RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
he_IL
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
כאן אנו מדווחים על פרוטוקול למדידת מתח חמצוני בעוברי דג זברה חיים. הליך זה מאפשר זיהוי מיני חמצן תגובתיים (ROS) הן ברקמות עובר שלמות והן באוכלוסיות תאים בודדים. פרוטוקול זה יבצע ניתוחים איכותיים וכמותיים כאחד.
רמות גבוהה של מיני חמצן מגיבים (ROS) עלולות לגרום לשינוי במצב חיזור הסלולרי למצב עקה חמצונית. מצב זה גורם לחמצון של מולקולות (שומנים בדם, ה-DNA, חלבונים) ומוביל למותם של תאים. סטרס חמצונים גם משפיע על ההתקדמות של כמה מצבים פתולוגיים כגון סוכרת, Retinopathies, ניוון מוחיים, וסרטן. לפיכך, חשוב להגדיר בכלים כדי לחקור תנאי עקה חמצונית לא רק ברמה של תאים בודדים, אלא גם בהקשר של כל האורגניזמים. כאן, אנו רואים את עובר דג הזברה כשימושי במערכת vivo לבצע מחקרים כאלה ומציגים פרוטוקול למדידת לחץ חמצוני in vivo. ניצול של בדיקות ROS ניאון וקווי ניאון מהונדסים דג הזברה, אנו מפתחים שתי שיטות שונות למדידת לחץ חמצוני in vivo: ט) "שיטה כל עובר ROS איתור" למדידה איכותית של סטרס חמצונים וii) "תא בודד שיטת ROS זיהוי "למדידות כמותיות של סטרס חמצונים. בזאת, אנחנו מדגימים את יעילותם של הליכים אלה על ידי הגדלת לחץ חמצוני ברקמות על ידי סוכני חמצון ושיטות פיסיולוגיות או גנטיות. פרוטוקול זה הוא נוח למסכים גנטיים קדימה וזה יעזור לי יחסי כתובת סיבה ותוצאה של ROS במודלים של בעלי חיים של פתולוגיות הקשורות ללחץ חמצוני כגון הפרעות נוירולוגיות וסרטן.
סטרס חמצונים מוגדר באופן ספציפי כתנאי הנובע ממצב חיזור סלולארי לא מאוזן. תגובות חיזור מורכבות המתרחשות באופן שיגרתי בתוך תאים לקבוע את חיזור המדינה הסלולרית. תגובות חיזור מורכבות מכל התגובות כימיות מורכבות בהעברת אלקטרונים בין האטומים של מולקולות ביולוגיות ייצור חיזור וחמצון של מולקולות (כלומר תגובות חיזור). התגובות הללו הן זרז על ידי מינים מופעלים באופן אלקטרוני (כלומר מינים פרו חמצוני-), המתאפיינים בחוסר יציבות מבנית קיצונית והפעלה ספונטנית של אלקטרונים לא מאוזנים שיחליפו עם ביומולקולות השכנה. תגובות לא סדירות אלה לגרום לניזק לדנ"א, carboxylation חלבון, וחמצון שומנים בדם, וסופו של דבר להוביל למוות של תאי 1. הרמות גבוהות של סטרס חמצונים כבר הקשורות להזדקנות וההתפתחות של מצבים פתולוגיים שונים 2. יש סטרס חמצוניםדווח להיות אחראי לשינויים בכלי הדם בסוכרת ומחלות לב וכלי דם 3,4. זה גם משחק תפקיד קריטי בניוון עצבי במחלת אלצהיימר ופרקינסון 5. יתר על כן, סטרס חמצונים הוכח כגורם קריטי בשלטון התקדמות סרטן ואירועים גרורתי 6,7. בנוסף, תגובות דלקתיות והחיסוניות עשויות לעורר לחץ חמצוני ותמיכה נוספת 8.
