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Research Article
Joel J. Thevarajah1,2,3, Michael D. O'Connor1,4, Patrice Castignolles2,3, Marianne Gaborieau1,2,3
1Molecular Medicine Research Group,Western Sydney University, 2Australian Centre for Research on Separation Science,Western Sydney University, 3School of Science and Health,Western Sydney University, 4School of Medicine,Western Sydney University
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Free 용액 모세관 전기영동은 화학 반응을 실시간으로 정량적으로 모니터링할 수 있는 빠르고 저렴하며 강력한 분석 방법입니다. 빠르고 편리하며 정확한 분석을 위한 유용성은 세포 접착력 향상을 위한 키토산 필름에 공유 펩타이드 이식 분석을 통해 입증되었습니다.
프리 용액을 모세관 전기 영동 (CE)은 전계의인가를 통해 용액 분석, 일반적으로 충전 된 화합물을 분리한다. 크로마토 그래피와 같은 다른 분석 분리 기술에 비해, CE 강력한, 저렴하고 효율적으로 (복잡한 자연 행렬 또는 중합체 샘플의 수에 대한) 어떤 샘플 준비가 필요하지 않습니다. CE는 빠르게 분리 된 화합물에 대해 관찰 된 신호는 용액에서의 양에 정비례로 실시간 (예를 들어, 화학 반응 속도)의 혼합물의 방출을 수행하기 위해 사용될 수있다.
여기서, CE 효율이 후속 생의학 애플리케이션 키토산 필름 상 펩티드의 공유 래프팅 모니터링 설명된다. 키토산의 항균 및 생체 특성은 이러한 세포 성장 기판 등 생물 의학 응용 프로그램에 대한 매력적인 소재 확인합니다. 공유 RGDS 펩티드를 (그 래프팅 아르기닌 - 글리신 -아스파르트 산 - 세린) 키토산 필름의 표면에 세포 부착을 향상시키는 것을 목적으로한다. 역사적으로, 크로마토 그래피 및 아미노산 분석 그래프트 펩티드의 양을 직접 측정을 제공하기 위해 사용되어왔다. 그러나 CE 제공하는 샘플 제제의 신속한 분리 부재 펩티드 래프팅 방법의 균등하면서도 정확한 실시간 모니터링을 가능하게한다. CE 분리는 반응 혼합물의 다른 구성 요소를 정량화 할 수있다 : 제 (비 그래프트) 펩타이드와 화학적 커플 링제. 이러한 방식으로 CE의 사용은 하류 어플리케이션에 개선 된 필름을 초래한다.
키토산 필름은 고체 NMR (핵 자기 공명) 분광법을 특징으로 하였다. 이 기술은 많은 시간이 걸린다 실시간으로 적용 할 수 있지만, 펩티드의 직접적인 측정치를 산출하고, 따라서 CE 기술을 검증한다.
무료 용액 모세관 전기 영동 (CE)는 그 전하로 마찰 비율 1.2에 기반 솔루션의 화합물을 분리하는 기술이다. 충전 - 투 - 크기 비율은 종종 문헌에 언급되어 있지만,이 단순화는이 작품에서 폴리 펩타이드를 포함하여, 고분자 전해질에 적용되지 않습니다, 또한 작은 유기 분자 3에 적합하지 줬습니다. CE는 정지상 만 배경 전해질 (통상 버퍼)를 갖고 있지 않는 다른 분리 기술과 다르다. 이 기술은 5, 발효 양조주 6 합성 중합체 7 음식 샘플 8 지루한 샘플 준비없이 거의 용해 펩티드 (9) 상에 이식 식물 섬유 등의 복잡한 매트릭스 (4) 샘플의 넓은 범위를 분석 할 수있는 능력의 견고 할 수 정화. 이 용해 문제가 복잡한 고분자 전해질 (들에 특히 중요하다UCH 따라서 키토산 (10)와 젤란 검 11) 및뿐만 집계 또는 용액에 침전 존재하고 성공적으로 샘플 여과없이 분석되고있다. 또한, 아침 시리얼에 설탕의 분석 물 (8)에 침전 아침 시리얼 샘플의 입자 샘플을 주입하고있었습니다. 이것은 또한 분기 고분자 전해질 또는 공중 합체 (12, 13)의 분석을 확장합니다. 많은 작업은 특별히 프로테오믹스 (14), 천연 또는 합성 펩티드 15, 단백질 및 펩티드 (16)의 마이크로 칩 분리의 키랄 분리를위한 단백질의 CE 분석 기술의 개발에 완성되었다. 분리 및 분석 모세관 일어날 때문에, 단지 작은 샘플 볼륨과 용매 크로마토 5,6,17 포함한 다른 분리 기술보다 낮은 운전 비용이 CE 할 수있게하는 데 사용된다. CE 분리하여 고속이기 때문에,이 과정 제어를 허용반응 속도의 반지. 이는 개선 된 세포 부착 18 키토산 필름 상 펩티드의 이식의 경우에서 설명 하였다.
