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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
analisi chemiotattica visivi sono essenziali per una migliore comprensione di come le cellule eucariotiche controllare la migrazione delle cellule direzionale chemoattractant-mediata. Qui, descriviamo i metodi dettagliati per: 1) in tempo reale, il monitoraggio ad alta risoluzione di molteplici analisi chemiotattica, e 2) visualizzando contemporaneamente il gradiente chemiotattico e le dinamiche spazio-temporali di eventi in cellule HL60 neutrofili simile segnalazione.
Le cellule eucariotiche percepiscono e si muovono verso un gradiente chemioattrattivo, un processo cellulare chiamato chemiotassi. La chemiotassi svolge un ruolo critico in molti processi fisiologici, come l'embriogenesi, la modellazione dei neuroni, le metastasi delle cellule tumorali, il reclutamento di neutrofili nei siti di infiammazione e lo sviluppo dell'organismo modello Dictyostelium discoideum. Le cellule eucariotiche rilevano i chemio-attrattivi utilizzando recettori accoppiati a proteine G. I saggi visivi di chemiotassi sono essenziali per una migliore comprensione del modo in cui le cellule eucariotiche controllano la migrazione cellulare direzionale mediata da chemioattrattivi. Qui, descriviamo metodi dettagliati per: 1) il monitoraggio in tempo reale e ad alta risoluzione di più saggi chemiotassici e 2) la visualizzazione simultanea del gradiente chemioattrattivo e della dinamica spaziotemporale degli eventi di segnalazione in cellule HL60 simili ai neutrofili.
Le cellule eucariotiche senso e si muovono verso la maggiore concentrazione all'interno di un gradiente chemiotattico, un processo cellulare indicato come chemiotassi. Chemiotassi gioca un ruolo critico in molti processi fisiologici, come l'embriogenesi 1, neurone patterning 2, le metastasi delle cellule tumorali 3, il reclutamento dei neutrofili a siti di infiammazione 4, e lo sviluppo del modello di organismo Dictyostelium discoideum 5. In generale, le cellule eucariotiche senso chemoattractants utilizzando G-proteine recettori accoppiati 5. L'impegno di chemiotattici con questi recettori promuove la dissociazione delle proteine G eterotrimeriche Gα e Gβγ, che a loro volta attivano vie di trasduzione del segnale a valle che infine regolano l'organizzazione spazio-temporale del citoscheletro actina di guidare la migrazione delle cellule 5-9.
biologi cellulari stanno sviluppando e migliorando la chemiotassiè metodi per esaminare come recettori accoppiati a proteine g (GPCR) di segnalazione media la migrazione delle cellule dirette. Il saggio della camera o la migrazione transwell Boyden è stato sviluppato nel 1960 da Boyden 10. Il test funziona creando un gradiente di composti chemotattiche tra due pozzetti separati da una membrana microporosa. La sua semplicità e facilità d'uso rendono il saggio chemiotassi più usato fino ad oggi. Tuttavia, il test non consente al processo di migrazione delle cellule da visualizzare. La camera di Zigmond è il primo dispositivo a microfluidi visivo che permette l'imaging chiaro di migrazione delle cellule su un vetrino in una costrizione stretto verso una fonte chemoattrattante 11. Dunn 12 e 13 Insall modificati e migliorati ad alta risoluzione e la capacità di imaging a lungo termine del test chemiotassi camera di Zigmond. A causa delle caratteristiche, altamente prevedibili di diffusione dominante di flusso del fluido, microfluidica è stata fornitura di soluzioni per il prossimo-Generatisu analisi chemiotattica come EZ-TAXIScan (un dispositivo di analisi della mobilità delle cellule).
Con la stabilità del gradiente assicurato, il dispositivo consente sei chemiotassi test da effettuare contemporaneamente (Figura 1A). In contrasto con i gradienti direzionalmente fissi generati nei vari saggi camera sopra, il saggio ago o micropipetta sviluppato da Guenther Gerisch genera un gradiente con una sorgente mobile 14. Nel saggio, chemiotattico viene rilasciato da una micropipetta mobile per generare un gradiente stabile. Con questo test l'ago, i ricercatori hanno scoperto che le cellule diverse generano pseudopodi con caratteristiche fondamentalmente diverse. L'applicazione di microscopia a fluorescenza, siamo stati in grado di visualizzare il gradiente per facilitare la sua misurazione quantitativa tutto 15. In questo studio, descriviamo metodi dettagliati per la preparazione chemiotattica HL60 (leucemia promielocitica umana), le cellule, il monitoraggio contemporaneamente più assa chemiotassiys con il dispositivo di analisi della mobilità delle cellule, e la visualizzazione dei GPCR-mediata dinamiche spazio-temporali di molecole di segnalazione come la proteina chinasi D1 in singole cellule vive in risposta a stimoli visibili, chemotattiche spatiotemporally controllabili. I nostri metodi di imaging avanzati possono essere applicati a studi generali chemiotassi, e sono particolarmente adatti per sistemi cellulari di mammifero.