בתאים חיים, מינים הפרו חמצוני נגזרים מהחמצן (ROS; מיני חמצן תגובתי) או חנקן (RNS; מיני חנקן תגובתי). ROS כולל הידרוקסיל רדיקלי, אניון superoxide (OH). (O 2 -), ומי חמצן (H 2 O 2). RNS העיקרי הוא תחמוצת חנקן (NO).. סדרה של מינים תגובתי משניים יכולה להיות שנוצרה על ידי אינטראקציות ספונטניות between ROS וRNS או מתכות בחינם יוני 9. לדוגמא, אניון סופראוקסיד מגיב עם תחמוצת חנקן ליצירת peroxynitrate (ONOO -), ואילו H 2 O 2 מגיב עם Fe 2 + יוצר רדיקלים הידרוקסיל. ROS וRNS, בשל יכולתם להגיב עם כמה ביומולקולות, נחשבים איום מסוכן לשמירה על מדינת חיזור הפיזיולוגית 10. כדי לשמור על תאי מדינת חיזור מצוידים בסדרה של רעלים מולקולות נוגד חמצון ואנזימים. סופראוקסיד דיסמוטאז (SOD), Catalase, peroxidase גלוטתיון וPeroxiredoxins בעצם מהווים האנזימטית-הארסנל נוגד חמצון המספק הגנה תאית ממינים פרו חמצוני כוללים H 2 O 2, OH וOONO -. 11. גם מולקולות נוגדת חמצון כמו הוויטמין C ו-E, פוליפנולים וCoenzymeQ10 (CoQ10) הן בעלי חשיבות קריטית כדי להרוות ROS ודה המסוכנת שלהםrivatives 12,13. עם זאת, ייצור מוגבר של ROS וRNS, או חוסר תפקוד במערכת נוגד החמצון, מסיט את חיזור המדינה הסלולרית לסטרס חמצונים 14.
חוץ מהקונוטציה השלילית שלהם, ROS יכול לשחק תפקידים פיסיולוגיים שונים בתאים ממוצא שונה. תאים בדרך כלל מייצרים ROS כמולקולות איתות לתווך אירועים ביולוגיים נורמלים כגון הגנת מארחת ותיקון פצע 15-17. מינים תגובתי בדרך כלל מיוצרים בתאים על ידי אנזימים תאיים כגון NOX (NADPH אוקסידאז) וXO (Xantine אוקסידאז) בתגובה לגורמי איתות, גורמי גדילה, ותנודות תאיים של רמות סידן 18,19. זה כבר דווח כי ROS עשוי דיפרנציאלי לווסת את פעילותם של גורמים גרעיניים חשובים כגון p53 או מרכיבים תאיים כגון ATM-kinase, רגולטור של התגובה לנזק לדנ"א 20. באנלוגיה ROS מאוד להשפיע איתות הסלולר על ידי תיווך החמצון דואר ואיון של phosphatases החלבון טירוזין (PTPs), אשר הוקם כמכרעת בויסות העברת האותות 21. יתר על כן, שיטות proteomic מבוססים להוכיח כי RNS כן הם אחראים לשינויים חלבון מסוימים ושינויים של איתות מולקולרית. RNS להגיב עם קבוצות תיאול ציסטאין שינוים לS-nitrothiols (SNO) ומפעילות מסלולים מולקולריים במקביל למצבים פתולוגיים כגון מחלות דלקתיות ואוטואימוניות 22,23.
מאז ניסויי תרבית תאים באופן חלקי בלבד לשכפל מספר רב של גורמים הפועלים בvivo, זה הוא עניין רב לבצע מחקרי חיזור במודלים של בעלי החיים 24,25. כדי להשיג זאת, דג הזברה כבר נחשב מודל בעלי חיים בעלי חוליות מתאים ללמוד דינמיקת סטרס חמצונים 26. דג הזברה היא מודל למערכת חדשה המעניקה מספר יתרונות ללמוד אירועים תאיים וגנטיים בdev חוליותelopment ומחלות. אשכולות גדולים של עוברים יכולים להיות שנוצרו וזמינים שבועיים לצרכי ניסוי. יתר על כן הבהירות יוצאת דופן האופטית של עוברי דג הזברה, כמו גם גודלם הזעיר, מאפשר הדמיה תא בודדת ומעקב דינמי באורגניזמים שלמים 27. בעשור האחרון, מספר לא מבוטל של מוטציות דג הזברה כבר נוצר למודל מצבים פתולוגיים אדם כגון סרטן ומחלות גנטיות 28-31. והכי חשוב, מספר רב של קווים מהונדסים הופק כדי לאפשר הזדמנויות נרחבות של מניפולציות גנטיות וביולוגיות 32. לדוגמא, קווי דג הזברה רקמות ספציפיות מהונדסים מנוצלים באופן קבוע במחקרי vivo. קווים אלה מבטאים חלבון פלואורסצנטי תחת השליטה של אמרגן שנבחר, המציע את היכולת לזהות תאים בודדים in vivo, כמו גם את המבנה האנטומי שהם מהווים.
