RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
he_IL
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
הפרוטוקול הנוכחי פיתח שיטה להערכת התפוקה של תרכובות על לוח TLC באמצעות טכניקת התאורה הכחולה-LED. היתרונות של גישה זו הם שהיא בטוחה, יעילה, זולה, ומאפשרת לחוקר למדוד מספר דגימות בו זמנית.
כרומטוגרפיה של שכבה דקה (TLC) היא טכניקה אנליטית נגישה שנעשה בה שימוש נרחב במחקר בכימיה אורגנית כדי לכמת את התשואה של דגימות לא ידועות. המחקר הנוכחי פיתח שיטה יעילה, זולה ובטוחה להעריך את תפוקת הדגימות על צלחת TLC באמצעות תאורת ה-LED הכחולה. לובסטטין שהופק מאספרגילוס טראוס היה התרכובת לדוגמה ששימשה במחקר הנוכחי. מודלים של רגרסיה המבוססים על תקן lovastatin שימשו להערכת התשואה של lovastatin. הושוו שלוש שיטות: ביו-אסאי, גילוי UV ותאורת LED כחולה. התוצאה הראתה כי שיטת התאורה blue-LED יעילה הרבה יותר בזמן מאשר שיטות זיהוי UV ובדיקת ביולוגיה. בנוסף, תאורת ה-LED הכחולה הייתה אופציה בטוחה יחסית בגלל החשש מסכנות ביולוגיות בשיטת הביו-אסאי (למשל, זיהום מיקרוביאלי) וחשיפה לקרינה אולטרה סגולה בשיטת גילוי ה-UV. בהשוואה לשיטות היקרות הדורשות מכשירים מיוחדים והכשרה ארוכת טווח לפני עבודה עצמאית, כגון GC, HPLC ו- HPTLC, השימוש בתאורת Blue-LED היה אפשרות חסכונית להעריך את תפוקת הדגימות מצלחת TLC.
כרומטוגרפיה בשכבה דקה (TLC) נמצאת בשימוש נרחב כטכניקה איכותית וכמותית בתחום הכימיה האורגנית 1,2,3. היתרונות העיקריים של TLC הם שהיא מספקת זיהוי מהיר, דרישות מדגם גמישות, ואינה דורשת ציוד מיוחד4. עד כה, למרות שגישות מתקדמות רבות הוקמו, TLC היא עדיין השיטה העיקרית לזיהוי דגימות לא ידועות בתערובת. עם זאת, האתגר של גישה זו הוא היעדר ציוד בטוח וזול לכימות תפוקת הדגימה, במיוחד לפיתוח מעבדות עם תקציבים מוגבלים. המחקר הנוכחי, אם כן, נועד לפתח שיטה יעילה, בטוחה וזולה בשילוב עם TLC כדי להעריך את התשואה של הדגימות.
שלא כמו TLC בעל ביצועים גבוהים (HPTLC), כרומטוגרפיה נוזלית בעלת ביצועים גבוהים (HPLC) וכרומטוגרפיית גז (GC) עם דרישות דגימה מחמירות, זמן רב ומעורבות של multistep להכנת דגימה 1,5, TLC הראה מספר יתרונות. ראשית, לצורך הכנת הדגימה, HPLC ו- GC אינם יכולים לזהות את התמצית הגולמית מכיוון שהתמצית הגולמית עשויה לחבר את העמודה של HPLC ו- GC. שנית, כאשר הדגימות אינן מתאימות ל- UV (חשוב לניתוח HPLC) או עם תנודתיות נמוכה (חשוב לניתוח GC), ניתן להחיל TLC על דגימות אלה, והשימוש במגיב הדמיה הופך את הדגימות המבודדות לגלויות על שכבות דקות 6,7,8. שלישית, עבור משתמשים כלליים, HPLC ו- GC דורשים בדרך כלל זמן רב יחסית לפני שהם עובדים באופן עצמאי, בהשוואה ל- TLC. בנוסף, ניתוח TLC כמותי, המכונה TLC בעל ביצועים גבוהים (HPTLC), יכול להפוך את המידע על לוח TLC לדיגיטלי באמצעות סורק רגיש במיוחד. עם זאת, העלות של מערכת HPTLC הוא יקר יחסית. ככזה, פיתוח גישה חסכונית ומהירה לכימות דגימות על צלחת TLC הוא נושא חשוב.