1. La cultura e la differenziazione dei neutrofili umano-come le cellule HL60
2. rivestimento della superficie di vetro coperchio della camera 4well
3. Chemiotassi Assay Utilizzando Cell Analisi Mobilità Dispositivo
4. trasfezione con elettroporazione
5. Monitoraggio GPCR-mediata membrana traslocazione di PKD1 da Multi-channel fluorescente Microscopia
l'imaging simultaneo di chemiotassi di più celle HL60 con dispositivo di analisi della mobilità delle cellule
Sulla base del principio di microfluidica 16, il costruttore ha fornito profili simulati dei gradienti: un gradiente viene generato entro 1 minuto, stabilizzata entro 5 minuti, e mantenuta oltre 2 ore. I profili altamente prevedibili dei gradienti stabili generati da microfluidica consentono a più chemiotassi test da effettuare contemporaneamente. In questo studio, abbiamo osservato tre analisi chemiotattica simultanee (Figura 2a e Movie 1). Abbiamo scoperto che le cellule HL60 iniziato chemotaxing subito dopo il chemiotattico è stato iniettato nel pozzo del chemiotattico, e tenuto chemotaxing in un percorso rettilineo per i seguenti 60 minuti, in linea con i risultati della simulazione per la stabilità del gradiente. Tracciare il percorso di viaggio e la morfologiadelle celle consente misurazioni quantitative e successivo confronto dei comportamenti chemiotassi utilizzando un indice di chemiotassi che include la lunghezza totale del percorso, velocità, direzionalità e morbidezza delle cellule (Figura 2B). Lunghezza totale percorso è la somma delle lunghezze dei segmenti di linea che collegano i centroidi di percorso. Velocità si ottiene dividendo la lunghezza totale percorso dal tempo. Direzionalità è misurata verso l'alto ed è definito come: (coordinata Y della fine del percorso meno coordinata Y d'inizio) diviso per totale lunghezza del percorso. Questo dà 1.0 per un oggetto in movimento direttamente verso l'alto. La rotondità della cella è una misura (in percentuale) di quanto efficientemente una data quantità di perimetro racchiude l'area. Un cerchio ha la più ampia per un dato perimetro e ha un parametro di rotondità del 100%. Una linea retta racchiude nessuna area e ha un parametro rotondità 0%. Mostriamo il comportamento chemiotassi quantitativamente misurato come descritto dai parametri selezionati chemiotassi(Figura 2C).
Monitoraggio PKD localizzazione subcellulare in cellule HL60 sotto un spatiotemporally visibile e controllabile stimolo fMLP
Si tratta di un grande progresso tecnico ai fini fluorescente e stimolo chemiotattico controllabile ad un sistema sperimentale. Storicamente, abbiamo applicato sia omogeneo stimolazione (chiamato anche uniforme) o stimolazione gradiente di osservare la risposta delle cellule e comportamenti. Tuttavia, la stimolazione "alla cieca" non solo non fornisce alcuna informazione spazio-temporale su come lo stimolo raggiunge le cellule, ma getta anche in dubbio eventuali osservazioni "anormali" di risposta cellulare alla stimolazione, semplicemente perché non vediamo lo stimolo. Abbiamo precedentemente dimostrato che colorante fluorescente (Alexa594) può essere applicato con chemiotattico per stabilire una relazione lineare tra la concentrazione chemiotattico e mintensità colorante fluorescente onitored 15. Con una configurazione di acquisizione della proteina fluorescente verde (GFP), una emissione rossa di colorante fluorescente (Alexa594), e la luce trasmessa, siamo in grado di monitorare le cellule aderenti, l'applicazione dello stimolo, e la risposta cellulare allo stimolo (Figura 3A). La proteina chinasi D è una famiglia di serina / treonina chinasi che svolgono ruoli essenziali nella migrazione delle cellule diretto 9,17. In risposta a uniformemente applicata la stimolazione fMLP (rosso), le cellule HL60 mediare una robusta membrana traslocazione di GFP-tagged proteina chinasi D1 (verde) (Figura 3B e Movie 2). In un gradiente fMLP (rosso) (Figura 4A), cellule HL60 reclutano attivamente PKD1 al bordo anteriore (Figura 4B e film 3). Un confronto attento della localizzazione subcellulare di GFP in sporgenza del bordo anteriore indica che PKD1 localizza nella parte posteriore del bordo anteriore (Figura 4C).