מספר מחקרי טוקסיקולוגי כבר השתמשו tהוא דג הזברה כדי להעריך את השפעת vivo של כימיקלים על הומאוסטזיס חיזור, מה שמראה את התאמתם של חוליות זו כמודל חיה לתחום של גילוי תרופות וסטרס חמצונים 33-35. למרות כמה בדיקות ניאון נבדקו כדי לפקח על סטרס חמצונים בזחלי דג הזברה 36,37, אין מבחני הוקמו כדי לזהות ולמדוד את הרמות של סטרס חמצונים ברקמות דג הזברה ותאי חיים. כאן אנו מתארים הליך לכימות in vivo של סטרס חמצונים בתאים חי של עוברי דג הזברה. כל כלי הדמיה, FACS מיון, בדיקות ניאון ותנאים פרו חמצוני משולבים כדי ליצור assay פשוט לאיתור והכימות של מיני חמצוני בעוברים ורקמות דג הזברה.
1. הכנת הכלים ופתרונות עבודה
2. זיווג של דגים למבוגרים ובחירה של עוברי דג הזברה
3. טיפול בעוברים עם אוקסידנט סוכן
4. ההר שלם ROS איתור שיטה
5. שיטת ROS איתור תא בודד
על ידי יישום השיטה שתוארה כאן, אנו יכולים בקלות למדוד ולזהות סטרס חמצונים (ורמות ROS) ברקמות עוברי דג הזברה. לאחר חציית דג הזברה מבוגר, ביצים נאספות ואפשרו לפתח ב28 C ° 72 הודעה hr הפריה (hpf). על מנת לגרום ללחץ חמצוני, אנו מציעים שתי גישות שונות: 1) טיפול בעוברים עם ריאגנטים פרו חמצון חזקים או 2) ההשקעה בROS קידום לאחר פגיעה ברקמות.
בגישה הראשונה, שהעסקנו שני חומרים כימיים שונים, בהתאם לצרכים הספציפיים: מי חמצן (H 2 O 2), כסוכן ROS הסלולרי הגנרית להרכיב, וrotenone, כנהג ROS המיטוכונדריה הספציפי. Rotenone הוא מעכב שלי מורכב של ETC, שderegulations הוא סיבתי של סטרס חמצונים 41.
בגישה השנייה, שנגרמים הצטברות של ROS על ידי יצירת פצע בסנפיר הזנב של עובר דג הזברה39. לחלופין, ניתן לקדם תנאי עקה חמצונית ברקמות דג הזברה על ידי דריסה עם הזרקת morpholino מסלול תגובת חמצון Nrf2 שהוא ההגנה סלולרית העיקרית כנגד ההשפעות הרעילות של סטרס החמצונים 38.
ברגע שסטרס החמצונים הוא מושרה בעוברי דג הזברה, ההצטברות של מיני חמצן תגובתי (ROS) ניתן למדוד באמצעות בדיקות כלליות או ספציפיות ROS המיטוכונדריה רגישות, אשר הופכות ניאון עם הפעלה (כלומר חמצון).
ניתן לנתח עוברים שטופלו על ידי שימוש בכל שיטת ההר ROS-זיהוי או על ידי יישום שיטת זיהוי תא ROS אחת כפי שסוכם באיור 1. הבחירה בין השיטות מסתמכת על הצורך בביצוע מדידה איכותית או כמותית של סטרס חמצונים. נציג תוצאות של שני השיטות מיוצגות באיור 2 ואיור 3.
