Abbiamo sviluppato un semi-automatico ottica Metodo di analisi Heartbeat (SoHa) per analizzare le registrazioni ottico ad alta velocità da Drosophila, Zebrafish e cuori embrionali di topo. Dimostriamo l'applicazione della nostra metodologia per l'analisi della funzione cardiaca nel moscerino della frutta e cuori embrionali di topo.
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Articolo metodologico
Semiautomatici Analisi Heartbeat ottica di piccoli cuori
In questo articolo
Sommario
Abstract
Abbiamo sviluppato un metodo per analizzare le registrazioni ottico ad alta velocità da
Protocollo
Semi-automatici di analisi battito cardiaco ottico
1. Pre-elaborazione -
Questa operazione fornisce informazioni sulla diametri cuore diastolica e sistolica.
Bordi cuore sono identificati e contrassegnati massimo durante la diastole e sistole. Registrazioni ottiche possono essere avanzate a velocità lenta e anche un solo fotogramma alla volta permettendo un'identifica....
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Discussione
Il modello Drosophila ha dimostrato di essere un potente strumento genetico che è stato usato per affrontare una serie di quesiti scientifici che spaziano dallo sviluppo embrionale all'apprendimento e alla memoria. Di recente questo organismo modello versatile è stato utilizzato per studiare la genetica della funzione cardiaca. Un certo numero di tentativi di quantificare fisiologia cardiaca in adulti Drosophila si sono basati sulle osservazioni fatte nei moscerini intatta attraverso la cuticola addominale. La maggi.......
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Dichiarazioni
Gli autori non hanno nulla da dichiarare.
Ringraziamenti
KO e AC sono supportati da una borsa e una borsa di studio della American Heart Association. SIB e RB sono sostenuti da sovvenzioni NIH.
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Materiali
| Nome | Azienda | Numero di catalogo | Commenti |
|---|---|---|---|
| Software MatLab | Mathworks | Ambiente necessario per il software di analisi. | |
| Fotocamera digitale EM-CCD | Hamamatsu Corp. | 9100 o 9300 | Altre fotocamere digitali ad alta velocità funzioneranno ugualmente. |
| Software HC per l'acquisizione dati di immagini | Hamamatsu Corp. | Qualsiasi altro software per l'acquisizione di immagini che produca filmati in formato avi funzionerà ugualmente. | |
| Microscopio ottico con obiettivo 10x | Leica Microsystems | Un obiettivo immerso che elimina l'interfaccia aria-acqua migliora notevolmente la risoluzione |
Riferimenti
- Cammarato, A., Dambacher, C. M., Reedy, M. C., Knowles, A. F., Kronert, W. A., Bodmer, R., Ocorr, K., Bernstein, S. I. Myosin Transducer mutations differentially affect motor function, myofibril structure, and the performance of skeletal and cardiac muscles. Mol Biol Cell. 19 (2), 553-562 (2008).
- Ocorr, K., Reeves, N., Wessells, R. J., Fink, M., Chen, H. -S. V., Akasaka, T., Yasuda, S., Me....
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