vivants de janvier 2023 classées comme saines (bleu), pâles (orange) ou blanchies (rouge), et (D) les colonies de coraux vivants d’août 2023 délimitées par le même schéma de classification. Le contour des colonies de coraux a été réalisé à l’aide d’une segmentation assistée par l’IA dans TagLab. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67343/67343fig05large.jpg" target="_blank">Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.</a>
<img alt="Figure 6" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67343/67343fig06.jpg"> 
Figure 6 : Exemple d’une orthomosaïque de haute qualité et d’une orthomosaïque de faible qualité, avec des annotations démontrant les attributs clés qui distinguent les deux. L’inspection visuelle de l’orthomosaïque et d’autres produits de données au cours de l’étape 5.4 du protocole est nécessaire pour évaluer si le protocole a été exécuté correctement ou si une refonte de la photographie du tracé est nécessaire pour atteindre les objectifs de qualité des données. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67343/67343fig06large.jpg" target="_blank">Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.</a>
Accès au logiciel : Les scripts python ReefShape, les instructions d’installation et d’utilisation, ainsi que des instructions plus détaillées sur la collecte de données et l’utilisation des logiciels sous la forme d’un livre blanc sont disponibles sur https://github.com/Perry-Institute/ReefShape. Nous avons l’intention de mettre à jour les scripts pour résoudre les problèmes au fur et à mesure qu’ils se présentent et d’apporter des améliorations. Par conséquent, nous vous recommandons d’utiliser la dernière version.
Figure supplémentaire 1. Capture d’écran illustrant l’enquête de collecte de données géode ReefShape dans l’application Survey123 sur un smartphone. Les utilisateurs peuvent accéder à l’enquête sans compte payant et reçoivent par e-mail leurs données préformatées pour être utilisées dans le traitement ReefShape lors de la soumission. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67343/SI-1_Survey123.tif" target="_blank">Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.</a>
Figure supplémentaire 2. Capture d’écran de l’interface graphique complète du script ReefShape Workflow. Les utilisateurs peuvent saisir toutes les informations nécessaires au traitement dans cette interface, ce qui permet une automatisation complète du flux de travail de photogrammétrie. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67343/SI-2_Full%20ReefShape%20Workflow%20Script.tif" target="_blank">Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.</a>
Figure supplémentaire 3. Capture d’écran de l’interface graphique du script Align Timepoints. Les utilisateurs peuvent utiliser ce script pour faciliter l’alignement automatique des enquêtes ultérieures sur le point temporel d’origine, ce qui permet d’analyser les changements de séries chronologiques. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67343/SI-3_Align%20Timepoints%20Script.tif" target="_blank">Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.</a>
Figure supplémentaire 4. Capture d’écran d’un modèle 3D, mettant en évidence les résultats représentatifs et le panneau de référence. Toutes les informations du panneau de référence sont configurées automatiquement en fonction de la barre d’échelle et des fichiers géoréférencés saisis dans le script Full ReefShape Workflow. Les différentes mesures de précision pour différentes données de référence (0,25 mm pour la mise à l’échelle, 10 cm pour la profondeur et ~70 cm pour la géolocalisation XY) sont saisies automatiquement et facilitent le traitement préférentiel de l’échelle, puis de la profondeur, puis des coordonnées XY dans la solution de localisation finale calculée par Metashape. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67343/SI-4_GeoRef_Example.tif" target="_blank">Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.</a>
Dossier supplémentaire 1 : Les instructions de préparation de l’équipement, les exigences et les paramètres du système de caméra, ainsi que les exigences informatiques et les étapes de configuration du logiciel qui ne relèvent pas du champ d’application du protocole lui-même sont contenues dans le fichier supplémentaire. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67343/Supplementary_File_1_.docx" target="_blank">Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.</a>

Reefshape : un système pour la collecte efficace et le traitement automatisé de données de photogrammétrie sous-marine de séries chronologiques pour la surveillance de l’habitat benthique

Large-area imaging (LAI) through structure-from-motion photogrammetry has gained significant traction as a monitoring tool for coral reef ecosystems, ...

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Reefshape : un système pour la collecte efficace et le traitement automatisé de données de photogrammétrie sous-marine de séries chronologiques pour la surveillance de l’habitat benthique

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