שיטת ההר ROS איתור כל
איור 2 מראה את יישום שיטת ההר ROS איתור השלם לin vivo הדמיה של סטרס החמצונים. בפרט, בשיטה זו יושמה כדי לעקוב אחרי שתינו לחץ "חזק" חמצוני שנוצר על ידי טיפולים פרו חמצון אקסוגניים כמו גם סטרס חמצונים שנוצרו על ידי יותר מצבים פיסיולוגיים כגון פציעות פצע או מחיקת גן "נמוכים".
רמות פיסיולוגיות של מיני חמצוני הנגרמות על ידי יצירת מיקרו פציעה או פצע רחב בסנפיר הזנב של עובר דג הזברה לחיות ב72 hpf. הוכח כי לאחר פציעה, H 2 O 2 מצטבר בדקות פצע שוליים 20 לאחר הפצע 39. על מנת להמחיש את ההצטברות של לחץ חמצוני בשוליים הפצע, עוברים הודגרו עם גנריבדיקה ROS רגישה וצלם ב20 דקות לאחר פציעתם 39. על ידי השוואת סנפירי זנב שלמים עם זנבות פצועים, אפשר להבחין הצטברות של הבדיקה הניאון בשוליים הפצע (איור 2 א). אות הקרינה חלשה שאינו ספציפית מזוהה בכל רחבי רקמת סנפיר הזנב בשני התנאים.
על מנת לאמת את ההצטברות הספציפית של החללית ROS רגישה בשוליים הפצע, H 2 O 2 הרמות בפצע כבר הוריד בגישה תרופתית. מאז זה כבר הוכיח כי H שולי פצע 2 O 2 צבירה היא מאוד רגיש לVAS2870 DUOX-מעכב 39, טופלו מראש עובר עם מעכב זה לפני פציעתם. השוואה של הקרינה של הבדיקה ROS רגישה, מעוברים ובקרות המתאימות טרום טיפול VAS, מצביעה על כך שהאות תלויה בהצטברות ROS (כלומר H 2 O 2) (איור 2).
בנוסף, יצרו רמות גבוהות של מיני חמצוני ברקמות דג הזברה על ידי טיפול בעוברי דג הזברה עם rotenone. עוברים שטופלו Rotenone ובקרות הודגרו עם בדיקה ROS רגישה גנריות כדי לזהות באופן ספציפי מיני ROS. לאחר מכן, הבדיקה נשטפה החוצה והעוברים היו הדמיה תחת מיקרוסקופ פלואורסצנטי סטריאו. סטרס החמצונים זוהו בכל הגוף של העוברים (איור 2 ג). תמונות בהגדלה גבוהה מראות אזורי אנטומיים שבו החללית עוברות מטבוליזם בהצלחה (איור 2 ד). תמונות שדה בהיר (פנלים העליונים) מבחינות מבנים אנטומיים, בעוד תמונות הקרינה (לוחות נמוכים) מצביעות על תאי ROS-חיוביים. כפי שמוצג על ידי תמונות ניאון התוצאות הן בעיקר דיווח איכותי של זיהוי סטרס חמצונים, אשר מושגת על ידי השוואת שליטה עם עוברים שטופלו.
תא בודד-ROS איתור שיטה
איור 3 חלקות דיווחי FACS הנציג וכימות של סטרס חמצונים על ידי יישום שיטת זיהוי תא הבודד ROS. שיטה זו הותאמה כדי למדוד את רמות לחץ חמצוני בתאי דג הזברה שהיו נתונים לתנאים פרו חמצון כפי שדווחו בפרוטוקול ומפורט באגדות דמות. כפי שתואר, סטרס החמצונים כבר נמדדו על ידי דוגרים רקמות דג הזברה ניתקו לתוך תאים בודדים עם בדיקה מולקולרית ROS רגיש. מאז הליך הניתוק וFACS עצמו עלול לגרום לניזק לתאים, הניתוח של דגימות דורש שרק "תאי חיים" נחשבים לquantitation סטרס חמצונים. בהתאם לכך, תאים ניתקו מנותחים על ידי בחירה את החלק היחסי של תאים המציגים פרמטרים "תא חי" פיזיים (איור 3 א) ועל ידי לא כולל תאים מתים (איור 3 ב). לפיכך, הדגימות נבדקות ועבוררמות לחץ חמצוני על פי הקרינה של הבדיקה ROS רגישה ולהצגת הקרינה אנדוגני כגון החיוביות עבור ה-GFP (איור 3 ג). מדגם ביקורת שלילי לבדיקת ROS רגישה צריך להיות כלול על מנת להעריך את לחץ חמצוני הנגרם על ידי טיפול ונהלים טכניים (איור 3 ג; פנל: בקרה -). כימות עלילת FACS יחסית הפגין בהיסטוגרמות מראים מדידות של משכפל שונה ביולוגי (איור 3D-E).