키토산은 키틴의 N의 -deacetylation 유래의 다당류이다. 키토산의 생체 적합성으로 인해 21, 18, 20 19 생체 접착제 및 세포 증식 기질로서 키토산 필름 등 다양한 생물 의학 응용에 사용될 수있다. 피브로넥틴, 콜라겐 및 라미닌 등의 특정 세포 외 기질 단백질에 대한 세포 부착은 직접 셀 (22)의 생존에 연결된다. 특히, 다른 세포 유형은 종종 생존과 적절한 기능에 대해 서로 다른 세포 외 기질 단백질에 부착이 필요합니다. 키토산 필름에 세포 부착은 피브로넥틴 (23)의 접목을 통해 개선 된 것으로 나타났다; 그러나, 제조, 정제 및 대형 단백질의 접목은 경제적으로 실행되지 않습니다. 대안 작은 펩타이드의 범위는 근래E는 많은 세포 외 기질 단백질의 특성을 모방 할 수있는 것으로 나타났다. 예를 들어, 피브로넥틴의 모방 체로서 RGD 펩티드 (아르기닌 - 글리신 - 아스파르트 산) 및 RGDS (아르기닌 - 글리신 - 아스파라긴산 - 세린)을 촉진하고 세포 부착 (24)을 증가시키는 데 사용되어왔다. 키토산 필름 상에 RGDS의 공유 이식은 생체 내 18 피브로넥틴에 연결하는 것으로 알려진 세포에 대한 향상된 세포 부착 결과. 더 큰 단백질을 대체하는 것은 동일한 기능은 상당한 비용 절감을 제공이 작은 펩티드 피브로넥틴을 추천.
이전 18 공표 여기서, 키토산 래프팅 펩티드 하였다. 이미 증명 된 바와 같이, 이러한 접근법은되도록 RGDS의 카복실산 기능화 할 커플 링제 EDC-HCl을 (1- 에틸 -3- (3- 디메틸 아미노 프로필 ) 카 보디이 미드 ) 및 NHS (N의 -hydroxysuccinimide)를 이용하여 간편하고 효율적으로 식립을 제공 에 이식키토산 필름. 이 래프팅 방법의 두 가지 장점은 키토산 또는 펩티드의 임의의 변형을 필요로하지 않는다는 점이며, 이는 향후의 세포 배양 애플리케이션 (18, 20)과의 호환성을 극대화하는 수성 매질에서 수행된다. 커플 링제와 펩티드가 충전 될 수있는 바와 같이, CE 반응 동력학의 분석에 적합한 방법이다. 중요한 CE 통해 반응 속도 분석 래프팅 반응의 실시간 모니터링을 가능하게하고, 따라서 모두 최적화 래프팅 정도를 정량 할 수 있습니다.
그것은 통상적으로 필요하지 않다하지만, CE 분석 결과는 공유 래프팅을 입증 고체 NMR (핵 자기 공명) 분광학 25, 26를 사용하여 키토산의 필름 상에 그 래프팅 펩타이드의 직접 측정에 의해 오프라인으로 확인 될 수있다 막 (18) 상에 펩타이드. 그러나, 고체 상태 NMR 분광법에 비해 실시간 분석을 제공CE 실시간 펩티드 소모와 반응의 동역학을 평가하는 것이 기능의 정량화 할 수있다.
상술 한 방법은 간단하고, 그 래프팅 정도 간접 정량 키토산 필름 상에 그 래프팅 펩티드를 실시간으로 분석 할 수있다. 입증 된 방법은 다른 화학적 반응만큼 반응물 또는 충전 할 수있는 분석하고자하는 제품의 실시간 정량적 평가로 확장 될 수있다.
