RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
he_IL
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
טרנספקציה לקו תאי המקרופאגים, RAW264.7, קשה בשל התגובה הטבעית של התא כנגד חומרים זרים. תיארנו כאן הליך עדין אך חזק להעברת גנים מדווחים על לוציפראז לתאי RAW264.7.
העברה של חומרים גנטיים רצויים לתאים היא הליך בלתי נמנע במחקרים ביו-רפואיים. בעוד שתוארו שיטות רבות, סוגים מסוימים של תאים עמידים לרבות מהשיטות הללו ומניבים יעילות טרנספקציה נמוכה1, מה שעלול לעכב את המחקר בסוגי תאים אלה. בפרוטוקול זה, אנו מציגים הליך טרנספקציה אופטימלי להכנסת גנים מדווחים של לוציפראז כ-DNA פלסמיד לקו תאי המקרופאגים RAW264.7. מתוארים שני סוגים שונים של ריאגנטים טרנספקציה (מבוססי שומנים ומבוססי פוליאמין), והערות חשובות ניתנות לאורך הפרוטוקול כדי להבטיח שתאי RAW264.7 ישתנו באופן מינימלי על ידי הליך הטרנספקציה וכל נתוני הניסוי המתקבלים הם התוצאות הישירות של הטיפול הניסיוני. בעוד שיעילות הטרנספקציה עשויה שלא להיות גבוהה יותר בהשוואה לשיטות טרנספקציה אחרות, ההליך המתואר חזק מספיק לזיהוי אות לוציפראז ב-RAW264.7 מבלי לשנות את התגובה הפיזיולוגית של התאים לגירויים.
Transfection של חומצות גרעין בתאים יש יישום מגוון במחקר מדעי. דוגמאות כוללות (1) גני כתב כדי ללמוד את התפקיד של גורמים גנטיים שונים בביטוי גנים, (2) פלסמידים ביטוי חלבון לביטוי יתר של החלבון של עניין, ו- (3) קטן מפריעים RNA לdownregulate ביטוי גנים. על ידי מניפולציה של רמת הביטוי של גנים מסוימים ומדידת השפעת ההפרש של מניפולציות כאלה, חוקרים יכולים להסיק את פונקציות הגן במערכות ביולוגיות שנבחרו. לא כל שיטות transfection לספק את אותה יעילות transfection, ואפילו באותה השיטה transfection לא transfect כל סוגי התאים באופן שווה 1. לפיכך, שיטות transfection שונות פותחו כגון שיטת סידן זרחה, dextran DEAE, transfection השומנים קטיוני, transfection פולימר שאינו השומנים קטיוני, electroporation, וnucleofection 2,3.
Transfection למקרופאגים הוא ESPEקשה cially בשל העובדה שמקרופאגים הם phagocytes המקצועי, כי הם מאוד רגישים לחומרים זרים ובם חיידקים נגזרו DNA (מפוגל) 4. מבוא של דנ"א זר מפעיל את המסלול-כמו אגרת קולט 9 (TLR9) שמוביל לייצור של ציטוקינים ו5,6 תחמוצת חנקן. מקרופאגים מופעלים אלה עשויים להיות אז פחות מגיבים לטיפול שהחוקרים מתכוונים לבדוק.
המעבדה שלנו באופן שגרתי transfects שורת תאי מקרופאג RAW264.7 עם גני כתב בלוציפראז, ופתחנו פרוטוקול כי הוא חזק מספיק כדי להיות אות בלוציפראז גבוהה משמעותי מרקע, אבל גם עדין מספיק למקרופאגים להישאר במצב המנוחה שלהם. ההתנהגויות של תאי transfected הוערכו על ידי גן כתב גחלילית בלוציפראז מחסה אזור האמרגן של IκBζ (pGL3- IκBζ). ביטוי IκBζ הוא שהוגברו על ידי שפת רכיב קיר תא החיידקopolyssacharide (LPS) 7,8, וdownregulated ידי ציטוקינים אנטי-דלקתיים, Interleukin-10 (IL-10) 8. כדי להסביר את שונות בין transfection בארות, אנחנו שיתוף transfect פלסמיד שליטה המכיל את הגן בלוציפראז Renilla (למשל, phRL-TK) למטרות נורמליזציה. הפרוטוקול המתואר הוא מותאם לאחר בדיקת פרמטרים שונים, כולל תזמון של transfection, סוג של חומרים כימיים transfection, כמויות של חומרים כימיים transfection ושל פלסמיד דנ"א, כמו גם יחס של מגיב transfection לפלסמיד דנ"א. שני ריאגנטים transfection הכלולים בפרוטוקול זה הם (1) מגיב transfection שומנים מבוסס ו( 2) חלבון / מגיב transfection מבוסס polyamine.