חוץ לכמת את רמת לחץ חמצוני על טיפולים מי חמצן, שיטה זו יושמה כדי לכמת את רמות לחץ חמצוני בתנאים פיסיולוגיים כגון בmorphants nrf2a ובקרות המתאימות (איור 3F).
יתר על כן, על ידי שילוב של שיטת זיהוי ROS תא הבודד עם בדיקות ROS רגישות ספציפיות כגון RO המיטוכונדריהבדיקות ה-S-רגישה, אפשר גם למדוד לחץ חמצוני בהקשר של טיפולים ממוקדי מיטוכונדריה הספציפיים פרו חמצון (איור 3G).

איור 1. דמות סכמטי של השיטה למדידת רמות ROS בעוברי דג הזברה. מבוגרים דג הזברה הם חצו בטנקי הרבייה המתאימים. ביצים מופרות נאספות אז לתוך צלחות ומאוחסנות ב 28 ° C כדי לאפשר עובר להתפתח באופן מלא. אינדוקציה של סטרס חמצונים יכולה להיות מושגת בדרכים שונות, או על ידי טיפולי תרופות או על ידי עלבונות גנטיים או פיזיים. לחלופין, במקרה שעבר מוטציה גנטית הוא ניתח, ניתן לדלג דגירה זה ולהמשיך הלאה. בשלב זה, ניתן להמשיך לאחר שתי שיטות שונות. על פי "כל מ 'שיטת ount ROS איתור "(משמאל), עובר דג הזברה מודגרת מייד עם בדיקה (1) ולאחר מכן ניתחתי עם הקרינה או מיקרוסקופ confocal (2) ROS רגישה ניאון. בשיטת "תא בודד ROS איתור" (מימין), עובר דג הזברה הם ניתקו לתוך תאים בודדים (1), הודגרו עם בדיקה ROS רגישה ניאון (2) ונותח על ידי FACS לגילוי הקרינה ולכמת (3). בעוד שיטת "שלם ההר-ROS זיהוי" מאפשרת זיהוי עקה חמצונית בעוברי חיים כassay איכותי, "תא יחיד המבוססים" מענקי שיטה איכותיים ומדידות כמותיות של רמות סטרס חמצונים בעיקר.

איור 2. נציג תוצאות של כל שיטת ההר ROS איתור.) עוברי דג הזברה ב72 hpf היו נתוניםלפציעתם כפי שתואר בעבר על ידי Niethammer et al. 2009 39. תמונות confocal נציג להראות הצטברות מינים פרו חמצוני (ROS) (ראש חץ) בשוליים הפצע של סנפיר הזנב הפצוע. מיני חמצוני זוהו עם חללית ROS גנריות (CellROX; 2.5 מיקרומטר) 20 דקות לאחר שהפצע כבר עשה. בר סולם 20 מיקרומטר. ב ') תמונות confocal נציג מראים מרווח בסופו של עוברי דג הזברה ב72 hpf. עוברים טופלו קודם לכן בVAS2870 (20 מיקרומטר) או DMSO ל90 דקות לפני הפצע כבר עשה. ROS זוהו עם בדיקה הגנרית ROS רגישה (CellROX; 2.5 מיקרומטר) 20 דקות אחרי הפצע. בר סולם 20 מיקרומטר. C) תמונה של כל גוף מראה סטרס חמצונים הנגרם rotenone בעוברי דג הזברה. סטרס חמצונים הוא מאוד מזוהה באזור הזנב של העוברים כפי שמוצגים בפנל D). Rotenone הוא מעכב חזק של ETC המיטוכונדריה המשפיע בעיקר עלוב חייםתאי שריר etal בדג זברה. סרגל קנה מידה, 180 מיקרומטר.