שיטות דומות פותחו לכימות תפוקת TLC; לדוגמה, Johnson9 דיווח על טכניקה המאפשרת לכמת את הדגימות על צלחת TLC באמצעות סורק שטוח המחובר למחשב. בשנת 2001, El-Gindy et al.10 פיתחו את השיטה TLC- densitometric, אשר שימשה לאיתור התרכובת עם צפיפות אופטית, והטכניקה יושמה גם על ידי Elkady et al.11. בשנת 2007, הס2 הציג את שיטת ה-TELC (DE-TLC) המשופרת דיגיטלית המיושמת כדי לזהות את התפוקה של תרכובת על צלחת TLC באמצעות מצלמה דיגיטלית בשילוב עם אור UV. הס גם השווה את הבדלי העלויות בין שיטת HPTLC לשיטת DE-TLC והגיע למסקנה כי ניתן להשתמש בשיטת DE-TLC במעבדות תיכון ומכללות בגלל עלותה הזולה2. עם זאת, העלות של שיטת TLC-densitometric עדיין הייתה יקרה, והפעלת אור אולטרה סגול דורשת הכשרה מקדימה מספקת למקרה שהמשתמשים עלולים להיחשף לקרינה אולטרה סגולה. לכן, בהתאם ל- TLC, רצוי לפתח שיטה יעילה, בטוחה וזולה לכימות תפוקת המדגם.
המחקר הנוכחי תיאר פרוטוקול לגילוי הדגימה על צלחת TLC באמצעות תאורת ה-LED הכחולה, ופיתח מודל רגרסיה עם אמינות גבוהה (ערך ריבועי R גבוה) כדי למדוד את מידות הפסים ולאחר מכן לקבוע את התפוקה המורכבת. לבסוף, נמצא כי שיטת התאורה blue-LED היא בטוחה יחסית (לעומת שיטת גילוי UV), זולה (לעומת. GC, HPLC ו-HPTLC), וגישה יעילה (לעומת שיטת bioassay) לכימות תשואה.
הפרוטוקול הנוכחי מתואר באמצעות lovastatin כדוגמה. לובסטטין הופק מאספרגילוס טראוס בן שבוע.
1. מיצוי תרכובת
הערה: לפרטים על מיצוי תרכובת, ראו איור 1.
2. הפרדת התמצית הגולמית לפי עמודת ספיחה בפאזה רגילה (NP)
3. הכנה וטעינה של לוחות כרומטוגרמה בשכבה דקה (TLC)
4. ניתוח על ידי תאורת ה- LED הכחולה
5. הערכת תשואה לפי מודל הרגרסיה
מחקר זה הציג את שיטת תאורת ה-LED הכחולה כדי להעריך את תפוקת התרכובות, ושיטה זו אומתה והושוותה לשיטות ביו-אסאי ו-UV שזוהו (טבלה 1). מודלי הרגרסיה פותחו על בסיס ממדי הפסים וריכוז התקנים לשלוש שיטות, בהתאמה, כדי לחזות את תפוקת הדגימות. ראשית, בתוצאות שיטת הביו-אסאי, ריבוע ה-R בין ממדי אזור העיכוב לתקני לובסטטין היה 0.99, ותפוקת הדגימה הייתה 0.56 מ"ג שנחזתה על ידי מודל הרגרסיה (איור 2). שנית, בשיטת גילוי UV, ריבוע ה-R בין תקני הלובסטטין לבין ממד הפסים על לוחית ה-TLC היה 0.97, ותפוקת הדגימה שנחזתה על-ידי מודל הרגרסיה הייתה 0.53 מ"ג (איור 3). יש לציין ששולי הרצועה היו מטושטשים, ונצפו פסים בעוצמת אות נמוכה יחסית (איור 3A). שלישית, בשיטת תאורת ה-LED הכחולה, ריבוע ה-R בין תקני לובסטטין לממד הפסים בלוח ה-TLC היה 0.98, ותפוקת הדגימה הייתה 0.54 מ"ג שנחזתה על-ידי מודל הרגרסיה (איור 4). התפוקה החזויה באמצעות תאורת ה-LED הכחולה הייתה קרובה יותר לשיטת הביו-אסאי (שנקבעה כבקרה). הממד של הלהקה היה פרופורציונלי לכמות הלובסטטין, והפסים הברורים התקבלו בשיטת התאורה הכחולה-LED. בנוסף, שעות העבודה של שיטות התאורה bioassay, UV-detected ו- blue-LED היו בערך 24 שעות, 2 שעות, ו 1 שעות, בהתאמה; (הערה: שעת עבודה פירושה הזמן הכולל שהושקע בבדיקת התשואה של lovastatin).