Figura 1. cellulare mobilità analizzatore consente fino a 6 analisi chemiotattica simultanee. (A) Schema mostra la progettazione di un chip di dispositivo di analisi della mobilità cellulare per il monitoraggio simultaneo di 6 analisi chemiotattica indipendenti. spettacoli Red chemiotattico aggiunti ai pozzetti. (B) Introduzione di cellule HL60 ai pozzi di cellule, mentre il fattore chemiotattico diffonde per stabilire una pendenza costante fMLP. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 2. il monitoraggio simultaneo di molteplici analisi chemiotattica con le cellule HL60. (A (B) Schema mostra la lunghezza del percorso di viaggio e la morfologia delle cellule HL60 tracciate. (C) Quantificazione dei chemiotassi la lunghezza totale del percorso, la velocità, la direzionalità, e rotondità. Media ± SD è mostrato; n = 10, 12, o 11 per nessuna sfumatura, fMLP pendenza senza trattamento CID755673, e il trattamento fMLP con il trattamento CID755673, rispettivamente. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

figure 4. principale bordo localizzazione PKD1 in chemotaxing cellule HL60. configurazione acquisizione modalità (A) Canale facilita la visualizzazione del gradiente fMLP e le dinamiche spazio-temporali di PKD1. In A - C, le cellule HL60 transitoriamente espressi PKD1 GFP-tagged; visualizzare il gradiente fMLP generato da una micropipetta (DIC), 100 nM fMLP (rosso) è stato miscelato con 0,1 ug colorante fluorescente / ml Alexa 594. (B) localizzazione Arricchito di PKD1 all'avanguardia della cella chemotaxing. Barra di scala = 10 micron. (C) fusione di immagini mostrano che PKD1 localizza nella parte posteriore del bordo d'attacco in cellule HL60. Verde mostra PKD1 localizzazione cellulare, e l'immagine DIC mostra la zona sporgente del bordo di attacco. Scala bar = 5 micron. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Gli autori dichiarano di non avere alcun interesse finanziario concorrente per questo lavoro.
analisi chemiotattica visivi sono essenziali per una migliore comprensione di come le cellule eucariotiche controllare la migrazione delle cellule direzionale chemoattractant-mediata. Qui, descriviamo i metodi dettagliati per: 1) in tempo reale, il monitoraggio ad alta risoluzione di molteplici analisi chemiotattica, e 2) visualizzando contemporaneamente il gradiente chemiotattico e le dinamiche spazio-temporali di eventi in cellule HL60 neutrofili simile segnalazione.
Questo lavoro è supportato dal fondo intramurale di NIAID, NIH.
| RPMI 1640 Medium GlutaMAX | Life technologies | 61870-036 | |
| Piruvato di sodio | Thermo Fisher Scietific | 11360-070 | |
| Siero fetale bovino | Gemini Bio-Products | 100-106 | |
| 1 M HEPES soluzione sterile, pH 7.3 | Quality Biological Inc. | A611-J848-06 | |
| Soluzione di penicillina streptomicina | Fisher Scientific | 15140122 | |
| Soluzione NucleofectorTM 2b | Lonza | AAB-1001 | |
| AmaxaTM Linea cellulare NucleofectorTM Kit V che include Soluzione NucleofectorTM, pipette Singe use, AmaxaTM certificato 100 ml di alluminio cuvette per elettrodi | Lonza | VCA-1003 | |
| Lab-Tek camerato #1.0 Borosilicato Coverglass | Nalge Nunc International Inc | 155383 | |
| 2% Soluzione di gelatina | Sigma-Aldrich | G1393 | |
| Fibronectina | Sigma-Aldrich | F1141 | |
| HBSS (Hanks' Balanced Salt Solution) | Life Technologies | 14025-076 | |
| Albumina sierica bovina | Sigma-Aldrich | A3803 | |
| Camere di vetro di copertura Lab-Tek II a pozzetto singolo | Nalge Nunc International Inc | 155361 | |
| Camere di vetro di copertura Lab-Tek II a quattro pozzetti | Nalge Nunc International Inc | 155383 | |
| Alexa 594 | Thermo Fisher Scientific | A-10438 | |
| fMLP | Sigma -Aldrich | F3506-5MG | |
| Spessore del vetro di copertura (2) 22 mm x 22 mm | Corning | 2855-22 | |
| EZ-TAXIScan | Effector Cell Institute, Inc. | MIC-1001 | |
| EZ-TAXIScan chip (5 mm) | Effector Cell Institute, Inc. | EZT-F01-5 | |
| 1701RN 10 μ l siringa | Hamilton | 80030 | |
| Femtotips II Punte per iniezione | Eppendorf | 5242956003 | |
| Femtotips II | Eppendorf | 930000043 | |
| TransferMan NK2, incluso modulo motore, testa X con regolatore dell'angolo e ausili per il posizionamento. | Eppendorf | 5188900056 | |
| il software DIAS | Solltech Inc. | ||
| Microscopio confocale LSM 780 META o equivalente con obiettivo 40X 1,3 NA o 60X 1,4 NA olio DIC Plan-Neofluar | Carl Zeiss |