איור 3. תוצאות נציג של התאים בודדים בשיטת ROS איתור.) עלילת הנציג FACS מראה מדגם טיפוסי של עוברי דג הזברה ניתקה לתאים בודדים. תאי חיים הם מגודרים באזור R1 פי עם הפרמטרים FSC-H ו SSC-H. SSC-H: 539 (מתח), 1.0 (AmpGain), מצב: ליניארי; FSC-H:. E00 (מתח), 2.1 (AmpGain) B) עלילת הנציג FACS מראה מדגם טיפוסי של עוברי דג הזברה ניתקה לתאים בודדים. לפני ניתוח FACS, המדגם כבר הודגרו עם יודיד Propidium (PI; מיקרוגרם / מיליליטר 1) במשך 5 דקות. תאים מתים הם מגודרים באזור R2 פי עם הקרינה לצרכן (ערוץ fl2-H). FSC-H: E00 (מתח), 2.1 (AmpGain), מצב: ליניארי, SSC-H: 539 (מתח), 1.0 (AmpGain), מצב: liקרוב. ערוצי מתח: FL-2:. 613 חלקות FACS הנציג התחבר C) מראים ניתקו עוברי דג הזברה נתון לטיפול פרו חמצון (H 2 O 2) ובקרות המתאימות. תאי האנדותל הם דמיינו ידי ערוץ ה-GFP. חלקות FACS מייצגות את כל התאים מושפעים סטרס חמצונים (ROS) על UL ו UR. תאים שליליים נרשמות על רביעים נמוכים יותר (LL וLR). TG (Kdrl: GFP) עוברי דג הזברה s843 ב48hpf הודגרו עם H 2 O 2 (2 מ"מ) או H 2 O כשליטה ל10 דקות. לפני ניתוח FACS, עוברים מעובדים כמתואר בפרוטוקול. תאים מושפעים מלחץ חמצוני שזוהו באמצעות בדיקה הגנרית ROS רגיש ניאון (CellROX; 2.5 מיקרומטר). מדגם לא מודגרות עם החללית ROS רגישה נכלל כביקורת שלילית. השוואת המדגם נתון לטיפול פרו חמצון עם השליטה בהתאמה, את מספר התאים זמם על רביעים העליונים (UL + UR) הוא גבוה יותר. acquis FACSהגדרות ition היו כדלקמן: ערוצי מתח: FL-1: 582 התחבר; היסטוגרמה 410 התחבר ד ') מראה את אחוז התאים (UL + UR) מושפע מלחץ חמצוני בH 2 O עוברים שטופלו 2 ובקרה בהתאמה: FL-4.. מדידות הקשורים לדגימות שמוצגת ב-C. תאים מושפעים מלחץ חמצוני שזוהו באמצעות בדיקה הגנרית ROS רגיש ניאון (CellROX; 2.5 מיקרומטר). תוצאות הן הממוצעים של n = 2 משכפל ביולוגי שונה ± SD. E) היסטוגרמה המראה את אחוז תאי אנדותל (+ GFP) מושפע מלחץ חמצוני (ROS +) בH 2 O עוברים שטופלו 2 ובקרה בהתאמה. מדידות הקשורים לדגימות שמוצגת ב-C. תוצאות הן הממוצעת של n = 2 משכפל שונה ביולוגי ± SD. F) היסטוגרמה המראה את אחוז התאים המושפע מלחץ חמצוני (ROS +) בmorphants nrf2a (nrf2a MO) ובקרות המתאימות(Ctrl MO) ב24 hpf. תוצאות הן הממוצעים של n = 2 משכפל ביולוגי שונה ± סטיית תקן G) היסטוגרמה המראה את אחוז התאים המושפעים מלחץ חמצוני של המיטוכונדריה בעוברים שטופלו (Rotenone;. 10 מיקרומטר) ובקרות המתאימות (Ctrl; DMSO) ב72 hpf. לאחר הניתוק של עוברים לתוך תאים בודדים, מתח חמצוני של המיטוכונדריה (ROS המיטוכונדריה +) נמדד עם בדיקה של המיטוכונדריה ספציפית (MitoSOX; 5 מיקרומטר). תוצאות הן הממוצעים של n = 3 משכפל ביולוגי שונה ± SD.