키토산 필름 1. 준비
인산염 완충 식염수 2. 준비 (PBS)
pH가 9.2에서 75 mM의 나트륨 붕산염 완충액 3. 준비
키토산 인터넷 4. 준비그 래프팅 반응에 대한 LMS
모세관 전기 영동 장비의 5. 준비 및 검증
키토산 필름에 RGDS 6. 손톱
그 래프팅 반응의 제 모니터링 CE 사용
8. 데이터 누 CE에 대한 tment
(2) 펩타이드 이식 필름 (18) 9. 추가 특성
CE 키토산 필름 상 펩티드 (예, RGDS)의 이식을 모니터링에 적합하다. 적합한 커플 링제는 키토산에 이식 할 (그림 1) 펩티드를 활성화 EDC 염산 및 NHS를 포함한다. CE는 반응 매질로부터 관심있는 다른 분자를 분리 할 수있다. electropherogram에 피크를 지정하려면, 순수한 RGDS는, EDC-HCl을하고 NHS는, 용해 주입 별도로 분리 하였다. 피크 할당 한 후, 반응 매질을 주입하고, 다양한 반응물 (도 2)를 발견 하였다. (- (((에틸) (히드 록시 페닐) 메틸렌) 아미노) - N, N-1 -dimethylpropan 아민 3) EDC-HCl을 사이드 생성물 EDH 염산으로 반응시켰다. 디메틸 설폭 사이드 (DMSO)는 CE 분리하기위한 내부 표준으로서 사용된다. 키토산은 수용성 필름의 형태로 이식 실험에서 존재하고, 따라서 주사 또는 CE에서 관찰되지 않는다. 모든 원시 데이터, t 참고그는 이동 시간 축이 전기 영동 이동도의 W (μ) (식 2)의 분포에 전기 영동 이동성 축 (식 1) 및 UV 흡광도 축으로 변환되어 기록된다.
분취 액이 반응 매질에서 가져옵니다으로 그들은 CE 기기에 넣고 주입된다. 반응의 정도는 RGDS (도 3)와 관련된 피크의 감소를 통해 모니터링된다. 또한, EDC-HCl을 피크 시간 이상 동안 EDH 염산 피크 증가 감소한다는 것을 알 수있다. 따라서 그것은 RGDS는 키토산 필름 상에 그 래프팅되는 반응 매질로부터 제거되는 것으로 가정하고, 펩티드의 부반응에서 제품에 할당 할 수있는 신호가없는 것이 중요하다. 오버레이 electropherograms (도 3A)을 반응의 시작부터 종료까지의 펩티드 소비 정량을 허용한다. 또한 주목해야한다반응 속도는 처음 18 시간 (그림 3B)을 측정 하였다 있지만 반응이 최대 범위로 진행하는, 4 시간은 충분하다고 판단했다. 정량화 할 수 있도록 최적의 주입 부피가 과부하 방지하면서 비가 충분히 높은 신호 - 대 - 잡음 (도 4A)을 보장하기 위해 필요하며 RGDS의 경우이고, 주사는 중축 (도 4b 방지 실시간으로 완료 될 필요가 있었다 ).
은 CE 기반 기술은 빠르고 간단 키토산 필름에 접목 펩타이드를 분석하기 위해 여기에 설명; 그러나, 직접 이식 과정을 정량화하지 않는다. NMR 스펙트럼은 래프팅을 입증하기 위해 사용된다; 이 측정은 실시간으로 수행 될 수 없다 (이는 통상적으로 몇 시간 정도), 후 반응을 완료 할 필요가있다. 전 및 이식 후에 키토산 필름의 질적 비교는 펩티드의 성공적인 식립을 죽 도시우 키토산 펩티드 (도 5) 사이의 아마이드 결합에 대응하는 그래프트 막 70 ppm에서의 신호의 외관.

그 래프팅 반응 그림 1. 계획. EDC - 염산과 키토산의 필름 표면에의 접목 다음 RGDS의 카르 복실 산 작용기의 NHS에 의한 활성화를 나타낸 화학 반응식. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오 .