איור 1: זרימת העבודה של הפרוטוקול. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 2: שיטת הבדיקה הביולוגית. (A) ביו-אסאי של לובסטטין נגד נוירוספורה קראסה (דגירה במשך 24 שעות ב-30 מעלות צלזיוס). בסוף הניסוי צולמו לוחות האגר בקוטר 90 מ"מ תחת אור נראה. (B) הריכוזים של שישה תקני לובסטטין היו: מס' 1 (1 מ"ג/מ"ל), מס' 2 (0.75 מ"ג/מ"ל), מס' 3 (0.5 מ"ג/מ"ל) ומס' 4 (0.25 מ"ג/מ"ל). מדגם מס' 5 דולל ל-0.25× (1:4). מדגם מס' 6 דולל ל-0.5× (1:2). ממד אזור העיכוב (מ"מ2) נמדד על ידי תוכנת ההדמיה. (C) מודל רגרסיה פותח באמצעות תוכנת ניתוח נתונים וגרפים המבוססת על ממד אזור העיכוב של התקנים. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 3: צלחת כרומטוגרמה בשכבה דקה (TLC) שנחשפה לאור UV. (A) ה-n-הקסאן:אתיל אצטט (2:3 v/v) שימש כשלב הנייד בניתוח TLC, ולוחית ה-TLC נחשפה לאור UV (365 ננומטר) לאחר השרייה במפתח (10% H2SO4). (B) הריכוזים של שישה תקני לובסטטין היו: מס' 1 (1 מ"ג/מ"ל), מס' 2 (0.75 מ"ג/מ"ל), מס' 3 (0.5 מ"ג/מ"ל) ומס' 4 (0.25 מ"ג/מ"ל). מדגם מס' 5 דולל ל-0.25× (1:4). מדגם מס' 6 דולל ל-0.5× (1:2). ממד אזור העיכוב (מ"מ2) נמדד על ידי תוכנת ההדמיה. (C) מודל רגרסיה פותח באמצעות תוכנת ניתוח נתונים וגרפים המבוססת על הממד של הפסים הסטנדרטיים של לובסטטין על לוח TLC. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 4: צלחת כרומטוגרמה בשכבה דקה (TLC) שנסרקה על-ידי מאיר ה-LED הכחול. (A) n-הקסאן:אתיל אצטט (2:3 v/v) שימש כשלב הנייד בניתוח TLC, ולוחית ה-TLC נסרקה על-ידי מאיר ה-LED הכחול. (B) הריכוזים של שישה תקני לובסטטין היו: מס' 1 (1 מ"ג/מ"ל), מס' 2 (0.75 מ"ג/מ"ל), מס' 3 (0.5 מ"ג/מ"ל) ומס' 4 (0.25 מ"ג/מ"ל). מדגם מס' 5 דולל ל-0.25× (1:4). מדגם מס' 6 דולל ל-0.5× (1:2). ממד אזור העיכוב (מ"מ2) נמדד על ידי תוכנת ההדמיה. (C) מודל רגרסיה פותח באמצעות תוכנת ניתוח נתונים וגרפים המבוססת על הממד של הפסים הסטנדרטיים של לובסטטין על לוח TLC. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
| ביו-אסאי | תאורת LED כחולה | זוהה UV | |
| תצפית תוצאות | העיניים | תאורת LED כחולה ועיניים | אור UV ועיניים |
| רזולוציית תמונה | בינוני | גבוה | נמוך (תמונה מטושטשת וקלושה) |
| עלות זמן משוערת | 24 שעות | 1 שעה | שעתיים |
| נדרשת מיומנות ניתוח | בינוני | נמוך | בינוני |
| בטיחות | זיהום מיקרוביאלי | בטוח מאוד | חשיפה לאור UV |
| משוואת רגרסיה | y = 0.0019x + 0.0304 | y = 0.0399x - 0.1271 | y = 0.0657x - 0.6405 |
| ריבוע R | 0.99 | 0.98 | 0.97 |
| מדרון | 0.0019 | 0.0399 | 0.0657 |
| יירוט | 0.0304 | -0.1271 | -0.6405 |
| שגיאת תקן של שיפוע | 8.94E-05 | 3.54E-03 | 6.28E-03 |
| שגיאת תקן של יירוט | 0.03032 | 0.07115 | 0.12375 |
טבלה 1: השוואה בין שלוש שיטות האיתור ששימשו במחקר זה.