למחברים אין מה לחשוף.
כאן אנו מדווחים על פרוטוקול למדידת מתח חמצוני בעוברי דג זברה חיים. הליך זה מאפשר זיהוי מיני חמצן תגובתיים (ROS) הן ברקמות עובר שלמות והן באוכלוסיות תאים בודדים. פרוטוקול זה יבצע ניתוחים איכותיים וכמותיים כאחד.
התמיכה במעבדת מאסימו סנטורו מגיעה מ-HFSP, Marie Curie Action, Telethon ו-AIRC. אנו מודים לדפנה גייס ולאמיליאנו פניירי על הקריאה הביקורתית של כתב היד.
| תמיסת מי חמצן | SIGMA | 516813 | אין לאחסן דילולים |
| תמיסת מלח מאוזנת של האנק 1x | GIBCO | 14025 | |
| מתיל תאית | SIGMA | M0387 | |
| אינסטנט אוקיינוס אקווריום תערובת מלח ים | INSTANT OCEAN | SS15-10 | |
| טריקאין | SIGMA | A5040 | |
| בדיקה רגישה ל-ROS של Cgeneric: מגיב אדום עמוק של CellROX | INVITROGEN | C10422 | |
| בדיקה רגישה ל-ROS ספציפית למיטוכונדריה: MitoSOX | INVITROGEN | M36008 | ממיסים בקבוקון אחד עם 13 μ l של DMSO |
| הידרואתידין | INVITROGEN | D23107 | |
| רוטנון | SIGMA | R8875 | הכן תמיסת מלאי של 5 מ"מ ב-DMSO. |
| דימתיל סולפוקסיד | SIGMA | D2650 | |
| VAS2870; 3-בנזיל-7-(2-בנזוקסזוליל)תיו-1,2,3-טריאזולו(4,5-d)פירימידין | EnzoLifeScience | BML-EI395 | ממיסים את האבקה ב-DMSO; דילויט במי דגים |
| פרופידיום יודי | בדיקות מולקולריות (Life Technologies) | P3566 | |
| 7-aminoactinomycin D (7-AAD) | בדיקות מולקולריות (Life Technologies) | A1310 | |
| Nrf2a Morpholino | GeneTools | 5'-CATTTCAATCTCCAT CATGTCTCAG-3'Ref | : Timme-LaLaragy et al.; 2012 (PMID: 22174413); קוביאשי et al.; 2002 (PMID:12167159) |
| קולגנאז P | ROCHE | 11213857001 | להמיס את האבקה ב-100 מ"ג/מ"ל ב-HBSS סטרילי. אחסן את הכמויות בטמפרטורה של -20 מעלות; C |
| תמיסת מלח חוצצת פוספט (PBS) | GIBCO | 10010-056 | |
| סרום בקר עוברי | GIBCO | 10082-147 | |
| טבליות קוקטייל מעכב פרוטאז מלא | ROCHE | ממיסים טבליה אחת ב-1 מ"ל מים | |
| 0.5% טריפסין-EDTA (10x), ללא פנול אדום | GIBCO | 15400-054 | הכן תמיסת עבודה אחת לפני השימוש |
| מיקרוסקופ מורכב | מיקרוסקופ סטריאוZEISS | ||
| עם תאורת פלואורסצנט | מצלמת Nikon | AZ100 | |
| ZEISS | AxioCamMRm | ||
| לרכישת תמונות פלואורסצנטיות | ZEISS | ZEN 2011 | |
| סדרן תאים המופעל על ידי פלואורסצנטי | BD FACSצנטריפוגת קליבור | ||
| צינורות | FACS של Eppendorf | 5417R | |
| BD | 342065 | ||
| Multiwell Plate | BD Falcon | 353047 | |
| צלחות פטרי מעוקרות ולא מטופלות 90 מ"מ | VWR | 391-1915 | |
| מיקרוסקופ קונפוקלי | Leica | Leica SP5 |