1. פלסמיד דנ"א טיהור
2. culturing תא וזריעה
3. Transfection
4. גירוי תא וAssay בלוציפראז
ניתוח נתונים 5.
איור 1 משווה את יעילות transfection של שני ריאגנטים transfection בRAW264.7. מגיב השומנים מבוססי בדרך כלל נתן שיעור transfection כ -25% ואילו transfection מבוסס polyamine חלבון / הביא כ -5% יעילות (איור 1 א). ההבדל ביעילות transfection נצפה גם באותות בלוציפראז בתאי RAW264.7 transfected עם כתב אמרגן pGL3-IκBζ (איור 1). תוספת של LPS לתאי transfected אלה הגדילה את אות גחלילית בלוציפראז, אינדיקציה ישירה של פעילות שעתוק המוגברת של כתב אמרגן IκBζ. במילים אחרות, התוצאות הראו כי LPS הוגבר הביטוי של גן IκBζ, עולה בקנה אחד עם דיווחים קודמים 7,8. איור 2 מציג את התוצאות שהתקבלו בניסויים הטיפוסיים שלנו, באמצעות transfection שומנים מבוססי כדוגמא. לאחר קבלת ערכי אות בודדות מFiלוציפראז refly ולוציפראז Renilla (2A דמויות ו2B), האותות בלוציפראז גחלילית היו מנורמלים לאות לוציפראז Renilla (איור 2 ג). נורמליזציה מומלצת בשל וריאציה להיטב היטב ביעילות transfection. כדי לקבוע אם תנאי הטיפול (LPS או LPS + IL-10) שינו את אותות כתב, גחלילית: יחס Renilla (כלומר, האותות מנורמלים) של קבוצות הטיפול הושוו לזה של המדגם (איור 2 שלא טופלו (unstimulated) ). הנתונים שלנו הראו כי תאי RAW264.7 טיפול עם LPS הוגברו פעילותו של כתב אמרגן pGL3-IκBζ, מצביעים על כך שLPS הגביר את רמת השעתוק של גן IκBζ. בנוכחות של IL-10, כתב אמרגן IκBζ היה פעילות נמוכה יותר, מה שמרמז כי IL-10 הצליחו לעכב שעתוק מושרה LPS של גן IκBζ. החלבון / transfection מבוסס בדרך כלל polyamineנתן ערכים נמוכים יותר בשני לוציפראז הגחלילית ואותות בלוציפראז Renilla. איור 3 משווה את משך זמן מנוחה בין transfection וגירוי (24 שעות או 48 שעות), ומראה כי אותות לוציפראז ירידה לאורך זמן. הירידה באות לא להפריע לפרשנות נתונים כאשר מגיב transfection השומנים מבוסס שימשה (איור 3 א); אינדוקציה על ידי LPS ועיכוב על ידי IL-10 עדיין נצפתה לאחר 48 שעות של מנוחה. עם זאת, הירידה באות הייתה משמעותית יותר כאשר החלבון / מגיב transfection מבוסס polyamine שימש (איור 3), במיוחד את אותות לוציפראז Renilla. כתוצאה מכך, ההבדל בין קבוצות טיפול לא נצפה לאחר 48 שעות מנוחה.
השפעה לא רצויה אחד transfection היא מוות של תאים ולכן ההשפעה של כל שיטת transfection על התואר של אפופטוזיס הוערכה. תאים היו transfected, או לא, ונתונים לAnnexin-V ויודיד propidium (PI)מכתים. Lysates הוכן מהתאים אלה נותחו גם לנוכחות של חלבון פולי שלם ובקע ADP פולימראז ribose (PARP). ניתוח תזרים cytometric של Annexin-V / תאי PI מוכתמים הציע שtransfection השומנים מבוסס מעט הגדיל את חלקם של תאים חיוביים Annexin-V בהשוואה לתאי untransfected, בעוד transfection מבוסס polyamine חלבון / לא עשה (איור 4 א) . באופן דומה, המבוססים על השומנים transfected מעט הגדיל את חלקם של PARP ביקע בעוד transfection מבוסס polyamine חלבון / לא עשה (איור 4). עם זאת, למרות המספרים גבוהים של תאים אפופטוטיים, המורפולוגיה של התאים על ידי מיקרוסקופ אור לא השתנתה (איור 4C). יותר מכך, התגובה הביולוגית של תאי transfected שומנים מבוססי נשארה זהה לאלה של תאי untransfected (איור 4D). התאים היו מגורה עם LPS ± IL-10, ועל הסכומים של TNF ^5; מופרש לתוך supernatant התרבות היו לכמת ידי ELISA. שני תאי transfected untransfected ושומנים מבוססי עשו כמויות דומות של TNFα בתגובה לLPS ועוכבו על ידי התוספת של IL10. אין TNFα נעשה כאשר התאים לא מגורה (איור 4D) מצביע על כך שהתאים נשארו נאיביים לאחר transfection.