반응 매질에 존재하는 종의도 2 피크의 지정. 부분적으로 가수 분해 된 EDC의 솔루션에 대한 A. 분리 및 피크 할당 -HCl (분홍색), RGDS과 PBS (보라색)에 대한 (적색), NHS (청색), 및 반응 매질 (검정). 이동 시간의 함수로서 제시 반응 매체 (블랙)의 B. Electropherograms (전기 영동 이동성이 이전 시대에 가난한 반복)을 극복하기 위해 사용되어야한다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

RGDS 소비 그림 3. CE 모니터링. (A)는 반응 시간 30 분 (보라색 실선), 60 분 (마젠타 대시 라인), 90 분 (파란색 실선), 120 분 (녹색 점선)에서 펩타이드 피크를 입혔다 이식의 150 분 (적색 실선)와 (B) 반응 속도는 복제 (광장 및 원)에서 18 시간에 걸쳐 완성했다.PLOAD / 54549 / 54549fig3large.jpg "대상 ="_ 빈 ">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 차선의 결과를 보여주는 반응 매체 4. 오버레이 펩타이드 피크 (A) 변하는 (유체) 주입 시간 :. 5 초 (파란 선), 10 초 (검은 선), 20 초 (레드 라인), 30 초 (마젠타 라인) . 주입하기 전에 오랜 기간 동안 CE 유리 병에 남아있는 (B) 반응 매체 :. 30 분 (레드 라인), 90 분 (파란색 선) 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 5. 13키토산 필름의 C 부어 상태 NMR 스펙트럼. 영화 전 (검은 선)의 비교 및 후 (파란색 선) 펩타이드 이식. 단지 별표로 표시됩니다 이식 후 기록 된 스펙트럼에 존재하는 신호. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 더 경쟁 재정적 이해 관계가 없음을 선언합니다.
Free 용액 모세관 전기영동은 화학 반응을 실시간으로 정량적으로 모니터링할 수 있는 빠르고 저렴하며 강력한 분석 방법입니다. 빠르고 편리하며 정확한 분석을 위한 유용성은 세포 접착력 향상을 위한 키토산 필름에 공유 펩타이드 이식 분석을 통해 입증되었습니다.
MG, MO'C 및 PC는 연구 종자 기금을 지원해 준 WSU의 분자 의학 연구 그룹과 Michele Mason (WSU), Richard Wuhrer (Advanced Materials Characterisation Facility, AMCF, WSU) 및 Hervé Cottet (Montpellier)에게 토론에 감사드립니다.
| Water | Millipore | 실험에 사용된 모든 물은 Milli-Q 품질의 | |
| 키토산 분말(중분자량) | 인Sigma-Aldrich | 448877 | 로트MKBH1108V 사용되었습니다. 다당류와 같은 천연 제품에서 상당한 배치 간 변동이 발생합니다 |
| 아세트산 - Unilab | Ajax Finechem | 2-2.5L GL | 실험실 시약 |
| Dimethylsulfoxide | Sigma-Aldrich | D4540 | 실험실 시약, 피부에 약간 위험하며, 섭취하면 위험 |
| . 수산화나트륨 | 시그마-알드리치 | 221465 | 실험실 시약, 부식성 |
| 1-에틸-3-(3-디메틸아미노프로필)카르보디이미드 | Sigma-Aldrich | D80002 | 피부 자극성 |
| N-하이드록시숙신이미드 | Sigma-Aldrich | 130672 | 피부 자극성 |
| 염화나트륨 | Ajax Finechem | 466-500G | 실험실 시약 |
| 염화칼륨 - Univar | Ajax Finechem | 384-500G | 분석 시약, 경미한 피부 자극성 |
| 인산수소이나트륨 - Unilab | Ajax Finechem | 1234-500G | 실험실 시약, 경미한 피부 자극성 |
| 인산이수소 칼륨 - Univar | Ajax Finechem | 4745-500G | 분석 시약, 약간의 피부 자극성 |
| 올리고아크릴레이트 표준 | 맞춤 제작 | 합성 프로토콜에 대한 참조 참조: Castignolles, P.; 가보리오, M.; 힐더, E. F.; 스프롱, E.; 퍼거슨, C. J.; 길버트, R. G. Macromol. Rapid Commun. 2006, 27, 42-46 | |
| 붕산 | BDH AnalR, Merck Pty Ltd | 10058 | 부식성 |
| 염산 - Unilab | Ajax Finechem | A1367-2.5L | 실험실 시약, 부식 |
| 융합 실리카 튜브 | Polymicro (Molex) | TSP050375 | 표준 폴리이미드 코팅이 된 유연한 용융 실리카 모세관 튜브, 50 µ m 내경, 363 & micro; M 외경 |
| Agilent 7100 CE | Agilent Technologies | G7100CE | 모세관 전기영동 기기 |
| Orbital shaker | IKA | KS260 | |
| 전자 저울 | Mettler Toledo | MS204S | |
| Milli-Q 합성 | Millipore | ZMQS5VF01 | 초순수 여과 시스템 |
| 파라필름 | Labtek | PM966 | 파라핀 왁스 |