| שיטה דנסיטומטרית TLC | ניתוח תמונות TLC | |||||||
| אל-גינדי ואח' 10 |
אלקדי ואח'.11 |
מושארף ואח'.12 |
ג'ונסון9 | הס2 | שיטת תאורת LED כחולה (מחקר זה) |
|||
| לדוגמה | אצבוטולול HCL | ציפרופלוקסצין HCL | מטרונידזול | דאנאזול | כולסטרול | ונילין | ניקוטינמיד | לובסטטין |
| תוצאות | UV גלאי |
TLC סורק |
TLC סורק |
סורק שטוח | מצלמה דיגיטלית עם מנורת UV |
תאורת LED כחולה | ||
| אורך גל | 230 נאנומטר | 280 נאנומטר | 280 נאנומטר | 291 נאנומטר | נה | 254 נאנומטר | נה | |
| מקדם מתאם | 0.996אמפר | 0.9991א | 0.9994א | 0.996אמפר | 0.998א | 0.971ב' | 0.987ב' | 0.99א 0.98ב' |
| משוואת רגרסיה | נה | y = 5.7853x +19.9383 |
y = 1.1104x + 6.9755 |
y = 7.949x + 2460 | y = 0.96x | נה | נה | y = 0.0399x -0.1271 |
| a: מקדם המתאם של פירסון | ||||||||
| b: ריבוע R |
לוח 2: השוואה בין שיטות קודמות לבין המחקר הנוכחי.
איור משלים 1: צלחת הכרומטוגרמה בעלת השכבה הדקה (TLC) עם אמפיצילין נסרקה בשיטת תאורת ה-LED הכחולה. (A) אתיל אצטט:מתנול (9:13 v/v) שימש כשלב הנייד בניתוח TLC, ולוחית ה-TLC נסרקה על ידי תאורת ה-LED הכחולה. (B) הריכוז של ארבעה תקני אמפיצילין היה: מס' 1 (100 מ"ג/מ"ל), מס' 2 (75 מ"ג/מ"ל), מס' 3 (50 מ"ג/מ"ל) ומס' 4 (25 מ"ג/מ"ל). ממדי הפסים נמדדו על ידי תוכנת ההדמיה. (C) מודל רגרסיה פותח באמצעות תוכנת ניתוח נתונים וגרפים המבוססת על הממד של הפסים הסטנדרטיים של אמפיצילין על לוח TLC. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
איור משלים 2: צלחת כרומטוגרמה בשכבה דקה (TLC) עם אפרמיצין שנסרקה בשיטת תאורת ה-LED הכחולה. (A) מתנול: מים (6:5 v/v) שימשו כשלב הנייד בניתוח TLC ולוחית ה- TLC נסרקה על ידי תאורת ה- LED הכחולה. (B) הריכוז של ארבעה תקני אפרמיצין היה: מס' 1 (50 מ"ג/מ"ל), מס' 2 (40 מ"ג/מ"ל), מס' 3 (30 מ"ג/מ"ל) ומס' 4 (20 מ"ג/מ"ל). ממדי הפסים נמדדו על ידי תוכנת ההדמיה. (C) מודל רגרסיה פותח באמצעות תוכנת ניתוח נתונים וגרפים המבוססת על הממד של הפסים הסטנדרטיים של אפרמיצין על לוח TLC. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
כל המחברים מצהירים כי אין להם ניגודי עניינים.
הפרוטוקול הנוכחי פיתח שיטה להערכת התפוקה של תרכובות על לוח TLC באמצעות טכניקת התאורה הכחולה-LED. היתרונות של גישה זו הם שהיא בטוחה, יעילה, זולה, ומאפשרת לחוקר למדוד מספר דגימות בו זמנית.
מחקר זה נתמך על ידי משרד המדע והטכנולוגיה, טייוואן (MOST 108-2320-B-110-007-MY3).
| אגר קונדלב בקטריולוגי אמריקאי | 1802.00 | ||
| Aspergillus terreus | ATCC 20542 | ||
| תאורת LED כחולה | MICROTEK | Bio-1000F | |
| צנטריפוגה | תרמו מדעית | HERAEUS Megafuge 8 | |
| מנורת UV קומפקטית | UVP | UVGL-25 | |
| אתיל אצטט | MACRON | MA-H078-10 | |
| נייר סינון 125 מ"מ | ADVANTEC | 60311102 | |
| ImageJ | NIH | תוכנה חופשית | https://imagej.nih.gov/ij/download.html |
| לובסטטין תקן | ACROS | A0404262 | |
| MiBio פלואו | MICROTEK | V1.04 | |
| n-הקסאן | C-ECHO | HH3102-000000-72EC | |
| OriginPro | OriginLab | 9.1 | https://www.originlab.com/origin |
| מרק דקסטרוז תפוחי אדמה H | STBIO MEDIA | ||
| מאייד סיבובי | EYELA | SB-1000 | |
| חומצה גופרתית | Fluka | 30743-2.5L-GL | |
| ג'ל סיליקה TLC 60 F254 | MERCK | 1.05554.0001 | |
| חומצה טריפלואורואצטית | Alfa Aesar | 10229873 | |
| מכונת רטט אולטרסאונד | DELTA | DC600 |