איור 1. transfection שומנים מבוססי נתן יעילות transfection גבוהה מהחלבון / transfection מבוסס polyamine. תאי RAW264.7 () היו transfected פלסמיד להביע GFP גם עם ריאגנטים transfection מבוססי polyamine חלבון / שומנים מבוססי או. אות ה- GFP נמדדה על ידי cytometry זרימה לאחר 24 שעות. תאים (B) RAW264.7 היו transfected עם כתב אמרגן pGL3-IkBζ. לאחר 48 שעות מנוחה, גאמות היו מגורה עם LPS עבור 6 שעות. אות בלוציפראז גחלילית נמדדה על פי הוראות יצרן. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

2. נתונים איור אופייניים assay בלוציפראז. תאי RAW264.7 היו transfected עם TK-Renilla וכתב אמרגן IkBζ. לאחר 24 שעות מנוחה, תאים היו מגורה עם LPS ± IL-10 לשעה 2. (א) בלוציפראז גחלילית ואותות בלוציפראז (B) Renilla נמדדו לפי הוראות יצרן assay בלוציפראז. פעילות כתב (C) הייתה מנורמלת לאות TK-Renilla ולהתוות כיחס Firefly / Renilla. (ד) מקפלים שינוי מחושב על ידי החלוקהגחלילית:. יחס Renilla של דגימות מגורה על ידי שמדגם unstimulated אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 3. עוצמת אות בלוציפראז הוא תלוי זמן. מבוסס polyamine חלבון / תאים () transfected שומנים מבוסס ו( ב) transfected היו נחו או שעה 24 או 48 שעות לפני גירוי עם LPS ± IL-10 עבור שעה 2. לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

(א) בתאי RAW264.7 היו transfected עם כתב אמרגן IkBζ. לאחר 24 שעות מנוחה, המוות של תאים הוערך על ידי Annexin-V וצביעת יודיד propidium (PI) על cytometer זרימה. תאים (B) transfected היו נתונים לimmunoblotting ניתוח לPARP (באורך מלא ובקעו) וGAPDH (שליטת טעינה). עוצמות להקה אז היו לכמת באמצעות תוכנת הדמיה. L = transfection שומנים מבוסס, P = חלבון / transfection מבוסס polyamine, STP = 0.1 מיקרומטר staurosporin. תמונות (C) מיקרוסקופים של תאי transfected עם מגיב transfection שומנים מבוסס. תאים (ד) transfected עם מגיב transfection שומנים מבוסס היו מגורה עם LPS ± IL-10 במשך 6 שעות, והרמות של TNFα ציטוקינים פרו-הדלקתי נמדדו באמצעות ELISA. אנא לחץ עליומחדש כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.
יש המחברים אין לחשוף.
טרנספקציה לקו תאי המקרופאגים, RAW264.7, קשה בשל התגובה הטבעית של התא כנגד חומרים זרים. תיארנו כאן הליך עדין אך חזק להעברת גנים מדווחים על לוציפראז לתאי RAW264.7.
מחקר זה מומן על ידי מענק של המכונים הקנדיים לחקר הבריאות (CIHR). STC מחזיקה בפרס מחקר לדוקטורט מה-CIHR וקרן מייקל סמית'. EYS מחזיקה במלגת CIHR. תוכנית ההכשרה להשתלות CIHR סיפקה גם מלגות לתארים מתקדמים ל-STC, EYS ו-SS.
| PureLink HiPure Plasmid Maxiprep Kit | Life Technologies | K210007 | כל ערכת maxiprep תעבוד |
| פנול: כלורופורם: אלכוהול איזואמיל | Life Technologies | 15593-049 | כיתה ביולוגיה מולקולרית. פנול רעיל אז עבדו במכסה האדים, אם אפשר. השתמש בשכבה האורגנית השקופה התחתונה אם נוצרות שתי שכבות של נוזל במיכל. |
| DMEM | Thermo Scientific | SH30243.01 | חם ב-37 מעלות; C אמבט מים לפני השימוש. |
| סרום בקר עוברי | Thermo Scientific | SH30396.03 | מושבת ב-56 מעלות; C אמבט מים למשך 45 דקות לפני השימוש. |
| Opti-MEM | Life Technologies | 31985-070 | יש לחמם לטמפרטורת החדר לפחות לפני השימוש. |
| מגיב טרנספקציה XtremeGene HP DBA | Roche | 6366236001 | יש לחמם לטמפרטורת החדר לפני השימוש. |
| GeneJuice | EMD Millipore | 70967 | יש לחמם לטמפרטורת החדר לפני השימוש. |
| 5x מאגר ליזה פסיבי | Promega | E1941 | 30 מ"ל כלול במערכת הבדיקה Dual Luciferase Reporter |
| הבדיקה Dual Luciferase Reporter | Promega | E1910 |